MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus gasseri ATCC 33323 chromosome

Total Repeats: 43050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42003	NC_008530	ATT	2	6	1849169	1849174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116630397
42004	NC_008530	ACT	3	9	1849178	1849186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116630397
42005	NC_008530	AAT	2	6	1849229	1849234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116630397
42006	NC_008530	TTA	2	6	1849295	1849300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116630397
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42008	NC_008530	TACC	2	8	1849372	1849379	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42009	NC_008530	AT	3	6	1849386	1849391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42013	NC_008530	TCC	2	6	1849516	1849521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116630398
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42039	NC_008530	A	6	6	1850730	1850735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42042	NC_008530	AATC	2	8	1850789	1850796	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42043	NC_008530	T	6	6	1850803	1850808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42053	NC_008530	AAT	2	6	1851344	1851349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116630400
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42055	NC_008530	AATT	2	8	1851474	1851481	50 %	50 %	0 %	0 %	116630400
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42120	NC_008530	GAA	2	6	1853935	1853940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116630403
42121	NC_008530	AAG	2	6	1853948	1853953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116630403
42122	NC_008530	TTG	2	6	1853966	1853971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116630403
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42124	NC_008530	AT	3	6	1854068	1854073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42125	NC_008530	TCA	2	6	1854164	1854169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116630404
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42157	NC_008530	TAT	2	6	1855405	1855410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42159	NC_008530	TACT	2	8	1855434	1855441	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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42162	NC_008530	GGA	2	6	1855554	1855559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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42226	NC_008530	T	6	6	1858078	1858083	0 %	100 %	0 %	0 %	116630406
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42233	NC_008530	CCT	2	6	1858369	1858374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116630406
42234	NC_008530	ATATT	2	10	1858427	1858436	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42235	NC_008530	TAA	2	6	1858444	1858449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42236	NC_008530	A	6	6	1858464	1858469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42237	NC_008530	T	7	7	1858497	1858503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42238	NC_008530	AAT	2	6	1858516	1858521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42239	NC_008530	ATC	2	6	1858529	1858534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42355	NC_008530	A	7	7	1863190	1863196	100 %	0 %	0 %	0 %	116630412
42356	NC_008530	ATTCTT	2	12	1863225	1863236	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116630412
42357	NC_008530	TAA	2	6	1863306	1863311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116630412
42358	NC_008530	A	6	6	1863310	1863315	100 %	0 %	0 %	0 %	116630412
42359	NC_008530	ATA	2	6	1863337	1863342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116630412
42360	NC_008530	T	6	6	1863383	1863388	0 %	100 %	0 %	0 %	116630412
42361	NC_008530	TCT	2	6	1863412	1863417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116630412
42362	NC_008530	CCA	2	6	1863458	1863463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116630412
42363	NC_008530	AGCC	2	8	1863478	1863485	25 %	0 %	25 %	50 %	116630412
42364	NC_008530	T	6	6	1863490	1863495	0 %	100 %	0 %	0 %	116630412
42365	NC_008530	A	6	6	1863501	1863506	100 %	0 %	0 %	0 %	116630412
42366	NC_008530	CAT	2	6	1863510	1863515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116630412
42367	NC_008530	T	6	6	1863559	1863564	0 %	100 %	0 %	0 %	116630412
42368	NC_008530	TTG	2	6	1863697	1863702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42369	NC_008530	AT	3	6	1863721	1863726	50 %	50 %	0 %	0 %	116630413
42370	NC_008530	GAAAG	2	10	1863743	1863752	60 %	0 %	40 %	0 %	116630413
42371	NC_008530	CA	3	6	1863836	1863841	50 %	0 %	0 %	50 %	116630413
42372	NC_008530	A	6	6	1863868	1863873	100 %	0 %	0 %	0 %	116630413
42373	NC_008530	CTA	2	6	1863888	1863893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116630413
42374	NC_008530	GAC	2	6	1863951	1863956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116630413
