MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus gasseri ATCC 33323 chromosome

Total Repeats: 43050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_008530	CTT	2	6	1891927	1891932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116630435
43002	NC_008530	CCA	2	6	1891989	1891994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116630435
43003	NC_008530	CCA	2	6	1892181	1892186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116630435
43004	NC_008530	ATTT	2	8	1892192	1892199	25 %	75 %	0 %	0 %	116630435
43005	NC_008530	TCT	2	6	1892208	1892213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116630435
43006	NC_008530	CAA	2	6	1892284	1892289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116630435
43007	NC_008530	TCC	2	6	1892399	1892404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116630435
43008	NC_008530	T	6	6	1892464	1892469	0 %	100 %	0 %	0 %	116630435
43009	NC_008530	ATAA	2	8	1892477	1892484	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43010	NC_008530	TAAA	2	8	1892486	1892493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43011	NC_008530	A	7	7	1892491	1892497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43012	NC_008530	CCA	2	6	1892507	1892512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43013	NC_008530	ATG	2	6	1892524	1892529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43014	NC_008530	ACT	2	6	1892544	1892549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43015	NC_008530	ATTT	2	8	1892572	1892579	25 %	75 %	0 %	0 %	116630436
43016	NC_008530	T	6	6	1892583	1892588	0 %	100 %	0 %	0 %	116630436
43017	NC_008530	ACG	2	6	1892610	1892615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116630436
43018	NC_008530	ACGTTC	3	18	1892622	1892639	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116630436
43019	NC_008530	CTT	2	6	1892643	1892648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116630436
43020	NC_008530	TTC	2	6	1892652	1892657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116630436
43021	NC_008530	ACT	2	6	1892704	1892709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116630436
43022	NC_008530	ATG	2	6	1892893	1892898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116630436
43023	NC_008530	ATCC	2	8	1892922	1892929	25 %	25 %	0 %	50 %	116630436
43024	NC_008530	CATA	2	8	1892984	1892991	50 %	25 %	0 %	25 %	116630436
43025	NC_008530	CTT	2	6	1893044	1893049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116630436
43026	NC_008530	TCT	2	6	1893067	1893072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116630436
43027	NC_008530	CATC	2	8	1893125	1893132	25 %	25 %	0 %	50 %	116630436
43028	NC_008530	TTG	2	6	1893147	1893152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116630436
43029	NC_008530	TAA	2	6	1893189	1893194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116630436
43030	NC_008530	ATT	2	6	1893196	1893201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116630436
43031	NC_008530	CCA	2	6	1893306	1893311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116630436
43032	NC_008530	TAG	2	6	1893353	1893358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116630436
43033	NC_008530	ACT	2	6	1893373	1893378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116630436
43034	NC_008530	TAGC	2	8	1893492	1893499	25 %	25 %	25 %	25 %	116630437
43035	NC_008530	GTTC	2	8	1893527	1893534	0 %	50 %	25 %	25 %	116630437
43036	NC_008530	CCG	2	6	1893654	1893659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116630437
43037	NC_008530	ACA	2	6	1893731	1893736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116630437
43038	NC_008530	CTT	2	6	1893762	1893767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116630437
43039	NC_008530	TC	4	8	1893785	1893792	0 %	50 %	0 %	50 %	116630437
43040	NC_008530	CTTA	2	8	1893831	1893838	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43041	NC_008530	A	7	7	1893843	1893849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43042	NC_008530	CTT	2	6	1893976	1893981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116630438
43043	NC_008530	TAA	2	6	1894037	1894042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43044	NC_008530	GAAAA	2	10	1894108	1894117	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43045	NC_008530	T	6	6	1894120	1894125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43046	NC_008530	T	7	7	1894171	1894177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43047	NC_008530	T	6	6	1894181	1894186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43048	NC_008530	CAA	2	6	1894189	1894194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43049	NC_008530	ATA	2	6	1894238	1894243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43050	NC_008530	TAAA	2	8	1894257	1894264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.