MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_008526	TTA	2	6	2151366	2151371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41002	NC_008526	TCA	2	6	2151435	2151440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495619
41003	NC_008526	AAGG	2	8	2151467	2151474	50 %	0 %	50 %	0 %	116495619
41004	NC_008526	CGA	2	6	2151495	2151500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495619
41005	NC_008526	TCG	2	6	2151501	2151506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495619
41006	NC_008526	TACG	2	8	2151519	2151526	25 %	25 %	25 %	25 %	116495619
41007	NC_008526	GAA	2	6	2151557	2151562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495619
41008	NC_008526	TTC	2	6	2151674	2151679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495619
41009	NC_008526	AGC	2	6	2151695	2151700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495619
41010	NC_008526	TGG	2	6	2151864	2151869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495619
41011	NC_008526	TCT	2	6	2151886	2151891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495619
41012	NC_008526	TCA	2	6	2151897	2151902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495619
41013	NC_008526	GAA	2	6	2152025	2152030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495619
41014	NC_008526	TTC	2	6	2152031	2152036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495619
41015	NC_008526	TG	3	6	2152252	2152257	0 %	50 %	50 %	0 %	116495619
41016	NC_008526	AGGA	2	8	2152288	2152295	50 %	0 %	50 %	0 %	116495619
41017	NC_008526	CTT	2	6	2152348	2152353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495619
41018	NC_008526	AGC	2	6	2152409	2152414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495619
41019	NC_008526	TGT	2	6	2152435	2152440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495619
41020	NC_008526	CAA	2	6	2152472	2152477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495619
41021	NC_008526	TGA	2	6	2152505	2152510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495619
41022	NC_008526	CTT	2	6	2152637	2152642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495619
41023	NC_008526	AAAG	2	8	2152706	2152713	75 %	0 %	25 %	0 %	116495619
41024	NC_008526	CG	3	6	2152878	2152883	0 %	0 %	50 %	50 %	116495619
41025	NC_008526	CTT	2	6	2152895	2152900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495619
41026	NC_008526	AAGG	2	8	2152916	2152923	50 %	0 %	50 %	0 %	116495619
41027	NC_008526	TCT	2	6	2152939	2152944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495619
41028	NC_008526	CAG	2	6	2153023	2153028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495619
41029	NC_008526	GAT	2	6	2153078	2153083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495619
41030	NC_008526	ACC	2	6	2153120	2153125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495619
41031	NC_008526	CGG	2	6	2153148	2153153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495619
41032	NC_008526	AT	3	6	2153178	2153183	50 %	50 %	0 %	0 %	116495619
41033	NC_008526	CGC	2	6	2153185	2153190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495619
41034	NC_008526	CAT	2	6	2153222	2153227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495619
41035	NC_008526	TTA	2	6	2153229	2153234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495619
41036	NC_008526	TTGTC	2	10	2153257	2153266	0 %	60 %	20 %	20 %	116495619
41037	NC_008526	GAT	2	6	2153276	2153281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495619
41038	NC_008526	CT	3	6	2153400	2153405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41039	NC_008526	T	6	6	2153454	2153459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41040	NC_008526	CGAA	2	8	2153469	2153476	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41041	NC_008526	AAT	2	6	2153596	2153601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41042	NC_008526	ATG	2	6	2153695	2153700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41043	NC_008526	CTG	2	6	2153712	2153717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41044	NC_008526	CTA	2	6	2153763	2153768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41045	NC_008526	CGA	2	6	2153822	2153827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41046	NC_008526	GGC	2	6	2153947	2153952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41047	NC_008526	CGA	2	6	2154214	2154219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41048	NC_008526	AGC	2	6	2154312	2154317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495620
41049	NC_008526	TAT	2	6	2154351	2154356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495620
41050	NC_008526	ACC	2	6	2154385	2154390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495620
41051	NC_008526	AGCT	2	8	2154400	2154407	25 %	25 %	25 %	25 %	116495620
41052	NC_008526	CAT	2	6	2154495	2154500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41053	NC_008526	TTA	2	6	2154517	2154522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41054	NC_008526	TTTAA	2	10	2154551	2154560	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41055	NC_008526	CAGT	2	8	2154577	2154584	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41056	NC_008526	ATC	2	6	2154590	2154595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41057	NC_008526	ATT	2	6	2154685	2154690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41058	NC_008526	ATT	2	6	2154809	2154814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41059	NC_008526	TAA	2	6	2154977	2154982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41060	NC_008526	CTA	2	6	2155005	2155010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41061	NC_008526	TTG	2	6	2155034	2155039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41062	NC_008526	TAA	2	6	2155066	2155071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41063	NC_008526	ACA	2	6	2155082	2155087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41064	NC_008526	ATA	2	6	2155108	2155113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41065	NC_008526	TCAG	2	8	2155181	2155188	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41066	NC_008526	GCA	2	6	2155241	2155246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41067	NC_008526	GAA	2	6	2155249	2155254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41068	NC_008526	AAAT	2	8	2155273	2155280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41069	NC_008526	ATTTAA	2	12	2155285	2155296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41070	NC_008526	ATA	2	6	2155308	2155313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41071	NC_008526	A	6	6	2155433	2155438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41072	NC_008526	AT	3	6	2155442	2155447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41073	NC_008526	