MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_008526	AAT	2	6	1576971	1576976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495060
30002	NC_008526	AGC	2	6	1577045	1577050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30003	NC_008526	GTC	2	6	1577058	1577063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30004	NC_008526	TTC	2	6	1577135	1577140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495061
30005	NC_008526	T	6	6	1577141	1577146	0 %	100 %	0 %	0 %	116495061
30006	NC_008526	CAA	2	6	1577185	1577190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495061
30007	NC_008526	T	6	6	1577204	1577209	0 %	100 %	0 %	0 %	116495061
30008	NC_008526	ACCG	2	8	1577210	1577217	25 %	0 %	25 %	50 %	116495061
30009	NC_008526	AATCA	2	10	1577237	1577246	60 %	20 %	0 %	20 %	116495061
30010	NC_008526	CGTT	2	8	1577271	1577278	0 %	50 %	25 %	25 %	116495061
30011	NC_008526	ATC	2	6	1577282	1577287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495061
30012	NC_008526	TTC	2	6	1577351	1577356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495061
30013	NC_008526	TGCT	2	8	1577432	1577439	0 %	50 %	25 %	25 %	116495061
30014	NC_008526	ATG	2	6	1577490	1577495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495061
30015	NC_008526	TTA	2	6	1577718	1577723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495061
30016	NC_008526	CAA	2	6	1577876	1577881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495061
30017	NC_008526	CAC	2	6	1577914	1577919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495061
30018	NC_008526	TTC	2	6	1578059	1578064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495061
30019	NC_008526	ACC	2	6	1578191	1578196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495061
30020	NC_008526	CCG	2	6	1578204	1578209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495061
30021	NC_008526	GAT	2	6	1578215	1578220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495061
30022	NC_008526	ATG	2	6	1578333	1578338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495061
30023	NC_008526	TCA	2	6	1578378	1578383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495061
30024	NC_008526	ACA	2	6	1578406	1578411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495061
30025	NC_008526	TTC	2	6	1578467	1578472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495061
30026	NC_008526	TTC	2	6	1578510	1578515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495061
30027	NC_008526	TAAA	2	8	1578520	1578527	75 %	25 %	0 %	0 %	116495061
30028	NC_008526	TTC	2	6	1578557	1578562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495061
30029	NC_008526	CATTTT	2	12	1578590	1578601	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116495061
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30031	NC_008526	CAT	2	6	1578725	1578730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495061
30032	NC_008526	CTT	2	6	1578763	1578768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495061
30033	NC_008526	AAT	2	6	1578941	1578946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495062
30034	NC_008526	ACC	2	6	1578971	1578976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495062
30035	NC_008526	CAA	2	6	1578995	1579000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495062
30036	NC_008526	AGA	2	6	1579039	1579044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495062
30037	NC_008526	GCCA	2	8	1579103	1579110	25 %	0 %	25 %	50 %	116495062
30038	NC_008526	CCG	2	6	1579128	1579133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495062
30039	NC_008526	CTT	2	6	1579252	1579257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495062
30040	NC_008526	ATG	2	6	1579360	1579365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495062
30041	NC_008526	T	6	6	1579369	1579374	0 %	100 %	0 %	0 %	116495062
30042	NC_008526	TGGT	2	8	1579455	1579462	0 %	50 %	50 %	0 %	116495062
30043	NC_008526	A	6	6	1579481	1579486	100 %	0 %	0 %	0 %	116495062
30044	NC_008526	ATA	2	6	1579497	1579502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495062
30045	NC_008526	AAG	2	6	1579521	1579526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495062
30046	NC_008526	TCT	2	6	1579593	1579598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495062
30047	NC_008526	TCT	2	6	1579623	1579628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495062
30048	NC_008526	TCG	2	6	1579636	1579641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495062
30049	NC_008526	CCG	2	6	1579749	1579754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495062
30050	NC_008526	CCTTG	2	10	1579792	1579801	0 %	40 %	20 %	40 %	116495062
30051	NC_008526	TCC	2	6	1579845	1579850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116495062
30052	NC_008526	GCCA	3	12	1579858	1579869	25 %	0 %	25 %	50 %	116495062
30053	NC_008526	AGA	2	6	1580035	1580040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495062
30054	NC_008526	GAT	2	6	1580054	1580059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495062
30055	NC_008526	GCA	2	6	1580105	1580110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495063
30056	NC_008526	CAA	2	6	1580124	1580129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495063
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30058	NC_008526	CAT	2	6	1580265	1580270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495063
30059	NC_008526	GAA	2	6	1580295	1580300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495063
30060	NC_008526	AGAT	2	8	1580305	1580312	50 %	25 %	25 %	0 %	116495063
30061	NC_008526	GGC	2	6	1580313	1580318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495063
30062	NC_008526	TTA	2	6	1580365	1580370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495063
30063	NC_008526	CA	3	6	1580443	1580448	50 %	0 %	0 %	50 %	116495063
30064	NC_008526	AGCAA	2	10	1580452	1580461	60 %	0 %	20 %	20 %	116495063
30065	NC_008526	CAT	2	6	1580483	1580488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495063
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30068	NC_008526	GTC	2	6	1580556	1580561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495063
30069	NC_008526	AT	4	8	1580617	1580624	50 %	50 %	0 %	0 %	116495063
30070	NC_008526	GCAG	2	8	1580647	1580654	25 %	0 %	50 %	25 %	116495063
