MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 44176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_009513	GAA	2	6	519795	519800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543700
11502	NC_009513	ATG	2	6	519835	519840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543700
11503	NC_009513	TTC	2	6	519883	519888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543700
11504	NC_009513	GTC	2	6	519889	519894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543700
11505	NC_009513	ACTC	2	8	519933	519940	25 %	25 %	0 %	50 %	148543700
11506	NC_009513	TGC	2	6	519956	519961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543700
11507	NC_009513	TGA	2	6	519971	519976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543700
11508	NC_009513	GGT	3	9	519981	519989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543700
11509	NC_009513	AT	3	6	520040	520045	50 %	50 %	0 %	0 %	148543700
11510	NC_009513	CTA	2	6	520048	520053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543700
11511	NC_009513	TCT	2	6	520081	520086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543700
11512	NC_009513	TGG	2	6	520154	520159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543700
11513	NC_009513	GAA	2	6	520181	520186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543700
11514	NC_009513	AGA	2	6	520346	520351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543700
11515	NC_009513	ATT	2	6	520364	520369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543700
11516	NC_009513	GCT	2	6	520437	520442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543700
11517	NC_009513	CATG	2	8	520445	520452	25 %	25 %	25 %	25 %	148543700
11518	NC_009513	ACC	2	6	520456	520461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543700
11519	NC_009513	AAG	2	6	520482	520487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543700
11520	NC_009513	A	6	6	520559	520564	100 %	0 %	0 %	0 %	148543700
11521	NC_009513	GAA	2	6	520575	520580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543700
11522	NC_009513	ATG	2	6	520590	520595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_009513	GATT	2	8	520654	520661	25 %	50 %	25 %	0 %	148543701
11524	NC_009513	TGT	2	6	520779	520784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543701
11525	NC_009513	GAT	2	6	520829	520834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543701
11526	NC_009513	GC	3	6	520858	520863	0 %	0 %	50 %	50 %	148543701
11527	NC_009513	TGGT	2	8	520908	520915	0 %	50 %	50 %	0 %	148543701
11528	NC_009513	ATG	2	6	520952	520957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543701
11529	NC_009513	ACA	2	6	520980	520985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543701
11530	NC_009513	CGGT	2	8	520998	521005	0 %	25 %	50 %	25 %	148543701
11531	NC_009513	AAG	2	6	521027	521032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543701
11532	NC_009513	GAAT	2	8	521037	521044	50 %	25 %	25 %	0 %	148543701
11533	NC_009513	CCTA	2	8	521078	521085	25 %	25 %	0 %	50 %	148543701
11534	NC_009513	CTG	2	6	521112	521117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543701
11535	NC_009513	TGA	2	6	521143	521148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543701
11536	NC_009513	ATG	2	6	521205	521210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543701
11537	NC_009513	AAT	2	6	521276	521281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543701
11538	NC_009513	AATGC	2	10	521432	521441	40 %	20 %	20 %	20 %	148543701
11539	NC_009513	TGA	2	6	521461	521466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543701
11540	NC_009513	AGC	2	6	521509	521514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543701
11541	NC_009513	CAC	2	6	521518	521523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543701
11542	NC_009513	TGG	2	6	521542	521547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543701
11543	NC_009513	AAT	2	6	521562	521567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543701
11544	NC_009513	T	6	6	521567	521572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_009513	AGG	2	6	521580	521585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_009513	ACA	2	6	521588	521593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543702
11547	NC_009513	GTT	2	6	521629	521634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543702
11548	NC_009513	AAC	2	6	521715	521720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543702
11549	NC_009513	GTT	2	6	521749	521754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543702
11550	NC_009513	ATGG	2	8	521767	521774	25 %	25 %	50 %	0 %	148543702
11551	NC_009513	TGA	2	6	521841	521846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543702
11552	NC_009513	ATG	2	6	521951	521956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543702
11553	NC_009513	AAT	2	6	521962	521967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543702
11554	NC_009513	GTG	2	6	522026	522031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543702
11555	NC_009513	GGT	2	6	522049	522054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543702
11556	NC_009513	ATGAA	2	10	522176	522185	60 %	20 %	20 %	0 %	148543702
11557	NC_009513	GAAC	2	8	522231	522238	50 %	0 %	25 %	25 %	148543702
11558	NC_009513	AAG	2	6	522463	522468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543702
11559	NC_009513	TGA	2	6	522507	522512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543702
11560	NC_009513	ACA	2	6	522535	522540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543702
11561	NC_009513	ACT	2	6	522559	522564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543702
11562	NC_009513	TTG	2	6	522650	522655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543702
11563	NC_009513	TTC	2	6	522695	522700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543702
11564	NC_009513	ATC	2	6	522724	522729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543702
11565	NC_009513	GAA	2	6	522760	522765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543702
11566	NC_009513	CGG	2	6	522787	522792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543702
11567	NC_009513	ATG	2	6	522911	522916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543702
