MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_008526	CGC	2	6	1840711	1840716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495308
35003	NC_008526	CGA	2	6	1840851	1840856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495308
35004	NC_008526	CTTCT	2	10	1840876	1840885	0 %	60 %	0 %	40 %	116495308
35005	NC_008526	TCC	2	6	1840900	1840905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35006	NC_008526	TGAT	2	8	1840906	1840913	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35007	NC_008526	ATT	2	6	1840996	1841001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35008	NC_008526	GCG	2	6	1841032	1841037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35009	NC_008526	CAT	2	6	1841067	1841072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35010	NC_008526	A	8	8	1841137	1841144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35011	NC_008526	AAT	2	6	1841172	1841177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35012	NC_008526	ATGCT	2	10	1841236	1841245	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35013	NC_008526	AAGC	2	8	1841264	1841271	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35014	NC_008526	GTCC	2	8	1841309	1841316	0 %	25 %	25 %	50 %	116495309
35015	NC_008526	ATA	2	6	1841332	1841337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495309
35016	NC_008526	CGC	2	6	1841385	1841390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495309
35017	NC_008526	TGAT	2	8	1841401	1841408	25 %	50 %	25 %	0 %	116495309
35018	NC_008526	TG	3	6	1841443	1841448	0 %	50 %	50 %	0 %	116495309
35019	NC_008526	CA	3	6	1841568	1841573	50 %	0 %	0 %	50 %	116495309
35020	NC_008526	CAACC	2	10	1841598	1841607	40 %	0 %	0 %	60 %	116495309
35021	NC_008526	TAT	2	6	1841684	1841689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495309
35022	NC_008526	TGA	2	6	1841777	1841782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495309
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35024	NC_008526	CTTG	2	8	1841849	1841856	0 %	50 %	25 %	25 %	116495309
35025	NC_008526	CTT	2	6	1841885	1841890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495309
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35028	NC_008526	GTC	2	6	1841997	1842002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495309
35029	NC_008526	TGA	2	6	1842077	1842082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495309
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35040	NC_008526	A	6	6	1842609	1842614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35041	NC_008526	TCAG	2	8	1842714	1842721	25 %	25 %	25 %	25 %	116495310
35042	NC_008526	AAGC	2	8	1842850	1842857	50 %	0 %	25 %	25 %	116495310
35043	NC_008526	CAAA	2	8	1842961	1842968	75 %	0 %	0 %	25 %	116495310
35044	NC_008526	T	6	6	1843048	1843053	0 %	100 %	0 %	0 %	116495310
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35046	NC_008526	T	7	7	1843104	1843110	0 %	100 %	0 %	0 %	116495310
35047	NC_008526	GTA	2	6	1843372	1843377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495311
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35052	NC_008526	TCG	2	6	1843717	1843722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495311
35053	NC_008526	GGC	2	6	1843735	1843740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495311
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35055	NC_008526	GTCA	2	8	1843819	1843826	25 %	25 %	25 %	25 %	116495311
35056	NC_008526	TCAGCA	2	12	1843860	1843871	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116495311
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35058	NC_008526	T	8	8	1843937	1843944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35059	NC_008526	TTC	2	6	1843948	1843953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35060	NC_008526	TTTTC	2	10	1843980	1843989	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35061	NC_008526	ATG	2	6	1844036	1844041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35062	NC_008526	AAT	2	6	1844077	1844082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35063	NC_008526	GTT	2	6	1844095	1844100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35064	NC_008526	T	6	6	1844173	1844178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35065	NC_008526	AGG	2	6	1844186	1844191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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35085	NC_008526	A	6	6	1845346	1845351	100 %	0 %	0 %	0 %	116495312
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35090	NC_008526	GAG	2	6	1845633	1845638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35091	NC_008526	ATG	2	6	1845719	1845724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35092	NC_008526	CGC	2	6	1845725	1845730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35093	NC_008526	AGG	2	6	1845790	1845795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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35103	NC_008526	GTT	2	6	1846210	1846215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495313
35104	NC_008526	CAG	2	6	1846224	1846229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495313
35105	NC_008526	CAT	2	6	1846452	1846457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495314
