MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_008526	TGA	2	6	1734609	1734614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495220
33003	NC_008526	TAT	2	6	1734676	1734681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495220
33004	NC_008526	A	6	6	1734689	1734694	100 %	0 %	0 %	0 %	116495220
33005	NC_008526	ATATGG	2	12	1734746	1734757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495220
33006	NC_008526	GAC	2	6	1734781	1734786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495220
33007	NC_008526	CGA	2	6	1734844	1734849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495220
33008	NC_008526	A	6	6	1734957	1734962	100 %	0 %	0 %	0 %	116495220
33009	NC_008526	TTA	2	6	1735024	1735029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495220
33010	NC_008526	TGA	2	6	1735059	1735064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495220
33011	NC_008526	A	7	7	1735099	1735105	100 %	0 %	0 %	0 %	116495220
33012	NC_008526	AGG	2	6	1735169	1735174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116495220
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33017	NC_008526	GCA	2	6	1735277	1735282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495221
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33019	NC_008526	T	6	6	1735343	1735348	0 %	100 %	0 %	0 %	116495221
33020	NC_008526	CGG	2	6	1735371	1735376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495221
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33033	NC_008526	AATC	2	8	1736147	1736154	50 %	25 %	0 %	25 %	116495221
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33038	NC_008526	TTATC	2	10	1736398	1736407	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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33052	NC_008526	GTA	2	6	1737116	1737121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33106	NC_008526	T	6	6	1739782	1739787	0 %	100 %	0 %	0 %	116495225
33107	NC_008526	TTG	2	6	1739797	1739802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495225
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33110	NC_008526	GT	3	6	1740036	1740041	0 %	50 %	50 %	0 %	116495226
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33122	NC_008526	TGC	2	6	1740903	1740908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495226
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33232	NC_008526	ATC	2	6	1746469	1746474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495231
33233	NC_008526	TGCT	2	8	1746475	1746482	0 %	50 %	25 %	25 %	116495231
33234	NC_008526	GCC	2	6	1746488	1746493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495231
33235	NC_008526	TCAA	2	8	1746515	1746522	50 %	25 %	0 %	25 %	116495231
33236	NC_008526	TTCGT	2	10	1746566	1746575	0 %	60 %	20 %	20 %	116495231
33237	NC_008526	CGC	2	6	1746643	1746648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495231
33238	NC_008526	GC	3	6	1746745	1746750	0 %	0 %	50 %	50 %	116495231
33239	NC_008526	CACC	2	8	1746774	1746781	25 %	0 %	0 %	75 %	116495231
33240	NC_008526	GGT	2	6	1746817	1746822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495231
33241	NC_008526	GAC	2	6	1746883	1746888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495231
33242	NC_008526	TCG	2	6	1746945	1746950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495231
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33244	NC_008526	GTCC	2	8	1746964	1746971	0 %	25 %	25 %	50 %	116495231
33245	NC_008526	TGA	2	6	1746990	1746995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495231
33246	NC_008526	TTG	2	6	1747045	1747050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495231
33247	NC_008526	CAT	2	6	1747065	1747070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495231
33248	NC_008526	TGA	2	6	1747130	1747135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495231
33249	NC_008526	CAA	2	6	1747152	1747157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495231
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33256	NC_008526	GAT	2	6	1747404	1747409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495231
33257	NC_008526	CATC	2	8	1747431	1747438	25 %	25 %	0 %	50 %	116495231
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33259	NC_008526	GCT	2	6	1747487	1747492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495231
33260	NC_008526	CAG	2	6	1747587	1747592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495231
33261	NC_008526	ATG	2	6	1747622	1747627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495231
33262	NC_008526	GTTT	2	8	1747678	1747685	0 %	75 %	25 %	0 %	116495231
33263	NC_008526	CGC	2	6	1747686	1747691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495231
33264	NC_008526	ATTGC	2	10	1747709	1747718	20 %	40 %	20 %	20 %	116495231
33265	NC_008526	CGA	2	6	1747737	1747742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495231
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33268	NC_008526	GAT	2	6	1747896	1747901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495231
33269	NC_008526	ATCA	2	8	1747945	1747952	50 %	25 %	0 %	25 %	116495231
33270	NC_008526	GCTA	2	8	1748059	1748066	25 %	25 %	25 %	25 %	116495231
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33272	NC_008526	CAG	2	6	1748264	1748269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495232
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33298	NC_008526	ATC	2	6	1749609	1749614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495234
