MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363 chromosome

Total Repeats: 57285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009004	TGA	2	6	220520	220525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623107
5002	NC_009004	GAA	2	6	220728	220733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623107
5003	NC_009004	TTA	2	6	220765	220770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623107
5004	NC_009004	GAA	2	6	220806	220811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623107
5005	NC_009004	TTG	2	6	220855	220860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125623107
5006	NC_009004	ATT	2	6	220890	220895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623107
5007	NC_009004	TTA	2	6	220915	220920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623107
5008	NC_009004	CAA	2	6	220932	220937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125623107
5009	NC_009004	ATG	2	6	220947	220952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623107
5010	NC_009004	AAC	2	6	220985	220990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125623107
5011	NC_009004	TGA	2	6	221048	221053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623107
5012	NC_009004	TGC	2	6	221117	221122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623107
5013	NC_009004	TTG	2	6	221146	221151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125623107
5014	NC_009004	TCT	2	6	221169	221174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125623107
5015	NC_009004	GCT	2	6	221205	221210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623107
5016	NC_009004	TTTG	2	8	221348	221355	0 %	75 %	25 %	0 %	125623107
5017	NC_009004	ATG	2	6	221455	221460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623107
5018	NC_009004	TGG	2	6	221504	221509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125623107
5019	NC_009004	TGC	2	6	221543	221548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623107
5020	NC_009004	TGG	2	6	221549	221554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125623107
5021	NC_009004	TGA	2	6	221591	221596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623107
5022	NC_009004	A	6	6	221673	221678	100 %	0 %	0 %	0 %	125623107
5023	NC_009004	TGG	2	6	221798	221803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125623107
5024	NC_009004	GGGAT	2	10	221814	221823	20 %	20 %	60 %	0 %	125623107
5025	NC_009004	ATG	2	6	221911	221916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623107
5026	NC_009004	AAG	2	6	221929	221934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623107
5027	NC_009004	T	6	6	222035	222040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_009004	TAT	2	6	222099	222104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_009004	A	6	6	222109	222114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_009004	TGA	2	6	222127	222132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_009004	TGAAAA	2	12	222158	222169	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_009004	GAA	2	6	222260	222265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623108
5033	NC_009004	A	9	9	222264	222272	100 %	0 %	0 %	0 %	125623108
5034	NC_009004	GAAG	2	8	222312	222319	50 %	0 %	50 %	0 %	125623108
5035	NC_009004	GTT	2	6	222358	222363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125623108
5036	NC_009004	T	6	6	222416	222421	0 %	100 %	0 %	0 %	125623108
5037	NC_009004	TGG	2	6	222524	222529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125623108
5038	NC_009004	TTA	2	6	222537	222542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623108
5039	NC_009004	CAAA	2	8	222550	222557	75 %	0 %	0 %	25 %	125623108
5040	NC_009004	GA	3	6	222608	222613	50 %	0 %	50 %	0 %	125623108
5041	NC_009004	TCA	2	6	222652	222657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125623108
5042	NC_009004	GAT	2	6	222675	222680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623108
5043	NC_009004	TCG	2	6	222713	222718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623108
5044	NC_009004	TGGT	2	8	222736	222743	0 %	50 %	50 %	0 %	125623108
5045	NC_009004	ATT	2	6	222780	222785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623108
5046	NC_009004	TGA	2	6	222866	222871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623108
5047	NC_009004	ATTG	2	8	222881	222888	25 %	50 %	25 %	0 %	125623108
5048	NC_009004	AC	3	6	222889	222894	50 %	0 %	0 %	50 %	125623108
5049	NC_009004	ATT	2	6	222900	222905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623108
5050	NC_009004	AGA	2	6	222938	222943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623108
5051	NC_009004	CAC	2	6	222958	222963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125623108
5052	NC_009004	TGG	2	6	223019	223024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125623108
5053	NC_009004	GTG	2	6	223048	223053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125623108
5054	NC_009004	TGGT	2	8	223168	223175	0 %	50 %	50 %	0 %	125623108
5055	NC_009004	TCG	2	6	223187	223192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623108
5056	NC_009004	TTGG	2	8	223237	223244	0 %	50 %	50 %	0 %	125623108
5057	NC_009004	TTTG	2	8	223336	223343	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_009004	AAT	2	6	223367	223372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_009004	A	6	6	223378	223383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_009004	ATT	3	9	223492	223500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623109
5061	NC_009004	GAT	2	6	223504	223509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623109
5062	NC_009004	TAT	3	9	223543	223551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623109
5063	NC_009004	TGG	2	6	223557	223562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125623109
5064	NC_009004	CAG	2	6	223583	223588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125623109
5065	NC_009004	AAG	2	6	223589	223594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623109
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5067	NC_009004	T	7	7	223668	223674	0 %	100 %	0 %	0 %	125623109
5068	NC_009004	ATG	2	6	223700	223705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623109
5069	NC_009004	TGA	2	6	223736	223741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623109
5070	NC_009004	CTT	2	6	223857	223862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125623109
5071	NC_009004	AATA	2	8	223922	223929	75 %	25 %	0 %	0 %	125623109
5072	NC_009004	AGTTT	2	10	223939	223948	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_009004	AGA	2	6	224020	224025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623110
5074	NC_009004	AAGA	2	8	224031	224038	75 %	0 %	25 %	0 %	125623110
5075	NC_009004	TCA	2	6	224087	224092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125623110
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5078	NC_009004	GCTC	2	8	224357	224364	0 %	25 %	25 %	50 %	125623110
5079	NC_009004	GAA	2	6	224387	224392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623110
5080	NC_009004	A	6	6	224549	224554	100 %	0 %	0 %	0 %	125623110
5081	NC_009004	A	6	6	224559	224564	100 %	0 %	0 %	0 %	125623110
5082	NC_009004	CAA	2	6	224724	224729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125623110