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35107	NC_008526	AAG	2	6	1846537	1846542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495314
35108	NC_008526	ATT	2	6	1846590	1846595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495314
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35110	NC_008526	CCT	2	6	1846620	1846625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35111	NC_008526	TGG	2	6	1846641	1846646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35112	NC_008526	T	6	6	1846656	1846661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35113	NC_008526	CTG	2	6	1846674	1846679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35114	NC_008526	CCA	2	6	1846685	1846690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35115	NC_008526	ATT	3	9	1846701	1846709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35116	NC_008526	TTA	2	6	1846722	1846727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35117	NC_008526	TTC	2	6	1846737	1846742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35118	NC_008526	GT	3	6	1846768	1846773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35119	NC_008526	CAA	2	6	1846868	1846873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495315
35120	NC_008526	CAT	2	6	1846897	1846902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495315
35121	NC_008526	ACAT	2	8	1846906	1846913	50 %	25 %	0 %	25 %	116495315
35122	NC_008526	GGC	2	6	1846950	1846955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495315
35123	NC_008526	TCCG	2	8	1847017	1847024	0 %	25 %	25 %	50 %	116495315
35124	NC_008526	GGC	2	6	1847032	1847037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495315
35125	NC_008526	ATT	2	6	1847106	1847111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495315
35126	NC_008526	AGC	2	6	1847169	1847174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495315
35127	NC_008526	GAC	2	6	1847238	1847243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495315
35128	NC_008526	ATC	2	6	1847270	1847275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495315
35129	NC_008526	GCT	2	6	1847283	1847288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495315
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35131	NC_008526	TCA	2	6	1847369	1847374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495315
35132	NC_008526	T	7	7	1847484	1847490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35133	NC_008526	TTG	2	6	1847533	1847538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495316
35134	NC_008526	CAG	2	6	1847561	1847566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495316
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35136	NC_008526	T	6	6	1847788	1847793	0 %	100 %	0 %	0 %	116495316
35137	NC_008526	CCG	2	6	1847860	1847865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495316
35138	NC_008526	CAGC	2	8	1847995	1848002	25 %	0 %	25 %	50 %	116495316
35139	NC_008526	ATG	2	6	1848036	1848041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495316
35140	NC_008526	T	6	6	1848061	1848066	0 %	100 %	0 %	0 %	116495316
35141	NC_008526	GT	3	6	1848112	1848117	0 %	50 %	50 %	0 %	116495316
35142	NC_008526	T	7	7	1848316	1848322	0 %	100 %	0 %	0 %	116495316
35143	NC_008526	TGAC	2	8	1848333	1848340	25 %	25 %	25 %	25 %	116495316
35144	NC_008526	CGAA	2	8	1848449	1848456	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35145	NC_008526	AGG	2	6	1848526	1848531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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35147	NC_008526	CGG	2	6	1848644	1848649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495317
35148	NC_008526	CTAT	2	8	1848713	1848720	25 %	50 %	0 %	25 %	116495317
35149	NC_008526	TCATT	2	10	1848785	1848794	20 %	60 %	0 %	20 %	116495317
35150	NC_008526	GGC	2	6	1848861	1848866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495317
35151	NC_008526	TGT	2	6	1848923	1848928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495317
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35153	NC_008526	A	6	6	1848984	1848989	100 %	0 %	0 %	0 %	116495317
35154	NC_008526	GGC	2	6	1849059	1849064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495317
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35157	NC_008526	TTG	2	6	1849131	1849136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495317
35158	NC_008526	TGA	2	6	1849148	1849153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495317
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35180	NC_008526	GGT	2	6	1850250	1850255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35181	NC_008526	TTG	2	6	1850262	1850267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35182	NC_008526	ATC	2	6	1850303	1850308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35207	NC_008526	GCAA	2	8	1851469	1851476	50 %	0 %	25 %	25 %	116495320
35208	NC_008526	GCT	2	6	1851502	1851507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495320
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35210	NC_008526	AT	3	6	1851557	1851562	50 %	50 %	0 %	0 %	116495321
35211	NC_008526	TTTGA	2	10	1851598	1851607	20 %	60 %	20 %	0 %	116495321
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35216	NC_008526	ATT	2	6	1851775	1851780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495321
