MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_008526	GTC	2	6	1362102	1362107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494859
26003	NC_008526	GTT	2	6	1362162	1362167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494859
26004	NC_008526	TTG	2	6	1362192	1362197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494859
26005	NC_008526	TTAA	2	8	1362357	1362364	50 %	50 %	0 %	0 %	116494859
26006	NC_008526	TTC	2	6	1362387	1362392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494859
26007	NC_008526	ATCA	2	8	1362460	1362467	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26008	NC_008526	A	6	6	1362471	1362476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26009	NC_008526	CGA	2	6	1362536	1362541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26010	NC_008526	GC	3	6	1362616	1362621	0 %	0 %	50 %	50 %	116494860
26011	NC_008526	TAA	2	6	1362740	1362745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494860
26012	NC_008526	GCAA	2	8	1362802	1362809	50 %	0 %	25 %	25 %	116494860
26013	NC_008526	AGC	2	6	1362946	1362951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494861
26014	NC_008526	CGC	2	6	1363013	1363018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494861
26015	NC_008526	CAA	2	6	1363029	1363034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494861
26016	NC_008526	AAG	2	6	1363069	1363074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494861
26017	NC_008526	ACG	2	6	1363092	1363097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494861
26018	NC_008526	TGC	2	6	1363114	1363119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494861
26019	NC_008526	TGAAAC	2	12	1363121	1363132	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116494861
26020	NC_008526	GCA	2	6	1363157	1363162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494861
26021	NC_008526	CAAG	2	8	1363166	1363173	50 %	0 %	25 %	25 %	116494861
26022	NC_008526	CAG	2	6	1363174	1363179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494861
26023	NC_008526	TTC	2	6	1363245	1363250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494861
26024	NC_008526	CAG	2	6	1363350	1363355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494861
26025	NC_008526	ATC	2	6	1363360	1363365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494861
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26028	NC_008526	GCA	2	6	1363601	1363606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494861
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26031	NC_008526	ATC	2	6	1363789	1363794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494861
26032	NC_008526	TTG	2	6	1363800	1363805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494861
26033	NC_008526	T	7	7	1363826	1363832	0 %	100 %	0 %	0 %	116494861
26034	NC_008526	CAA	2	6	1363903	1363908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494862
26035	NC_008526	TGGA	2	8	1363964	1363971	25 %	25 %	50 %	0 %	116494862
26036	NC_008526	TTG	2	6	1364060	1364065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494862
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26042	NC_008526	GGT	2	6	1364556	1364561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494862
26043	NC_008526	TGC	2	6	1364637	1364642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494862
26044	NC_008526	CGA	2	6	1364729	1364734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494862
26045	NC_008526	TCG	2	6	1364774	1364779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494862
26046	NC_008526	TTA	2	6	1364811	1364816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494862
26047	NC_008526	GCCG	2	8	1364833	1364840	0 %	0 %	50 %	50 %	116494862
26048	NC_008526	GCG	2	6	1364860	1364865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494862
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26050	NC_008526	GCA	3	9	1365039	1365047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494862
26051	NC_008526	GGC	2	6	1365093	1365098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494862
26052	NC_008526	CGT	2	6	1365121	1365126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494862
26053	NC_008526	CTG	2	6	1365133	1365138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494862
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26058	NC_008526	AGT	2	6	1365328	1365333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26062	NC_008526	A	7	7	1365485	1365491	100 %	0 %	0 %	0 %	116494863
26063	NC_008526	ATT	2	6	1365557	1365562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494863
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26069	NC_008526	GT	3	6	1366014	1366019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26070	NC_008526	GGA	2	6	1366023	1366028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26071	NC_008526	CGGCC	2	10	1366050	1366059	0 %	0 %	40 %	60 %	116494864
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26085	NC_008526	T	6	6	1366777	1366782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26086	NC_008526	ATA	2	6	1366793	1366798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494865
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26102	NC_008526	CCGG	2	8	1367641	1367648	0 %	0 %	50 %	50 %	116494865
26103	NC_008526	TTG	2	6	1367696	1367701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494865
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26105	NC_008526	AAGG	2	8	1367782	1367789	50 %	0 %	50 %	0 %	116494865
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26467	NC_008526	GGT	2	6	1387941	1387946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494887
26468	NC_008526	CGACT	2	10	1387985	1387994	20 %	20 %	20 %	40 %	116494887
26469	NC_008526	TGC	2	6	1388060	1388065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494887
26470	NC_008526	TTG	2	6	1388215	1388220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494887
26471	NC_008526	ATT	2	6	1388241	1388246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494887
26472	NC_008526	TCA	2	6	1388340	1388345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494887
26473	NC_008526	TGA	2	6	1388393	1388398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494887
26474	NC_008526	CCA	2	6	1388442	1388447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494887
26475	NC_008526	GAA	2	6	1388484	1388489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494887
26476	NC_008526	GTC	2	6	1388500	1388505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494887
26477	NC_008526	TAC	2	6	1388547	1388552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494887
26478	NC_008526	TCG	2	6	1388567	1388572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494887
26479	NC_008526	TTC	2	6	1388622	1388627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494887
26480	NC_008526	TGAT	2	8	1388713	1388720	25 %	50 %	25 %	0 %	116494887
26481	NC_008526	AAG	2	6	1388743	1388748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494887
26482	NC_008526	TCAAA	2	10	1388780	1388789	60 %	20 %	0 %	20 %	116494887
26483	NC_008526	GTT	2	6	1388955	1388960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494887
26484	NC_008526	T	6	6	1388986	1388991	0 %	100 %	0 %	0 %	116494887
26485	NC_008526	AAG	2	6	1389133	1389138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494887
26486	NC_008526	T	7	7	1389195	1389201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26487	NC_008526	GC	3	6	1389230	1389235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26488	NC_008526	CCA	2	6	1389489	1389494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26489	NC_008526	GAAC	2	8	1389528	1389535	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26490	NC_008526	GCCAC	2	10	1389543	1389552	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
26491	NC_008526	AGG	2	6	1389557	1389562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26492	NC_008526	AGC	2	6	1389615	1389620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494888
26493	NC_008526	TCA	2	6	1389690	1389695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494888
26494	NC_008526	GC	3	6	1389735	1389740	0 %	0 %	50 %	50 %	116494888
26495	NC_008526	GAA	2	6	1389775	1389780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494888
26496	NC_008526	ATT	2	6	1389802	1389807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494888
26497	NC_008526	CTG	2	6	1389833	1389838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494888
26498	NC_008526	GTG	2	6	1389958	1389963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494888
26499	NC_008526	TTG	2	6	1390004	1390009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494888
26500	NC_008526	GCC	2	6	1390123	1390128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494888

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