MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47501	NC_008526	AGC	2	6	2476369	2476374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495952
47502	NC_008526	GTC	2	6	2476544	2476549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495952
47503	NC_008526	AAT	2	6	2476554	2476559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495952
47504	NC_008526	TTG	2	6	2476586	2476591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495952
47505	NC_008526	AACC	2	8	2476597	2476604	50 %	0 %	0 %	50 %	116495952
47506	NC_008526	GTA	2	6	2476787	2476792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495952
47507	NC_008526	GCA	2	6	2476793	2476798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495952
47508	NC_008526	TGGTGA	2	12	2476800	2476811	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	116495952
47509	NC_008526	GTTCCT	2	12	2476818	2476829	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	116495952
47510	NC_008526	TTG	2	6	2476988	2476993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495952
47511	NC_008526	CTC	2	6	2477010	2477015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47512	NC_008526	CTA	2	6	2477048	2477053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47513	NC_008526	TA	3	6	2477052	2477057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47514	NC_008526	ATA	2	6	2477071	2477076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47515	NC_008526	ATC	2	6	2477082	2477087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47516	NC_008526	CTT	2	6	2477148	2477153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495953
47517	NC_008526	GTT	2	6	2477169	2477174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495953
47518	NC_008526	GCG	2	6	2477176	2477181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495953
47519	NC_008526	GGT	2	6	2477265	2477270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495953
47520	NC_008526	CGA	2	6	2477272	2477277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495953
47521	NC_008526	ACC	2	6	2477313	2477318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495953
47522	NC_008526	CTT	2	6	2477366	2477371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495953
47523	NC_008526	GTTC	2	8	2477387	2477394	0 %	50 %	25 %	25 %	116495953
47524	NC_008526	GTTT	2	8	2477398	2477405	0 %	75 %	25 %	0 %	116495953
47525	NC_008526	CAT	2	6	2477423	2477428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495953
47526	NC_008526	ATCA	2	8	2477460	2477467	50 %	25 %	0 %	25 %	116495953
47527	NC_008526	CCT	2	6	2477567	2477572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47528	NC_008526	CGCT	2	8	2477581	2477588	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47529	NC_008526	CTT	3	9	2477759	2477767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495954
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47532	NC_008526	ACA	2	6	2477895	2477900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495954
47533	NC_008526	AGAC	2	8	2477960	2477967	50 %	0 %	25 %	25 %	116495954
47534	NC_008526	CTT	2	6	2478002	2478007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495954
47535	NC_008526	CTT	3	9	2478074	2478082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495954
47536	NC_008526	TGT	2	6	2478085	2478090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495954
47537	NC_008526	TAG	2	6	2478163	2478168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495954
47538	NC_008526	TCCT	2	8	2478181	2478188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47539	NC_008526	CAT	2	6	2478196	2478201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47540	NC_008526	CA	3	6	2478212	2478217	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47541	NC_008526	T	6	6	2478231	2478236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47542	NC_008526	A	7	7	2478242	2478248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47543	NC_008526	AACGGC	2	12	2478259	2478270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47544	NC_008526	A	6	6	2478313	2478318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47545	NC_008526	AAAG	2	8	2478365	2478372	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47546	NC_008526	CG	3	6	2478385	2478390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47547	NC_008526	GAG	2	6	2478461	2478466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47548	NC_008526	ACC	2	6	2478563	2478568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47549	NC_008526	C	6	6	2478660	2478665	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47550	NC_008526	GTG	2	6	2478676	2478681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47551	NC_008526	GTT	2	6	2478720	2478725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47552	NC_008526	AGA	2	6	2478826	2478831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47553	NC_008526	CGC	3	9	2478907	2478915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495955
47554	NC_008526	TGC	2	6	2478926	2478931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495955
47555	NC_008526	GCG	2	6	2479008	2479013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495955
47556	NC_008526	CAG	2	6	2479316	2479321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495955
47557	NC_008526	CTT	2	6	2479329	2479334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495955
47558	NC_008526	GCT	3	9	2479382	2479390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495955
47559	NC_008526	GC	3	6	2479406	2479411	0 %	0 %	50 %	50 %	116495955
47560	NC_008526	AGT	3	9	2479502	2479510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495955
47561	NC_008526	CATTGC	2	12	2479580	2479591	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116495955
47562	NC_008526	ATC	2	6	2479746	2479751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495955
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47564	NC_008526	GATCAT	2	12	2479811	2479822	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116495955
47565	NC_008526	TGGT	2	8	2479843	2479850	0 %	50 %	50 %	0 %	116495955
47566	NC_008526	GTT	2	6	2479855	2479860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495955
47567	NC_008526	ATC	2	6	2479953	2479958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495955
47568	NC_008526	CTT	2	6	2479974	2479979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495955
47569	NC_008526	CTT	2	6	2480001	2480006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495955
47570	NC_008526	TCAGCT	2	12	2480021	2480032	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116495955
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47572	NC_008526	CAG	2	6	2480129	2480134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495955
47573	NC_008526	TGAG	2	8	2480225	2480232	25 %	25 %	50 %	0 %	116495955
47574	NC_008526	GCT	2	6	2480241	2480246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495955
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47579	NC_008526	TCG	2	6	2480428	2480433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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47583	NC_008526	GTT	2	6	2480735	2480740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495956
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47585	NC_008526	CGTTTG	2	12	2480769	2480780	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116495956
47586	NC_008526	GGC	2	6	2480830	2480835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495956
47587	NC_008526	ATA	2	6	2480856	2480861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495956
47588	NC_008526	TGTC	2	8	2480906	2480913	0 %	50 %	25 %	25 %	116495956
47589	NC_008526	CGTA	2	8	2480957	2480964	25 %	25 %	25 %	25 %	116495956
47590	NC_008526	TCAACG	2	12	2481076	2481087	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116495956
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47592	NC_008526	ATC	2	6	2481306	2481311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495956
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47594	NC_008526	GCG	2	6	2481581	2481586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495956
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47602	NC_008526	GTC	2	6	2481946	2481951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495956
47603	NC_008526	TGCC	2	8	2482112	2482119	0 %	25 %	25 %	50 %	116495956
47604	NC_008526	TCTG	2	8	2482132	2482139	0 %	50 %	25 %	25 %	116495956
47605	NC_008526	CTTCA	2	10	2482140	2482149	20 %	40 %	0 %	40 %	116495956
47606	NC_008526	TGG	2	6	2482179	2482184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495956
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47608	NC_008526	TAAAT	2	10	2482224	2482233	60 %	40 %	0 %	0 %	116495956
47609	NC_008526	TCG	2	6	2482391	2482396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495956
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47612	NC_008526	CTGC	2	8	2482673	2482680	0 %	25 %	25 %	50 %	116495956
47613	NC_008526	TCT	2	6	2482706	2482711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495956
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47977	NC_008526	CGC	2	6	2505685	2505690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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47979	NC_008526	ATC	2	6	2505867	2505872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47980	NC_008526	CGC	2	6	2505907	2505912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47981	NC_008526	TGT	2	6	2505977	2505982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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47985	NC_008526	CAAT	2	8	2506120	2506127	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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