MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25503	NC_008526	CTT	2	6	1334914	1334919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494836
25504	NC_008526	CGT	2	6	1335011	1335016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494836
25505	NC_008526	GCC	2	6	1335053	1335058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494836
25506	NC_008526	AAG	2	6	1335094	1335099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494836
25507	NC_008526	A	6	6	1335144	1335149	100 %	0 %	0 %	0 %	116494836
25508	NC_008526	AATT	2	8	1335152	1335159	50 %	50 %	0 %	0 %	116494836
25509	NC_008526	TGT	2	6	1335164	1335169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494836
25510	NC_008526	AGATC	2	10	1335187	1335196	40 %	20 %	20 %	20 %	116494836
25511	NC_008526	CTGC	2	8	1335220	1335227	0 %	25 %	25 %	50 %	116494836
25512	NC_008526	GC	3	6	1335243	1335248	0 %	0 %	50 %	50 %	116494836
25513	NC_008526	GCC	2	6	1335311	1335316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494836
25514	NC_008526	CTG	2	6	1335337	1335342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494836
25515	NC_008526	AGC	2	6	1335392	1335397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494836
25516	NC_008526	TGA	2	6	1335415	1335420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494836
25517	NC_008526	AT	3	6	1335447	1335452	50 %	50 %	0 %	0 %	116494836
25518	NC_008526	TTC	2	6	1335461	1335466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494836
25519	NC_008526	TTC	2	6	1335491	1335496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25520	NC_008526	TGA	2	6	1335504	1335509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25521	NC_008526	CAA	2	6	1335546	1335551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25522	NC_008526	GGC	2	6	1335766	1335771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494837
25523	NC_008526	GGC	2	6	1335814	1335819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494837
25524	NC_008526	CCGG	2	8	1335820	1335827	0 %	0 %	50 %	50 %	116494837
25525	NC_008526	CGG	2	6	1335834	1335839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494837
25526	NC_008526	GGC	2	6	1335844	1335849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494837
25527	NC_008526	CAT	2	6	1335852	1335857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494837
25528	NC_008526	TGA	2	6	1335867	1335872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494837
25529	NC_008526	TGG	2	6	1335927	1335932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494837
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25535	NC_008526	TCA	2	6	1336172	1336177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494837
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25537	NC_008526	CAAGC	2	10	1336261	1336270	40 %	0 %	20 %	40 %	116494837
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25541	NC_008526	TGA	2	6	1336488	1336493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494837
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25553	NC_008526	T	7	7	1337280	1337286	0 %	100 %	0 %	0 %	116494838
25554	NC_008526	CGA	2	6	1337290	1337295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494838
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25588	NC_008526	ATG	2	6	1338857	1338862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494838
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25591	NC_008526	TGA	2	6	1339070	1339075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25592	NC_008526	T	7	7	1339127	1339133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25599	NC_008526	ATC	2	6	1339515	1339520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494839
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25601	NC_008526	ATCG	2	8	1339578	1339585	25 %	25 %	25 %	25 %	116494839
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25605	NC_008526	GTG	2	6	1339667	1339672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494839
25606	NC_008526	GCC	2	6	1339673	1339678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494839
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25740	NC_008526	GCA	2	6	1347423	1347428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494846
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25744	NC_008526	ATTG	2	8	1347692	1347699	25 %	50 %	25 %	0 %	116494846
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25752	NC_008526	TTG	2	6	1348255	1348260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494846
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25760	NC_008526	ATT	2	6	1348780	1348785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494846
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25842	NC_008526	A	6	6	1353322	1353327	100 %	0 %	0 %	0 %	116494849
25843	NC_008526	CTG	2	6	1353416	1353421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494849
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25851	NC_008526	CGG	2	6	1353909	1353914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494850
25852	NC_008526	GAAC	2	8	1354090	1354097	50 %	0 %	25 %	25 %	116494850
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25971	NC_008526	ATG	2	6	1360973	1360978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494858
25972	NC_008526	CG	3	6	1361042	1361047	0 %	0 %	50 %	50 %	116494858
25973	NC_008526	ATA	2	6	1361069	1361074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494858
25974	NC_008526	GTC	2	6	1361086	1361091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494858
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25978	NC_008526	A	7	7	1361356	1361362	100 %	0 %	0 %	0 %	116494858
25979	NC_008526	TCA	2	6	1361385	1361390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494858
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25985	NC_008526	TTAA	2	8	1361642	1361649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25986	NC_008526	CAGGG	2	10	1361668	1361677	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25987	NC_008526	CGG	2	6	1361691	1361696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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25991	NC_008526	TCAA	2	8	1361795	1361802	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25992	NC_008526	AGG	2	6	1361819	1361824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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25999	NC_008526	TGG	2	6	1362017	1362022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494859
26000	NC_008526	TTA	2	6	1362024	1362029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494859

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