MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_008526	GGC	3	9	1310048	1310056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494814
25003	NC_008526	GGT	2	6	1310108	1310113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494814
25004	NC_008526	TTGA	2	8	1310145	1310152	25 %	50 %	25 %	0 %	116494814
25005	NC_008526	TCA	2	6	1310162	1310167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494814
25006	NC_008526	TTGA	2	8	1310178	1310185	25 %	50 %	25 %	0 %	116494814
25007	NC_008526	TGG	2	6	1310189	1310194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494814
25008	NC_008526	GAC	2	6	1310210	1310215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494814
25009	NC_008526	CGA	2	6	1310229	1310234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494814
25010	NC_008526	TTA	2	6	1310283	1310288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494814
25011	NC_008526	CAC	2	6	1310363	1310368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494814
25012	NC_008526	CAAG	2	8	1310408	1310415	50 %	0 %	25 %	25 %	116494814
25013	NC_008526	GGC	2	6	1310435	1310440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494814
25014	NC_008526	TGA	2	6	1310441	1310446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494814
25015	NC_008526	CAG	2	6	1310561	1310566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494814
25016	NC_008526	GTT	2	6	1310570	1310575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494814
25017	NC_008526	GAA	2	6	1310601	1310606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494814
25018	NC_008526	ATT	2	6	1310638	1310643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494814
25019	NC_008526	CAT	2	6	1310655	1310660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494814
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25021	NC_008526	CCG	2	6	1310725	1310730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494814
25022	NC_008526	AGCG	2	8	1310811	1310818	25 %	0 %	50 %	25 %	116494814
25023	NC_008526	AAAC	2	8	1310846	1310853	75 %	0 %	0 %	25 %	116494814
25024	NC_008526	CAA	2	6	1310881	1310886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494814
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25032	NC_008526	T	6	6	1311153	1311158	0 %	100 %	0 %	0 %	116494815
25033	NC_008526	A	7	7	1311167	1311173	100 %	0 %	0 %	0 %	116494815
25034	NC_008526	GAT	2	6	1311240	1311245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494815
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25039	NC_008526	TGA	2	6	1311339	1311344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494815
25040	NC_008526	TGC	2	6	1311357	1311362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494815
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25043	NC_008526	CTG	2	6	1311475	1311480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494815
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25049	NC_008526	A	7	7	1311708	1311714	100 %	0 %	0 %	0 %	116494815
25050	NC_008526	CCAT	2	8	1311753	1311760	25 %	25 %	0 %	50 %	116494815
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25052	NC_008526	CAG	2	6	1311916	1311921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494815
25053	NC_008526	AGT	2	6	1312046	1312051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494816
25054	NC_008526	GAC	2	6	1312059	1312064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494816
25055	NC_008526	CGGC	2	8	1312073	1312080	0 %	0 %	50 %	50 %	116494816
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25063	NC_008526	GCAAT	2	10	1312369	1312378	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25064	NC_008526	AGTA	3	12	1312445	1312456	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25065	NC_008526	ACC	2	6	1312485	1312490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25066	NC_008526	GGT	2	6	1312525	1312530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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25069	NC_008526	ATC	2	6	1312568	1312573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494817
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25085	NC_008526	GCT	2	6	1313095	1313100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494818
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25088	NC_008526	GCGATT	2	12	1313191	1313202	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116494818
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25099	NC_008526	CAC	2	6	1313656	1313661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494818
25100	NC_008526	AGAA	2	8	1313693	1313700	75 %	0 %	25 %	0 %	116494818
25101	NC_008526	CGG	2	6	1313805	1313810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25102	NC_008526	ATC	2	6	1313826	1313831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25103	NC_008526	TGG	2	6	1313896	1313901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494819
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25107	NC_008526	ATGCGG	2	12	1314081	1314092	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116494819
25108	NC_008526	T	6	6	1314109	1314114	0 %	100 %	0 %	0 %	116494819
25109	NC_008526	ATG	2	6	1314183	1314188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494819
