MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria welshimeri serovar 6b str. SLCC5334 chromosome

Total Repeats: 67091

< Previous12...123124125126127128129130131132133134135Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
67001	NC_008555	AC	3	6	2810756	2810761	50 %	0 %	0 %	50 %	116874191
67002	NC_008555	A	6	6	2810771	2810776	100 %	0 %	0 %	0 %	116874191
67003	NC_008555	TTA	2	6	2810877	2810882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116874191
67004	NC_008555	CTT	2	6	2810901	2810906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116874191
67005	NC_008555	TCC	2	6	2810956	2810961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116874191
67006	NC_008555	ACT	2	6	2810983	2810988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116874191
67007	NC_008555	TCCA	2	8	2811004	2811011	25 %	25 %	0 %	50 %	116874191
67008	NC_008555	AGA	2	6	2811043	2811048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116874191
67009	NC_008555	TA	3	6	2811135	2811140	50 %	50 %	0 %	0 %	116874191
67010	NC_008555	TCC	2	6	2811155	2811160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67011	NC_008555	A	7	7	2811162	2811168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67012	NC_008555	T	6	6	2811204	2811209	0 %	100 %	0 %	0 %	116874192
67013	NC_008555	ATGA	2	8	2811291	2811298	50 %	25 %	25 %	0 %	116874192
67014	NC_008555	TTTC	2	8	2811301	2811308	0 %	75 %	0 %	25 %	116874192
67015	NC_008555	AAG	2	6	2811311	2811316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116874192
67016	NC_008555	GTTTT	2	10	2811341	2811350	0 %	80 %	20 %	0 %	116874192
67017	NC_008555	AAT	2	6	2811429	2811434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116874192
67018	NC_008555	GTT	2	6	2811451	2811456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116874192
67019	NC_008555	TTA	2	6	2811457	2811462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116874192
67020	NC_008555	AATT	2	8	2811465	2811472	50 %	50 %	0 %	0 %	116874192
67021	NC_008555	TCT	2	6	2811571	2811576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116874192
67022	NC_008555	TCT	2	6	2811649	2811654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116874192
67023	NC_008555	T	6	6	2811705	2811710	0 %	100 %	0 %	0 %	116874192
67024	NC_008555	ACTTCC	2	12	2811724	2811735	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	116874192
67025	NC_008555	CTT	2	6	2811782	2811787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116874192
67026	NC_008555	TC	3	6	2811814	2811819	0 %	50 %	0 %	50 %	116874192
67027	NC_008555	CTTT	2	8	2811821	2811828	0 %	75 %	0 %	25 %	116874192
67028	NC_008555	CCT	2	6	2811834	2811839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116874193
67029	NC_008555	T	6	6	2811839	2811844	0 %	100 %	0 %	0 %	116874193
67030	NC_008555	GCT	2	6	2811861	2811866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116874193
67031	NC_008555	T	6	6	2811866	2811871	0 %	100 %	0 %	0 %	116874193
67032	NC_008555	TTC	3	9	2811881	2811889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116874193
67033	NC_008555	AGC	2	6	2811896	2811901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116874193
67034	NC_008555	CCT	2	6	2811910	2811915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116874193
67035	NC_008555	ATT	2	6	2811938	2811943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116874193
67036	NC_008555	GTAAT	2	10	2812009	2812018	40 %	40 %	20 %	0 %	116874193
67037	NC_008555	ATTT	2	8	2812069	2812076	25 %	75 %	0 %	0 %	116874193
67038	NC_008555	CAT	2	6	2812091	2812096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116874193
67039	NC_008555	TGA	2	6	2812106	2812111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116874193
67040	NC_008555	CAA	2	6	2812132	2812137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116874193
67041	NC_008555	ATA	2	6	2812148	2812153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116874193
67042	NC_008555	CTG	2	6	2812204	2812209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116874193
67043	NC_008555	CTA	2	6	2812212	2812217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116874193
67044	NC_008555	AGT	2	6	2812236	2812241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116874193
67045	NC_008555	CAT	2	6	2812274	2812279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116874193