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33300	NC_008526	ATC	2	6	1749788	1749793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495234
33301	NC_008526	TTGCC	2	10	1749811	1749820	0 %	40 %	20 %	40 %	116495234
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33303	NC_008526	GTT	2	6	1749834	1749839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495234
33304	NC_008526	TGC	2	6	1749850	1749855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495235
33305	NC_008526	ATC	2	6	1749889	1749894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495235
33306	NC_008526	CATG	2	8	1749951	1749958	25 %	25 %	25 %	25 %	116495235
33307	NC_008526	TCG	2	6	1750004	1750009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495235
33308	NC_008526	GAG	2	6	1750012	1750017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116495235
33309	NC_008526	GCTG	2	8	1750031	1750038	0 %	25 %	50 %	25 %	116495235
33310	NC_008526	CGG	2	6	1750051	1750056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495235
33311	NC_008526	AGT	2	6	1750122	1750127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495235
33312	NC_008526	CCA	2	6	1750164	1750169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495235
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33314	NC_008526	ATC	2	6	1750246	1750251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495235
33315	NC_008526	TCA	2	6	1750374	1750379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495235
33316	NC_008526	TGC	2	6	1750403	1750408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495235
33317	NC_008526	GCG	2	6	1750451	1750456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495235
33318	NC_008526	ATC	2	6	1750462	1750467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495235
33319	NC_008526	CAT	2	6	1750497	1750502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495235
33320	NC_008526	GTC	2	6	1750514	1750519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495235
33321	NC_008526	A	6	6	1750619	1750624	100 %	0 %	0 %	0 %	116495235
33322	NC_008526	TCTTT	2	10	1750626	1750635	0 %	80 %	0 %	20 %	116495235
33323	NC_008526	GGC	2	6	1750774	1750779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495235
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33325	NC_008526	ATG	2	6	1750919	1750924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495235
33326	NC_008526	TTG	2	6	1750929	1750934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495235
33327	NC_008526	ATCA	2	8	1750951	1750958	50 %	25 %	0 %	25 %	116495235
33328	NC_008526	CTTT	2	8	1750975	1750982	0 %	75 %	0 %	25 %	116495236
33329	NC_008526	AAC	2	6	1751065	1751070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495236
33330	NC_008526	GCA	2	6	1751201	1751206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495236
33331	NC_008526	GCG	2	6	1751215	1751220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495236
33332	NC_008526	AGC	2	6	1751238	1751243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495236
33333	NC_008526	GCC	2	6	1751244	1751249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495236
33334	NC_008526	TGC	2	6	1751386	1751391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495236
33335	NC_008526	CTTT	2	8	1751453	1751460	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33336	NC_008526	TAA	2	6	1751531	1751536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33337	NC_008526	TCGT	2	8	1751537	1751544	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33338	NC_008526	TCGCCA	2	12	1751634	1751645	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33339	NC_008526	GCC	2	6	1751652	1751657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33340	NC_008526	A	7	7	1751665	1751671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33341	NC_008526	TCA	2	6	1751696	1751701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33342	NC_008526	GTT	2	6	1751709	1751714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33343	NC_008526	CAA	2	6	1751765	1751770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495237
33344	NC_008526	CAA	4	12	1751801	1751812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495237
33345	NC_008526	CCA	2	6	1751842	1751847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495237
33346	NC_008526	AAC	2	6	1751907	1751912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495237
33347	NC_008526	ATA	3	9	1751953	1751961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495237
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33349	NC_008526	CGC	2	6	1752181	1752186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495237
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33468	NC_008526	TGA	2	6	1757466	1757471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495242
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33494	NC_008526	GAC	2	6	1758739	1758744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495242
33495	NC_008526	TTG	2	6	1758745	1758750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495242
33496	NC_008526	TGA	2	6	1758764	1758769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495242
33497	NC_008526	CAA	2	6	1758780	1758785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495242
33498	NC_008526	ATT	3	9	1759094	1759102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33499	NC_008526	TAA	2	6	1759121	1759126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33500	NC_008526	GA	3	6	1759137	1759142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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