MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363 chromosome

Total Repeats: 57285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009004	T	7	7	84	90	0 %	100 %	0 %	0 %	125622883
2	NC_009004	TGTC	2	8	110	117	0 %	50 %	25 %	25 %	125622883
3	NC_009004	CTTG	2	8	138	145	0 %	50 %	25 %	25 %	125622883
4	NC_009004	A	6	6	157	162	100 %	0 %	0 %	0 %	125622883
5	NC_009004	ATT	2	6	164	169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125622883
6	NC_009004	A	6	6	172	177	100 %	0 %	0 %	0 %	125622883
7	NC_009004	GAT	2	6	222	227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622883
8	NC_009004	ATG	2	6	248	253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622883
9	NC_009004	CGT	2	6	274	279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125622883
10	NC_009004	AATC	2	8	286	293	50 %	25 %	0 %	25 %	125622883
11	NC_009004	TGA	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622883
12	NC_009004	GCA	2	6	412	417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125622883
13	NC_009004	TTGCTG	2	12	419	430	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	125622883
14	NC_009004	TGG	2	6	468	473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125622883
15	NC_009004	ATGC	2	8	499	506	25 %	25 %	25 %	25 %	125622883
16	NC_009004	ACTT	2	8	644	651	25 %	50 %	0 %	25 %	125622883
17	NC_009004	GAT	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622883
18	NC_009004	AAG	2	6	683	688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622883
19	NC_009004	ACT	2	6	826	831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125622883
20	NC_009004	CTA	2	6	871	876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125622883
21	NC_009004	A	6	6	1056	1061	100 %	0 %	0 %	0 %	125622883
22	NC_009004	CAA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125622883
23	NC_009004	A	8	8	1095	1102	100 %	0 %	0 %	0 %	125622883
24	NC_009004	ATT	2	6	1121	1126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125622883
25	NC_009004	TGG	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125622883
26	NC_009004	ACA	2	6	1270	1275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125622883
27	NC_009004	CTA	3	9	1473	1481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009004	TAT	2	6	1486	1491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009004	TAA	2	6	1539	1544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125622884
30	NC_009004	TTGAAG	2	12	1628	1639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622884
31	NC_009004	TCAA	2	8	1678	1685	50 %	25 %	0 %	25 %	125622884
32	NC_009004	ATA	2	6	1703	1708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125622884
33	NC_009004	TTA	2	6	1747	1752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125622884
34	NC_009004	GCT	2	6	1756	1761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125622884
35	NC_009004	GTA	2	6	1774	1779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622884
36	NC_009004	TTG	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125622884
37	NC_009004	TTC	2	6	1917	1922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125622884
38	NC_009004	TGAAAG	2	12	1931	1942	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	125622884
39	NC_009004	GAAA	2	8	1947	1954	75 %	0 %	25 %	0 %	125622884
40	NC_009004	AGA	2	6	2097	2102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622884
41	NC_009004	ATCA	2	8	2139	2146	50 %	25 %	0 %	25 %	125622884
42	NC_009004	ATG	2	6	2171	2176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622884
43	NC_009004	AAG	2	6	2177	2182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622884
44	NC_009004	TCA	2	6	2195	2200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125622884
45	NC_009004	TTA	2	6	2238	2243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125622884
46	NC_009004	TTGA	2	8	2251	2258	25 %	50 %	25 %	0 %	125622884
47	NC_009004	TGC	2	6	2328	2333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125622884
48	NC_009004	CAAC	2	8	2381	2388	50 %	0 %	0 %	50 %	125622884
49	NC_009004	GAA	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622884
50	NC_009004	AAG	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622884
51	NC_009004	TATC	2	8	2501	2508	25 %	50 %	0 %	25 %	125622884
52	NC_009004	TGAT	2	8	2528	2535	25 %	50 %	25 %	0 %	125622884
53	NC_009004	GAA	2	6	2617	2622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622884
54	NC_009004	GTAC	2	8	2650	2657	25 %	25 %	25 %	25 %	125622884
55	NC_009004	AATT	2	8	2659	2666	50 %	50 %	0 %	0 %	125622884
56	NC_009004	TGTC	2	8	2709	2716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009004	T	6	6	2764	2769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009004	TA	3	6	2780	2785	50 %	50 %	0 %	0 %	125622885
59	NC_009004	ATT	2	6	2814	2819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125622885
60	NC_009004	GAA	2	6	2833	2838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
61	NC_009004	A	7	7	2843	2849	100 %	0 %	0 %	0 %	125622885
62	NC_009004	TAC	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125622885
63	NC_009004	CTT	2	6	2873	2878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125622885
64	NC_009004	GAAA	2	8	2898	2905	75 %	0 %	25 %	0 %	125622885
65	NC_009004	CAG	2	6	2936	2941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125622885
66	NC_009004	AAC	2	6	2969	2974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125622885
67	NC_009004	TTA	2	6	2979	2984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125622885
68	NC_009004	CAA	2	6	3005	3010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125622885
69	NC_009004	A	6	6	3073	3078	100 %	0 %	0 %	0 %	125622885
70	NC_009004	A	7	7	3214	3220	100 %	0 %	0 %	0 %	125622885
71	NC_009004	TTG	2	6	3296	3301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125622885
72	NC_009004	CAG	2	6	3316	3321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125622885
73	NC_009004	GAA	2	6	3370	3375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