35217	NC_008526	CAT	2	6	1851822	1851827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495321
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35220	NC_008526	CGC	2	6	1852098	1852103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495321
35221	NC_008526	CTG	2	6	1852197	1852202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495321
35222	NC_008526	CAC	2	6	1852204	1852209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495321
35223	NC_008526	TAT	2	6	1852245	1852250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35224	NC_008526	A	6	6	1852254	1852259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35225	NC_008526	AAC	2	6	1852304	1852309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35226	NC_008526	ACG	2	6	1852337	1852342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35227	NC_008526	ATCA	2	8	1852354	1852361	50 %	25 %	0 %	25 %	116495322
35228	NC_008526	CAT	2	6	1852402	1852407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495322
35229	NC_008526	TCG	2	6	1852482	1852487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495322
35230	NC_008526	TG	3	6	1852554	1852559	0 %	50 %	50 %	0 %	116495322
35231	NC_008526	GGC	2	6	1852614	1852619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495322
35232	NC_008526	TCA	2	6	1852693	1852698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495322
35233	NC_008526	TG	3	6	1852704	1852709	0 %	50 %	50 %	0 %	116495322
35234	NC_008526	CCA	2	6	1852711	1852716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495322
35235	NC_008526	CGG	2	6	1852739	1852744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495322
35236	NC_008526	CTTC	2	8	1852774	1852781	0 %	50 %	0 %	50 %	116495322
35237	NC_008526	CTT	2	6	1852801	1852806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495322
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35239	NC_008526	CG	3	6	1852894	1852899	0 %	0 %	50 %	50 %	116495322
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35341	NC_008526	GCCA	2	8	1858082	1858089	25 %	0 %	25 %	50 %	116495327
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35345	NC_008526	ATAA	2	8	1858166	1858173	75 %	25 %	0 %	0 %	116495328
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35348	NC_008526	CCAG	2	8	1858369	1858376	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35349	NC_008526	GGCT	2	8	1858414	1858421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35350	NC_008526	CCG	2	6	1858457	1858462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495329
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35352	NC_008526	T	6	6	1858548	1858553	0 %	100 %	0 %	0 %	116495329
35353	NC_008526	GCCG	2	8	1858588	1858595	0 %	0 %	50 %	50 %	116495329
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35355	NC_008526	AAT	2	6	1858637	1858642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495329
35356	NC_008526	ATG	2	6	1858673	1858678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495329
35357	NC_008526	AAT	2	6	1858685	1858690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495329
35358	NC_008526	ATC	2	6	1858703	1858708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495329
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35373	NC_008526	T	6	6	1859458	1859463	0 %	100 %	0 %	0 %	116495329
35374	NC_008526	GC	3	6	1859484	1859489	0 %	0 %	50 %	50 %	116495329
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35382	NC_008526	GGC	2	6	1859877	1859882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495330
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35391	NC_008526	TTG	2	6	1860315	1860320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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35424	NC_008526	TAC	2	6	1861988	1861993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35434	NC_008526	A	7	7	1862319	1862325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35448	NC_008526	ACA	2	6	1863028	1863033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495335
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35463	NC_008526	GTT	2	6	1863677	1863682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495336
35464	NC_008526	TTGA	2	8	1863746	1863753	25 %	50 %	25 %	0 %	116495336
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35467	NC_008526	T	7	7	1863782	1863788	0 %	100 %	0 %	0 %	116495336
35468	NC_008526	TGG	2	6	1863836	1863841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495336
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35470	NC_008526	A	6	6	1863895	1863900	100 %	0 %	0 %	0 %	116495336
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35472	NC_008526	CG	3	6	1863968	1863973	0 %	0 %	50 %	50 %	116495336
35473	NC_008526	TTA	2	6	1864114	1864119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35474	NC_008526	T	7	7	1864165	1864171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35475	NC_008526	TTTGC	2	10	1864285	1864294	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35476	NC_008526	TAC	2	6	1864315	1864320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35477	NC_008526	TAG	2	6	1864321	1864326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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