MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 44176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009513	AGA	2	6	250876	250881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543452
5502	NC_009513	CGC	2	6	250894	250899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148543452
5503	NC_009513	ATTA	2	8	250914	250921	50 %	50 %	0 %	0 %	148543452
5504	NC_009513	TAA	2	6	250940	250945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543452
5505	NC_009513	AAAG	2	8	250967	250974	75 %	0 %	25 %	0 %	148543452
5506	NC_009513	AAG	2	6	250984	250989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543452
5507	NC_009513	CAA	2	6	250990	250995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543452
5508	NC_009513	AT	3	6	250997	251002	50 %	50 %	0 %	0 %	148543452
5509	NC_009513	GTC	2	6	251050	251055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543452
5510	NC_009513	GGGAC	2	10	251103	251112	20 %	0 %	60 %	20 %	148543452
5511	NC_009513	TGT	2	6	251195	251200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543452
5512	NC_009513	CTTTG	2	10	251203	251212	0 %	60 %	20 %	20 %	148543452
5513	NC_009513	AAG	2	6	251239	251244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_009513	TC	3	6	251251	251256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_009513	TTTTTA	2	12	251263	251274	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_009513	ATATT	2	10	251299	251308	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_009513	ACGATT	2	12	251326	251337	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5518	NC_009513	A	6	6	251356	251361	100 %	0 %	0 %	0 %	148543453
5519	NC_009513	TAT	2	6	251364	251369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543453
5520	NC_009513	TAG	2	6	251376	251381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543453
5521	NC_009513	ATT	2	6	251383	251388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543453
5522	NC_009513	TTG	2	6	251392	251397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543453
5523	NC_009513	AAGC	2	8	251584	251591	50 %	0 %	25 %	25 %	148543453
5524	NC_009513	GTA	2	6	251614	251619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543453
5525	NC_009513	AAAC	2	8	251652	251659	75 %	0 %	0 %	25 %	148543453
5526	NC_009513	TAAT	2	8	251696	251703	50 %	50 %	0 %	0 %	148543453
5527	NC_009513	AAGA	2	8	251722	251729	75 %	0 %	25 %	0 %	148543453
5528	NC_009513	GAA	2	6	251881	251886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543453
5529	NC_009513	AAT	2	6	251920	251925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543453
5530	NC_009513	GAA	2	6	252046	252051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543453
5531	NC_009513	CAA	2	6	252055	252060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543453
5532	NC_009513	CTT	2	6	252084	252089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543453
5533	NC_009513	GTT	2	6	252118	252123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543453
5534	NC_009513	CAA	2	6	252247	252252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543453
5535	NC_009513	AAG	2	6	252263	252268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543453
5536	NC_009513	TGA	2	6	252289	252294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543454
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5538	NC_009513	T	6	6	252424	252429	0 %	100 %	0 %	0 %	148543454
5539	NC_009513	CTAT	2	8	252518	252525	25 %	50 %	0 %	25 %	148543454
5540	NC_009513	TTG	2	6	252534	252539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543454
5541	NC_009513	AGCG	2	8	252581	252588	25 %	0 %	50 %	25 %	148543454
5542	NC_009513	GAT	2	6	252604	252609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543454
5543	NC_009513	TTA	2	6	252698	252703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543454
5544	NC_009513	CCT	2	6	252715	252720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148543454
5545	NC_009513	AATGA	2	10	252752	252761	60 %	20 %	20 %	0 %	148543454
5546	NC_009513	CAA	2	6	252794	252799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543454
5547	NC_009513	TTA	2	6	252819	252824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543454
5548	NC_009513	TC	4	8	252871	252878	0 %	50 %	0 %	50 %	148543454
5549	NC_009513	ATT	2	6	252997	253002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543455
5550	NC_009513	ATT	2	6	253009	253014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543455
5551	NC_009513	TGG	2	6	253080	253085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543455
5552	NC_009513	GAT	2	6	253125	253130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543455
5553	NC_009513	TTG	2	6	253157	253162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543455
5554	NC_009513	TTA	2	6	253199	253204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543455
5555	NC_009513	GTT	2	6	253218	253223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543455
5556	NC_009513	TTCTT	2	10	253238	253247	0 %	80 %	0 %	20 %	148543455
5557	NC_009513	CAGT	2	8	253257	253264	25 %	25 %	25 %	25 %	148543455
5558	NC_009513	AGCT	2	8	253266	253273	25 %	25 %	25 %	25 %	148543455
5559	NC_009513	CAA	2	6	253277	253282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543455
5560	NC_009513	TTTG	2	8	253287	253294	0 %	75 %	25 %	0 %	148543455
5561	NC_009513	TCG	2	6	253380	253385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543455
5562	NC_009513	TGT	2	6	253452	253457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543455
5563	NC_009513	TAC	2	6	253466	253471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543455
5564	NC_009513	GCT	2	6	253492	253497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543455
5565	NC_009513	GCT	2	6	253543	253548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543455
5566	NC_009513	GAT	2	6	253581	253586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543455
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5568	NC_009513	ATC	2	6	253690	253695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543455
5569	NC_009513	ATCGA	2	10	253726	253735	40 %	20 %	20 %	20 %	148543455
5570	NC_009513	ACA	2	6	253761	253766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_009513	ACA	2	6	253771	253776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_009513	TAT	3	9	253810	253818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_009513	T	6	6	253876	253881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_009513	TTAA	2	8	253938	253945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_009513	AGAA	2	8	253963	253970	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_009513	TGG	2	6	253997	254002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543456
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5578	NC_009513	T	6	6	254053	254058	0 %	100 %	0 %	0 %	148543456
5579	NC_009513	TCA	2	6	254083	254088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543456
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5583	NC_009513	TGATGT	2	12	254358	254369	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148543456
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5592	NC_009513	TTGG	2	8	254647	254654	0 %	50 %	50 %	0 %	148543456
5593	NC_009513	GTC	2	6	254675	254680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543456
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5599	NC_009513	TTA	2	6	254966	254971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543457
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5602	NC_009513	CAAA	2	8	255073	255080	75 %	0 %	0 %	25 %	148543457
5603	NC_009513	CTT	2	6	255085	255090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543457
5604	NC_009513	TAT	2	6	255111	255116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543457
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5607	NC_009513	ATG	2	6	255254	255259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543457
5608	NC_009513	TGC	2	6	255366	255371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543457
5609	NC_009513	TGAT	2	8	255584	255591	25 %	50 %	25 %	0 %	148543457
5610	NC_009513	AAC	2	6	255597	255602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543457
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5621	NC_009513	GTA	3	9	256226	256234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_009513	TTA	2	6	256241	256246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_009513	GGA	2	6	256253	256258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_009513	TTA	2	6	256488	256493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543458
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