MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_008526	CGC	2	6	1654299	1654304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495139
31502	NC_008526	CAA	2	6	1654377	1654382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495139
31503	NC_008526	CTT	2	6	1654416	1654421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31504	NC_008526	CTTA	2	8	1654425	1654432	25 %	50 %	0 %	25 %	116495140
31505	NC_008526	CAG	2	6	1654461	1654466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495140
31506	NC_008526	TTG	2	6	1654494	1654499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495140
31507	NC_008526	CTG	3	9	1654566	1654574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495140
31508	NC_008526	CGC	2	6	1654578	1654583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495140
31509	NC_008526	CAG	2	6	1654609	1654614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495140
31510	NC_008526	TGCCAA	2	12	1654627	1654638	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116495140
31511	NC_008526	CAA	2	6	1654662	1654667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495140
31512	NC_008526	TCA	2	6	1654668	1654673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495140
31513	NC_008526	CAT	2	6	1654734	1654739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495140
31514	NC_008526	TTC	2	6	1654774	1654779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495140
31515	NC_008526	CTG	2	6	1654902	1654907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495140
31516	NC_008526	AAT	2	6	1654942	1654947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495140
31517	NC_008526	GCC	3	9	1654948	1654956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495140
31518	NC_008526	GCA	2	6	1655030	1655035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495140
31519	NC_008526	CGT	2	6	1655043	1655048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495140
31520	NC_008526	CTT	2	6	1655089	1655094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495140
31521	NC_008526	CTG	2	6	1655098	1655103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495140
31522	NC_008526	ATACCG	2	12	1655177	1655188	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116495140
31523	NC_008526	TGT	2	6	1655208	1655213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495140
31524	NC_008526	GCC	2	6	1655350	1655355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495140
31525	NC_008526	AATT	2	8	1655368	1655375	50 %	50 %	0 %	0 %	116495140
31526	NC_008526	T	6	6	1655374	1655379	0 %	100 %	0 %	0 %	116495140
31527	NC_008526	TCAT	2	8	1655381	1655388	25 %	50 %	0 %	25 %	116495140
31528	NC_008526	TCC	2	6	1655398	1655403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116495141
31529	NC_008526	CGG	2	6	1655410	1655415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495141
31530	NC_008526	CTT	2	6	1655449	1655454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495141
31531	NC_008526	GCA	2	6	1655470	1655475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495141
31532	NC_008526	TCA	2	6	1655502	1655507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495141
31533	NC_008526	ATGA	2	8	1655579	1655586	50 %	25 %	25 %	0 %	116495141
31534	NC_008526	TAA	2	6	1655603	1655608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495141
31535	NC_008526	CAT	2	6	1655617	1655622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495141
31536	NC_008526	CCG	2	6	1655706	1655711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495142
31537	NC_008526	CTG	2	6	1655753	1655758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495142
31538	NC_008526	CCA	2	6	1655767	1655772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495142
31539	NC_008526	CCAA	2	8	1655839	1655846	50 %	0 %	0 %	50 %	116495142
31540	NC_008526	GC	3	6	1655859	1655864	0 %	0 %	50 %	50 %	116495142
31541	NC_008526	CTG	2	6	1655951	1655956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495142
31542	NC_008526	GT	3	6	1655960	1655965	0 %	50 %	50 %	0 %	116495142
31543	NC_008526	ACA	2	6	1656017	1656022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495142
31544	NC_008526	GTT	2	6	1656047	1656052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495142
31545	NC_008526	ATA	2	6	1656069	1656074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495142
31546	NC_008526	TCA	2	6	1656131	1656136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495142
31547	NC_008526	CCA	2	6	1656141	1656146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495142
31548	NC_008526	CG	3	6	1656175	1656180	0 %	0 %	50 %	50 %	116495142
31549	NC_008526	TAT	2	6	1656200	1656205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495142
31550	NC_008526	CCA	2	6	1656214	1656219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495142
31551	NC_008526	AAT	2	6	1656311	1656316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495142
31552	NC_008526	A	7	7	1656396	1656402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31553	NC_008526	TGT	2	6	1656416	1656421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31554	NC_008526	GGC	2	6	1656456	1656461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31555	NC_008526	GTA	2	6	1656471	1656476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31556	NC_008526	T	6	6	1656485	1656490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31557	NC_008526	TCT	2	6	1656524	1656529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495143
31558	NC_008526	AAT	2	6	1656539	1656544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495143