30071	NC_008526	A	6	6	1580662	1580667	100 %	0 %	0 %	0 %	116495063
30072	NC_008526	AAC	2	6	1580679	1580684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495063
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30078	NC_008526	A	6	6	1580895	1580900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30079	NC_008526	T	7	7	1580912	1580918	0 %	100 %	0 %	0 %	116495064
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30083	NC_008526	TCA	2	6	1581144	1581149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495064
30084	NC_008526	ATC	2	6	1581152	1581157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495064
30085	NC_008526	TGC	2	6	1581200	1581205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495064
30086	NC_008526	TAT	2	6	1581262	1581267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495064
30087	NC_008526	CTTG	2	8	1581294	1581301	0 %	50 %	25 %	25 %	116495064
30088	NC_008526	GTC	2	6	1581320	1581325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495064
30089	NC_008526	A	6	6	1581387	1581392	100 %	0 %	0 %	0 %	116495064
30090	NC_008526	A	6	6	1581554	1581559	100 %	0 %	0 %	0 %	116495064
30091	NC_008526	GCG	2	6	1581560	1581565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495064
30092	NC_008526	ATG	2	6	1581591	1581596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495064
30093	NC_008526	CG	3	6	1581618	1581623	0 %	0 %	50 %	50 %	116495064
30094	NC_008526	CCT	2	6	1581670	1581675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30095	NC_008526	TTA	2	6	1581772	1581777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30098	NC_008526	AAC	2	6	1582004	1582009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30099	NC_008526	GCTGT	2	10	1582029	1582038	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30100	NC_008526	CTGA	2	8	1582171	1582178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30101	NC_008526	TTG	2	6	1582198	1582203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30102	NC_008526	TTTCTT	2	12	1582228	1582239	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	116495065
30103	NC_008526	TCA	2	6	1582275	1582280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495065
30104	NC_008526	GTC	2	6	1582316	1582321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495065
30105	NC_008526	CTT	2	6	1582423	1582428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495065
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30109	NC_008526	TGATT	2	10	1582756	1582765	20 %	60 %	20 %	0 %	116495065
30110	NC_008526	TTG	2	6	1582788	1582793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495066
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30113	NC_008526	GCTG	2	8	1582888	1582895	0 %	25 %	50 %	25 %	116495066
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30118	NC_008526	CGC	2	6	1583316	1583321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495066
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30230	NC_008526	TCC	2	6	1588181	1588186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116495072
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30233	NC_008526	T	7	7	1588253	1588259	0 %	100 %	0 %	0 %	116495072
30234	NC_008526	CAGC	2	8	1588265	1588272	25 %	0 %	25 %	50 %	116495072
30235	NC_008526	TGC	2	6	1588321	1588326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495072
30236	NC_008526	CAT	2	6	1588414	1588419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495072
30237	NC_008526	CCA	2	6	1588437	1588442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495072
30238	NC_008526	TGGC	2	8	1588578	1588585	0 %	25 %	50 %	25 %	116495072
30239	NC_008526	ATG	2	6	1588595	1588600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495072
30240	NC_008526	TCA	2	6	1588619	1588624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495072
30241	NC_008526	TTGGT	2	10	1588666	1588675	0 %	60 %	40 %	0 %	116495072
30242	NC_008526	GGC	2	6	1588739	1588744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495072
30243	NC_008526	CAT	2	6	1588819	1588824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495072
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30248	NC_008526	TGAA	2	8	1589035	1589042	50 %	25 %	25 %	0 %	116495072
30249	NC_008526	CTG	2	6	1589044	1589049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30250	NC_008526	TGG	2	6	1589100	1589105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495073
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30300	NC_008526	GAAT	2	8	1591583	1591590	50 %	25 %	25 %	0 %	116495074
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30315	NC_008526	AGCC	2	8	1592115	1592122	25 %	0 %	25 %	50 %	116495075
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30333	NC_008526	CGTA	2	8	1593220	1593227	25 %	25 %	25 %	25 %	116495075
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30340	NC_008526	AAT	2	6	1593552	1593557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30341	NC_008526	TC	3	6	1593564	1593569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30342	NC_008526	CAT	2	6	1593679	1593684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495076
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30348	NC_008526	TG	3	6	1593865	1593870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30349	NC_008526	CCT	2	6	1593872	1593877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30350	NC_008526	TTC	2	6	1593888	1593893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30472	NC_008526	CGT	2	6	1600148	1600153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30473	NC_008526	TTC	2	6	1600188	1600193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30474	NC_008526	TTAA	2	8	1600197	1600204	50 %	50 %	0 %	0 %	116495087
30475	NC_008526	TTGG	2	8	1600247	1600254	0 %	50 %	50 %	0 %	116495087
30476	NC_008526	GTC	2	6	1600270	1600275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495087
30477	NC_008526	GTT	2	6	1600394	1600399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495087
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30499	NC_008526	TCA	2	6	1601153	1601158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495087
30500	NC_008526	CTT	2	6	1601207	1601212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495088

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