MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_008526	ATC	2	6	2176858	2176863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495640
41502	NC_008526	GCC	2	6	2176993	2176998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495640
41503	NC_008526	TGA	2	6	2177060	2177065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495640
41504	NC_008526	ACC	2	6	2177093	2177098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495640
41505	NC_008526	TCGCAG	2	12	2177136	2177147	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41506	NC_008526	GGA	2	6	2177254	2177259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41507	NC_008526	TGAT	2	8	2177268	2177275	25 %	50 %	25 %	0 %	116495641
41508	NC_008526	ATG	2	6	2177303	2177308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495641
41509	NC_008526	A	6	6	2177315	2177320	100 %	0 %	0 %	0 %	116495641
41510	NC_008526	AAC	2	6	2177444	2177449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495641
41511	NC_008526	GAA	2	6	2177525	2177530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495641
41512	NC_008526	AACG	2	8	2177585	2177592	50 %	0 %	25 %	25 %	116495641
41513	NC_008526	TCA	2	6	2177613	2177618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495641
41514	NC_008526	TCA	2	6	2177791	2177796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495641
41515	NC_008526	TGC	2	6	2177836	2177841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495641
41516	NC_008526	CAC	2	6	2177996	2178001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495641
41517	NC_008526	AGA	2	6	2178381	2178386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495641
41518	NC_008526	GAC	2	6	2178464	2178469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495641
41519	NC_008526	AATG	2	8	2178491	2178498	50 %	25 %	25 %	0 %	116495641
41520	NC_008526	CGT	2	6	2178503	2178508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495641
41521	NC_008526	GCC	2	6	2178533	2178538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495641
41522	NC_008526	CTGA	2	8	2178569	2178576	25 %	25 %	25 %	25 %	116495641
41523	NC_008526	TCA	2	6	2178636	2178641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495641
41524	NC_008526	CGC	2	6	2178723	2178728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41525	NC_008526	A	6	6	2178776	2178781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41526	NC_008526	GCA	2	6	2178818	2178823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495642
41527	NC_008526	TGC	2	6	2178860	2178865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495642
41528	NC_008526	TAA	2	6	2178892	2178897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495642
41529	NC_008526	CCAA	2	8	2178941	2178948	50 %	0 %	0 %	50 %	116495642
41530	NC_008526	ATG	2	6	2178949	2178954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495642
41531	NC_008526	AAC	2	6	2179036	2179041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495642
41532	NC_008526	CAG	2	6	2179056	2179061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495642
41533	NC_008526	CTT	2	6	2179062	2179067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495642
41534	NC_008526	ATC	2	6	2179333	2179338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495642
41535	NC_008526	TGTT	2	8	2179378	2179385	0 %	75 %	25 %	0 %	116495642
41536	NC_008526	TGA	2	6	2179388	2179393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495642
41537	NC_008526	CCGT	2	8	2179422	2179429	0 %	25 %	25 %	50 %	116495642
41538	NC_008526	TGCA	2	8	2179537	2179544	25 %	25 %	25 %	25 %	116495642
41539	NC_008526	GCA	2	6	2179568	2179573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495642
41540	NC_008526	TCG	2	6	2179581	2179586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495642
41541	NC_008526	CG	3	6	2179657	2179662	0 %	0 %	50 %	50 %	116495642
41542	NC_008526	GTTT	2	8	2179817	2179824	0 %	75 %	25 %	0 %	116495642
41543	NC_008526	TGC	2	6	2179905	2179910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495642
41544	NC_008526	GT	3	6	2179959	2179964	0 %	50 %	50 %	0 %	116495642
41545	NC_008526	GCC	2	6	2180005	2180010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495642
41546	NC_008526	CTTT	2	8	2180037	2180044	0 %	75 %	0 %	25 %	116495642
41547	NC_008526	TCC	2	6	2180133	2180138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41548	NC_008526	GAC	3	9	2180181	2180189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41549	NC_008526	CAA	2	6	2180253	2180258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41550	NC_008526	TTG	2	6	2180279	2180284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41551	NC_008526	GTCCT	2	10	2180309	2180318	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41552	NC_008526	T	6	6	2180357	2180362	0 %	100 %	0 %	0 %	116495643
41553	NC_008526	CAG	2	6	2180494	2180499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495643
41554	NC_008526	TGC	2	6	2180520	2180525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495643
41555	NC_008526	GT	3	6	2180527	2180532	0 %	50 %	50 %	0 %	116495643
41556	NC_008526	GC	3	6	2180614	2180619	0 %	0 %	50 %	50 %	116495643
41557	NC_008526	ACA	2	6	2180631	2180636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495643
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41559	NC_008526	CAC	2	6	2180671	2180676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495643
41560	NC_008526	ACC	2	6	2180717	2180722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495643
41561	NC_008526	CAG	2	6	2180779	2180784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495643
41562	NC_008526	TTA	2	6	2180934	2180939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495643
41563	NC_008526	GCC	2	6	2180983	2180988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495643
41564	NC_008526	AGCAA	2	10	2181021	2181030	60 %	0 %	20 %	20 %	116495643