11568	NC_009513	AGA	2	6	522924	522929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543702
11569	NC_009513	GTT	2	6	522961	522966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543702
11570	NC_009513	AGA	2	6	523011	523016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543702
11571	NC_009513	AGG	2	6	523019	523024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148543702
11572	NC_009513	TAT	2	6	523058	523063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543703
11573	NC_009513	ATGATA	2	12	523084	523095	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148543703
11574	NC_009513	CTG	2	6	523120	523125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543703
11575	NC_009513	TGC	2	6	523166	523171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543703
11576	NC_009513	TGA	2	6	523214	523219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543703
11577	NC_009513	ATT	2	6	523242	523247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543703
11578	NC_009513	AG	3	6	523324	523329	50 %	0 %	50 %	0 %	148543703
11579	NC_009513	AGA	2	6	523366	523371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543703
11580	NC_009513	TGC	2	6	523436	523441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543703
11581	NC_009513	AAT	2	6	523492	523497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_009513	T	6	6	523629	523634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_009513	TAA	2	6	523641	523646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_009513	TGATA	2	10	523657	523666	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_009513	ATA	2	6	523732	523737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543704
11586	NC_009513	T	6	6	523765	523770	0 %	100 %	0 %	0 %	148543704
11587	NC_009513	T	7	7	523797	523803	0 %	100 %	0 %	0 %	148543704
11588	NC_009513	ACC	2	6	523809	523814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543704
11589	NC_009513	ACTGG	2	10	523849	523858	20 %	20 %	40 %	20 %	148543704
11590	NC_009513	GGA	2	6	523938	523943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_009513	A	6	6	523952	523957	100 %	0 %	0 %	0 %	148543705
11592	NC_009513	TTG	2	6	523958	523963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543705
11593	NC_009513	A	6	6	524010	524015	100 %	0 %	0 %	0 %	148543705
11594	NC_009513	AGC	2	6	524034	524039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543705
11595	NC_009513	TTA	2	6	524116	524121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543705
11596	NC_009513	GATAAG	2	12	524149	524160	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148543705
11597	NC_009513	ATC	2	6	524193	524198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543705
11598	NC_009513	TGG	2	6	524295	524300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543705
11599	NC_009513	ATT	2	6	524362	524367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543705
11600	NC_009513	ATTT	2	8	524422	524429	25 %	75 %	0 %	0 %	148543705
11601	NC_009513	TGA	2	6	524462	524467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543705
11602	NC_009513	GCA	2	6	524470	524475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543705
11603	NC_009513	ACA	2	6	524494	524499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543705
11604	NC_009513	TGC	2	6	524508	524513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543705
11605	NC_009513	TTG	2	6	524528	524533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543705
11606	NC_009513	CGT	2	6	524700	524705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543705
11607	NC_009513	ATTG	2	8	524739	524746	25 %	50 %	25 %	0 %	148543705
11608	NC_009513	GGA	2	6	524754	524759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148543705
11609	NC_009513	AAG	2	6	524783	524788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543705
11610	NC_009513	AGA	2	6	524958	524963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543705
11611	NC_009513	ACG	2	6	524967	524972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543705
11612	NC_009513	GCT	2	6	525073	525078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543705
11613	NC_009513	AT	3	6	525132	525137	50 %	50 %	0 %	0 %	148543705
11614	NC_009513	ACA	2	6	525171	525176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543705
11615	NC_009513	AAATT	2	10	525215	525224	60 %	40 %	0 %	0 %	148543705
11616	NC_009513	ACGA	2	8	525312	525319	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11617	NC_009513	GAA	2	6	525361	525366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_009513	CAAGG	2	10	525425	525434	40 %	0 %	40 %	20 %	148543706
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11984	NC_009513	GAT	2	6	542626	542631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543723
11985	NC_009513	CAT	2	6	542724	542729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543723
11986	NC_009513	AAT	2	6	542785	542790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543723
11987	NC_009513	GCA	2	6	542840	542845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543723
11988	NC_009513	GCT	2	6	542888	542893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543723
11989	NC_009513	TTC	2	6	542914	542919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543723
11990	NC_009513	ATGC	2	8	542964	542971	25 %	25 %	25 %	25 %	148543723
11991	NC_009513	CAG	2	6	542991	542996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543723
11992	NC_009513	AT	3	6	543056	543061	50 %	50 %	0 %	0 %	148543723
11993	NC_009513	TGT	2	6	543070	543075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543723
11994	NC_009513	GAA	3	9	543114	543122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543723
11995	NC_009513	AGT	2	6	543161	543166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543723
11996	NC_009513	CTT	2	6	543192	543197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543723
11997	NC_009513	CGA	2	6	543201	543206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543723
11998	NC_009513	T	6	6	543218	543223	0 %	100 %	0 %	0 %	148543723
11999	NC_009513	AGG	2	6	543307	543312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148543723
12000	NC_009513	ATC	2	6	543323	543328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543723

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