MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_008526	TCC	2	6	2230116	2230121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116495688
42503	NC_008526	CAT	3	9	2230279	2230287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495688
42504	NC_008526	CTG	2	6	2230361	2230366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495688
42505	NC_008526	CAT	2	6	2230367	2230372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495688
42506	NC_008526	T	6	6	2230387	2230392	0 %	100 %	0 %	0 %	116495688
42507	NC_008526	CTTT	2	8	2230423	2230430	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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42509	NC_008526	GATCA	2	10	2230625	2230634	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42510	NC_008526	AGT	2	6	2230656	2230661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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42512	NC_008526	ATG	2	6	2230697	2230702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495689
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42515	NC_008526	TTGGT	2	10	2230742	2230751	0 %	60 %	40 %	0 %	116495689
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42517	NC_008526	T	6	6	2230771	2230776	0 %	100 %	0 %	0 %	116495689
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42523	NC_008526	CG	4	8	2231029	2231036	0 %	0 %	50 %	50 %	116495689
42524	NC_008526	TGC	2	6	2231073	2231078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495689
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42533	NC_008526	CAGT	2	8	2231811	2231818	25 %	25 %	25 %	25 %	116495689
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42551	NC_008526	ATG	2	6	2232661	2232666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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42553	NC_008526	CAT	2	6	2232748	2232753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495690
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42563	NC_008526	GC	3	6	2233104	2233109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42564	NC_008526	TGC	2	6	2233188	2233193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42571	NC_008526	TTAA	2	8	2233578	2233585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42572	NC_008526	ACA	2	6	2233629	2233634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42573	NC_008526	TTG	2	6	2233662	2233667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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42605	NC_008526	TTC	2	6	2235005	2235010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495691
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42733	NC_008526	T	6	6	2240829	2240834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42734	NC_008526	CG	3	6	2240858	2240863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42735	NC_008526	ATT	2	6	2240900	2240905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42737	NC_008526	CAA	2	6	2240942	2240947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495698
42738	NC_008526	ATT	2	6	2240974	2240979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495698
42739	NC_008526	GC	4	8	2241009	2241016	0 %	0 %	50 %	50 %	116495698
42740	NC_008526	GAC	2	6	2241049	2241054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495698
42741	NC_008526	CTG	2	6	2241056	2241061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495698
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42768	NC_008526	AAG	2	6	2242374	2242379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495698
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42837	NC_008526	AATC	2	8	2244798	2244805	50 %	25 %	0 %	25 %	116495701
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42839	NC_008526	A	6	6	2244989	2244994	100 %	0 %	0 %	0 %	116495701
42840	NC_008526	TGC	2	6	2245045	2245050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495701
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42849	NC_008526	GC	3	6	2245532	2245537	0 %	0 %	50 %	50 %	116495702
42850	NC_008526	ATC	2	6	2245554	2245559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495702
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42852	NC_008526	GTC	2	6	2245650	2245655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495702
42853	NC_008526	AAT	2	6	2245700	2245705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495702
42854	NC_008526	TCC	2	6	2245716	2245721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116495702
42855	NC_008526	AGC	2	6	2245736	2245741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495702
42856	NC_008526	ATC	2	6	2245748	2245753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495702
42857	NC_008526	AGT	2	6	2245764	2245769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495702
42858	NC_008526	TCG	2	6	2245798	2245803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495702
42859	NC_008526	CAA	2	6	2245811	2245816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495702
42860	NC_008526	TAA	2	6	2245871	2245876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495702
42861	NC_008526	CCCT	2	8	2245890	2245897	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42862	NC_008526	AGAGC	2	10	2245936	2245945	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42863	NC_008526	TTAC	2	8	2246009	2246016	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42864	NC_008526	AC	3	6	2246015	2246020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42865	NC_008526	ATTCT	2	10	2246044	2246053	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42866	NC_008526	GTG	2	6	2246121	2246126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42867	NC_008526	CAC	2	6	2246212	2246217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42868	NC_008526	CGC	2	6	2246227	2246232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42869	NC_008526	CT	3	6	2246241	2246246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42870	NC_008526	ATT	2	6	2246298	2246303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42871	NC_008526	ATT	2	6	2246313	2246318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42872	NC_008526	ACAA	2	8	2246332	2246339	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42873	NC_008526	TGC	2	6	2246407	2246412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495703
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42881	NC_008526	CAT	2	6	2246857	2246862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495703
42882	NC_008526	TG	3	6	2246865	2246870	0 %	50 %	50 %	0 %	116495703
42883	NC_008526	AGC	2	6	2246971	2246976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42884	NC_008526	T	10	10	2246988	2246997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42885	NC_008526	CAA	2	6	2247058	2247063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42886	NC_008526	TCTG	2	8	2247113	2247120	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42887	NC_008526	GCTT	2	8	2247170	2247177	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42888	NC_008526	ATCA	2	8	2247187	2247194	50 %	25 %	0 %	25 %	116495704
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42894	NC_008526	GCCG	2	8	2247525	2247532	0 %	0 %	50 %	50 %	116495704
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42899	NC_008526	TTCCG	2	10	2247800	2247809	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42900	NC_008526	GCA	2	6	2247810	2247815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42901	NC_008526	TTCGCA	2	12	2247899	2247910	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42902	NC_008526	T	6	6	2247911	2247916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42903	NC_008526	GATT	2	8	2247986	2247993	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42904	NC_008526	T	7	7	2248080	2248086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42905	NC_008526	GGT	2	6	2248218	2248223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495705
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42924	NC_008526	A	7	7	2249227	2249233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42925	NC_008526	ACG	2	6	2249317	2249322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495706
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42942	NC_008526	CTC	2	6	2250011	2250016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42943	NC_008526	CAT	2	6	2250120	2250125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495707
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42966	NC_008526	CTGTT	2	10	2251326	2251335	0 %	60 %	20 %	20 %	116495709
42967	NC_008526	GTT	2	6	2251454	2251459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495709
42968	NC_008526	GCA	2	6	2251559	2251564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495709
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