42375	NC_008530	CAGA	2	8	1863983	1863990	50 %	0 %	25 %	25 %	116630413
42376	NC_008530	ATG	2	6	1863992	1863997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116630413
42377	NC_008530	TTA	2	6	1864016	1864021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116630413
42378	NC_008530	TG	3	6	1864029	1864034	0 %	50 %	50 %	0 %	116630413
42379	NC_008530	AAG	2	6	1864110	1864115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116630413
42380	NC_008530	A	6	6	1864131	1864136	100 %	0 %	0 %	0 %	116630413
42381	NC_008530	CTA	2	6	1864179	1864184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116630413
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42385	NC_008530	TGG	2	6	1864265	1864270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116630414
42386	NC_008530	AGT	2	6	1864369	1864374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116630414
42387	NC_008530	AAAG	2	8	1864378	1864385	75 %	0 %	25 %	0 %	116630414
42388	NC_008530	TAA	2	6	1864465	1864470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116630414
42389	NC_008530	CTAA	2	8	1864475	1864482	50 %	25 %	0 %	25 %	116630414
42390	NC_008530	A	6	6	1864485	1864490	100 %	0 %	0 %	0 %	116630414
42391	NC_008530	ACT	2	6	1864493	1864498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116630414
42392	NC_008530	TAAA	2	8	1864576	1864583	75 %	25 %	0 %	0 %	116630414
42393	NC_008530	ACT	2	6	1864591	1864596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42394	NC_008530	T	6	6	1864607	1864612	0 %	100 %	0 %	0 %	116630415
42395	NC_008530	A	7	7	1864614	1864620	100 %	0 %	0 %	0 %	116630415
42396	NC_008530	A	6	6	1864627	1864632	100 %	0 %	0 %	0 %	116630415
42397	NC_008530	GTT	3	9	1864633	1864641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116630415
42398	NC_008530	AAGTT	2	10	1864703	1864712	40 %	40 %	20 %	0 %	116630415
42399	NC_008530	AGT	2	6	1864797	1864802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116630415
42400	NC_008530	GTT	2	6	1864876	1864881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116630415
42401	NC_008530	AAT	2	6	1864883	1864888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116630415
42402	NC_008530	TCAT	2	8	1864920	1864927	25 %	50 %	0 %	25 %	116630416
42403	NC_008530	CTAT	2	8	1864929	1864936	25 %	50 %	0 %	25 %	116630416
42404	NC_008530	GAT	2	6	1864976	1864981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116630416
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42409	NC_008530	GAA	2	6	1865223	1865228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116630416
42410	NC_008530	GCAA	2	8	1865276	1865283	50 %	0 %	25 %	25 %	116630416
42411	NC_008530	TGA	2	6	1865420	1865425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116630416
42412	NC_008530	A	6	6	1865460	1865465	100 %	0 %	0 %	0 %	116630416
42413	NC_008530	GCTC	2	8	1865549	1865556	0 %	25 %	25 %	50 %	116630416
42414	NC_008530	TTG	2	6	1865560	1865565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116630416
42415	NC_008530	A	6	6	1865574	1865579	100 %	0 %	0 %	0 %	116630416
42416	NC_008530	AGATA	2	10	1865615	1865624	60 %	20 %	20 %	0 %	116630416
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42420	NC_008530	AAG	2	6	1865848	1865853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116630416
42421	NC_008530	TGAC	2	8	1865917	1865924	25 %	25 %	25 %	25 %	116630416
42422	NC_008530	TGC	2	6	1865957	1865962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116630416
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42425	NC_008530	CTGAAA	2	12	1866016	1866027	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116630416
42426	NC_008530	TGA	2	6	1866047	1866052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116630416
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42428	NC_008530	ATT	2	6	1866225	1866230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116630416
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42430	NC_008530	CAT	2	6	1866311	1866316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116630416
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42432	NC_008530	CTG	2	6	1866493	1866498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116630416
42433	NC_008530	TGG	2	6	1866545	1866550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116630416
42434	NC_008530	GTG	2	6	1866577	1866582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116630416
42435	NC_008530	AAG	2	6	1866606	1866611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116630416
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42437	NC_008530	GCA	2	6	1866678	1866683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116630416
42438	NC_008530	ATT	2	6	1866686	1866691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116630416
42439	NC_008530	TAA	2	6	1866782	1866787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116630416
