MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33502	NC_008526	TCT	2	6	1759241	1759246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495243
33503	NC_008526	GTT	2	6	1759264	1759269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495243
33504	NC_008526	CTT	2	6	1759297	1759302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495243
33505	NC_008526	TCA	2	6	1759401	1759406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495243
33506	NC_008526	GAA	2	6	1759456	1759461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33507	NC_008526	TAA	2	6	1759513	1759518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33508	NC_008526	CA	3	6	1759522	1759527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33509	NC_008526	TG	3	6	1759558	1759563	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33510	NC_008526	AAC	2	6	1759667	1759672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495244
33511	NC_008526	GCA	2	6	1759803	1759808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495244
33512	NC_008526	GCT	2	6	1759911	1759916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495244
33513	NC_008526	TCA	2	6	1759944	1759949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495244
33514	NC_008526	TTC	2	6	1759952	1759957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495244
33515	NC_008526	AAT	2	6	1759973	1759978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495244
33516	NC_008526	CCTTG	2	10	1760019	1760028	0 %	40 %	20 %	40 %	116495244
33517	NC_008526	CAA	2	6	1760073	1760078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495244
33518	NC_008526	CATC	2	8	1760178	1760185	25 %	25 %	0 %	50 %	116495244
33519	NC_008526	GCGAT	2	10	1760222	1760231	20 %	20 %	40 %	20 %	116495244
33520	NC_008526	TTC	2	6	1760324	1760329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495244
33521	NC_008526	GAA	2	6	1760404	1760409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495244
33522	NC_008526	AAT	2	6	1760471	1760476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495244
33523	NC_008526	ATC	2	6	1760482	1760487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495244
33524	NC_008526	ATC	2	6	1760569	1760574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495244
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33526	NC_008526	AATTG	2	10	1760931	1760940	40 %	40 %	20 %	0 %	116495244
33527	NC_008526	TCCA	2	8	1760984	1760991	25 %	25 %	0 %	50 %	116495244
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33531	NC_008526	GCG	2	6	1761124	1761129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495244
33532	NC_008526	CTT	2	6	1761138	1761143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495244
33533	NC_008526	TTCC	2	8	1761172	1761179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33534	NC_008526	AAC	2	6	1761199	1761204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33535	NC_008526	GCTA	2	8	1761230	1761237	25 %	25 %	25 %	25 %	116495245
33536	NC_008526	CTT	2	6	1761254	1761259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495245
33537	NC_008526	TGA	2	6	1761267	1761272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495245
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33540	NC_008526	T	6	6	1761350	1761355	0 %	100 %	0 %	0 %	116495245
33541	NC_008526	TCA	2	6	1761541	1761546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495245
33542	NC_008526	CGA	2	6	1761554	1761559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495245
33543	NC_008526	CAAG	2	8	1761566	1761573	50 %	0 %	25 %	25 %	116495245
33544	NC_008526	CCA	2	6	1761601	1761606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495245
33545	NC_008526	TGT	2	6	1761631	1761636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495245
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33547	NC_008526	ATC	2	6	1761663	1761668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495245
33548	NC_008526	CGATT	2	10	1761711	1761720	20 %	40 %	20 %	20 %	116495245
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33550	NC_008526	CG	3	6	1761914	1761919	0 %	0 %	50 %	50 %	116495245
33551	NC_008526	AAC	2	6	1762075	1762080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495245
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33553	NC_008526	CAAA	2	8	1762102	1762109	75 %	0 %	0 %	25 %	116495245
33554	NC_008526	GCC	2	6	1762278	1762283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495245
33555	NC_008526	GTT	2	6	1762312	1762317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495245
33556	NC_008526	TTG	2	6	1762367	1762372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495245
33557	NC_008526	ATG	2	6	1762396	1762401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495245
33558	NC_008526	GGC	2	6	1762413	1762418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495245
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33561	NC_008526	ATC	2	6	1762606	1762611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33562	NC_008526	TTCG	2	8	1762617	1762624	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33563	NC_008526	ATT	2	6	1762625	1762630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33564	NC_008526	TTTA	2	8	1762646	1762653	25 %	75 %	0 %	0 %	116495246
33565	NC_008526	TGA	2	6	1762687	1762692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495246
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33567	NC_008526	TGA	2	6	1762790	1762795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495246
33568	NC_008526	ATG	2	6	1762867	1762872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495246
33569	NC_008526	ATAA	2	8	1762914	1762921	75 %	25 %	0 %	0 %	116495246
33570	NC_008526	GAC	2	6	1762947	1762952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495246
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33574	NC_008526	AAT	2	6	1763097	1763102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495246
33575	NC_008526	TAAAAG	2	12	1763114	1763125	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116495246
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33582	NC_008526	AAAATC	2	12	1763761	1763772	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116495246
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33585	NC_008526	AAG	2	6	1763887	1763892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33586	NC_008526	ACA	2	6	1763917	1763922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495247
33587	NC_008526	TCA	2	6	1763940	1763945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495247
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33589	NC_008526	GC	3	6	1764076	1764081	0 %	0 %	50 %	50 %	116495247
33590	NC_008526	CAA	2	6	1764430	1764435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33591	NC_008526	TACTCA	2	12	1764476	1764487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495248
33592	NC_008526	TGA	2	6	1764503	1764508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495248
33593	NC_008526	AT	3	6	1764515	1764520	50 %	50 %	0 %	0 %	116495248
33594	NC_008526	TGA	2	6	1764536	1764541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495248
33595	NC_008526	ATA	2	6	1764574	1764579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495248
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33597	NC_008526	TTA	2	6	1764647	1764652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495248
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33599	NC_008526	GCTG	2	8	1764695	1764702	0 %	25 %	50 %	25 %	116495248
33600	NC_008526	CCTGA	2	10	1764703	1764712	20 %	20 %	20 %	40 %	116495248
33601	NC_008526	CGAT	2	8	1764832	1764839	25 %	25 %	25 %	25 %	116495248
33602	NC_008526	ATC	2	6	1764856	1764861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495248
33603	NC_008526	GTT	2	6	1764972	1764977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495248
33604	NC_008526	ACG	2	6	1765048	1765053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495249
33605	NC_008526	CATCCA	2	12	1765191	1765202	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	116495249
33606	NC_008526	AT	3	6	1765253	1765258	50 %	50 %	0 %	0 %	116495249
33607	NC_008526	CTT	2	6	1765266	1765271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495249
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33611	NC_008526	CGTC	2	8	1765400	1765407	0 %	25 %	25 %	50 %	116495249
33612	NC_008526	CTT	2	6	1765539	1765544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495249
33613	NC_008526	TTC	2	6	1765585	1765590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33614	NC_008526	GC	3	6	1765612	1765617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33615	NC_008526	AGCC	2	8	1765667	1765674	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33616	NC_008526	TG	3	6	1765678	1765683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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