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5086	NC_009004	CTT	2	6	224995	225000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125623110
5087	NC_009004	AAGA	2	8	225151	225158	75 %	0 %	25 %	0 %	125623110
5088	NC_009004	GATT	2	8	225210	225217	25 %	50 %	25 %	0 %	125623110
5089	NC_009004	AAT	2	6	225268	225273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_009004	TTA	2	6	225307	225312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_009004	TCAAAA	2	12	225318	225329	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5092	NC_009004	TTG	2	6	225402	225407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125623111
5093	NC_009004	GCC	2	6	225412	225417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125623111
5094	NC_009004	TGTT	2	8	225418	225425	0 %	75 %	25 %	0 %	125623111
5095	NC_009004	CCG	2	6	225533	225538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125623111
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5098	NC_009004	AGT	2	6	225583	225588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623111
5099	NC_009004	GTT	3	9	225593	225601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125623111
5100	NC_009004	CTG	3	9	225636	225644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623111
5101	NC_009004	TCA	2	6	225736	225741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_009004	TGA	2	6	225758	225763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_009004	A	6	6	225851	225856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_009004	ATAA	2	8	225870	225877	75 %	25 %	0 %	0 %	125623112
5105	NC_009004	AGA	2	6	226074	226079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623112
5106	NC_009004	A	6	6	226173	226178	100 %	0 %	0 %	0 %	125623112
5107	NC_009004	AAAT	2	8	226186	226193	75 %	25 %	0 %	0 %	125623112
5108	NC_009004	A	6	6	226197	226202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_009004	A	6	6	226204	226209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_009004	A	6	6	226228	226233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_009004	A	6	6	226246	226251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_009004	AGA	2	6	226316	226321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623113
5113	NC_009004	ACG	2	6	226328	226333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125623113
5114	NC_009004	T	6	6	226345	226350	0 %	100 %	0 %	0 %	125623113
5115	NC_009004	GTC	2	6	226522	226527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623113
5116	NC_009004	GAA	2	6	226578	226583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623113
5117	NC_009004	TAT	2	6	226607	226612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623113
5118	NC_009004	TGA	2	6	226655	226660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623113
5119	NC_009004	CTT	2	6	226717	226722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125623113
5120	NC_009004	ATG	2	6	226749	226754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623113
5121	NC_009004	AAG	2	6	226846	226851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623113
5122	NC_009004	AGA	2	6	226893	226898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623114
5123	NC_009004	AGC	2	6	226965	226970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125623114
5124	NC_009004	AAGC	2	8	227009	227016	50 %	0 %	25 %	25 %	125623114
5125	NC_009004	ATT	2	6	227036	227041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623114
5126	NC_009004	ATA	3	9	227117	227125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125623114
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5128	NC_009004	GCT	2	6	227317	227322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623114
5129	NC_009004	CGT	2	6	227383	227388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623114
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5133	NC_009004	AGA	2	6	227782	227787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623115
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5136	NC_009004	A	6	6	228044	228049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_009004	TAA	3	9	228055	228063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_009004	AG	3	6	228064	228069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5139	NC_009004	GGA	2	6	228082	228087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5140	NC_009004	A	7	7	228101	228107	100 %	0 %	0 %	0 %	125623116
5141	NC_009004	AGC	2	6	228128	228133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125623116
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5145	NC_009004	GTC	2	6	228226	228231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623116
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5150	NC_009004	AAT	2	6	228448	228453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125623116
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5152	NC_009004	T	6	6	228493	228498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5153	NC_009004	AAG	2	6	228712	228717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623117
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5163	NC_009004	GAA	2	6	229146	229151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623117
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5198	NC_009004	AAT	2	6	230593	230598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5215	NC_009004	T	7	7	231376	231382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5216	NC_009004	ATA	2	6	231398	231403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5217	NC_009004	A	7	7	231433	231439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5219	NC_009004	CTGC	2	8	231484	231491	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5220	NC_009004	TGA	2	6	231503	231508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5230	NC_009004	A	7	7	232050	232056	100 %	0 %	0 %	0 %	125623120
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5234	NC_009004	TTA	2	6	232213	232218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623120
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5240	NC_009004	T	7	7	232625	232631	0 %	100 %	0 %	0 %	125623120
5241	NC_009004	GATT	2	8	232688	232695	25 %	50 %	25 %	0 %	125623120
5242	NC_009004	T	7	7	232730	232736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_009004	AGC	2	6	232827	232832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125623121
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5245	NC_009004	ATG	2	6	232945	232950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623121
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5248	NC_009004	CTG	2	6	233192	233197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623121
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5250	NC_009004	CAT	2	6	233291	233296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125623121
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5292	NC_009004	TCAAG	2	10	235629	235638	40 %	20 %	20 %	20 %	125623124
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5372	NC_009004	AT	3	6	239447	239452	50 %	50 %	0 %	0 %	125623128
5373	NC_009004	A	6	6	239489	239494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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