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25111	NC_008526	TGTC	2	8	1314255	1314262	0 %	50 %	25 %	25 %	116494819
25112	NC_008526	CTT	2	6	1314265	1314270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494819
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25114	NC_008526	GC	3	6	1314395	1314400	0 %	0 %	50 %	50 %	116494819
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25116	NC_008526	CAG	2	6	1314575	1314580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494819
25117	NC_008526	TTA	2	6	1314582	1314587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494819
25118	NC_008526	GAC	2	6	1314606	1314611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494819
25119	NC_008526	CGT	2	6	1314613	1314618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494819
25120	NC_008526	AGT	2	6	1314643	1314648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494819
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25143	NC_008526	AGC	2	6	1316136	1316141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494820
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25147	NC_008526	A	6	6	1316297	1316302	100 %	0 %	0 %	0 %	116494820
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25233	NC_008526	GCT	2	6	1321214	1321219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494824
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25236	NC_008526	CGC	2	6	1321257	1321262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494824
25237	NC_008526	AAG	2	6	1321299	1321304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494824
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25239	NC_008526	ATC	2	6	1321452	1321457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494824
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25242	NC_008526	TTC	2	6	1321674	1321679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494824
25243	NC_008526	TC	3	6	1321692	1321697	0 %	50 %	0 %	50 %	116494824
25244	NC_008526	TAC	2	6	1321788	1321793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494824
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25246	NC_008526	ACTTG	2	10	1321848	1321857	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25247	NC_008526	TTC	2	6	1321972	1321977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494825
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25258	NC_008526	A	7	7	1322912	1322918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25259	NC_008526	T	6	6	1322936	1322941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25260	NC_008526	A	7	7	1323047	1323053	100 %	0 %	0 %	0 %	116494826
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25340	NC_008526	A	6	6	1326940	1326945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25346	NC_008526	A	7	7	1327199	1327205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25347	NC_008526	AGG	2	6	1327272	1327277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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25349	NC_008526	TGT	2	6	1327333	1327338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494831
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25352	NC_008526	CAA	2	6	1327450	1327455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494831
25353	NC_008526	GTT	2	6	1327472	1327477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494831
25354	NC_008526	GGC	2	6	1327600	1327605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494831
25355	NC_008526	CGA	2	6	1327614	1327619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494831
25356	NC_008526	TAC	2	6	1327655	1327660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494831
25357	NC_008526	CAA	2	6	1327684	1327689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494831
25358	NC_008526	ATG	2	6	1327905	1327910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494831
25359	NC_008526	GCC	2	6	1328006	1328011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494831
25360	NC_008526	TTAA	2	8	1328045	1328052	50 %	50 %	0 %	0 %	116494831
25361	NC_008526	CTG	2	6	1328067	1328072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494831
25362	NC_008526	TTC	2	6	1328177	1328182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494831
25363	NC_008526	TGC	2	6	1328211	1328216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494831
25364	NC_008526	GT	3	6	1328250	1328255	0 %	50 %	50 %	0 %	116494831
25365	NC_008526	GTTC	2	8	1328266	1328273	0 %	50 %	25 %	25 %	116494831
25366	NC_008526	TGA	2	6	1328286	1328291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494831
25367	NC_008526	CGG	2	6	1328379	1328384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494831
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25369	NC_008526	GTT	2	6	1328489	1328494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494831
25370	NC_008526	GCA	2	6	1328732	1328737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494831
25371	NC_008526	ATCA	2	8	1328754	1328761	50 %	25 %	0 %	25 %	116494832
25372	NC_008526	TGT	2	6	1328786	1328791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494832
