MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_008526	GAG	2	6	2305115	2305120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116495760
44003	NC_008526	AAT	2	6	2305131	2305136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495760
44004	NC_008526	ACACC	2	10	2305259	2305268	40 %	0 %	0 %	60 %	116495760
44005	NC_008526	ATTC	2	8	2305292	2305299	25 %	50 %	0 %	25 %	116495760
44006	NC_008526	ATC	3	9	2305404	2305412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495760
44007	NC_008526	GCT	2	6	2305448	2305453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495760
44008	NC_008526	CGA	3	9	2305489	2305497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495760
44009	NC_008526	A	6	6	2305606	2305611	100 %	0 %	0 %	0 %	116495760
44010	NC_008526	TGA	2	6	2305655	2305660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495760
44011	NC_008526	TCG	2	6	2305687	2305692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495760
44012	NC_008526	CGAA	2	8	2305732	2305739	50 %	0 %	25 %	25 %	116495760
44013	NC_008526	ATG	2	6	2305782	2305787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495760
44014	NC_008526	GCC	2	6	2305806	2305811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495760
44015	NC_008526	GGC	2	6	2305926	2305931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495760
44016	NC_008526	TCT	2	6	2305957	2305962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495760
44017	NC_008526	T	6	6	2305962	2305967	0 %	100 %	0 %	0 %	116495760
44018	NC_008526	CTT	2	6	2306003	2306008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495760
44019	NC_008526	TGA	2	6	2306026	2306031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495760
44020	NC_008526	TAA	2	6	2306068	2306073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495760
44021	NC_008526	AAT	2	6	2306130	2306135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495760
44022	NC_008526	CGT	2	6	2306193	2306198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495760
44023	NC_008526	AGC	2	6	2306262	2306267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495760
44024	NC_008526	TCA	2	6	2306281	2306286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495760
44025	NC_008526	CGG	2	6	2306341	2306346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495760
44026	NC_008526	GC	3	6	2306370	2306375	0 %	0 %	50 %	50 %	116495760
44027	NC_008526	ACAT	2	8	2306416	2306423	50 %	25 %	0 %	25 %	116495760
44028	NC_008526	T	6	6	2306460	2306465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44029	NC_008526	ATTGT	2	10	2306473	2306482	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44030	NC_008526	TCCT	2	8	2306505	2306512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44031	NC_008526	GGGC	2	8	2306564	2306571	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44032	NC_008526	CGC	2	6	2306599	2306604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44033	NC_008526	CTAT	2	8	2306644	2306651	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44034	NC_008526	A	6	6	2306653	2306658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44035	NC_008526	CAG	2	6	2306728	2306733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44036	NC_008526	TCA	2	6	2306806	2306811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495761
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44039	NC_008526	CTT	2	6	2306933	2306938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495761
44040	NC_008526	TTC	2	6	2306946	2306951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495761
44041	NC_008526	TCA	2	6	2306953	2306958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495761
44042	NC_008526	CAT	2	6	2307057	2307062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495761
44043	NC_008526	ATA	2	6	2307100	2307105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495761
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44050	NC_008526	GATA	2	8	2307365	2307372	50 %	25 %	25 %	0 %	116495761
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44052	NC_008526	TGT	2	6	2307416	2307421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495761
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44055	NC_008526	CGA	2	6	2307515	2307520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495761
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44059	NC_008526	A	6	6	2307722	2307727	100 %	0 %	0 %	0 %	116495761
44060	NC_008526	CAA	2	6	2307789	2307794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495761
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44063	NC_008526	CG	3	6	2307925	2307930	0 %	0 %	50 %	50 %	116495761
44064	NC_008526	AC	3	6	2307938	2307943	50 %	0 %	0 %	50 %	116495761
44065	NC_008526	CG	3	6	2308031	2308036	0 %	0 %	50 %	50 %	116495761
44066	NC_008526	ATC	2	6	2308044	2308049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495761
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44068	NC_008526	TAT	2	6	2308201	2308206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44069	NC_008526	GGT	2	6	2308243	2308248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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44073	NC_008526	GAC	2	6	2308609	2308614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495762
