MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_008526	GGCATC	2	12	2403291	2403302	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116495860
46002	NC_008526	GAT	2	6	2403380	2403385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495860
46003	NC_008526	TGT	2	6	2403445	2403450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495860
46004	NC_008526	GTC	2	6	2403516	2403521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495860
46005	NC_008526	GCCA	2	8	2403542	2403549	25 %	0 %	25 %	50 %	116495860
46006	NC_008526	AGC	2	6	2403595	2403600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495860
46007	NC_008526	GCT	2	6	2403624	2403629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495860
46008	NC_008526	ACC	2	6	2403702	2403707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495860
46009	NC_008526	GCAA	2	8	2403719	2403726	50 %	0 %	25 %	25 %	116495860
46010	NC_008526	TGAT	2	8	2403787	2403794	25 %	50 %	25 %	0 %	116495860
46011	NC_008526	ACTG	2	8	2403824	2403831	25 %	25 %	25 %	25 %	116495860
46012	NC_008526	AAG	2	6	2403865	2403870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495860
46013	NC_008526	CTA	2	6	2403923	2403928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495860
46014	NC_008526	CAA	2	6	2403986	2403991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495860
46015	NC_008526	CCAG	2	8	2404126	2404133	25 %	0 %	25 %	50 %	116495860
46016	NC_008526	CGC	2	6	2404261	2404266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495860
46017	NC_008526	TCA	2	6	2404276	2404281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495860
46018	NC_008526	ATC	2	6	2404336	2404341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495860
46019	NC_008526	A	6	6	2404365	2404370	100 %	0 %	0 %	0 %	116495860
46020	NC_008526	TGC	2	6	2404510	2404515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495860
46021	NC_008526	AAG	2	6	2404516	2404521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495860
46022	NC_008526	ATG	2	6	2404558	2404563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495860
46023	NC_008526	A	6	6	2404575	2404580	100 %	0 %	0 %	0 %	116495860
46024	NC_008526	GAT	2	6	2404653	2404658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495860
46025	NC_008526	GCG	2	6	2404694	2404699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495860
46026	NC_008526	CTG	2	6	2404734	2404739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495860
46027	NC_008526	CAA	2	6	2404788	2404793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495860
46028	NC_008526	ACC	2	6	2404901	2404906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495860
46029	NC_008526	AAG	2	6	2404911	2404916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495860
46030	NC_008526	CGC	2	6	2404919	2404924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495860
46031	NC_008526	GAT	2	6	2404925	2404930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495860
46032	NC_008526	ATC	2	6	2405017	2405022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495860
46033	NC_008526	ATG	2	6	2405049	2405054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495860
46034	NC_008526	CAT	2	6	2405156	2405161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495860
46035	NC_008526	CCG	2	6	2405318	2405323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495860
46036	NC_008526	T	7	7	2405395	2405401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46037	NC_008526	TAAG	2	8	2405434	2405441	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46038	NC_008526	T	6	6	2405526	2405531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46039	NC_008526	TAAA	2	8	2405536	2405543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46040	NC_008526	ATT	2	6	2405594	2405599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46041	NC_008526	ATC	2	6	2405630	2405635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46042	NC_008526	AGA	2	6	2405660	2405665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46043	NC_008526	ACG	2	6	2405838	2405843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495861
46044	NC_008526	AAC	2	6	2405846	2405851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495861
46045	NC_008526	CGA	2	6	2405935	2405940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495861
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46047	NC_008526	TGG	2	6	2405964	2405969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495861
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46050	NC_008526	CCT	2	6	2406058	2406063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46051	NC_008526	TC	3	6	2406081	2406086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46052	NC_008526	CAA	2	6	2406130	2406135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46053	NC_008526	TAG	2	6	2406154	2406159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46054	NC_008526	T	7	7	2406167	2406173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46055	NC_008526	TTC	2	6	2406207	2406212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495862
46056	NC_008526	CAA	2	6	2406332	2406337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495862
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46058	NC_008526	CGT	2	6	2406383	2406388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495862
46059	NC_008526	CAT	2	6	2406455	2406460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495862
46060	NC_008526	TCGCCA	2	12	2406484	2406495	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116495862
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46068	NC_008526	T	6	6	2406908	2406913	0 %	100 %	0 %	0 %	116495862
46069	NC_008526	AGGA	2	8	2406963	2406970	50 %	0 %	50 %	0 %	116495862
46070	NC_008526	CCAGT	2	10	2406974	2406983	20 %	20 %	20 %	40 %	116495862
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46076	NC_008526	AAT	2	6	2407223	2407228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495862
