MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 44176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009513	TTTA	2	8	1	8	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009513	T	7	7	11	17	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009513	ATT	2	6	19	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009513	AAT	2	6	39	44	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009513	CT	3	6	166	171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009513	CTG	2	6	178	183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009513	AT	3	6	194	199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009513	ATT	2	6	260	265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009513	AC	3	6	271	276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009513	T	6	6	291	296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009513	ATT	2	6	297	302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009513	AGG	2	6	367	372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009513	ATT	2	6	375	380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009513	TC	5	10	483	492	0 %	50 %	0 %	50 %	148543244
15	NC_009513	A	7	7	645	651	100 %	0 %	0 %	0 %	148543244
16	NC_009513	AGA	2	6	653	658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543244
17	NC_009513	CTT	2	6	670	675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543244
18	NC_009513	CTC	2	6	688	693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148543244
19	NC_009513	GTT	2	6	723	728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543244
20	NC_009513	GCA	2	6	756	761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543244
21	NC_009513	TTGCCG	2	12	763	774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543244
22	NC_009513	TATT	2	8	802	809	25 %	75 %	0 %	0 %	148543244
23	NC_009513	G	7	7	813	819	0 %	0 %	100 %	0 %	148543244
24	NC_009513	TAA	2	6	944	949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543244
25	NC_009513	AAC	2	6	958	963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543244
26	NC_009513	AGA	2	6	968	973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543244
27	NC_009513	TGA	2	6	1001	1006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543244
28	NC_009513	A	6	6	1080	1085	100 %	0 %	0 %	0 %	148543244
29	NC_009513	ATATTG	2	12	1240	1251	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148543244
30	NC_009513	TATAA	2	10	1458	1467	60 %	40 %	0 %	0 %	148543244
31	NC_009513	CGG	2	6	1586	1591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543244
32	NC_009513	ACC	2	6	1602	1607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543244
33	NC_009513	A	6	6	1643	1648	100 %	0 %	0 %	0 %	148543244
34	NC_009513	TAA	2	6	1718	1723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009513	CTA	3	9	1812	1820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009513	AT	3	6	1843	1848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009513	TA	3	6	1850	1855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009513	CATT	2	8	1904	1911	25 %	50 %	0 %	25 %	148543245
39	NC_009513	AAT	2	6	1921	1926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543245
40	NC_009513	GTA	2	6	1984	1989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543245
41	NC_009513	GTA	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543245
42	NC_009513	TTA	2	6	2045	2050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543245
43	NC_009513	GAA	2	6	2083	2088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543245
44	NC_009513	CTT	2	6	2115	2120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543245
45	NC_009513	TAA	2	6	2268	2273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543245
46	NC_009513	AAG	2	6	2303	2308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543245
47	NC_009513	ATG	2	6	2374	2379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543245
48	NC_009513	ATT	2	6	2482	2487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543245
49	NC_009513	CTG	2	6	2654	2659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543245
50	NC_009513	ACA	2	6	2662	2667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543245
51	NC_009513	ATC	2	6	2694	2699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543245
52	NC_009513	GTTAA	2	10	2746	2755	40 %	40 %	20 %	0 %	148543245
53	NC_009513	GTG	2	6	2789	2794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543245
54	NC_009513	GAA	2	6	2818	2823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543245
55	NC_009513	GTA	2	6	2827	2832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543245
56	NC_009513	AGA	2	6	2970	2975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543245
57	NC_009513	TAA	2	6	3031	3036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009513	TGTTT	2	10	3061	3070	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009513	TAA	2	6	3105	3110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009513	A	6	6	3169	3174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009513	TAA	2	6	3206	3211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009513	AAT	2	6	3227	3232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009513	A	7	7	3262	3268	100 %	0 %	0 %	0 %	148543246
64	NC_009513	GAA	2	6	3271	3276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543246