TAAT	2	8	2155508	2155515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41074	NC_008526	A	6	6	2155533	2155538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41075	NC_008526	GA	3	6	2155606	2155611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41076	NC_008526	CCT	2	6	2155625	2155630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41077	NC_008526	ATT	2	6	2155642	2155647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41078	NC_008526	GAA	2	6	2155678	2155683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41079	NC_008526	ATC	2	6	2155874	2155879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41080	NC_008526	A	7	7	2155927	2155933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41081	NC_008526	CAAA	2	8	2155942	2155949	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41082	NC_008526	GAG	2	6	2155970	2155975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41083	NC_008526	ATC	2	6	2156017	2156022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495621
41084	NC_008526	CAA	2	6	2156030	2156035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495621
41085	NC_008526	TTTG	2	8	2156055	2156062	0 %	75 %	25 %	0 %	116495621
41086	NC_008526	TAT	2	6	2156090	2156095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495621
41087	NC_008526	CAAT	2	8	2156150	2156157	50 %	25 %	0 %	25 %	116495621
41088	NC_008526	T	8	8	2156159	2156166	0 %	100 %	0 %	0 %	116495621
41089	NC_008526	A	7	7	2156172	2156178	100 %	0 %	0 %	0 %	116495621
41090	NC_008526	CAA	2	6	2156184	2156189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41091	NC_008526	ATTC	2	8	2156211	2156218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41092	NC_008526	TAC	2	6	2156227	2156232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41093	NC_008526	GAA	2	6	2156494	2156499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41094	NC_008526	T	7	7	2156526	2156532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41095	NC_008526	TAT	3	9	2156557	2156565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41096	NC_008526	AGC	2	6	2156580	2156585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41097	NC_008526	GTT	2	6	2156592	2156597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41098	NC_008526	CGA	2	6	2156749	2156754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495622
41099	NC_008526	AAT	2	6	2156763	2156768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495622
41100	NC_008526	GC	3	6	2156963	2156968	0 %	0 %	50 %	50 %	116495622
41101	NC_008526	CAA	2	6	2157004	2157009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495622
41102	NC_008526	GAA	2	6	2157103	2157108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495622
41103	NC_008526	TAA	2	6	2157166	2157171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495622
41104	NC_008526	GAA	2	6	2157265	2157270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495622
41105	NC_008526	TTC	2	6	2157377	2157382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495622
41106	NC_008526	AAT	2	6	2157421	2157426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495622
41107	NC_008526	CG	3	6	2157439	2157444	0 %	0 %	50 %	50 %	116495622
41108	NC_008526	GAC	2	6	2157520	2157525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495622
41109	NC_008526	GTTT	2	8	2157527	2157534	0 %	75 %	25 %	0 %	116495622
41110	NC_008526	TTG	2	6	2157610	2157615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495622
41111	NC_008526	ATC	2	6	2157692	2157697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495622
41112	NC_008526	TGA	2	6	2157765	2157770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495622
41113	NC_008526	GTGGAC	2	12	2157823	2157834	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116495622
41114	NC_008526	GTG	2	6	2157943	2157948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495622
41115	NC_008526	GCT	2	6	2157980	2157985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495622
41116	NC_008526	T	6	6	2158000	2158005	0 %	100 %	0 %	0 %	116495622
41117	NC_008526	AGC	2	6	2158160	2158165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495622
41118	NC_008526	GTC	2	6	2158199	2158204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495622
41119	NC_008526	A	6	6	2158250	2158255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41120	NC_008526	AAAG	2	8	2158277	2158284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41121	NC_008526	CTTT	2	8	2158310	2158317	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41122	NC_008526	TTC	2	6	2158367	2158372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495623
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41357	NC_008526	ACA	2	6	2169945	2169950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41358	NC_008526	GCCA	2	8	2170064	2170071	25 %	0 %	25 %	50 %	116495635
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41480	NC_008526	ATG	2	6	2176182	2176187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495639
41481	NC_008526	TGC	2	6	2176202	2176207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495639
41482	NC_008526	GTT	3	9	2176218	2176226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495639
41483	NC_008526	GTC	2	6	2176227	2176232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495639
41484	NC_008526	TC	3	6	2176334	2176339	0 %	50 %	0 %	50 %	116495639
41485	NC_008526	GATCAT	2	12	2176355	2176366	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116495639
41486	NC_008526	ATC	2	6	2176374	2176379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495639
41487	NC_008526	CTG	2	6	2176391	2176396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495639
41488	NC_008526	TC	3	6	2176406	2176411	0 %	50 %	0 %	50 %	116495639
41489	NC_008526	CAT	2	6	2176412	2176417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495639
41490	NC_008526	ATT	2	6	2176487	2176492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495639
41491	NC_008526	TCC	2	6	2176539	2176544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116495639
41492	NC_008526	CAT	2	6	2176583	2176588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495639
41493	NC_008526	GT	3	6	2176621	2176626	0 %	50 %	50 %	0 %	116495639
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41495	NC_008526	TCA	3	9	2176684	2176692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495639
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41497	NC_008526	GC	3	6	2176737	2176742	0 %	0 %	50 %	50 %	116495639
41498	NC_008526	ACA	2	6	2176794	2176799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495640
41499	NC_008526	A	7	7	2176811	2176817	100 %	0 %	0 %	0 %	116495640
41500	NC_008526	A	6	6	2176837	2176842	100 %	0 %	0 %	0 %	116495640

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