MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_008526	ATA	2	6	1525515	1525520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495009
29003	NC_008526	CAG	2	6	1525542	1525547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495009
29004	NC_008526	GTC	2	6	1525683	1525688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495009
29005	NC_008526	A	6	6	1525690	1525695	100 %	0 %	0 %	0 %	116495009
29006	NC_008526	GC	3	6	1525720	1525725	0 %	0 %	50 %	50 %	116495009
29007	NC_008526	TTC	2	6	1525735	1525740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495009
29008	NC_008526	CCGG	2	8	1525748	1525755	0 %	0 %	50 %	50 %	116495009
29009	NC_008526	TGG	2	6	1525824	1525829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495009
29010	NC_008526	AACTTC	2	12	1525863	1525874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495009
29011	NC_008526	T	6	6	1525921	1525926	0 %	100 %	0 %	0 %	116495009
29012	NC_008526	TTC	2	6	1525998	1526003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495009
29013	NC_008526	AGA	2	6	1526006	1526011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495009
29014	NC_008526	CTT	2	6	1526102	1526107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495009
29015	NC_008526	CGG	2	6	1526120	1526125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495009
29016	NC_008526	ATTTT	2	10	1526158	1526167	20 %	80 %	0 %	0 %	116495009
29017	NC_008526	TGCT	2	8	1526227	1526234	0 %	50 %	25 %	25 %	116495010
29018	NC_008526	TTTGA	2	10	1526254	1526263	20 %	60 %	20 %	0 %	116495010
29019	NC_008526	TTG	2	6	1526321	1526326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495010
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29027	NC_008526	ACGA	2	8	1527181	1527188	50 %	0 %	25 %	25 %	116495010
29028	NC_008526	CAG	2	6	1527192	1527197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495010
29029	NC_008526	CAT	2	6	1527217	1527222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495010
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29032	NC_008526	AGT	2	6	1527547	1527552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29033	NC_008526	ACT	2	6	1527569	1527574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29034	NC_008526	A	7	7	1527624	1527630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29035	NC_008526	ACC	2	6	1527667	1527672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29036	NC_008526	T	7	7	1527676	1527682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29037	NC_008526	CAA	2	6	1527876	1527881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29038	NC_008526	A	6	6	1527916	1527921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29039	NC_008526	ATTA	2	8	1528039	1528046	50 %	50 %	0 %	0 %	116495011
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29045	NC_008526	CATT	2	8	1528242	1528249	25 %	50 %	0 %	25 %	116495011
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29052	NC_008526	TTA	2	6	1528636	1528641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495012
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29055	NC_008526	CGC	2	6	1528799	1528804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495012
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29079	NC_008526	GC	3	6	1530169	1530174	0 %	0 %	50 %	50 %	116495014
29080	NC_008526	TAA	3	9	1530258	1530266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495014
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29086	NC_008526	ATT	2	6	1530643	1530648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29087	NC_008526	CAA	2	6	1530669	1530674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29088	NC_008526	CGA	2	6	1530690	1530695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29089	NC_008526	CAC	2	6	1530697	1530702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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29091	NC_008526	TCG	2	6	1530802	1530807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495015
29092	NC_008526	CAG	2	6	1530863	1530868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495015
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29102	NC_008526	ATC	2	6	1531149	1531154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495015
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29116	NC_008526	GCA	2	6	1531880	1531885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495015
29117	NC_008526	CGT	2	6	1531920	1531925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495015
29118	NC_008526	GTC	2	6	1531932	1531937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495015
29119	NC_008526	GC	3	6	1531985	1531990	0 %	0 %	50 %	50 %	116495015
29120	NC_008526	ACA	2	6	1532023	1532028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495015
29121	NC_008526	GCAA	2	8	1532030	1532037	50 %	0 %	25 %	25 %	116495015
29122	NC_008526	ATT	2	6	1532060	1532065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495015
29123	NC_008526	CAG	2	6	1532137	1532142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495015
29124	NC_008526	TTG	2	6	1532180	1532185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495015
29125	NC_008526	CAT	2	6	1532219	1532224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495015
29126	NC_008526	TCT	2	6	1532267	1532272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495016
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29128	NC_008526	GT	3	6	1532403	1532408	0 %	50 %	50 %	0 %	116495016
29129	NC_008526	AAT	2	6	1532486	1532491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495016
29130	NC_008526	ACTG	2	8	1532493	1532500	25 %	25 %	25 %	25 %	116495016
29131	NC_008526	AAT	2	6	1532521	1532526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495016
29132	NC_008526	ATG	2	6	1532537	1532542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495016
29133	NC_008526	TCA	2	6	1532621	1532626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495016
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29135	NC_008526	GCA	2	6	1532733	1532738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495016
29136	NC_008526	GAG	2	6	1532775	1532780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116495016
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29139	NC_008526	T	6	6	1532880	1532885	0 %	100 %	0 %	0 %	116495016
29140	NC_008526	CAT	2	6	1532907	1532912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495016
