MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_008526	T	7	7	1499947	1499953	0 %	100 %	0 %	0 %	116494984
28503	NC_008526	GCC	2	6	1499974	1499979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494984
28504	NC_008526	TGGC	2	8	1500185	1500192	0 %	25 %	50 %	25 %	116494984
28505	NC_008526	TCA	2	6	1500211	1500216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494984
28506	NC_008526	GACG	2	8	1500292	1500299	25 %	0 %	50 %	25 %	116494984
28507	NC_008526	TGC	2	6	1500396	1500401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494984
28508	NC_008526	A	6	6	1500420	1500425	100 %	0 %	0 %	0 %	116494984
28509	NC_008526	GCCT	2	8	1500458	1500465	0 %	25 %	25 %	50 %	116494984
28510	NC_008526	AGTT	2	8	1500575	1500582	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28511	NC_008526	ATG	2	6	1500663	1500668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28512	NC_008526	GCC	2	6	1500681	1500686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28513	NC_008526	TCGC	2	8	1500814	1500821	0 %	25 %	25 %	50 %	116494985
28514	NC_008526	CAT	2	6	1500870	1500875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494985
28515	NC_008526	TTC	2	6	1500904	1500909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494985
28516	NC_008526	TGG	2	6	1500984	1500989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494985
28517	NC_008526	ATC	2	6	1501024	1501029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494985
28518	NC_008526	TTC	2	6	1501126	1501131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494985
28519	NC_008526	CCA	2	6	1501270	1501275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494985
28520	NC_008526	TCA	2	6	1501332	1501337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494985
28521	NC_008526	AAC	2	6	1501408	1501413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494985
28522	NC_008526	CTT	2	6	1501449	1501454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494985
28523	NC_008526	CAAGG	2	10	1501474	1501483	40 %	0 %	40 %	20 %	116494985
28524	NC_008526	CTT	2	6	1501488	1501493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494985
28525	NC_008526	CTT	2	6	1501594	1501599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494985
28526	NC_008526	CTT	2	6	1501606	1501611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494985
28527	NC_008526	CTT	2	6	1501615	1501620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494985
28528	NC_008526	GCT	2	6	1501631	1501636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494985
28529	NC_008526	TCA	2	6	1501649	1501654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494985
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28531	NC_008526	GGTCA	2	10	1501741	1501750	20 %	20 %	40 %	20 %	116494985
28532	NC_008526	TCT	3	9	1501767	1501775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494985
28533	NC_008526	TCG	2	6	1501805	1501810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494985
28534	NC_008526	TGC	2	6	1501842	1501847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494985
28535	NC_008526	TCT	2	6	1501857	1501862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494985
28536	NC_008526	GGT	2	6	1501882	1501887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494985
28537	NC_008526	T	6	6	1501889	1501894	0 %	100 %	0 %	0 %	116494985
28538	NC_008526	GCC	3	9	1501895	1501903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494985
28539	NC_008526	TGC	2	6	1501933	1501938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494985
28540	NC_008526	TCT	2	6	1501953	1501958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494985
28541	NC_008526	T	7	7	1501986	1501992	0 %	100 %	0 %	0 %	116494985
28542	NC_008526	TCC	2	6	1502008	1502013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28543	NC_008526	TTG	3	9	1502021	1502029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494986
28544	NC_008526	GCC	2	6	1502226	1502231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494986
28545	NC_008526	GCT	2	6	1502287	1502292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494986
28546	NC_008526	T	6	6	1502361	1502366	0 %	100 %	0 %	0 %	116494986
28547	NC_008526	ATC	2	6	1502384	1502389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494986
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28549	NC_008526	CGA	2	6	1502489	1502494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494986
28550	NC_008526	TGT	2	6	1502496	1502501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494986
28551	NC_008526	TGC	2	6	1502511	1502516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494986
28552	NC_008526	CG	3	6	1502680	1502685	0 %	0 %	50 %	50 %	116494986
28553	NC_008526	CAC	2	6	1502752	1502757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494986
28554	NC_008526	TCA	2	6	1502772	1502777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494986
28555	NC_008526	ATCC	2	8	1502780	1502787	25 %	25 %	0 %	50 %	116494986
28556	NC_008526	GAT	2	6	1502824	1502829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494986
28557	NC_008526	TCA	2	6	1502874	1502879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494986
28558	NC_008526	AC	3	6	1502888	1502893	50 %	0 %	0 %	50 %	116494986
28559	NC_008526	GCTT	2	8	1502902	1502909	0 %	50 %	25 %	25 %	116494986
28560	NC_008526	ATG	2	6	1502919	1502924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494986
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28570	NC_008526	TCA	2	6	1503421	1503426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494986
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28573	NC_008526	TGC	2	6	1503497	1503502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494986
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28577	NC_008526	ATG	2	6	1503664	1503669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494986
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28579	NC_008526	AC	3	6	1503873	1503878	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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28584	NC_008526	CTT	2	6	1504187	1504192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494987
28585	NC_008526	CAT	2	6	1504210	1504215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494987
28586	NC_008526	CTG	2	6	1504271	1504276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494987
28587	NC_008526	CTT	2	6	1504277	1504282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494987
28588	NC_008526	AC	3	6	1504294	1504299	50 %	0 %	0 %	50 %	116494987
28589	NC_008526	GCA	2	6	1504362	1504367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494987
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28593	NC_008526	CTG	2	6	1504525	1504530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494987
28594	NC_008526	TCG	2	6	1504549	1504554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494987
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28597	NC_008526	CGAAT	2	10	1504688	1504697	40 %	20 %	20 %	20 %	116494987
28598	NC_008526	ATA	2	6	1504833	1504838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494987
28599	NC_008526	ACCA	2	8	1504859	1504866	50 %	0 %	0 %	50 %	116494987
28600	NC_008526	GCT	2	6	1504899	1504904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494987
28601	NC_008526	CAA	2	6	1504952	1504957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494987
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28604	NC_008526	CG	3	6	1505100	1505105	0 %	0 %	50 %	50 %	116494987
28605	NC_008526	TCA	2	6	1505277	1505282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494987
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28607	NC_008526	ATT	2	6	1505318	1505323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494987
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28609	NC_008526	TTGC	2	8	1505405	1505412	0 %	50 %	25 %	25 %	116494987
28610	NC_008526	GC	3	6	1505411	1505416	0 %	0 %	50 %	50 %	116494987
28611	NC_008526	CAA	2	6	1505425	1505430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494987
28612	NC_008526	CAT	2	6	1505560	1505565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494987
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28951	NC_008526	TTTTGA	2	12	1522691	1522702	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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28977	NC_008526	GTC	2	6	1524146	1524151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495008
28978	NC_008526	GCT	2	6	1524180	1524185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495008
28979	NC_008526	TGGC	2	8	1524329	1524336	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28980	NC_008526	T	6	6	1524338	1524343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28981	NC_008526	TCG	2	6	1524370	1524375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495009
28982	NC_008526	TTC	2	6	1524490	1524495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495009
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28988	NC_008526	TCT	2	6	1524787	1524792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495009
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28991	NC_008526	ACC	2	6	1524958	1524963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495009
28992	NC_008526	CAA	2	6	1524977	1524982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495009
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