MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_008526	GCC	2	6	2099316	2099321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495566
40002	NC_008526	CTG	2	6	2099366	2099371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495566
40003	NC_008526	GAT	2	6	2099383	2099388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495566
40004	NC_008526	CGC	2	6	2099433	2099438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495566
40005	NC_008526	TTG	2	6	2099532	2099537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495566
40006	NC_008526	CGC	2	6	2099554	2099559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495566
40007	NC_008526	TTG	2	6	2099561	2099566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495566
40008	NC_008526	TGATG	2	10	2099675	2099684	20 %	40 %	40 %	0 %	116495566
40009	NC_008526	ATCCG	2	10	2099763	2099772	20 %	20 %	20 %	40 %	116495566
40010	NC_008526	CGA	2	6	2099809	2099814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495566
40011	NC_008526	GAAT	2	8	2100042	2100049	50 %	25 %	25 %	0 %	116495566
40012	NC_008526	TCT	2	6	2100051	2100056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495566
40013	NC_008526	TTG	2	6	2100108	2100113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495566
40014	NC_008526	GCC	2	6	2100141	2100146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495566
40015	NC_008526	TTG	2	6	2100155	2100160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495566
40016	NC_008526	GCC	2	6	2100173	2100178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495566
40017	NC_008526	TTC	2	6	2100305	2100310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495566
40018	NC_008526	AGT	2	6	2100322	2100327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495566
40019	NC_008526	T	7	7	2100378	2100384	0 %	100 %	0 %	0 %	116495566
40020	NC_008526	ATG	2	6	2100390	2100395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495566
40021	NC_008526	AAG	2	6	2100417	2100422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40022	NC_008526	A	6	6	2100447	2100452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40023	NC_008526	CCG	2	6	2100455	2100460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40024	NC_008526	GT	3	6	2100473	2100478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40025	NC_008526	GCT	2	6	2100508	2100513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495567
40026	NC_008526	CGT	2	6	2100587	2100592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495567
40027	NC_008526	AAT	2	6	2100617	2100622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495567
40028	NC_008526	GCC	2	6	2100678	2100683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495567
40029	NC_008526	GCG	2	6	2100882	2100887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495567
40030	NC_008526	CTGC	2	8	2100970	2100977	0 %	25 %	25 %	50 %	116495567
40031	NC_008526	TCACGG	2	12	2101075	2101086	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116495567
40032	NC_008526	AGCC	2	8	2101098	2101105	25 %	0 %	25 %	50 %	116495567
40033	NC_008526	GCC	2	6	2101109	2101114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495567
40034	NC_008526	ATC	2	6	2101127	2101132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495567
40035	NC_008526	GTG	2	6	2101210	2101215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495567
40036	NC_008526	GCT	2	6	2101221	2101226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495567
40037	NC_008526	TGC	2	6	2101284	2101289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40038	NC_008526	GAA	2	6	2101336	2101341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40039	NC_008526	CAAT	2	8	2101367	2101374	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40040	NC_008526	GCGTC	2	10	2101382	2101391	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40041	NC_008526	TCA	2	6	2101400	2101405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40042	NC_008526	TG	3	6	2101423	2101428	0 %	50 %	50 %	0 %	116495568
40043	NC_008526	CAA	2	6	2101435	2101440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495568
40044	NC_008526	CCG	2	6	2101564	2101569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495568
40045	NC_008526	CGC	2	6	2101641	2101646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495568
40046	NC_008526	TTG	2	6	2101650	2101655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495568
40047	NC_008526	TGA	2	6	2101671	2101676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495568
40048	NC_008526	ACTT	2	8	2101714	2101721	25 %	50 %	0 %	25 %	116495568
40049	NC_008526	GAAT	2	8	2101739	2101746	50 %	25 %	25 %	0 %	116495568
40050	NC_008526	CAC	2	6	2101764	2101769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495568
40051	NC_008526	AAC	2	6	2101786	2101791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495568
40052	NC_008526	CAT	2	6	2101864	2101869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495568
40053	NC_008526	ACC	2	6	2101906	2101911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495568
40054	NC_008526	TCG	2	6	2101914	2101919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495568
40055	NC_008526	CA	3	6	2101931	2101936	50 %	0 %	0 %	50 %	116495568
40056	NC_008526	AGC	2	6	2101954	2101959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495568
40057	NC_008526	CTG	2	6	2101965	2101970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495568
40058	NC_008526	TTC	2	6	2102032	2102037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495568
40059	NC_008526	T	6	6	2102065	2102070	0 %	100 %	0 %	0 %	116495568
40060	NC_008526	CTT	2	6	2102205	2102210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495568
40061	NC_008526	GTTGTG	2	12	2102217	2102228	0 %	50 %	50 %	0 %	116495568
40062	NC_008526	TCCT	2	8	2102239	2102246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40063	NC_008526	GGTT	2	8	2102578	2102585	0 %	50 %	50 %	0 %	116495569
40064	NC_008526	CAT	2	6	2102683	2102688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495569
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40070	NC_008526	TCG	2	6	2103241	2103246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495569
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40072	NC_008526	GCA	3	9	2103303	2103311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495569
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40074	NC_008526	CTG	2	6	2103388	2103393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495569
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40081	NC_008526	CTG	2	6	2103895	2103900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495570
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40086	NC_008526	GCAAT	2	10	2104073	2104082	40 %	20 %	20 %	20 %	116495570
