MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363 chromosome

Total Repeats: 57285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_009004	T	6	6	2424116	2424121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55002	NC_009004	TCA	2	6	2424140	2424145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125625223
55003	NC_009004	CTA	2	6	2424164	2424169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125625223
55004	NC_009004	GTTT	2	8	2424208	2424215	0 %	75 %	25 %	0 %	125625223
55005	NC_009004	CAT	2	6	2424257	2424262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125625223
55006	NC_009004	GCT	2	6	2424313	2424318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125625223
55007	NC_009004	AGCA	2	8	2424336	2424343	50 %	0 %	25 %	25 %	125625223
55008	NC_009004	CTG	3	9	2424359	2424367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125625223
55009	NC_009004	CAAG	2	8	2424424	2424431	50 %	0 %	25 %	25 %	125625223
55010	NC_009004	CCA	2	6	2424487	2424492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125625223
55011	NC_009004	TTTG	2	8	2424503	2424510	0 %	75 %	25 %	0 %	125625223
55012	NC_009004	GCT	2	6	2424514	2424519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125625223
55013	NC_009004	CCA	2	6	2424523	2424528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125625223
55014	NC_009004	TAA	2	6	2424534	2424539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125625223
55015	NC_009004	GAA	2	6	2424574	2424579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125625223
55016	NC_009004	AAT	2	6	2424642	2424647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125625223
55017	NC_009004	CAT	2	6	2424675	2424680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125625223
55018	NC_009004	CAA	2	6	2424689	2424694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125625223
55019	NC_009004	GTC	3	9	2424709	2424717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125625223
55020	NC_009004	ACT	2	6	2424721	2424726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125625223
55021	NC_009004	CAT	2	6	2424773	2424778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125625223
55022	NC_009004	AGAT	2	8	2424839	2424846	50 %	25 %	25 %	0 %	125625223
55023	NC_009004	TTC	2	6	2424864	2424869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125625223
55024	NC_009004	AG	3	6	2424900	2424905	50 %	0 %	50 %	0 %	125625223
55025	NC_009004	T	6	6	2424910	2424915	0 %	100 %	0 %	0 %	125625223
55026	NC_009004	ACA	2	6	2424916	2424921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125625223
55027	NC_009004	AAT	2	6	2424972	2424977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125625223
55028	NC_009004	CGC	2	6	2424990	2424995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125625223
55029	NC_009004	AGCAAT	2	12	2425044	2425055	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	125625223
55030	NC_009004	AAG	2	6	2425075	2425080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125625223
55031	NC_009004	AGA	2	6	2425196	2425201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125625223
55032	NC_009004	ATG	2	6	2425231	2425236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125625223
55033	NC_009004	ACCAAA	2	12	2425332	2425343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125625223
55034	NC_009004	TCC	2	6	2425368	2425373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125625223
55035	NC_009004	TGGA	2	8	2425384	2425391	25 %	25 %	50 %	0 %	125625223
55036	NC_009004	ACCCA	2	10	2425422	2425431	40 %	0 %	0 %	60 %	125625223
55037	NC_009004	ACA	2	6	2425444	2425449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125625223
55038	NC_009004	ATC	2	6	2425486	2425491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125625223
55039	NC_009004	AGA	2	6	2425495	2425500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125625223
55040	NC_009004	ATCA	2	8	2425530	2425537	50 %	25 %	0 %	25 %	125625223
55041	NC_009004	T	6	6	2425542	2425547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55042	NC_009004	TTGC	2	8	2425585	2425592	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55043	NC_009004	TAG	2	6	2425644	2425649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55044	NC_009004	T	6	6	2425658	2425663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55045	NC_009004	GTC	2	6	2425843	2425848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125625224
55046	NC_009004	ATA	2	6	2425874	2425879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125625224
55047	NC_009004	CTG	2	6	2425881	2425886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125625224
55048	NC_009004	AAC	2	6	2425890	2425895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125625224
55049	NC_009004	GTT	2	6	2425926	2425931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125625224
55050	NC_009004	TCC	2	6	2425978	2425983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125625224
55051	NC_009004	ACT	2	6	2426012	2426017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125625224
55052	NC_009004	CAA	2	6	2426019	2426024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125625224
55053	NC_009004	A	6	6	2426113	2426118	100 %	0 %	0 %	0 %	125625224
55054	NC_009004	CCA	2	6	2426159	2426164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125625224
55055	NC_009004	TGC	2	6	2426209	2426214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125625224
55056	NC_009004	TCA	2	6	2426228	2426233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125625224
55057	NC_009004	ACC	2	6	2426302	2426307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125625224
55058	NC_009004	CT	3	6	2426320	2426325	0 %	50 %	0 %	50 %	125625224
55059	NC_009004	CAC	2	6	2426380	2426385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125625224