67046	NC_008555	TTG	2	6	2812319	2812324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116874193
67047	NC_008555	GTTTC	2	10	2812333	2812342	0 %	60 %	20 %	20 %	116874193
67048	NC_008555	GTT	2	6	2812420	2812425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116874193
67049	NC_008555	AGT	2	6	2812446	2812451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116874193
67050	NC_008555	AAC	2	6	2812466	2812471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116874193
67051	NC_008555	AAT	2	6	2812472	2812477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116874193
67052	NC_008555	TAA	2	6	2812519	2812524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116874193
67053	NC_008555	CTA	2	6	2812618	2812623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116874193
67054	NC_008555	TCT	2	6	2812672	2812677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116874193
67055	NC_008555	GCC	2	6	2812813	2812818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116874194
67056	NC_008555	ATA	3	9	2812831	2812839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116874194
67057	NC_008555	GATT	2	8	2812853	2812860	25 %	50 %	25 %	0 %	116874194
67058	NC_008555	TCT	2	6	2812864	2812869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116874194
67059	NC_008555	GACA	2	8	2812913	2812920	50 %	0 %	25 %	25 %	116874194
67060	NC_008555	T	7	7	2812931	2812937	0 %	100 %	0 %	0 %	116874194
67061	NC_008555	CTT	2	6	2812973	2812978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116874194
67062	NC_008555	ACA	2	6	2812993	2812998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116874194
67063	NC_008555	T	8	8	2813053	2813060	0 %	100 %	0 %	0 %	116874194
67064	NC_008555	T	9	9	2813070	2813078	0 %	100 %	0 %	0 %	116874194
67065	NC_008555	TCT	2	6	2813092	2813097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67066	NC_008555	A	10	10	2813139	2813148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67067	NC_008555	TTC	2	6	2813188	2813193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116874195
67068	NC_008555	ACG	3	9	2813198	2813206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116874195
67069	NC_008555	T	7	7	2813264	2813270	0 %	100 %	0 %	0 %	116874195
67070	NC_008555	ATTA	2	8	2813304	2813311	50 %	50 %	0 %	0 %	116874195
67071	NC_008555	TATCA	2	10	2813429	2813438	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67072	NC_008555	AAAT	2	8	2813483	2813490	75 %	25 %	0 %	0 %	116874196
67073	NC_008555	AT	3	6	2813489	2813494	50 %	50 %	0 %	0 %	116874196
67074	NC_008555	TC	3	6	2813496	2813501	0 %	50 %	0 %	50 %	116874196
67075	NC_008555	AGT	2	6	2813503	2813508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116874196
67076	NC_008555	CTA	2	6	2813541	2813546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116874196
67077	NC_008555	CTG	2	6	2813580	2813585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116874196
67078	NC_008555	TTA	2	6	2813610	2813615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116874196
67079	NC_008555	TTC	3	9	2813707	2813715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116874196
67080	NC_008555	A	6	6	2813731	2813736	100 %	0 %	0 %	0 %	116874196
67081	NC_008555	T	8	8	2813753	2813760	0 %	100 %	0 %	0 %	116874196
67082	NC_008555	CTT	2	6	2813778	2813783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116874196
67083	NC_008555	ATC	2	6	2813815	2813820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116874196
67084	NC_008555	CTG	2	6	2813826	2813831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116874196
67085	NC_008555	CAT	2	6	2813868	2813873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116874196
67086	NC_008555	T	7	7	2813967	2813973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67087	NC_008555	TCCT	2	8	2814014	2814021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67088	NC_008555	AGT	2	6	2814037	2814042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67089	NC_008555	CCT	2	6	2814049	2814054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67090	NC_008555	TTTA	2	8	2814072	2814079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67091	NC_008555	AC	3	6	2814112	2814117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

< Previous12...123124125126127128129130131132133134135Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.