65	NC_009513	TTGA	2	8	3286	3293	25 %	50 %	25 %	0 %	148543246
66	NC_009513	TTA	2	6	3302	3307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543246
67	NC_009513	AGA	2	6	3327	3332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543246
68	NC_009513	ATT	2	6	3337	3342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543246
69	NC_009513	AGC	2	6	3354	3359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543246
70	NC_009513	ATG	2	6	3395	3400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543246
71	NC_009513	GAT	2	6	3406	3411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543246
72	NC_009513	CGG	2	6	3412	3417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543246
73	NC_009513	AAGAT	2	10	3437	3446	60 %	20 %	20 %	0 %	148543246
74	NC_009513	ACC	2	6	3458	3463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543246
75	NC_009513	TTA	2	6	3473	3478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543246
76	NC_009513	AGTA	2	8	3481	3488	50 %	25 %	25 %	0 %	148543246
77	NC_009513	TTA	2	6	3676	3681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543247
78	NC_009513	TAA	2	6	3703	3708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543247
79	NC_009513	A	6	6	3721	3726	100 %	0 %	0 %	0 %	148543247
80	NC_009513	A	6	6	3770	3775	100 %	0 %	0 %	0 %	148543247
81	NC_009513	ATT	2	6	3839	3844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543247
82	NC_009513	CGC	2	6	3888	3893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148543247
83	NC_009513	A	7	7	3973	3979	100 %	0 %	0 %	0 %	148543247
84	NC_009513	CAA	2	6	4008	4013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543247
85	NC_009513	TGC	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543247
86	NC_009513	ATT	2	6	4074	4079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543247
87	NC_009513	T	6	6	4091	4096	0 %	100 %	0 %	0 %	148543247
88	NC_009513	TGA	2	6	4193	4198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543247
89	NC_009513	TAC	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543247
90	NC_009513	AAC	2	6	4274	4279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543247
91	NC_009513	GAT	2	6	4299	4304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543247
92	NC_009513	ACA	2	6	4355	4360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543247
93	NC_009513	AAC	2	6	4364	4369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543247
94	NC_009513	GATT	2	8	4394	4401	25 %	50 %	25 %	0 %	148543247
95	NC_009513	TGA	2	6	4402	4407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543247
96	NC_009513	ATT	4	12	4430	4441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543247
97	NC_009513	AC	3	6	4479	4484	50 %	0 %	0 %	50 %	148543247
98	NC_009513	GAC	2	6	4523	4528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543247
99	NC_009513	TTAA	2	8	4557	4564	50 %	50 %	0 %	0 %	148543247
100	NC_009513	AGG	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148543247
101	NC_009513	AAC	2	6	4629	4634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543248
102	NC_009513	ATG	2	6	4668	4673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543248
103	NC_009513	TCA	2	6	4759	4764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543248
104	NC_009513	TGA	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543248
105	NC_009513	TGT	2	6	4831	4836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543248
106	NC_009513	GGA	2	6	4952	4957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148543248
107	NC_009513	TGG	2	6	4963	4968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543248
108	NC_009513	CGG	2	6	4969	4974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543248
109	NC_009513	TGT	2	6	5014	5019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543248
110	NC_009513	TAC	2	6	5072	5077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543248
111	NC_009513	CTT	2	6	5245	5250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543248
112	NC_009513	AGACTA	2	12	5667	5678	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148543248
113	NC_009513	TTA	2	6	5744	5749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543248
114	NC_009513	ATT	2	6	5774	5779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543248
115	NC_009513	GCT	2	6	5813	5818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543248
116	NC_009513	ATT	2	6	5920	5925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543248
117	NC_009513	GGT	2	6	5948	5953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543248
118	NC_009513	AGCAA	2	10	5956	5965	60 %	0 %	20 %	20 %	148543248
119	NC_009513	TTC	2	6	5991	5996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543248
120	NC_009513	TTTA	2	8	6070	6077	25 %	75 %	0 %	0 %	148543248
121	NC_009513	TGA	2	6	6100	6105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543248
122	NC_009513	ATTA	2	8	6136	6143	50 %	50 %	0 %	0 %	148543248
123	NC_009513	GCC	2	6	6253	6258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148543248
124	NC_009513	TGA	2	6	6304	6309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543248
125	NC_009513	ACA	2	6	6410	6415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543248
126	NC_009513	GAC	2	6	6455	6460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543248
