MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_008526	CAG	2	6	2279335	2279340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495732
43502	NC_008526	T	6	6	2279369	2279374	0 %	100 %	0 %	0 %	116495732
43503	NC_008526	CCT	2	6	2279389	2279394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43504	NC_008526	ATG	2	6	2279413	2279418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43505	NC_008526	AC	4	8	2279518	2279525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43506	NC_008526	TGTT	2	8	2279553	2279560	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43507	NC_008526	CGG	2	6	2279584	2279589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43508	NC_008526	ATG	2	6	2279720	2279725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495733
43509	NC_008526	GCT	2	6	2279744	2279749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495733
43510	NC_008526	GGA	2	6	2279751	2279756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116495733
43511	NC_008526	CAT	2	6	2279818	2279823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495733
43512	NC_008526	GA	3	6	2279828	2279833	50 %	0 %	50 %	0 %	116495733
43513	NC_008526	GC	3	6	2279855	2279860	0 %	0 %	50 %	50 %	116495733
43514	NC_008526	ATGA	2	8	2279890	2279897	50 %	25 %	25 %	0 %	116495733
43515	NC_008526	TG	3	6	2279906	2279911	0 %	50 %	50 %	0 %	116495733
43516	NC_008526	CCTG	2	8	2279933	2279940	0 %	25 %	25 %	50 %	116495733
43517	NC_008526	GGT	2	6	2280010	2280015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495733
43518	NC_008526	TCA	2	6	2280104	2280109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495733
43519	NC_008526	TGGA	2	8	2280173	2280180	25 %	25 %	50 %	0 %	116495733
43520	NC_008526	CGA	2	6	2280290	2280295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495733
43521	NC_008526	CAA	2	6	2280300	2280305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495733
43522	NC_008526	CAG	2	6	2280322	2280327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495733
43523	NC_008526	AAT	2	6	2280343	2280348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495733
43524	NC_008526	CCG	2	6	2280372	2280377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495733
43525	NC_008526	GCG	2	6	2280416	2280421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495733
43526	NC_008526	GTT	2	6	2280473	2280478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495733
43527	NC_008526	TGA	2	6	2280480	2280485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495733
43528	NC_008526	TGCT	2	8	2280592	2280599	0 %	50 %	25 %	25 %	116495733
43529	NC_008526	CTT	2	6	2280612	2280617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495733
43530	NC_008526	TGA	2	6	2280633	2280638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495733
43531	NC_008526	GCA	2	6	2280684	2280689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495733
43532	NC_008526	CTT	2	6	2280699	2280704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495733
43533	NC_008526	TCA	3	9	2280764	2280772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495733
43534	NC_008526	GTT	2	6	2280786	2280791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495733
43535	NC_008526	TCA	2	6	2280843	2280848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495733
43536	NC_008526	GTCA	2	8	2280883	2280890	25 %	25 %	25 %	25 %	116495733
43537	NC_008526	TTC	2	6	2280940	2280945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495733
43538	NC_008526	ATC	2	6	2280962	2280967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495733
43539	NC_008526	TGG	2	6	2280971	2280976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495733
43540	NC_008526	ACC	2	6	2280989	2280994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495733
43541	NC_008526	TCA	2	6	2281031	2281036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495733
43542	NC_008526	T	6	6	2281038	2281043	0 %	100 %	0 %	0 %	116495733
43543	NC_008526	TCG	2	6	2281070	2281075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495733
43544	NC_008526	GCA	2	6	2281161	2281166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495733
43545	NC_008526	CTG	2	6	2281167	2281172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495733
43546	NC_008526	CAC	2	6	2281207	2281212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495733
43547	NC_008526	GAA	2	6	2281402	2281407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495733
43548	NC_008526	A	6	6	2281406	2281411	100 %	0 %	0 %	0 %	116495733
43549	NC_008526	TGA	2	6	2281443	2281448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495733
43550	NC_008526	ACGAGC	2	12	2281463	2281474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495733
43551	NC_008526	ATC	2	6	2281475	2281480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495733
43552	NC_008526	CAA	2	6	2281486	2281491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495733
43553	NC_008526	TAA	2	6	2281740	2281745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495733
43554	NC_008526	GTGG	2	8	2281753	2281760	0 %	25 %	75 %	0 %	116495733
43555	NC_008526	GAC	2	6	2281807	2281812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495733
43556	NC_008526	ACG	2	6	2281823	2281828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495733