25373	NC_008526	GTT	2	6	1328835	1328840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494832
25374	NC_008526	GGT	2	6	1328853	1328858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494832
25375	NC_008526	CAA	2	6	1328902	1328907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494832
25376	NC_008526	A	6	6	1328977	1328982	100 %	0 %	0 %	0 %	116494832
25377	NC_008526	CAC	2	6	1329049	1329054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494832
25378	NC_008526	GAA	2	6	1329078	1329083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494832
25379	NC_008526	ATCC	2	8	1329145	1329152	25 %	25 %	0 %	50 %	116494832
25380	NC_008526	GGT	2	6	1329162	1329167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494832
25381	NC_008526	TGA	2	6	1329227	1329232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494832
25382	NC_008526	ACCA	2	8	1329233	1329240	50 %	0 %	0 %	50 %	116494832
25383	NC_008526	GTT	2	6	1329315	1329320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494832
25384	NC_008526	ATGG	2	8	1329372	1329379	25 %	25 %	50 %	0 %	116494832
25385	NC_008526	AAC	2	6	1329409	1329414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494832
25386	NC_008526	AAG	2	6	1329430	1329435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494832
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25388	NC_008526	GCTT	2	8	1329584	1329591	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25389	NC_008526	CA	3	6	1329662	1329667	50 %	0 %	0 %	50 %	116494833
25390	NC_008526	TGC	2	6	1329686	1329691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494833
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25392	NC_008526	ACG	2	6	1329800	1329805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494833
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25397	NC_008526	TTA	2	6	1330023	1330028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494833
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25403	NC_008526	TCT	2	6	1330436	1330441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494833
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25407	NC_008526	AAT	2	6	1330549	1330554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494833
25408	NC_008526	CTG	2	6	1330580	1330585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494833
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25414	NC_008526	GTT	2	6	1330977	1330982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494833
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25417	NC_008526	ATA	2	6	1331108	1331113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494833
25418	NC_008526	GCA	2	6	1331125	1331130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494833
25419	NC_008526	AAG	2	6	1331354	1331359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494833
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25421	NC_008526	GCG	2	6	1331448	1331453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494833
25422	NC_008526	AACA	2	8	1331507	1331514	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25423	NC_008526	ACA	2	6	1331583	1331588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25424	NC_008526	TGT	2	6	1331611	1331616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25425	NC_008526	T	6	6	1331728	1331733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25426	NC_008526	CAC	2	6	1331750	1331755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25427	NC_008526	A	6	6	1331794	1331799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25428	NC_008526	CTTA	2	8	1331830	1331837	25 %	50 %	0 %	25 %	116494834
25429	NC_008526	GGC	2	6	1331880	1331885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494834
25430	NC_008526	ATG	2	6	1331887	1331892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494834
25431	NC_008526	ATG	2	6	1331911	1331916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494834
25432	NC_008526	TGGT	2	8	1331929	1331936	0 %	50 %	50 %	0 %	116494834
25433	NC_008526	AGC	2	6	1331938	1331943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494834
25434	NC_008526	CAA	2	6	1331948	1331953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494834
25435	NC_008526	CCA	2	6	1331956	1331961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494834
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25439	NC_008526	GCGTT	2	10	1332121	1332130	0 %	40 %	40 %	20 %	116494834
25440	NC_008526	GAA	2	6	1332153	1332158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494834
25441	NC_008526	CCA	2	6	1332196	1332201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494834
25442	NC_008526	TTG	2	6	1332280	1332285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494834
25443	NC_008526	TCA	2	6	1332308	1332313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494834
25444	NC_008526	GGC	2	6	1332315	1332320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494834
25445	NC_008526	GCG	2	6	1332394	1332399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494834
25446	NC_008526	TGA	3	9	1332410	1332418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494834
25447	NC_008526	CAG	2	6	1332426	1332431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494834
