MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_008526	GA	3	6	1256806	1256811	50 %	0 %	50 %	0 %	116494769
24003	NC_008526	A	6	6	1256814	1256819	100 %	0 %	0 %	0 %	116494769
24004	NC_008526	AGT	2	6	1256854	1256859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494769
24005	NC_008526	CCG	2	6	1256864	1256869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24006	NC_008526	CAA	2	6	1256874	1256879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24007	NC_008526	TGA	2	6	1256898	1256903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24008	NC_008526	GGA	2	6	1256904	1256909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24009	NC_008526	AGC	2	6	1256955	1256960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494770
24010	NC_008526	TAG	2	6	1257023	1257028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494770
24011	NC_008526	A	6	6	1257054	1257059	100 %	0 %	0 %	0 %	116494770
24012	NC_008526	GAAG	2	8	1257104	1257111	50 %	0 %	50 %	0 %	116494770
24013	NC_008526	AATC	2	8	1257117	1257124	50 %	25 %	0 %	25 %	116494770
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24015	NC_008526	GC	3	6	1257166	1257171	0 %	0 %	50 %	50 %	116494770
24016	NC_008526	TGATT	2	10	1257182	1257191	20 %	60 %	20 %	0 %	116494770
24017	NC_008526	AGC	2	6	1257193	1257198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494770
24018	NC_008526	GCA	2	6	1257203	1257208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494770
24019	NC_008526	TCAAGC	2	12	1257263	1257274	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116494770
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24021	NC_008526	GGAA	2	8	1257424	1257431	50 %	0 %	50 %	0 %	116494770
24022	NC_008526	GAT	2	6	1257570	1257575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494770
24023	NC_008526	AGC	3	9	1257599	1257607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494770
24024	NC_008526	CGG	3	9	1257625	1257633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494770
24025	NC_008526	ATG	2	6	1257688	1257693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494770
24026	NC_008526	CGT	2	6	1257714	1257719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24027	NC_008526	TGG	2	6	1257721	1257726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24028	NC_008526	GGT	2	6	1257875	1257880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24029	NC_008526	GGGC	2	8	1257906	1257913	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24030	NC_008526	T	6	6	1257914	1257919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24031	NC_008526	TAA	2	6	1257929	1257934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24032	NC_008526	GC	3	6	1257995	1258000	0 %	0 %	50 %	50 %	116494771
24033	NC_008526	GAA	2	6	1258010	1258015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494771
24034	NC_008526	ATG	2	6	1258105	1258110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494771
24035	NC_008526	ATT	2	6	1258173	1258178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494771
24036	NC_008526	GCA	2	6	1258412	1258417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494771
24037	NC_008526	TGGTCA	2	12	1258500	1258511	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116494771
24038	NC_008526	GAT	2	6	1258551	1258556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494771
24039	NC_008526	CCAT	2	8	1258563	1258570	25 %	25 %	0 %	50 %	116494771
24040	NC_008526	GTG	2	6	1258587	1258592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494771
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24044	NC_008526	GGACT	2	10	1258900	1258909	20 %	20 %	40 %	20 %	116494771
24045	NC_008526	GTC	2	6	1258974	1258979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494771
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24052	NC_008526	GC	3	6	1259309	1259314	0 %	0 %	50 %	50 %	116494771
24053	NC_008526	TCT	2	6	1259335	1259340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494771
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24057	NC_008526	TG	3	6	1259420	1259425	0 %	50 %	50 %	0 %	116494771
24058	NC_008526	TTG	2	6	1259448	1259453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494771
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24104	NC_008526	TTA	2	6	1262167	1262172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24105	NC_008526	GGT	2	6	1262227	1262232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494774
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24108	NC_008526	TGA	3	9	1262368	1262376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494774
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24112	NC_008526	GCCTT	2	10	1262494	1262503	0 %	40 %	20 %	40 %	116494774
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24115	NC_008526	AATG	2	8	1262588	1262595	50 %	25 %	25 %	0 %	116494774
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24117	NC_008526	T	6	6	1262701	1262706	0 %	100 %	0 %	0 %	116494774
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24235	NC_008526	GAT	2	6	1268457	1268462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494780
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24253	NC_008526	GAAGA	2	10	1269538	1269547	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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24352	NC_008526	T	7	7	1275398	1275404	0 %	100 %	0 %	0 %	116494786