41565	NC_008526	AGCC	2	8	2181048	2181055	25 %	0 %	25 %	50 %	116495643
41566	NC_008526	CGA	2	6	2181104	2181109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495643
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41570	NC_008526	AGC	2	6	2181299	2181304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495643
41571	NC_008526	AATC	2	8	2181398	2181405	50 %	25 %	0 %	25 %	116495643
41572	NC_008526	ATC	2	6	2181669	2181674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495643
41573	NC_008526	TTTG	2	8	2181732	2181739	0 %	75 %	25 %	0 %	116495643
41574	NC_008526	TGC	2	6	2181866	2181871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41575	NC_008526	ACAA	2	8	2181898	2181905	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41576	NC_008526	CAA	2	6	2181972	2181977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495644
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41578	NC_008526	ATC	2	6	2182149	2182154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495644
41579	NC_008526	AATTG	2	10	2182179	2182188	40 %	40 %	20 %	0 %	116495644
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41582	NC_008526	TCAA	2	8	2182330	2182337	50 %	25 %	0 %	25 %	116495644
41583	NC_008526	ATA	3	9	2182359	2182367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495644
41584	NC_008526	CTT	2	6	2182430	2182435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495644
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41586	NC_008526	TAT	2	6	2182498	2182503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41587	NC_008526	AAC	2	6	2182504	2182509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41588	NC_008526	TA	3	6	2182515	2182520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41589	NC_008526	ATTTT	2	10	2182547	2182556	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41590	NC_008526	T	7	7	2182553	2182559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41591	NC_008526	CAA	2	6	2182585	2182590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41592	NC_008526	CAC	2	6	2182640	2182645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41593	NC_008526	CGG	2	6	2182810	2182815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495645
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41602	NC_008526	AGACCT	2	12	2183542	2183553	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116495645
41603	NC_008526	AAC	2	6	2183586	2183591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495645
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41606	NC_008526	A	6	6	2183686	2183691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41607	NC_008526	ATT	2	6	2183726	2183731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495646
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41618	NC_008526	CAG	2	6	2184261	2184266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495646
41619	NC_008526	CGC	2	6	2184350	2184355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495646
41620	NC_008526	CGC	2	6	2184368	2184373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495646
41621	NC_008526	TGC	2	6	2184397	2184402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495646
41622	NC_008526	CAT	2	6	2184431	2184436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495646
41623	NC_008526	GTG	2	6	2184445	2184450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495646
41624	NC_008526	CAA	2	6	2184524	2184529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495646
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41627	NC_008526	TCA	2	6	2184599	2184604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495646
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41630	NC_008526	TCA	2	6	2184823	2184828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495646
41631	NC_008526	TCA	2	6	2184862	2184867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495646
41632	NC_008526	TCT	2	6	2184943	2184948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495646
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41634	NC_008526	CCTTG	2	10	2185052	2185061	0 %	40 %	20 %	40 %	116495646
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41636	NC_008526	TTC	2	6	2185153	2185158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495646
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41647	NC_008526	TGC	2	6	2186240	2186245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495647
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41654	NC_008526	CTG	2	6	2186445	2186450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495647
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41668	NC_008526	CCA	2	6	2187219	2187224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495647
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41671	NC_008526	TTCT	2	8	2187375	2187382	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41672	NC_008526	A	7	7	2187570	2187576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41673	NC_008526	CAA	2	6	2187705	2187710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41679	NC_008526	CATAGT	2	12	2187878	2187889	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116495648
41680	NC_008526	GCA	3	9	2187919	2187927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495648
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41695	NC_008526	TGT	2	6	2188710	2188715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495649
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41729	NC_008526	CTT	2	6	2190354	2190359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495650
41730	NC_008526	GCTG	2	8	2190398	2190405	0 %	25 %	50 %	25 %	116495650
41731	NC_008526	TGA	2	6	2190443	2190448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495650
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