25448	NC_008526	ATG	2	6	1332436	1332441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494834
25449	NC_008526	AGC	2	6	1332508	1332513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494834
25450	NC_008526	TTC	2	6	1332514	1332519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494834
25451	NC_008526	ATC	2	6	1332529	1332534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494834
25452	NC_008526	AAG	2	6	1332568	1332573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494834
25453	NC_008526	ACC	2	6	1332627	1332632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494834
25454	NC_008526	AAG	2	6	1332703	1332708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494834
25455	NC_008526	GTT	2	6	1332729	1332734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494834
25456	NC_008526	GGTGAA	2	12	1332735	1332746	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116494834
25457	NC_008526	CCG	2	6	1332808	1332813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494834
25458	NC_008526	ACA	2	6	1332814	1332819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494834
25459	NC_008526	GCA	2	6	1332824	1332829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494834
25460	NC_008526	TCA	2	6	1332845	1332850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494834
25461	NC_008526	GCC	2	6	1332879	1332884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494834
25462	NC_008526	GCA	2	6	1332925	1332930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494834
25463	NC_008526	TCAA	2	8	1332964	1332971	50 %	25 %	0 %	25 %	116494834
25464	NC_008526	TTC	2	6	1332972	1332977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494834
25465	NC_008526	GCT	2	6	1333075	1333080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494834
25466	NC_008526	TTTC	2	8	1333169	1333176	0 %	75 %	0 %	25 %	116494834
25467	NC_008526	TGCT	2	8	1333275	1333282	0 %	50 %	25 %	25 %	116494834
25468	NC_008526	TTC	2	6	1333299	1333304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494834
25469	NC_008526	CTT	2	6	1333322	1333327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494834
25470	NC_008526	CAT	2	6	1333382	1333387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494834
25471	NC_008526	TTG	2	6	1333401	1333406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494834
25472	NC_008526	TGA	2	6	1333430	1333435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494834
25473	NC_008526	TGC	2	6	1333449	1333454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494834
25474	NC_008526	TGC	2	6	1333458	1333463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494834
25475	NC_008526	TTG	2	6	1333474	1333479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494834
25476	NC_008526	GCA	2	6	1333492	1333497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494834
25477	NC_008526	GAA	2	6	1333503	1333508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494834
25478	NC_008526	TCG	2	6	1333684	1333689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494834
25479	NC_008526	TCA	2	6	1333726	1333731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494834
25480	NC_008526	T	6	6	1333777	1333782	0 %	100 %	0 %	0 %	116494834
25481	NC_008526	AGT	2	6	1333783	1333788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494834
25482	NC_008526	TCC	2	6	1333810	1333815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116494835
25483	NC_008526	TTGT	2	8	1333835	1333842	0 %	75 %	25 %	0 %	116494835
25484	NC_008526	GCTG	2	8	1334005	1334012	0 %	25 %	50 %	25 %	116494835
25485	NC_008526	TGCCA	2	10	1334024	1334033	20 %	20 %	20 %	40 %	116494835
25486	NC_008526	GGCCCC	2	12	1334058	1334069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494835
25487	NC_008526	GGC	2	6	1334111	1334116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494835
25488	NC_008526	TGA	2	6	1334126	1334131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494835
25489	NC_008526	TGC	2	6	1334169	1334174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494835
25490	NC_008526	GAC	2	6	1334196	1334201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494835
25491	NC_008526	GTG	2	6	1334242	1334247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494835
25492	NC_008526	GAC	3	9	1334340	1334348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494835
25493	NC_008526	GGC	2	6	1334385	1334390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494835
25494	NC_008526	CAG	2	6	1334396	1334401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494835
25495	NC_008526	TGC	2	6	1334442	1334447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494835
25496	NC_008526	CAG	2	6	1334477	1334482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494835
25497	NC_008526	GTT	2	6	1334569	1334574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494835
25498	NC_008526	GCC	2	6	1334619	1334624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494835
25499	NC_008526	GCGT	2	8	1334638	1334645	0 %	25 %	50 %	25 %	116494835
25500	NC_008526	CAAGTT	2	12	1334663	1334674	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116494835

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