46077	NC_008526	ATC	2	6	2407383	2407388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495862
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46081	NC_008526	ATC	2	6	2407577	2407582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46084	NC_008526	TATCCA	2	12	2407708	2407719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495863
46085	NC_008526	TGGCT	2	10	2407739	2407748	0 %	40 %	40 %	20 %	116495863
46086	NC_008526	CAT	2	6	2407772	2407777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495863
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46088	NC_008526	CAG	2	6	2407844	2407849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495863
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46090	NC_008526	CAT	2	6	2407984	2407989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495863
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46101	NC_008526	GTC	2	6	2408712	2408717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495863
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46111	NC_008526	GAG	2	6	2409372	2409377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46112	NC_008526	CAA	2	6	2409388	2409393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495864
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46115	NC_008526	AGTCA	2	10	2409545	2409554	40 %	20 %	20 %	20 %	116495864
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46117	NC_008526	CCA	2	6	2409564	2409569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495864
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46122	NC_008526	GCA	2	6	2409707	2409712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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46234	NC_008526	TCC	2	6	2415142	2415147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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46354	NC_008526	GCT	2	6	2421100	2421105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495875
46355	NC_008526	TCA	2	6	2421106	2421111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495875
46356	NC_008526	GTGAT	2	10	2421152	2421161	20 %	40 %	40 %	0 %	116495875
46357	NC_008526	TTC	2	6	2421186	2421191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495875
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46359	NC_008526	CAT	2	6	2421232	2421237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495875
46360	NC_008526	GGCT	2	8	2421265	2421272	0 %	25 %	50 %	25 %	116495875
46361	NC_008526	GCA	2	6	2421356	2421361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495876
46362	NC_008526	ATGAA	2	10	2421367	2421376	60 %	20 %	20 %	0 %	116495876
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46366	NC_008526	TTGC	2	8	2421413	2421420	0 %	50 %	25 %	25 %	116495876
46367	NC_008526	TACGC	2	10	2421435	2421444	20 %	20 %	20 %	40 %	116495876
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46372	NC_008526	GCA	2	6	2421572	2421577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495877
46373	NC_008526	CGG	2	6	2421636	2421641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495877
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46382	NC_008526	CTT	2	6	2422203	2422208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495877
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46384	NC_008526	AGCCA	2	10	2422219	2422228	40 %	0 %	20 %	40 %	116495877
46385	NC_008526	TCG	2	6	2422238	2422243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495877
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46390	NC_008526	CT	3	6	2422458	2422463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46391	NC_008526	A	6	6	2422474	2422479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46472	NC_008526	TGC	2	6	2425448	2425453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495881
46473	NC_008526	TTG	3	9	2425472	2425480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495881
46474	NC_008526	TGC	2	6	2425574	2425579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495881
46475	NC_008526	GCA	2	6	2425650	2425655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495881
46476	NC_008526	ACC	2	6	2425685	2425690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495881
46477	NC_008526	T	6	6	2425746	2425751	0 %	100 %	0 %	0 %	116495881
46478	NC_008526	AAC	2	6	2425760	2425765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495881
46479	NC_008526	TA	3	6	2425783	2425788	50 %	50 %	0 %	0 %	116495881
46480	NC_008526	TCC	2	6	2425799	2425804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46481	NC_008526	TA	4	8	2425851	2425858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46482	NC_008526	TTA	2	6	2425860	2425865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46483	NC_008526	TAT	2	6	2425870	2425875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46484	NC_008526	CCA	2	6	2426208	2426213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495882
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46486	NC_008526	TAA	2	6	2426322	2426327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495882
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46490	NC_008526	TGC	2	6	2426596	2426601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495882
46491	NC_008526	ATAA	2	8	2426700	2426707	75 %	25 %	0 %	0 %	116495882
46492	NC_008526	TTG	2	6	2426710	2426715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495882
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46495	NC_008526	CAG	2	6	2426888	2426893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495882
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46499	NC_008526	AT	3	6	2426956	2426961	50 %	50 %	0 %	0 %	116495882
46500	NC_008526	CTT	4	12	2427011	2427022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495882

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