74	NC_009004	TTAT	2	8	3379	3386	25 %	75 %	0 %	0 %	125622885
75	NC_009004	TGT	2	6	3417	3422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125622885
76	NC_009004	TGA	2	6	3435	3440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
77	NC_009004	GAT	2	6	3489	3494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
78	NC_009004	AAAT	2	8	3507	3514	75 %	25 %	0 %	0 %	125622885
79	NC_009004	CTT	2	6	3539	3544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125622885
80	NC_009004	TTA	2	6	3605	3610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125622885
81	NC_009004	TGA	2	6	3612	3617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
82	NC_009004	A	6	6	3617	3622	100 %	0 %	0 %	0 %	125622885
83	NC_009004	AGA	2	6	3636	3641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
84	NC_009004	A	6	6	3716	3721	100 %	0 %	0 %	0 %	125622885
85	NC_009004	T	6	6	3735	3740	0 %	100 %	0 %	0 %	125622885
86	NC_009004	CAG	2	6	3770	3775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125622885
87	NC_009004	AAG	2	6	3794	3799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
88	NC_009004	AAG	2	6	3836	3841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
89	NC_009004	T	8	8	3869	3876	0 %	100 %	0 %	0 %	125622885
90	NC_009004	A	8	8	3895	3902	100 %	0 %	0 %	0 %	125622885
91	NC_009004	GAT	2	6	3916	3921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
92	NC_009004	AAAGT	2	10	3938	3947	60 %	20 %	20 %	0 %	125622885
93	NC_009004	TGA	2	6	3966	3971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
94	NC_009004	AGA	2	6	4038	4043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
95	NC_009004	ACT	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125622885
96	NC_009004	AAT	2	6	4138	4143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125622885
97	NC_009004	A	8	8	4146	4153	100 %	0 %	0 %	0 %	125622885
98	NC_009004	A	7	7	4158	4164	100 %	0 %	0 %	0 %	125622885
99	NC_009004	T	6	6	4325	4330	0 %	100 %	0 %	0 %	125622885
100	NC_009004	TGA	2	6	4332	4337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
101	NC_009004	ATGTTG	2	12	4415	4426	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	125622885
102	NC_009004	TTG	2	6	4448	4453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125622885
103	NC_009004	TGA	2	6	4572	4577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
104	NC_009004	A	7	7	4616	4622	100 %	0 %	0 %	0 %	125622885
105	NC_009004	AG	3	6	4659	4664	50 %	0 %	50 %	0 %	125622885
106	NC_009004	TGA	2	6	4746	4751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
107	NC_009004	A	6	6	4751	4756	100 %	0 %	0 %	0 %	125622885
108	NC_009004	A	6	6	4763	4768	100 %	0 %	0 %	0 %	125622885
109	NC_009004	T	6	6	4892	4897	0 %	100 %	0 %	0 %	125622885
110	NC_009004	A	6	6	4943	4948	100 %	0 %	0 %	0 %	125622885
111	NC_009004	AC	3	6	4997	5002	50 %	0 %	0 %	50 %	125622885
112	NC_009004	TTG	2	6	5138	5143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125622885
113	NC_009004	T	6	6	5148	5153	0 %	100 %	0 %	0 %	125622885
114	NC_009004	GACT	2	8	5184	5191	25 %	25 %	25 %	25 %	125622885
115	NC_009004	CAG	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125622885
116	NC_009004	TGA	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
117	NC_009004	AAG	2	6	5234	5239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
118	NC_009004	AGA	2	6	5304	5309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
119	NC_009004	TGA	2	6	5355	5360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
120	NC_009004	AGT	2	6	5383	5388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
121	NC_009004	TGA	2	6	5427	5432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
122	NC_009004	TATT	2	8	5433	5440	25 %	75 %	0 %	0 %	125622885
123	NC_009004	GAA	2	6	5447	5452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
124	NC_009004	TCAT	2	8	5514	5521	25 %	50 %	0 %	25 %	125622885
125	NC_009004	ATG	2	6	5540	5545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
126	NC_009004	A	6	6	5603	5608	100 %	0 %	0 %	0 %	125622885
127	NC_009004	TTTA	2	8	5621	5628	25 %	75 %	0 %	0 %	125622885
128	NC_009004	AACC	2	8	5638	5645	50 %	0 %	0 %	50 %	125622885
129	NC_009004	AGA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
130	NC_009004	GCA	2	6	5734	5739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125622885
131	NC_009004	A	6	6	5772	5777	100 %	0 %	0 %	0 %	125622885
132	NC_009004	GAA	3	9	5794	5802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
133	NC_009004	A	6	6	5860	5865	100 %	0 %	0 %	0 %	125622885
134	NC_009004	CAAT	2	8	5876	5883	50 %	25 %	0 %	25 %	125622885
135	NC_009004	AAT	2	6	5886	5891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125622885
136	NC_009004	ATGA	2	8	5986	5993	50 %	25 %	25 %	0 %	125622885
137	NC_009004	AT	3	6	6120	6125	50 %	50 %	0 %	0 %	125622886
138	NC_009004	TTG	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125622886
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140	NC_009004	A	6	6	6281	6286	100 %	0 %	0 %	0 %	125622886
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145	NC_009004	TGA	2	6	6517	6522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622886
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262	NC_009004	CAAA	2	8	11939	11946	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
263	NC_009004	A	7	7	11944	11950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_009004	AAGG	2	8	11972	11979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
265	NC_009004	AAT	2	6	11998	12003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125622890
266	NC_009004	TCAG	2	8	12030	12037	25 %	25 %	25 %	25 %	125622890
267	NC_009004	TC	3	6	12063	12068	0 %	50 %	0 %	50 %	125622890
268	NC_009004	ATCT	2	8	12073	12080	25 %	50 %	0 %	25 %	125622890
269	NC_009004	CAC	2	6	12109	12114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125622890
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