MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27001	NC_008526	GCT	2	6	1417443	1417448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494912
27002	NC_008526	CGGA	2	8	1417482	1417489	25 %	0 %	50 %	25 %	116494912
27003	NC_008526	TCA	2	6	1417656	1417661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494912
27004	NC_008526	TGG	2	6	1417679	1417684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494912
27005	NC_008526	TCAG	2	8	1417710	1417717	25 %	25 %	25 %	25 %	116494912
27006	NC_008526	ATT	2	6	1417739	1417744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494912
27007	NC_008526	CAAAGC	2	12	1417752	1417763	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116494912
27008	NC_008526	GAGC	2	8	1417789	1417796	25 %	0 %	50 %	25 %	116494912
27009	NC_008526	GTC	2	6	1417818	1417823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494912
27010	NC_008526	AAC	2	6	1417841	1417846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494912
27011	NC_008526	A	6	6	1417926	1417931	100 %	0 %	0 %	0 %	116494912
27012	NC_008526	TCC	2	6	1418238	1418243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27013	NC_008526	CTT	2	6	1418353	1418358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494913
27014	NC_008526	GGC	2	6	1418443	1418448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494913
27015	NC_008526	ATC	2	6	1418470	1418475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494913
27016	NC_008526	GGC	2	6	1418485	1418490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494913
27017	NC_008526	TTC	2	6	1418509	1418514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494913
27018	NC_008526	T	7	7	1418521	1418527	0 %	100 %	0 %	0 %	116494913
27019	NC_008526	TGA	2	6	1418601	1418606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494913
27020	NC_008526	CTTTG	2	10	1418627	1418636	0 %	60 %	20 %	20 %	116494913
27021	NC_008526	CCTTC	2	10	1418654	1418663	0 %	40 %	0 %	60 %	116494914
27022	NC_008526	CCGG	2	8	1418713	1418720	0 %	0 %	50 %	50 %	116494914
27023	NC_008526	TGG	2	6	1418792	1418797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494914
27024	NC_008526	TGG	2	6	1418909	1418914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494914
27025	NC_008526	ATC	2	6	1418971	1418976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494914
27026	NC_008526	TGC	2	6	1419050	1419055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494915
27027	NC_008526	AGCC	2	8	1419058	1419065	25 %	0 %	25 %	50 %	116494915
27028	NC_008526	AAC	2	6	1419084	1419089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494915
27029	NC_008526	CTG	2	6	1419100	1419105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494915
27030	NC_008526	GCC	2	6	1419116	1419121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494915
27031	NC_008526	CGG	2	6	1419145	1419150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494915
27032	NC_008526	GTT	2	6	1419157	1419162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494915
27033	NC_008526	CATC	2	8	1419202	1419209	25 %	25 %	0 %	50 %	116494915
27034	NC_008526	CAA	2	6	1419352	1419357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494915
27035	NC_008526	CAA	2	6	1419452	1419457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494915
27036	NC_008526	CG	3	6	1419553	1419558	0 %	0 %	50 %	50 %	116494915
27037	NC_008526	AAG	2	6	1419582	1419587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494915
27038	NC_008526	T	6	6	1419674	1419679	0 %	100 %	0 %	0 %	116494915
27039	NC_008526	TTTG	2	8	1419743	1419750	0 %	75 %	25 %	0 %	116494916
27040	NC_008526	GAT	2	6	1419792	1419797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494916
27041	NC_008526	GCT	2	6	1419799	1419804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494916
27042	NC_008526	GCC	2	6	1419852	1419857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494916
27043	NC_008526	GAT	2	6	1419864	1419869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494916
27044	NC_008526	CAT	2	6	1419927	1419932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494916
27045	NC_008526	CGC	2	6	1419971	1419976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494916
27046	NC_008526	GTT	2	6	1419977	1419982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494916
27047	NC_008526	CTG	2	6	1420011	1420016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494916
27048	NC_008526	TGG	2	6	1420019	1420024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494916
27049	NC_008526	AACC	2	8	1420027	1420034	50 %	0 %	0 %	50 %	116494916
27050	NC_008526	GCC	2	6	1420206	1420211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494916
27051	NC_008526	AATC	2	8	1420424	1420431	50 %	25 %	0 %	25 %	116494916
27052	NC_008526	T	6	6	1420500	1420505	0 %	100 %	0 %	0 %	116494917
27053	NC_008526	ATT	2	6	1420531	1420536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494917
27054	NC_008526	CGA	2	6	1420538	1420543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494917
27055	NC_008526	GTT	2	6	1420601	1420606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494917
27056	NC_008526	GCA	2	6	1420652	1420657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494917
27057	NC_008526	AGTC	2	8	1420719	1420726	25 %	25 %	25 %	25 %	116494917
27058	NC_008526	CAA	2	6	1420825	1420830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494917
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27060	NC_008526	AGC	2	6	1420939	1420944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494917
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27062	NC_008526	T	6	6	1421002	1421007	0 %	100 %	0 %	0 %	116494917
27063	NC_008526	CAA	2	6	1421037	1421042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494917
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27066	NC_008526	GAA	2	6	1421224	1421229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494918
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27069	NC_008526	CG	3	6	1421299	1421304	0 %	0 %	50 %	50 %	116494918
27070	NC_008526	TGGTG	2	10	1421439	1421448	0 %	40 %	60 %	0 %	116494918
27071	NC_008526	A	7	7	1421530	1421536	100 %	0 %	0 %	0 %	116494918