42440	NC_008530	T	6	6	1866866	1866871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42441	NC_008530	ATC	2	6	1866906	1866911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116630417
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42443	NC_008530	TTC	2	6	1867013	1867018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116630417
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42446	NC_008530	T	6	6	1867181	1867186	0 %	100 %	0 %	0 %	116630417
42447	NC_008530	T	6	6	1867188	1867193	0 %	100 %	0 %	0 %	116630417
42448	NC_008530	ATT	2	6	1867215	1867220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116630417
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42451	NC_008530	TCTT	2	8	1867398	1867405	0 %	75 %	0 %	25 %	116630417
42452	NC_008530	T	7	7	1867447	1867453	0 %	100 %	0 %	0 %	116630417
42453	NC_008530	TTTA	2	8	1867517	1867524	25 %	75 %	0 %	0 %	116630417
42454	NC_008530	A	7	7	1867559	1867565	100 %	0 %	0 %	0 %	116630417
42455	NC_008530	ATC	2	6	1867607	1867612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116630417
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42458	NC_008530	AAT	2	6	1867781	1867786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42459	NC_008530	CTA	2	6	1867925	1867930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116630418
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42461	NC_008530	GTTGAT	2	12	1868260	1868271	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116630418
42462	NC_008530	CT	3	6	1868294	1868299	0 %	50 %	0 %	50 %	116630418
42463	NC_008530	TTC	2	6	1868349	1868354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116630418
42464	NC_008530	ACTA	2	8	1868367	1868374	50 %	25 %	0 %	25 %	116630418
42465	NC_008530	A	6	6	1868434	1868439	100 %	0 %	0 %	0 %	116630418
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42467	NC_008530	A	6	6	1868485	1868490	100 %	0 %	0 %	0 %	116630418
42468	NC_008530	AAG	2	6	1868495	1868500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116630418
42469	NC_008530	AGC	2	6	1868553	1868558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116630418
42470	NC_008530	GCA	2	6	1868646	1868651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116630418
42471	NC_008530	AAGCC	2	10	1868805	1868814	40 %	0 %	20 %	40 %	116630418
42472	NC_008530	TAA	2	6	1868835	1868840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116630418
42473	NC_008530	CTA	2	6	1868865	1868870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116630418
42474	NC_008530	ACTT	2	8	1868878	1868885	25 %	50 %	0 %	25 %	116630418
42475	NC_008530	TCT	2	6	1868977	1868982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116630418
42476	NC_008530	A	6	6	1869000	1869005	100 %	0 %	0 %	0 %	116630418
42477	NC_008530	ATC	2	6	1869075	1869080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116630418
42478	NC_008530	GCT	2	6	1869109	1869114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116630418
42479	NC_008530	AAAC	2	8	1869150	1869157	75 %	0 %	0 %	25 %	116630418
42480	NC_008530	CAA	2	6	1869221	1869226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116630418
42481	NC_008530	ATA	2	6	1869281	1869286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116630418
42482	NC_008530	GGT	2	6	1869304	1869309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116630418
42483	NC_008530	TGA	2	6	1869369	1869374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116630418
42484	NC_008530	TGG	2	6	1869394	1869399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116630418
42485	NC_008530	A	6	6	1869556	1869561	100 %	0 %	0 %	0 %	116630418
42486	NC_008530	AAG	2	6	1869578	1869583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116630418
42487	NC_008530	CAC	2	6	1869665	1869670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116630418
42488	NC_008530	TGA	2	6	1869705	1869710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116630418
42489	NC_008530	TCA	2	6	1869797	1869802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116630419
42490	NC_008530	AAGT	2	8	1869805	1869812	50 %	25 %	25 %	0 %	116630419
42491	NC_008530	AAG	2	6	1869819	1869824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116630419
42492	NC_008530	TTTAC	2	10	1869834	1869843	20 %	60 %	0 %	20 %	116630419
42493	NC_008530	TTAA	2	8	1869867	1869874	50 %	50 %	0 %	0 %	116630419
42494	NC_008530	AAAC	2	8	1869890	1869897	75 %	0 %	0 %	25 %	116630419
42495	NC_008530	A	6	6	1869945	1869950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42496	NC_008530	T	6	6	1869987	1869992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42497	NC_008530	TAC	2	6	1870079	1870084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116630420
42498	NC_008530	TAA	2	6	1870090	1870095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116630420
42499	NC_008530	ACCA	2	8	1870192	1870199	50 %	0 %	0 %	50 %	116630420
42500	NC_008530	TAA	2	6	1870228	1870233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116630420

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