127	NC_009513	TGT	2	6	6574	6579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009513	A	6	6	6593	6598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009513	GGA	2	6	6599	6604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009513	GAAT	3	12	6768	6779	50 %	25 %	25 %	0 %	148543249
131	NC_009513	AAG	2	6	6806	6811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543249
132	NC_009513	TTG	2	6	6921	6926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543249
133	NC_009513	TGATGG	2	12	6952	6963	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148543249
134	NC_009513	GCC	2	6	6968	6973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148543249
135	NC_009513	ATG	2	6	7062	7067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543249
136	NC_009513	TTA	2	6	7112	7117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543249
137	NC_009513	CTA	2	6	7152	7157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543249
138	NC_009513	TTA	2	6	7185	7190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543249
139	NC_009513	AATG	2	8	7207	7214	50 %	25 %	25 %	0 %	148543249
140	NC_009513	TGG	2	6	7273	7278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543249
141	NC_009513	AGT	2	6	7279	7284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543249
142	NC_009513	TAT	2	6	7333	7338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543249
143	NC_009513	GAA	2	6	7361	7366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543249
144	NC_009513	A	7	7	7368	7374	100 %	0 %	0 %	0 %	148543249
145	NC_009513	TAA	2	6	7417	7422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543249
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149	NC_009513	TTG	2	6	7749	7754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543249
150	NC_009513	TGA	2	6	7783	7788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543249
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152	NC_009513	ATT	2	6	7799	7804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543249
153	NC_009513	TGA	2	6	7842	7847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543249
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159	NC_009513	TGA	2	6	8176	8181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543249
160	NC_009513	GTG	2	6	8208	8213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543249
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172	NC_009513	ATT	2	6	8603	8608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543249
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199	NC_009513	AG	3	6	9635	9640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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222	NC_009513	GAT	2	6	10615	10620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
223	NC_009513	TGATA	2	10	10647	10656	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
224	NC_009513	TAA	2	6	10669	10674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_009513	ATT	2	6	11935	11940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543253
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259	NC_009513	AAAT	2	8	12392	12399	75 %	25 %	0 %	0 %	148543253
260	NC_009513	GAA	2	6	12424	12429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543253
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264	NC_009513	GTG	2	6	12596	12601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543253
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266	NC_009513	CAAG	2	8	12657	12664	50 %	0 %	25 %	25 %	148543253
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268	NC_009513	ACT	2	6	12808	12813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543254
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384	NC_009513	TA	3	6	17997	18002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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389	NC_009513	A	7	7	18175	18181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
390	NC_009513	ACC	2	6	18183	18188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
391	NC_009513	T	6	6	18204	18209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
392	NC_009513	ATG	2	6	18212	18217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
393	NC_009513	ACA	2	6	18298	18303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
394	NC_009513	ATA	3	9	18307	18315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
395	NC_009513	ATTT	2	8	18351	18358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
396	NC_009513	TAAAAT	2	12	18413	18424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
397	NC_009513	A	7	7	18446	18452	100 %	0 %	0 %	0 %	148543260
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399	NC_009513	CCATTT	2	12	18614	18625	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148543260
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401	NC_009513	A	6	6	18732	18737	100 %	0 %	0 %	0 %	148543260
402	NC_009513	GAA	2	6	18741	18746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543260
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405	NC_009513	A	6	6	18863	18868	100 %	0 %	0 %	0 %	148543260
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441	NC_009513	TAAT	2	8	20988	20995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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