27072	NC_008526	GTT	2	6	1421597	1421602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494918
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27076	NC_008526	TGAA	2	8	1421762	1421769	50 %	25 %	25 %	0 %	116494919
27077	NC_008526	GTG	2	6	1421802	1421807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494919
27078	NC_008526	ACCG	2	8	1421866	1421873	25 %	0 %	25 %	50 %	116494919
27079	NC_008526	CAG	2	6	1421877	1421882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494919
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27082	NC_008526	CG	3	6	1422050	1422055	0 %	0 %	50 %	50 %	116494919
27083	NC_008526	CAT	2	6	1422136	1422141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494919
27084	NC_008526	CG	4	8	1422142	1422149	0 %	0 %	50 %	50 %	116494919
27085	NC_008526	AATCG	2	10	1422191	1422200	40 %	20 %	20 %	20 %	116494919
27086	NC_008526	CGG	2	6	1422204	1422209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494919
27087	NC_008526	TCG	2	6	1422212	1422217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494919
27088	NC_008526	ATG	2	6	1422221	1422226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494919
27089	NC_008526	AGC	2	6	1422361	1422366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494919
27090	NC_008526	AT	3	6	1422391	1422396	50 %	50 %	0 %	0 %	116494919
27091	NC_008526	GCT	2	6	1422422	1422427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494919
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27099	NC_008526	TGA	2	6	1422647	1422652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494919
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27101	NC_008526	GAT	2	6	1422826	1422831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494919
27102	NC_008526	CGG	2	6	1422870	1422875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494919
27103	NC_008526	TTG	2	6	1422892	1422897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494919
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27106	NC_008526	AGTG	2	8	1423128	1423135	25 %	25 %	50 %	0 %	116494920
27107	NC_008526	TGA	2	6	1423163	1423168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494920
27108	NC_008526	TGT	2	6	1423201	1423206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494920
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27111	NC_008526	ATCA	2	8	1423589	1423596	50 %	25 %	0 %	25 %	116494921
27112	NC_008526	GTG	2	6	1423671	1423676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494921
27113	NC_008526	GCT	2	6	1423686	1423691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494921
27114	NC_008526	CAA	2	6	1423802	1423807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494921
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27116	NC_008526	CCG	2	6	1423845	1423850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494921
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27139	NC_008526	ACC	2	6	1424862	1424867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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27144	NC_008526	CT	3	6	1425044	1425049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27145	NC_008526	GATCAG	2	12	1425053	1425064	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27146	NC_008526	TGTT	2	8	1425090	1425097	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27147	NC_008526	ATA	2	6	1425110	1425115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27152	NC_008526	ATG	2	6	1425207	1425212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27154	NC_008526	ATT	3	9	1425236	1425244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27231	NC_008526	CAA	2	6	1429868	1429873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494925
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27233	NC_008526	TGGG	2	8	1429941	1429948	0 %	25 %	75 %	0 %	116494925
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27236	NC_008526	GCC	2	6	1430097	1430102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494925
27237	NC_008526	AT	3	6	1430368	1430373	50 %	50 %	0 %	0 %	116494926
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27240	NC_008526	GAA	2	6	1430496	1430501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494926
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27243	NC_008526	A	6	6	1430654	1430659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27332	NC_008526	TCC	2	6	1435236	1435241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27333	NC_008526	CTGGAT	2	12	1435398	1435409	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116494931
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27347	NC_008526	GAC	2	6	1436043	1436048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494931
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27350	NC_008526	GTC	2	6	1436102	1436107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494931
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27467	NC_008526	GCCAAA	2	12	1442486	1442497	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116494937
27468	NC_008526	CCT	2	6	1442564	1442569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27469	NC_008526	GCT	2	6	1442579	1442584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27470	NC_008526	AGC	2	6	1442635	1442640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27471	NC_008526	TAA	2	6	1442643	1442648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27472	NC_008526	A	6	6	1442691	1442696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27473	NC_008526	TCA	2	6	1442795	1442800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494938
27474	NC_008526	CTT	2	6	1442856	1442861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494938
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27490	NC_008526	GTA	2	6	1444352	1444357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494938
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27498	NC_008526	T	7	7	1444877	1444883	0 %	100 %	0 %	0 %	116494938
27499	NC_008526	GTA	2	6	1445016	1445021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494938
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