MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_008526	CGC	2	6	2204267	2204272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495661
42003	NC_008526	CTG	2	6	2204307	2204312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495661
42004	NC_008526	ATC	2	6	2204407	2204412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495661
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42006	NC_008526	GCA	2	6	2204543	2204548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495661
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42120	NC_008526	AGT	2	6	2211000	2211005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495670
42121	NC_008526	CGCA	2	8	2211046	2211053	25 %	0 %	25 %	50 %	116495670
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42124	NC_008526	CTT	2	6	2211348	2211353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495670
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42130	NC_008526	AAT	2	6	2211763	2211768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42159	NC_008526	A	6	6	2213347	2213352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42228	NC_008526	TCA	2	6	2217121	2217126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42230	NC_008526	ATC	3	9	2217304	2217312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495677
42231	NC_008526	AATG	2	8	2217324	2217331	50 %	25 %	25 %	0 %	116495677
42232	NC_008526	TGT	3	9	2217332	2217340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495677
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42234	NC_008526	TCG	2	6	2217407	2217412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495677
42235	NC_008526	TCT	2	6	2217501	2217506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495677
42236	NC_008526	TTTC	2	8	2217513	2217520	0 %	75 %	0 %	25 %	116495677
42237	NC_008526	ACA	2	6	2217536	2217541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42238	NC_008526	A	7	7	2217563	2217569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42239	NC_008526	ACT	2	6	2217665	2217670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42240	NC_008526	GTAT	2	8	2217680	2217687	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42241	NC_008526	TCTT	2	8	2217729	2217736	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42242	NC_008526	T	6	6	2217735	2217740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42243	NC_008526	TAA	2	6	2217880	2217885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42253	NC_008526	GCT	2	6	2218277	2218282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495678
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42259	NC_008526	T	6	6	2218543	2218548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42260	NC_008526	CATT	2	8	2218553	2218560	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42261	NC_008526	CTG	2	6	2218599	2218604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495679
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42296	NC_008526	TAAC	2	8	2219622	2219629	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42297	NC_008526	TG	3	6	2219671	2219676	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42298	NC_008526	TGC	2	6	2219824	2219829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495680
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42326	NC_008526	GGAAT	2	10	2221313	2221322	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42327	NC_008526	T	6	6	2221388	2221393	0 %	100 %	0 %	0 %	116495682
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42332	NC_008526	TTGG	2	8	2221563	2221570	0 %	50 %	50 %	0 %	116495682
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42337	NC_008526	GATT	2	8	2221732	2221739	25 %	50 %	25 %	0 %	116495682
42338	NC_008526	ATT	2	6	2221779	2221784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495682
42339	NC_008526	GCT	2	6	2221813	2221818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495682
42340	NC_008526	ATG	2	6	2221847	2221852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495682
42341	NC_008526	TCTGAG	2	12	2221903	2221914	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116495682
42342	NC_008526	ATG	2	6	2221950	2221955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495682
42343	NC_008526	CAT	2	6	2222005	2222010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495682
42344	NC_008526	TTGT	2	8	2222027	2222034	0 %	75 %	25 %	0 %	116495682
42345	NC_008526	CAC	3	9	2222044	2222052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495682
42346	NC_008526	AAG	2	6	2222058	2222063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495682
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42348	NC_008526	GATAAG	2	12	2222120	2222131	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116495682
42349	NC_008526	CAAG	2	8	2222164	2222171	50 %	0 %	25 %	25 %	116495682
42350	NC_008526	CAT	2	6	2222215	2222220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495682
42351	NC_008526	TTG	2	6	2222286	2222291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495682
42352	NC_008526	TGG	2	6	2222308	2222313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495682
42353	NC_008526	GAA	2	6	2222348	2222353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495682
42354	NC_008526	TGA	2	6	2222380	2222385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495682
42355	NC_008526	TGA	2	6	2222392	2222397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495682
42356	NC_008526	GAT	2	6	2222414	2222419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495682
42357	NC_008526	AAC	2	6	2222446	2222451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495682
42358	NC_008526	ATC	2	6	2222510	2222515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495682
42359	NC_008526	CA	3	6	2222638	2222643	50 %	0 %	0 %	50 %	116495682
42360	NC_008526	AAAC	2	8	2222660	2222667	75 %	0 %	0 %	25 %	116495682
42361	NC_008526	AAG	2	6	2222685	2222690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495682
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42363	NC_008526	T	7	7	2222768	2222774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42364	NC_008526	TAAAC	2	10	2222823	2222832	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42365	NC_008526	ATT	2	6	2222854	2222859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42393	NC_008526	ATCA	2	8	2224101	2224108	50 %	25 %	0 %	25 %	116495683
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42413	NC_008526	TATT	2	8	2225309	2225316	25 %	75 %	0 %	0 %	116495686
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42457	NC_008526	CGT	2	6	2227570	2227575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495687
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42471	NC_008526	CCATC	2	10	2228302	2228311	20 %	20 %	0 %	60 %	116495688
42472	NC_008526	TGCCG	2	10	2228318	2228327	0 %	20 %	40 %	40 %	116495688
42473	NC_008526	TCA	2	6	2228337	2228342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495688
42474	NC_008526	GCA	2	6	2228379	2228384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495688
42475	NC_008526	ATC	2	6	2228432	2228437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495688
42476	NC_008526	GCT	2	6	2228439	2228444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495688
42477	NC_008526	CAG	2	6	2228585	2228590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495688
42478	NC_008526	ATG	2	6	2228610	2228615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495688
42479	NC_008526	ACC	2	6	2228672	2228677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495688
42480	NC_008526	GCAT	2	8	2228703	2228710	25 %	25 %	25 %	25 %	116495688
42481	NC_008526	GGC	2	6	2228783	2228788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495688
42482	NC_008526	TTTC	2	8	2228899	2228906	0 %	75 %	0 %	25 %	116495688
42483	NC_008526	TTG	2	6	2229021	2229026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495688
42484	NC_008526	GT	3	6	2229040	2229045	0 %	50 %	50 %	0 %	116495688
42485	NC_008526	TTC	2	6	2229102	2229107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495688
42486	NC_008526	GGA	2	6	2229148	2229153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116495688
42487	NC_008526	CGG	2	6	2229179	2229184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495688
42488	NC_008526	AATC	2	8	2229206	2229213	50 %	25 %	0 %	25 %	116495688
42489	NC_008526	CAT	2	6	2229265	2229270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495688
42490	NC_008526	TAGT	2	8	2229397	2229404	25 %	50 %	25 %	0 %	116495688
42491	NC_008526	A	6	6	2229428	2229433	100 %	0 %	0 %	0 %	116495688
42492	NC_008526	CAA	2	6	2229440	2229445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495688
42493	NC_008526	ACA	2	6	2229559	2229564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495688
42494	NC_008526	CTG	2	6	2229588	2229593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495688
42495	NC_008526	TAC	2	6	2229613	2229618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495688
42496	NC_008526	AATA	2	8	2229705	2229712	75 %	25 %	0 %	0 %	116495688
42497	NC_008526	TCG	2	6	2229784	2229789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495688
42498	NC_008526	CGT	2	6	2229844	2229849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495688
42499	NC_008526	TGG	2	6	2229883	2229888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495688
42500	NC_008526	CTG	2	6	2229985	2229990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495688

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