43557	NC_008526	CATC	2	8	2281830	2281837	25 %	25 %	0 %	50 %	116495733
43558	NC_008526	TGT	2	6	2281873	2281878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495733
43559	NC_008526	ATC	2	6	2281961	2281966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495733
43560	NC_008526	TCA	3	9	2281971	2281979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495733
43561	NC_008526	CAT	2	6	2281986	2281991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495733
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43563	NC_008526	TGC	2	6	2282221	2282226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495733
43564	NC_008526	T	6	6	2282229	2282234	0 %	100 %	0 %	0 %	116495733
43565	NC_008526	TCT	2	6	2282265	2282270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495733
43566	NC_008526	ATG	2	6	2282377	2282382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43567	NC_008526	GTT	2	6	2282385	2282390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43568	NC_008526	ATG	2	6	2282537	2282542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495734
43569	NC_008526	GCT	2	6	2282567	2282572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495734
43570	NC_008526	CAG	2	6	2282595	2282600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495734
43571	NC_008526	ATTG	2	8	2282602	2282609	25 %	50 %	25 %	0 %	116495734
43572	NC_008526	AGC	2	6	2282677	2282682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495734
43573	NC_008526	CTT	2	6	2282797	2282802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495734
43574	NC_008526	AC	3	6	2282821	2282826	50 %	0 %	0 %	50 %	116495734
43575	NC_008526	TCA	2	6	2282862	2282867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495734
43576	NC_008526	CCCG	2	8	2282933	2282940	0 %	0 %	25 %	75 %	116495734
43577	NC_008526	GCA	2	6	2282987	2282992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495734
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43580	NC_008526	GTGGC	2	10	2283127	2283136	0 %	20 %	60 %	20 %	116495734
43581	NC_008526	CATC	2	8	2283147	2283154	25 %	25 %	0 %	50 %	116495734
43582	NC_008526	GCG	2	6	2283188	2283193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495734
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43584	NC_008526	TTG	2	6	2283261	2283266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495734
43585	NC_008526	CGG	2	6	2283357	2283362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495734
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43587	NC_008526	TAC	2	6	2283437	2283442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495734
43588	NC_008526	ATG	2	6	2283443	2283448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495734
43589	NC_008526	CGG	2	6	2283451	2283456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495734
43590	NC_008526	GCC	2	6	2283485	2283490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495734
43591	NC_008526	GGCT	2	8	2283550	2283557	0 %	25 %	50 %	25 %	116495734
43592	NC_008526	GCA	2	6	2283569	2283574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495734
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43600	NC_008526	AAC	2	6	2283951	2283956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495734
43601	NC_008526	TTG	2	6	2283962	2283967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495734
43602	NC_008526	TGA	2	6	2284044	2284049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495735
43603	NC_008526	TAT	2	6	2284155	2284160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495735
43604	NC_008526	AAAG	2	8	2284338	2284345	75 %	0 %	25 %	0 %	116495735
43605	NC_008526	ACT	2	6	2284351	2284356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495735
43606	NC_008526	CGGCG	2	10	2284606	2284615	0 %	0 %	60 %	40 %	116495736
43607	NC_008526	AGC	2	6	2284640	2284645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495736
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43610	NC_008526	CAT	2	6	2284700	2284705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495736
43611	NC_008526	ATCG	2	8	2284709	2284716	25 %	25 %	25 %	25 %	116495736
43612	NC_008526	TAGCC	2	10	2284869	2284878	20 %	20 %	20 %	40 %	116495736
43613	NC_008526	CCT	2	6	2285005	2285010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116495737
43614	NC_008526	A	6	6	2285060	2285065	100 %	0 %	0 %	0 %	116495737
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43616	NC_008526	ACAATC	2	12	2285260	2285271	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	116495737
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43845	NC_008526	TGT	2	6	2297399	2297404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43846	NC_008526	GCT	2	6	2297425	2297430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43959	NC_008526	TTG	2	6	2302860	2302865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495756
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43968	NC_008526	T	6	6	2303328	2303333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43969	NC_008526	TCA	2	6	2303338	2303343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43970	NC_008526	ACT	2	6	2303372	2303377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495757
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