MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_008526	TAT	3	9	1813448	1813456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34502	NC_008526	CAG	2	6	1813475	1813480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34503	NC_008526	GACA	2	8	1813566	1813573	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34504	NC_008526	T	6	6	1813633	1813638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34505	NC_008526	GTT	2	6	1813716	1813721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34506	NC_008526	CAA	2	6	1813748	1813753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34507	NC_008526	GGA	2	6	1813871	1813876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34508	NC_008526	TTA	2	6	1813965	1813970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34509	NC_008526	TGA	2	6	1813988	1813993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34510	NC_008526	ACT	2	6	1814006	1814011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34511	NC_008526	GCT	2	6	1814044	1814049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34512	NC_008526	TTG	2	6	1814069	1814074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34513	NC_008526	AT	3	6	1814123	1814128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34514	NC_008526	CGC	2	6	1814129	1814134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34515	NC_008526	TTA	2	6	1814179	1814184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34516	NC_008526	ATG	2	6	1814200	1814205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34517	NC_008526	TGC	2	6	1814283	1814288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34518	NC_008526	ATT	2	6	1814293	1814298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34519	NC_008526	GTGC	2	8	1814341	1814348	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34520	NC_008526	GGT	2	6	1814391	1814396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34521	NC_008526	CTT	2	6	1814403	1814408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34522	NC_008526	AAG	2	6	1814522	1814527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34523	NC_008526	GAG	2	6	1814539	1814544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34524	NC_008526	GCC	2	6	1814550	1814555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34525	NC_008526	GAT	2	6	1814577	1814582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34526	NC_008526	ATCA	2	8	1814587	1814594	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34527	NC_008526	GTTT	2	8	1814634	1814641	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34528	NC_008526	TTA	2	6	1814667	1814672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34529	NC_008526	CA	3	6	1814706	1814711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34530	NC_008526	GTG	2	6	1814811	1814816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34531	NC_008526	TCA	2	6	1814843	1814848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34532	NC_008526	TCT	2	6	1814891	1814896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34533	NC_008526	ACTCAA	2	12	1814985	1814996	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34534	NC_008526	TGC	2	6	1815078	1815083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34535	NC_008526	ACT	2	6	1815084	1815089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34536	NC_008526	TTG	2	6	1815145	1815150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34537	NC_008526	CTG	2	6	1815182	1815187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34538	NC_008526	T	6	6	1815195	1815200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34539	NC_008526	TGA	2	6	1815246	1815251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34540	NC_008526	GCT	2	6	1815259	1815264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34541	NC_008526	GCT	2	6	1815268	1815273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34542	NC_008526	TCA	2	6	1815295	1815300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34543	NC_008526	ATG	2	6	1815309	1815314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34544	NC_008526	ATCA	2	8	1815320	1815327	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34545	NC_008526	CCA	2	6	1815446	1815451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495294
34546	NC_008526	ATC	2	6	1815479	1815484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495294
34547	NC_008526	TTTG	2	8	1815574	1815581	0 %	75 %	25 %	0 %	116495294
34548	NC_008526	AGC	2	6	1815640	1815645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495294
34549	NC_008526	GCA	2	6	1815740	1815745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495294
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34552	NC_008526	TGGAC	2	10	1815933	1815942	20 %	20 %	40 %	20 %	116495294
34553	NC_008526	TATG	2	8	1816016	1816023	25 %	50 %	25 %	0 %	116495294
34554	NC_008526	ATTG	2	8	1816039	1816046	25 %	50 %	25 %	0 %	116495294
34555	NC_008526	GAT	2	6	1816091	1816096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495294
34556	NC_008526	TAT	3	9	1816121	1816129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495294
34557	NC_008526	CAA	2	6	1816130	1816135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495294
34558	NC_008526	CAA	2	6	1816166	1816171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495294
34559	NC_008526	GCG	2	6	1816223	1816228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495294
34560	NC_008526	ACTG	2	8	1816310	1816317	25 %	25 %	25 %	25 %	116495294
34561	NC_008526	CAAA	2	8	1816322	1816329	75 %	0 %	0 %	25 %	116495294
34562	NC_008526	TTC	2	6	1816518	1816523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495294
34563	NC_008526	TCG	2	6	1816737	1816742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495295
34564	NC_008526	T	6	6	1816795	1816800	0 %	100 %	0 %	0 %	116495295
34565	NC_008526	CAA	2	6	1816843	1816848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495295
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34569	NC_008526	GGGT	2	8	1817123	1817130	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
34570	NC_008526	GCG	2	6	1817147	1817152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495296
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34592	NC_008526	GGC	2	6	1818596	1818601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495296
34593	NC_008526	GTA	2	6	1818689	1818694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495296
34594	NC_008526	AAC	2	6	1818869	1818874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34597	NC_008526	CG	3	6	1818982	1818987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34598	NC_008526	A	6	6	1819007	1819012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34599	NC_008526	CCG	2	6	1819031	1819036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495297
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34602	NC_008526	T	8	8	1819113	1819120	0 %	100 %	0 %	0 %	116495297
34603	NC_008526	AAT	2	6	1819148	1819153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495297
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34605	NC_008526	AAT	2	6	1819172	1819177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495297
34606	NC_008526	T	6	6	1819204	1819209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34607	NC_008526	GCA	2	6	1819235	1819240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495298
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34609	NC_008526	CGC	2	6	1819453	1819458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495298
34610	NC_008526	CA	3	6	1819470	1819475	50 %	0 %	0 %	50 %	116495298
34611	NC_008526	GC	3	6	1819523	1819528	0 %	0 %	50 %	50 %	116495298
34612	NC_008526	CTGC	2	8	1819553	1819560	0 %	25 %	25 %	50 %	116495298
34613	NC_008526	ATG	2	6	1819673	1819678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495298
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34615	NC_008526	GAAATT	2	12	1819729	1819740	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116495298
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34618	NC_008526	T	7	7	1819908	1819914	0 %	100 %	0 %	0 %	116495298
34619	NC_008526	CGT	2	6	1820047	1820052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495298
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34739	NC_008526	TC	3	6	1825813	1825818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34740	NC_008526	ATCTC	2	10	1825849	1825858	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
34741	NC_008526	G	6	6	1825861	1825866	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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34743	NC_008526	CTC	2	6	1825988	1825993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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34986	NC_008526	TGC	2	6	1839858	1839863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495308
34987	NC_008526	CAT	2	6	1839975	1839980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495308
34988	NC_008526	ATG	2	6	1839989	1839994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495308
34989	NC_008526	TGT	2	6	1840073	1840078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495308
34990	NC_008526	AAC	2	6	1840079	1840084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495308
34991	NC_008526	GAA	2	6	1840123	1840128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495308
34992	NC_008526	ATG	2	6	1840151	1840156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495308
34993	NC_008526	CTG	2	6	1840218	1840223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495308
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