55060	NC_009004	GCT	2	6	2426471	2426476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125625224
55061	NC_009004	AAAT	2	8	2426481	2426488	75 %	25 %	0 %	0 %	125625224
55062	NC_009004	T	8	8	2426511	2426518	0 %	100 %	0 %	0 %	125625224
55063	NC_009004	TTC	2	6	2426539	2426544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125625224
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55066	NC_009004	GCT	2	6	2426729	2426734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125625224
55067	NC_009004	GATA	2	8	2426739	2426746	50 %	25 %	25 %	0 %	125625224
55068	NC_009004	T	6	6	2426836	2426841	0 %	100 %	0 %	0 %	125625224
55069	NC_009004	TCA	2	6	2426921	2426926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125625224
55070	NC_009004	AGTG	2	8	2426936	2426943	25 %	25 %	50 %	0 %	125625224
55071	NC_009004	TTCGTC	2	12	2426974	2426985	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	125625224
55072	NC_009004	AATT	2	8	2426991	2426998	50 %	50 %	0 %	0 %	125625224
55073	NC_009004	TTC	2	6	2427037	2427042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125625224
55074	NC_009004	TTC	2	6	2427049	2427054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125625224
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55077	NC_009004	TCT	2	6	2427196	2427201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55078	NC_009004	AT	4	8	2427202	2427209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55079	NC_009004	ACC	2	6	2427249	2427254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55080	NC_009004	AAG	2	6	2427256	2427261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55081	NC_009004	TCT	2	6	2427282	2427287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55082	NC_009004	ATT	2	6	2427307	2427312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55083	NC_009004	CCA	2	6	2427472	2427477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125625225
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55085	NC_009004	TCT	2	6	2427520	2427525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125625225
55086	NC_009004	CAT	2	6	2427543	2427548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125625225
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55089	NC_009004	TGAC	2	8	2427707	2427714	25 %	25 %	25 %	25 %	125625225
55090	NC_009004	TCATAA	2	12	2427742	2427753	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	125625225
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55102	NC_009004	TTG	2	6	2428130	2428135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125625225
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55105	NC_009004	T	6	6	2428220	2428225	0 %	100 %	0 %	0 %	125625225
55106	NC_009004	AAT	2	6	2428229	2428234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125625225
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55108	NC_009004	TCA	2	6	2428352	2428357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125625225
55109	NC_009004	TCC	2	6	2428363	2428368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55110	NC_009004	CTTT	2	8	2428378	2428385	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55111	NC_009004	T	8	8	2428408	2428415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55112	NC_009004	CAA	2	6	2428423	2428428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55113	NC_009004	T	6	6	2428431	2428436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55114	NC_009004	TTA	2	6	2428595	2428600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55115	NC_009004	CTCA	2	8	2428601	2428608	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55116	NC_009004	ATA	2	6	2428641	2428646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55117	NC_009004	GAT	2	6	2428648	2428653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55118	NC_009004	AGG	2	6	2428713	2428718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55119	NC_009004	TTA	2	6	2428757	2428762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125625226
55120	NC_009004	A	7	7	2428896	2428902	100 %	0 %	0 %	0 %	125625226
55121	NC_009004	GAT	2	6	2428962	2428967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125625226
55122	NC_009004	T	6	6	2428971	2428976	0 %	100 %	0 %	0 %	125625226
55123	NC_009004	TGA	2	6	2428994	2428999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125625226
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55146	NC_009004	T	7	7	2429987	2429993	0 %	100 %	0 %	0 %	125625228
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55166	NC_009004	ATTA	2	8	2430817	2430824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55167	NC_009004	A	7	7	2430824	2430830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55168	NC_009004	A	7	7	2430875	2430881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55217	NC_009004	A	7	7	2433300	2433306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55221	NC_009004	TAG	2	6	2433607	2433612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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55223	NC_009004	CTAAA	2	10	2433643	2433652	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55224	NC_009004	GA	3	6	2433709	2433714	50 %	0 %	50 %	0 %	125625233
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55231	NC_009004	TCAA	2	8	2434144	2434151	50 %	25 %	0 %	25 %	125625233
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55477	NC_009004	AATT	2	8	2445647	2445654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55478	NC_009004	T	6	6	2445691	2445696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55479	NC_009004	A	6	6	2445703	2445708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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