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44084	NC_008526	AAC	2	6	2309424	2309429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44085	NC_008526	CCA	2	6	2309449	2309454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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44089	NC_008526	GC	3	6	2309882	2309887	0 %	0 %	50 %	50 %	116495765
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44101	NC_008526	GT	3	6	2310319	2310324	0 %	50 %	50 %	0 %	116495765
44102	NC_008526	ATC	2	6	2310335	2310340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495765
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44107	NC_008526	GT	3	6	2310445	2310450	0 %	50 %	50 %	0 %	116495765
44108	NC_008526	GTC	2	6	2310482	2310487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495765
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44353	NC_008526	CTT	2	6	2323002	2323007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495777
44354	NC_008526	CTT	2	6	2323203	2323208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44355	NC_008526	GTA	2	6	2323240	2323245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44356	NC_008526	TTA	2	6	2323252	2323257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44357	NC_008526	GCT	2	6	2323284	2323289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44368	NC_008526	A	7	7	2323669	2323675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44369	NC_008526	T	7	7	2323691	2323697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44370	NC_008526	TTC	2	6	2323779	2323784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495779
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44441	NC_008526	T	6	6	2327449	2327454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44442	NC_008526	TCAT	2	8	2327534	2327541	25 %	50 %	0 %	25 %	116495782
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44460	NC_008526	GGC	2	6	2328283	2328288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495782
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44463	NC_008526	TGC	2	6	2328404	2328409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495782
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44466	NC_008526	ATG	2	6	2328597	2328602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495782
44467	NC_008526	CCA	2	6	2328623	2328628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495783
44468	NC_008526	GCT	2	6	2328629	2328634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495783
44469	NC_008526	ACACC	2	10	2328712	2328721	40 %	0 %	0 %	60 %	116495783
44470	NC_008526	TG	3	6	2328809	2328814	0 %	50 %	50 %	0 %	116495783
44471	NC_008526	A	6	6	2328878	2328883	100 %	0 %	0 %	0 %	116495783
44472	NC_008526	TGC	2	6	2328935	2328940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495783
44473	NC_008526	TAT	2	6	2328984	2328989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495783
44474	NC_008526	GATGCT	2	12	2329011	2329022	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116495783
44475	NC_008526	TGT	2	6	2329034	2329039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495783
44476	NC_008526	TCA	2	6	2329097	2329102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495783
44477	NC_008526	TGGC	2	8	2329142	2329149	0 %	25 %	50 %	25 %	116495783
44478	NC_008526	GTT	2	6	2329157	2329162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495783
44479	NC_008526	TCA	2	6	2329165	2329170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495783
44480	NC_008526	CTG	2	6	2329191	2329196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495783
44481	NC_008526	CTG	2	6	2329324	2329329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495783
44482	NC_008526	CACTTG	2	12	2329417	2329428	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116495783
44483	NC_008526	ATG	2	6	2329443	2329448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495783
44484	NC_008526	CTA	2	6	2329613	2329618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495783
44485	NC_008526	CAG	2	6	2329639	2329644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495783
44486	NC_008526	GATAC	2	10	2329672	2329681	40 %	20 %	20 %	20 %	116495783
44487	NC_008526	TGC	2	6	2329775	2329780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495783
44488	NC_008526	AGG	2	6	2329843	2329848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44489	NC_008526	CAT	2	6	2329852	2329857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495784
44490	NC_008526	AAAC	2	8	2329894	2329901	75 %	0 %	0 %	25 %	116495784
44491	NC_008526	TCG	2	6	2329947	2329952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495784
44492	NC_008526	ACC	2	6	2329982	2329987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495784
44493	NC_008526	TGC	2	6	2329989	2329994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495784
44494	NC_008526	GAT	2	6	2330114	2330119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495784
44495	NC_008526	TAT	2	6	2330156	2330161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495784
44496	NC_008526	ATCA	2	8	2330231	2330238	50 %	25 %	0 %	25 %	116495784
44497	NC_008526	GGC	2	6	2330296	2330301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495784
44498	NC_008526	ATC	2	6	2330483	2330488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495784
44499	NC_008526	CAG	2	6	2330510	2330515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495784
44500	NC_008526	GAA	2	6	2330537	2330542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495784

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