MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 44176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_009513	GCT	2	6	677203	677208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543842
15002	NC_009513	TGC	2	6	677220	677225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543842
15003	NC_009513	ATT	2	6	677344	677349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543842
15004	NC_009513	TCT	2	6	677481	677486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543842
15005	NC_009513	GCT	2	6	677536	677541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543842
15006	NC_009513	CAA	2	6	677546	677551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543842
15007	NC_009513	GATC	2	8	677617	677624	25 %	25 %	25 %	25 %	148543842
15008	NC_009513	CATGC	2	10	677633	677642	20 %	20 %	20 %	40 %	148543842
15009	NC_009513	CAA	2	6	677665	677670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543842
15010	NC_009513	ATT	2	6	677671	677676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543842
15011	NC_009513	A	6	6	677686	677691	100 %	0 %	0 %	0 %	148543842
15012	NC_009513	ATT	2	6	677696	677701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543842
15013	NC_009513	CAGG	2	8	677743	677750	25 %	0 %	50 %	25 %	148543842
15014	NC_009513	GATC	2	8	677751	677758	25 %	25 %	25 %	25 %	148543842
15015	NC_009513	TCC	2	6	677790	677795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148543842
15016	NC_009513	AAG	2	6	677810	677815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543842
15017	NC_009513	ATGGA	2	10	678001	678010	40 %	20 %	40 %	0 %	148543842
15018	NC_009513	CAG	2	6	678091	678096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543842
15019	NC_009513	TA	3	6	678125	678130	50 %	50 %	0 %	0 %	148543842
15020	NC_009513	A	6	6	678198	678203	100 %	0 %	0 %	0 %	148543842
15021	NC_009513	CTT	2	6	678224	678229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543842
15022	NC_009513	ATC	2	6	678287	678292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543842
15023	NC_009513	AAAC	2	8	678340	678347	75 %	0 %	0 %	25 %	148543842
15024	NC_009513	TAA	2	6	678356	678361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543842
15025	NC_009513	ATG	2	6	678365	678370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543842
15026	NC_009513	AT	3	6	678378	678383	50 %	50 %	0 %	0 %	148543842
15027	NC_009513	ATA	2	6	678471	678476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543842
15028	NC_009513	CTTG	2	8	678477	678484	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15029	NC_009513	TGT	2	6	678495	678500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_009513	ATA	2	6	678502	678507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_009513	ATT	2	6	678514	678519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_009513	A	6	6	678555	678560	100 %	0 %	0 %	0 %	148543843
15033	NC_009513	AAATTA	2	12	678677	678688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543843
15034	NC_009513	CAGT	2	8	678730	678737	25 %	25 %	25 %	25 %	148543843
15035	NC_009513	ACG	2	6	678792	678797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543843
15036	NC_009513	GTA	2	6	678820	678825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543843
15037	NC_009513	CTT	2	6	678904	678909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543843
15038	NC_009513	CTC	2	6	678953	678958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148543843
15039	NC_009513	ATC	2	6	678989	678994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543843
15040	NC_009513	AT	3	6	679020	679025	50 %	50 %	0 %	0 %	148543843
15041	NC_009513	GAT	2	6	679045	679050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543843
15042	NC_009513	GTA	2	6	679054	679059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543843
15043	NC_009513	ATT	2	6	679129	679134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543843
15044	NC_009513	AAG	2	6	679172	679177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543843
15045	NC_009513	ATT	2	6	679219	679224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543843
15046	NC_009513	TTG	2	6	679235	679240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543843
15047	NC_009513	GAA	2	6	679278	679283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543843
15048	NC_009513	ACGC	2	8	679315	679322	25 %	0 %	25 %	50 %	148543843
15049	NC_009513	TAT	2	6	679325	679330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543843
15050	NC_009513	GAT	2	6	679374	679379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543843
15051	NC_009513	CAATT	2	10	679391	679400	40 %	40 %	0 %	20 %	148543843
15052	NC_009513	AGAA	2	8	679409	679416	75 %	0 %	25 %	0 %	148543843
15053	NC_009513	TTA	2	6	679450	679455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543843
15054	NC_009513	AAG	2	6	679457	679462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543843
15055	NC_009513	CAAT	2	8	679486	679493	50 %	25 %	0 %	25 %	148543843
15056	NC_009513	TAAA	2	8	679512	679519	75 %	25 %	0 %	0 %	148543843
15057	NC_009513	T	7	7	679580	679586	0 %	100 %	0 %	0 %	148543844
15058	NC_009513	AAGG	2	8	679601	679608	50 %	0 %	50 %	0 %	148543844
15059	NC_009513	TCA	2	6	679673	679678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543844
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15061	NC_009513	CTC	2	6	679702	679707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148543844
15062	NC_009513	TAA	2	6	679713	679718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543844
15063	NC_009513	AGT	2	6	679755	679760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543844
15064	NC_009513	TCA	2	6	679766	679771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543844
15065	NC_009513	GAA	2	6	679776	679781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543844
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15069	NC_009513	CTC	2	6	679911	679916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148543844
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15072	NC_009513	TGC	2	6	680392	680397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543844
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15088	NC_009513	TAA	2	6	681424	681429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543845
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15091	NC_009513	TGC	2	6	681560	681565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543845
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15093	NC_009513	AATT	2	8	681685	681692	50 %	50 %	0 %	0 %	148543845
15094	NC_009513	CTG	2	6	681696	681701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543845
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15096	NC_009513	ATC	2	6	681823	681828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543845
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15099	NC_009513	AAT	2	6	682006	682011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_009513	A	7	7	682101	682107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_009513	T	6	6	682109	682114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_009513	ATT	2	6	682122	682127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_009513	AGC	2	6	682270	682275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15104	NC_009513	TGTT	2	8	682368	682375	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_009513	T	7	7	682391	682397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_009513	TAC	2	6	682410	682415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15107	NC_009513	GGA	2	6	682425	682430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_009513	GAAC	2	8	682440	682447	50 %	0 %	25 %	25 %	148543846
15109	NC_009513	CAA	2	6	682459	682464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543846
15110	NC_009513	GCT	2	6	682471	682476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543846
15111	NC_009513	GTT	2	6	682540	682545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543846
15112	NC_009513	ATG	2	6	682547	682552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543846
15113	NC_009513	GAA	2	6	682597	682602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543846
15114	NC_009513	AGT	2	6	682665	682670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543846
15115	NC_009513	TGC	2	6	682671	682676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543846
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15119	NC_009513	GAA	2	6	682783	682788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543846
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15121	NC_009513	ATG	2	6	682877	682882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543846
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15355	NC_009513	A	7	7	692661	692667	100 %	0 %	0 %	0 %	148543854
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