MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29502	NC_008526	ATG	2	6	1552261	1552266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495040
29503	NC_008526	GCC	2	6	1552267	1552272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495040
29504	NC_008526	GAT	2	6	1552317	1552322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495040
29505	NC_008526	CAT	2	6	1552362	1552367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495040
29506	NC_008526	CGA	2	6	1552431	1552436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495040
29507	NC_008526	AAT	2	6	1552466	1552471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495040
29508	NC_008526	CAG	2	6	1552584	1552589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495040
29509	NC_008526	GTC	2	6	1552607	1552612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495040
29510	NC_008526	ACCG	2	8	1552681	1552688	25 %	0 %	25 %	50 %	116495040
29511	NC_008526	TTCA	2	8	1552693	1552700	25 %	50 %	0 %	25 %	116495040
29512	NC_008526	GGT	2	6	1552865	1552870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495040
29513	NC_008526	TAA	2	6	1552876	1552881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495040
29514	NC_008526	AAC	2	6	1552960	1552965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495040
29515	NC_008526	TGA	2	6	1553000	1553005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495040
29516	NC_008526	CAC	3	9	1553011	1553019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495040
29517	NC_008526	TG	3	6	1553093	1553098	0 %	50 %	50 %	0 %	116495040
29518	NC_008526	T	6	6	1553103	1553108	0 %	100 %	0 %	0 %	116495040
29519	NC_008526	ATG	2	6	1553210	1553215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495040
29520	NC_008526	CTG	2	6	1553219	1553224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495040
29521	NC_008526	T	6	6	1553262	1553267	0 %	100 %	0 %	0 %	116495040
29522	NC_008526	CAT	2	6	1553367	1553372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495040
29523	NC_008526	GCA	2	6	1553400	1553405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495040
29524	NC_008526	TGG	2	6	1553422	1553427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495040
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29526	NC_008526	GCT	2	6	1553462	1553467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495040
29527	NC_008526	CTGA	2	8	1553592	1553599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29528	NC_008526	CCGT	2	8	1553662	1553669	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29529	NC_008526	TG	3	6	1553736	1553741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29530	NC_008526	AGG	2	6	1553767	1553772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29531	NC_008526	CAT	2	6	1553776	1553781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495041
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29533	NC_008526	GATC	2	8	1553911	1553918	25 %	25 %	25 %	25 %	116495041
29534	NC_008526	AAG	2	6	1553942	1553947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495041
29535	NC_008526	GAT	2	6	1553978	1553983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495041
29536	NC_008526	GAA	2	6	1554065	1554070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495041
29537	NC_008526	TGA	2	6	1554088	1554093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495041
29538	NC_008526	CGA	2	6	1554133	1554138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495041
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29540	NC_008526	GGA	2	6	1554155	1554160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29541	NC_008526	TAA	2	6	1554205	1554210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29542	NC_008526	AAC	2	6	1554211	1554216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29543	NC_008526	T	7	7	1554238	1554244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29544	NC_008526	A	6	6	1554268	1554273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29545	NC_008526	AGC	2	6	1554384	1554389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29546	NC_008526	CAT	3	9	1554413	1554421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29547	NC_008526	TG	3	6	1554438	1554443	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29548	NC_008526	ATG	2	6	1554447	1554452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29549	NC_008526	AAAG	2	8	1554455	1554462	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29550	NC_008526	GAT	2	6	1554496	1554501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495042
29551	NC_008526	T	7	7	1554501	1554507	0 %	100 %	0 %	0 %	116495042
29552	NC_008526	GCT	2	6	1554520	1554525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495042
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29555	NC_008526	AGAAA	2	10	1554986	1554995	80 %	0 %	20 %	0 %	116495043
29556	NC_008526	TACT	2	8	1555047	1555054	25 %	50 %	0 %	25 %	116495043
29557	NC_008526	CGG	2	6	1555076	1555081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495043
29558	NC_008526	TGA	2	6	1555154	1555159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495043
29559	NC_008526	ACC	2	6	1555171	1555176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495043
29560	NC_008526	A	7	7	1555189	1555195	100 %	0 %	0 %	0 %	116495043
29561	NC_008526	GAA	2	6	1555229	1555234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29562	NC_008526	TCA	2	6	1555302	1555307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495044
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29567	NC_008526	TGC	2	6	1555708	1555713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495044
29568	NC_008526	ATC	2	6	1555721	1555726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495044
29569	NC_008526	GAA	2	6	1555727	1555732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495044
29570	NC_008526	AAT	2	6	1555792	1555797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495044
29571	NC_008526	CGC	2	6	1555813	1555818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495044
29572	NC_008526	T	6	6	1555948	1555953	0 %	100 %	0 %	0 %	116495044
29573	NC_008526	ATG	2	6	1555968	1555973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495044
29574	NC_008526	TCAAG	2	10	1556005	1556014	40 %	20 %	20 %	20 %	116495044
29575	NC_008526	GAC	2	6	1556042	1556047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495044