31559	NC_008526	TCT	2	6	1656550	1656555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495143
31560	NC_008526	TGT	2	6	1656560	1656565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495143
31561	NC_008526	GTG	2	6	1656619	1656624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495143
31562	NC_008526	GCAATC	2	12	1656655	1656666	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116495143
31563	NC_008526	GTT	2	6	1656996	1657001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495143
31564	NC_008526	GCA	2	6	1657022	1657027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495143
31565	NC_008526	TGA	2	6	1657098	1657103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495143
31566	NC_008526	ATT	2	6	1657230	1657235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495143
31567	NC_008526	CTT	2	6	1657256	1657261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495143
31568	NC_008526	GCCA	2	8	1657267	1657274	25 %	0 %	25 %	50 %	116495143
31569	NC_008526	CAT	2	6	1657275	1657280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495143
31570	NC_008526	ACCG	2	8	1657335	1657342	25 %	0 %	25 %	50 %	116495143
31571	NC_008526	CAA	3	9	1657469	1657477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495143
31572	NC_008526	CAT	2	6	1657502	1657507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495143
31573	NC_008526	CAG	2	6	1657619	1657624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495143
31574	NC_008526	TCT	2	6	1657667	1657672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495143
31575	NC_008526	ATCG	2	8	1657683	1657690	25 %	25 %	25 %	25 %	116495143
31576	NC_008526	TTG	2	6	1657710	1657715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495143
31577	NC_008526	AAT	2	6	1657740	1657745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495143
31578	NC_008526	GTT	2	6	1657749	1657754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495143
31579	NC_008526	CAGT	2	8	1657963	1657970	25 %	25 %	25 %	25 %	116495143
31580	NC_008526	GCT	2	6	1658101	1658106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495143
31581	NC_008526	TGTC	2	8	1658183	1658190	0 %	50 %	25 %	25 %	116495143
31582	NC_008526	TAG	2	6	1658257	1658262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495143
31583	NC_008526	CTG	2	6	1658340	1658345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495143
31584	NC_008526	ATT	2	6	1658382	1658387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495143
31585	NC_008526	TTG	2	6	1658464	1658469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495143
31586	NC_008526	CAG	2	6	1658483	1658488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495143
31587	NC_008526	CAG	2	6	1658544	1658549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495143
31588	NC_008526	ATA	2	6	1658567	1658572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495143
31589	NC_008526	TGG	2	6	1658776	1658781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31590	NC_008526	GTTG	2	8	1658798	1658805	0 %	50 %	50 %	0 %	116495144
31591	NC_008526	TCG	2	6	1658849	1658854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495144
31592	NC_008526	GT	3	6	1658900	1658905	0 %	50 %	50 %	0 %	116495144
31593	NC_008526	AT	3	6	1658928	1658933	50 %	50 %	0 %	0 %	116495144
31594	NC_008526	TTC	2	6	1658938	1658943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495144
31595	NC_008526	T	6	6	1658984	1658989	0 %	100 %	0 %	0 %	116495144
31596	NC_008526	CTA	2	6	1659036	1659041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495144
31597	NC_008526	GTTGT	2	10	1659067	1659076	0 %	60 %	40 %	0 %	116495144
31598	NC_008526	CAG	2	6	1659080	1659085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495144
31599	NC_008526	CTT	2	6	1659105	1659110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495144
31600	NC_008526	ATG	2	6	1659184	1659189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495144
31601	NC_008526	TGGC	2	8	1659222	1659229	0 %	25 %	50 %	25 %	116495144
31602	NC_008526	TGC	2	6	1659264	1659269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495144
31603	NC_008526	ATT	2	6	1659286	1659291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495144
31604	NC_008526	GGC	2	6	1659316	1659321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495144
31605	NC_008526	TGGC	2	8	1659339	1659346	0 %	25 %	50 %	25 %	116495144
31606	NC_008526	CGC	2	6	1659348	1659353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495144
31607	NC_008526	TCA	2	6	1659359	1659364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495144
31608	NC_008526	GCA	2	6	1659447	1659452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495144
31609	NC_008526	GAT	2	6	1659501	1659506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495144
31610	NC_008526	CGA	2	6	1659572	1659577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495144
31611	NC_008526	CAA	2	6	1659602	1659607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495144
31612	NC_008526	TGC	2	6	1659623	1659628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495144
31613	NC_008526	CTG	2	6	1659946	1659951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495144
31614	NC_008526	CTG	3	9	1660045	1660053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495144
31615	NC_008526	CCG	2	6	1660193	1660198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495144
31616	NC_008526	ACC	2	6	1660261	1660266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495144
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