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29143	NC_008526	TAA	2	6	1533129	1533134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29144	NC_008526	ATCA	2	8	1533146	1533153	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29145	NC_008526	AAT	2	6	1533236	1533241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29146	NC_008526	GCA	2	6	1533284	1533289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29147	NC_008526	CTA	2	6	1533318	1533323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29148	NC_008526	AGC	2	6	1533365	1533370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495017
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29152	NC_008526	ATC	2	6	1533493	1533498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495017
29153	NC_008526	T	6	6	1533614	1533619	0 %	100 %	0 %	0 %	116495017
29154	NC_008526	ATG	2	6	1533739	1533744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495017
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29156	NC_008526	TCCGA	2	10	1533786	1533795	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29157	NC_008526	GAA	2	6	1533834	1533839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495018
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29172	NC_008526	TGG	2	6	1534844	1534849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495019
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29176	NC_008526	GCA	2	6	1535089	1535094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495019
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29189	NC_008526	CG	3	6	1535698	1535703	0 %	0 %	50 %	50 %	116495019
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29204	NC_008526	T	6	6	1536173	1536178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29205	NC_008526	ATA	2	6	1536186	1536191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29206	NC_008526	AAT	2	6	1536206	1536211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495020
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29218	NC_008526	GTT	2	6	1536692	1536697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495020
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29220	NC_008526	TGTC	2	8	1536732	1536739	0 %	50 %	25 %	25 %	116495020
29221	NC_008526	TCA	2	6	1536759	1536764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495020
29222	NC_008526	CAT	2	6	1536820	1536825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495020
29223	NC_008526	CAG	2	6	1536977	1536982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495021
29224	NC_008526	T	6	6	1537124	1537129	0 %	100 %	0 %	0 %	116495021
29225	NC_008526	AAT	2	6	1537136	1537141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495021
29226	NC_008526	GC	3	6	1537261	1537266	0 %	0 %	50 %	50 %	116495021
29227	NC_008526	A	7	7	1537302	1537308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29228	NC_008526	GCT	2	6	1537309	1537314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29229	NC_008526	ACC	2	6	1537340	1537345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29230	NC_008526	GC	3	6	1537399	1537404	0 %	0 %	50 %	50 %	116495022
29231	NC_008526	CATC	2	8	1537439	1537446	25 %	25 %	0 %	50 %	116495022
29232	NC_008526	TGT	2	6	1537529	1537534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495022
29233	NC_008526	GCT	2	6	1537628	1537633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495022
29234	NC_008526	CTT	2	6	1537640	1537645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495022
29235	NC_008526	ATCA	2	8	1537662	1537669	50 %	25 %	0 %	25 %	116495022
29236	NC_008526	CCGG	2	8	1537671	1537678	0 %	0 %	50 %	50 %	116495022
29237	NC_008526	GCT	2	6	1537856	1537861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495022
29238	NC_008526	CGT	2	6	1537881	1537886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495022
29239	NC_008526	CTT	2	6	1537916	1537921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495022
29240	NC_008526	TCA	2	6	1538018	1538023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495022
29241	NC_008526	TCA	2	6	1538026	1538031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495022
29242	NC_008526	GTGAA	2	10	1538204	1538213	40 %	20 %	40 %	0 %	116495022
29243	NC_008526	TG	3	6	1538352	1538357	0 %	50 %	50 %	0 %	116495022
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29257	NC_008526	CGA	2	6	1539533	1539538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495022
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29259	NC_008526	CCT	2	6	1539625	1539630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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29261	NC_008526	CGC	2	6	1539720	1539725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29262	NC_008526	GC	3	6	1539754	1539759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29263	NC_008526	AC	3	6	1539770	1539775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29264	NC_008526	A	7	7	1539930	1539936	100 %	0 %	0 %	0 %	116495023
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29342	NC_008526	T	6	6	1543643	1543648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29343	NC_008526	TCATAA	2	12	1543851	1543862	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116495029
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29349	NC_008526	AAT	2	6	1544256	1544261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29355	NC_008526	ACC	2	6	1544493	1544498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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29474	NC_008526	TCA	2	6	1550441	1550446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29475	NC_008526	CATG	2	8	1550530	1550537	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29476	NC_008526	GCT	2	6	1550599	1550604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29477	NC_008526	TCAA	2	8	1550763	1550770	50 %	25 %	0 %	25 %	116495039
29478	NC_008526	GCC	2	6	1550792	1550797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495039
29479	NC_008526	AGC	2	6	1550822	1550827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495039
29480	NC_008526	GCC	2	6	1550834	1550839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495039
29481	NC_008526	TCG	2	6	1550853	1550858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495039
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29486	NC_008526	GCA	2	6	1551105	1551110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495039
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29490	NC_008526	A	6	6	1551409	1551414	100 %	0 %	0 %	0 %	116495040
29491	NC_008526	GCA	2	6	1551629	1551634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495040
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29494	NC_008526	A	6	6	1551751	1551756	100 %	0 %	0 %	0 %	116495040
29495	NC_008526	GGCT	2	8	1551768	1551775	0 %	25 %	50 %	25 %	116495040
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