40087	NC_008526	AC	3	6	2104115	2104120	50 %	0 %	0 %	50 %	116495570
40088	NC_008526	CCT	2	6	2104313	2104318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40089	NC_008526	AC	3	6	2104394	2104399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40090	NC_008526	TCT	2	6	2104430	2104435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495571
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40102	NC_008526	CAA	2	6	2105327	2105332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495572
40103	NC_008526	GTT	2	6	2105357	2105362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495572
40104	NC_008526	CAC	2	6	2105531	2105536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495572
40105	NC_008526	GCT	2	6	2105578	2105583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495572
40106	NC_008526	GC	3	6	2105642	2105647	0 %	0 %	50 %	50 %	116495572
40107	NC_008526	CATT	2	8	2105732	2105739	25 %	50 %	0 %	25 %	116495572
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40109	NC_008526	CAT	2	6	2105816	2105821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495572
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40113	NC_008526	TCC	2	6	2106102	2106107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40114	NC_008526	CCA	2	6	2106128	2106133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495573
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40118	NC_008526	T	7	7	2106468	2106474	0 %	100 %	0 %	0 %	116495573
40119	NC_008526	TTG	2	6	2106584	2106589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495573
40120	NC_008526	CCA	2	6	2106630	2106635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495573
40121	NC_008526	GCT	2	6	2106636	2106641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495573
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40123	NC_008526	TGA	2	6	2106816	2106821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495573
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40145	NC_008526	GCAA	2	8	2107763	2107770	50 %	0 %	25 %	25 %	116495574
40146	NC_008526	CCT	2	6	2107774	2107779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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40155	NC_008526	GCA	2	6	2108107	2108112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495575
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40188	NC_008526	T	7	7	2109976	2109982	0 %	100 %	0 %	0 %	116495577
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40199	NC_008526	GTC	2	6	2110721	2110726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495579
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40208	NC_008526	CTTT	2	8	2111147	2111154	0 %	75 %	0 %	25 %	116495580
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40212	NC_008526	CGCT	2	8	2111324	2111331	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40213	NC_008526	AACTA	2	10	2111439	2111448	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40214	NC_008526	T	6	6	2111494	2111499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40215	NC_008526	TAT	2	6	2111505	2111510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40216	NC_008526	GAAT	2	8	2111534	2111541	50 %	25 %	25 %	0 %	116495581
40217	NC_008526	ATA	2	6	2111552	2111557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495581
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40219	NC_008526	A	9	9	2111601	2111609	100 %	0 %	0 %	0 %	116495581
40220	NC_008526	T	6	6	2111617	2111622	0 %	100 %	0 %	0 %	116495581
40221	NC_008526	A	6	6	2111652	2111657	100 %	0 %	0 %	0 %	116495581
40222	NC_008526	T	6	6	2111683	2111688	0 %	100 %	0 %	0 %	116495581
40223	NC_008526	GCA	2	6	2111737	2111742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495582
40224	NC_008526	T	6	6	2111787	2111792	0 %	100 %	0 %	0 %	116495582
40225	NC_008526	GCG	2	6	2111860	2111865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495582
40226	NC_008526	ACAG	2	8	2111929	2111936	50 %	0 %	25 %	25 %	116495582
40227	NC_008526	AAG	2	6	2111995	2112000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495582
40228	NC_008526	CAT	2	6	2112177	2112182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495582
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40230	NC_008526	GC	3	6	2112432	2112437	0 %	0 %	50 %	50 %	116495582
40231	NC_008526	CAA	2	6	2112471	2112476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495582
40232	NC_008526	ATC	2	6	2112564	2112569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495582
40233	NC_008526	GCC	2	6	2112643	2112648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495582
40234	NC_008526	A	6	6	2112688	2112693	100 %	0 %	0 %	0 %	116495582
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40236	NC_008526	TCT	2	6	2112799	2112804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495583
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40469	NC_008526	CATA	2	8	2123634	2123641	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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40473	NC_008526	CGC	2	6	2123888	2123893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495594
40474	NC_008526	ACA	2	6	2123924	2123929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495594
40475	NC_008526	CAG	2	6	2123932	2123937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495594
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40477	NC_008526	CA	3	6	2123970	2123975	50 %	0 %	0 %	50 %	116495594
40478	NC_008526	CAG	2	6	2124028	2124033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495594
40479	NC_008526	GCA	2	6	2124045	2124050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495594
40480	NC_008526	TGA	2	6	2124239	2124244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495594
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40491	NC_008526	ATC	2	6	2124655	2124660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495594
40492	NC_008526	CGG	2	6	2124687	2124692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495594
40493	NC_008526	T	7	7	2124829	2124835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40494	NC_008526	GTC	2	6	2124837	2124842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40495	NC_008526	TAA	2	6	2124995	2125000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495595
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40497	NC_008526	TGA	2	6	2125071	2125076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495595
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40499	NC_008526	AC	3	6	2125150	2125155	50 %	0 %	0 %	50 %	116495595
40500	NC_008526	CAA	2	6	2125166	2125171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495595

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