MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46502	NC_008526	GCC	2	6	2427062	2427067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495882
46503	NC_008526	CTAAA	3	15	2427220	2427234	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46504	NC_008526	A	6	6	2427232	2427237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46505	NC_008526	A	6	6	2427248	2427253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46506	NC_008526	CTG	2	6	2427259	2427264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46507	NC_008526	ATT	2	6	2427381	2427386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46508	NC_008526	CTG	2	6	2427474	2427479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495883
46509	NC_008526	TTC	2	6	2427482	2427487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495883
46510	NC_008526	TGA	2	6	2427510	2427515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495883
46511	NC_008526	T	6	6	2427590	2427595	0 %	100 %	0 %	0 %	116495883
46512	NC_008526	TGC	2	6	2427623	2427628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495883
46513	NC_008526	ATG	2	6	2427646	2427651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495883
46514	NC_008526	TAA	2	6	2427662	2427667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495883
46515	NC_008526	T	6	6	2427694	2427699	0 %	100 %	0 %	0 %	116495883
46516	NC_008526	CAAA	2	8	2427740	2427747	75 %	0 %	0 %	25 %	116495883
46517	NC_008526	TTG	2	6	2427761	2427766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46518	NC_008526	CTGGA	2	10	2427778	2427787	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46519	NC_008526	GAT	2	6	2427804	2427809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46520	NC_008526	TAGA	2	8	2427810	2427817	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46521	NC_008526	T	6	6	2427861	2427866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46522	NC_008526	T	6	6	2427914	2427919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46523	NC_008526	TCAGT	2	10	2427987	2427996	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46524	NC_008526	TCAA	2	8	2428002	2428009	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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46527	NC_008526	TTGT	2	8	2428176	2428183	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46528	NC_008526	TGT	2	6	2428201	2428206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46529	NC_008526	AAAC	2	8	2428221	2428228	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46530	NC_008526	ATT	2	6	2428253	2428258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46531	NC_008526	GGT	2	6	2428287	2428292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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46533	NC_008526	T	6	6	2428348	2428353	0 %	100 %	0 %	0 %	116495884
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46539	NC_008526	TAA	2	6	2428527	2428532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46540	NC_008526	TC	3	6	2428541	2428546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46541	NC_008526	AAC	2	6	2428577	2428582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46542	NC_008526	GCA	2	6	2428595	2428600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46543	NC_008526	GCAA	2	8	2428605	2428612	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46544	NC_008526	TGT	2	6	2428686	2428691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46545	NC_008526	GAAA	2	8	2428696	2428703	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46546	NC_008526	A	7	7	2428846	2428852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46547	NC_008526	TCA	2	6	2428925	2428930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495885
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46554	NC_008526	T	6	6	2429261	2429266	0 %	100 %	0 %	0 %	116495886
46555	NC_008526	CTT	2	6	2429271	2429276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495886
46556	NC_008526	TGC	2	6	2429309	2429314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495886
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46574	NC_008526	AGGT	2	8	2429821	2429828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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46581	NC_008526	TC	3	6	2430029	2430034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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46594	NC_008526	GCTT	2	8	2430475	2430482	0 %	50 %	25 %	25 %	116495887
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46604	NC_008526	TA	3	6	2430837	2430842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46605	NC_008526	T	6	6	2430853	2430858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46611	NC_008526	A	6	6	2431042	2431047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46612	NC_008526	CAAG	2	8	2431108	2431115	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46613	NC_008526	TGAT	2	8	2431130	2431137	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46614	NC_008526	GGA	2	6	2431149	2431154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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46977	NC_008526	ATT	2	6	2449713	2449718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495909
46978	NC_008526	GTG	2	6	2449741	2449746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495909
46979	NC_008526	CTGA	2	8	2449777	2449784	25 %	25 %	25 %	25 %	116495909
46980	NC_008526	TGG	2	6	2449872	2449877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495909
46981	NC_008526	AGC	2	6	2449917	2449922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495909
46982	NC_008526	CCGA	2	8	2450015	2450022	25 %	0 %	25 %	50 %	116495910
46983	NC_008526	CAT	2	6	2450053	2450058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495910
46984	NC_008526	TTCAGG	2	12	2450065	2450076	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116495910
46985	NC_008526	AAC	2	6	2450080	2450085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495910
46986	NC_008526	ATC	2	6	2450142	2450147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495910
46987	NC_008526	ACC	2	6	2450153	2450158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495910
46988	NC_008526	TGAA	2	8	2450163	2450170	50 %	25 %	25 %	0 %	116495910
46989	NC_008526	TTTTA	2	10	2450206	2450215	20 %	80 %	0 %	0 %	116495910
46990	NC_008526	ATC	3	9	2450280	2450288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495910
46991	NC_008526	CTG	2	6	2450358	2450363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495910
46992	NC_008526	GGC	2	6	2450372	2450377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495910
46993	NC_008526	CG	3	6	2450398	2450403	0 %	0 %	50 %	50 %	116495910
46994	NC_008526	ATC	2	6	2450426	2450431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495910
46995	NC_008526	CGA	2	6	2450437	2450442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495910
46996	NC_008526	GC	3	6	2450467	2450472	0 %	0 %	50 %	50 %	116495910
46997	NC_008526	GTT	2	6	2450488	2450493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495910
46998	NC_008526	ATG	2	6	2450528	2450533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495910
46999	NC_008526	GAA	2	6	2450700	2450705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47000	NC_008526	ATT	2	6	2450926	2450931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495911

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