24353	NC_008526	CTG	2	6	1275411	1275416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494786
24354	NC_008526	CGA	2	6	1275430	1275435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494786
24355	NC_008526	ATC	2	6	1275529	1275534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494786
24356	NC_008526	GCA	2	6	1275545	1275550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494786
24357	NC_008526	CGA	2	6	1275583	1275588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494786
24358	NC_008526	ATT	2	6	1275607	1275612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494786
24359	NC_008526	GAT	2	6	1275702	1275707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494786
24360	NC_008526	CGA	2	6	1275760	1275765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494786
24361	NC_008526	TTA	2	6	1275796	1275801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494786
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24374	NC_008526	TGC	2	6	1276810	1276815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494786
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24387	NC_008526	CAGT	2	8	1277509	1277516	25 %	25 %	25 %	25 %	116494786
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24409	NC_008526	CCGG	2	8	1278848	1278855	0 %	0 %	50 %	50 %	116494787
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24442	NC_008526	GAC	2	6	1280116	1280121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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24445	NC_008526	A	6	6	1280233	1280238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24446	NC_008526	TAA	2	6	1280242	1280247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24448	NC_008526	AGCT	2	8	1280431	1280438	25 %	25 %	25 %	25 %	116494789
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24463	NC_008526	GTTG	2	8	1281416	1281423	0 %	50 %	50 %	0 %	116494789
24464	NC_008526	CTT	2	6	1281448	1281453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494789
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24467	NC_008526	T	6	6	1281620	1281625	0 %	100 %	0 %	0 %	116494789
24468	NC_008526	TTC	2	6	1281686	1281691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494789
24469	NC_008526	GCT	3	9	1281711	1281719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494789
24470	NC_008526	CTG	2	6	1281752	1281757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494789
24471	NC_008526	AAG	2	6	1281759	1281764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494789
24472	NC_008526	ACC	2	6	1281773	1281778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494789
24473	NC_008526	TAA	2	6	1281802	1281807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494789
24474	NC_008526	AAT	2	6	1281847	1281852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494789
24475	NC_008526	AATC	2	8	1281865	1281872	50 %	25 %	0 %	25 %	116494789
24476	NC_008526	ATC	2	6	1281881	1281886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494789
24477	NC_008526	ATCA	2	8	1281908	1281915	50 %	25 %	0 %	25 %	116494789
24478	NC_008526	GAT	2	6	1281917	1281922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494789
24479	NC_008526	TTC	2	6	1281951	1281956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494789
24480	NC_008526	CCG	2	6	1281972	1281977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494789
24481	NC_008526	CGG	2	6	1281988	1281993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494789
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24483	NC_008526	GTT	2	6	1282180	1282185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494790
24484	NC_008526	CGT	2	6	1282189	1282194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494790
24485	NC_008526	ATG	2	6	1282237	1282242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494790
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24487	NC_008526	CAA	2	6	1282276	1282281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24488	NC_008526	A	7	7	1282293	1282299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24489	NC_008526	TCG	2	6	1282366	1282371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24490	NC_008526	TCG	2	6	1282405	1282410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24491	NC_008526	CGAT	2	8	1282447	1282454	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24492	NC_008526	TTG	2	6	1282455	1282460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24493	NC_008526	ACA	2	6	1282466	1282471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24494	NC_008526	GTT	2	6	1282597	1282602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24495	NC_008526	CT	3	6	1282696	1282701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24496	NC_008526	GAT	2	6	1282716	1282721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24497	NC_008526	TAT	2	6	1282743	1282748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24498	NC_008526	GTT	2	6	1282795	1282800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24499	NC_008526	TAA	2	6	1282808	1282813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24500	NC_008526	GTT	2	6	1282874	1282879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494791

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