29576	NC_008526	GCA	2	6	1556056	1556061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495044
29577	NC_008526	CTG	2	6	1556251	1556256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495044
29578	NC_008526	TTGC	2	8	1556402	1556409	0 %	50 %	25 %	25 %	116495044
29579	NC_008526	TCA	2	6	1556416	1556421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495044
29580	NC_008526	CCTT	2	8	1556451	1556458	0 %	50 %	0 %	50 %	116495044
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29582	NC_008526	CTGG	2	8	1556674	1556681	0 %	25 %	50 %	25 %	116495044
29583	NC_008526	GAT	2	6	1556714	1556719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495044
29584	NC_008526	TCA	2	6	1556727	1556732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495044
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29586	NC_008526	GT	3	6	1556860	1556865	0 %	50 %	50 %	0 %	116495044
29587	NC_008526	CACGTT	2	12	1556944	1556955	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116495044
29588	NC_008526	GAT	2	6	1557065	1557070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495044
29589	NC_008526	TCT	2	6	1557108	1557113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495044
29590	NC_008526	TAG	2	6	1557125	1557130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29591	NC_008526	TAT	2	6	1557164	1557169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29592	NC_008526	A	6	6	1557266	1557271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29593	NC_008526	CTTA	2	8	1557297	1557304	25 %	50 %	0 %	25 %	116495045
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29596	NC_008526	TTCAA	2	10	1557539	1557548	40 %	40 %	0 %	20 %	116495045
29597	NC_008526	AGAT	2	8	1557620	1557627	50 %	25 %	25 %	0 %	116495045
29598	NC_008526	GCC	2	6	1557697	1557702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495045
29599	NC_008526	CTG	2	6	1557724	1557729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495045
29600	NC_008526	CAG	2	6	1557759	1557764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495045
29601	NC_008526	CCG	2	6	1557851	1557856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495045
29602	NC_008526	TCA	2	6	1557879	1557884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495045
29603	NC_008526	GCGGA	2	10	1558092	1558101	20 %	0 %	60 %	20 %	116495045
29604	NC_008526	CAC	2	6	1558116	1558121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495045
29605	NC_008526	CCG	2	6	1558181	1558186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495045
29606	NC_008526	ACCAGC	2	12	1558210	1558221	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	116495045
29607	NC_008526	GCC	2	6	1558222	1558227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495045
29608	NC_008526	CAG	2	6	1558245	1558250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495045
29609	NC_008526	GCC	2	6	1558268	1558273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495045
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29611	NC_008526	TCA	2	6	1558403	1558408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495045
29612	NC_008526	ATA	2	6	1558438	1558443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495045
29613	NC_008526	TCC	2	6	1558465	1558470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29614	NC_008526	AGCAT	2	10	1558503	1558512	40 %	20 %	20 %	20 %	116495046
29615	NC_008526	CAAA	2	8	1558517	1558524	75 %	0 %	0 %	25 %	116495046
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29967	NC_008526	CTT	2	6	1575259	1575264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495060
29968	NC_008526	TCGGCA	2	12	1575297	1575308	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116495060
29969	NC_008526	GAT	3	9	1575316	1575324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495060
29970	NC_008526	TTC	2	6	1575372	1575377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495060
29971	NC_008526	GCA	2	6	1575388	1575393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495060
29972	NC_008526	CCA	2	6	1575499	1575504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495060
29973	NC_008526	CTG	2	6	1575524	1575529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495060
29974	NC_008526	TCA	2	6	1575576	1575581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495060
29975	NC_008526	AATT	2	8	1575595	1575602	50 %	50 %	0 %	0 %	116495060
29976	NC_008526	GATC	2	8	1575628	1575635	25 %	25 %	25 %	25 %	116495060
29977	NC_008526	TTC	2	6	1575638	1575643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495060
29978	NC_008526	ATCA	2	8	1575650	1575657	50 %	25 %	0 %	25 %	116495060
29979	NC_008526	CAT	2	6	1575802	1575807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495060
29980	NC_008526	CAT	2	6	1576027	1576032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495060
29981	NC_008526	GC	3	6	1576148	1576153	0 %	0 %	50 %	50 %	116495060
29982	NC_008526	TCT	2	6	1576167	1576172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495060
29983	NC_008526	T	7	7	1576187	1576193	0 %	100 %	0 %	0 %	116495060
29984	NC_008526	AGTC	2	8	1576213	1576220	25 %	25 %	25 %	25 %	116495060
29985	NC_008526	TTG	2	6	1576328	1576333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495060
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29988	NC_008526	TGC	2	6	1576410	1576415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495060
29989	NC_008526	ACT	2	6	1576419	1576424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495060
29990	NC_008526	GCA	2	6	1576428	1576433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495060
29991	NC_008526	TTC	2	6	1576454	1576459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495060
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29993	NC_008526	GCT	2	6	1576494	1576499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495060
29994	NC_008526	TCA	2	6	1576506	1576511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495060
29995	NC_008526	TTC	2	6	1576559	1576564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495060
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29999	NC_008526	GCA	2	6	1576782	1576787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495060
30000	NC_008526	GCC	2	6	1576950	1576955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495060

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