MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_008526	CA	3	6	1231538	1231543	50 %	0 %	0 %	50 %	116494743
23502	NC_008526	GCA	2	6	1231562	1231567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494743
23503	NC_008526	GATT	2	8	1231631	1231638	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23504	NC_008526	T	6	6	1231673	1231678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23505	NC_008526	GGT	2	6	1231690	1231695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23506	NC_008526	CAT	2	6	1231760	1231765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23507	NC_008526	AAG	2	6	1231855	1231860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23508	NC_008526	ATTC	2	8	1231894	1231901	25 %	50 %	0 %	25 %	116494744
23509	NC_008526	ATC	2	6	1231928	1231933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494744
23510	NC_008526	TGC	2	6	1231949	1231954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494744
23511	NC_008526	GCC	2	6	1232023	1232028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494744
23512	NC_008526	AAGC	2	8	1232051	1232058	50 %	0 %	25 %	25 %	116494744
23513	NC_008526	ATG	2	6	1232113	1232118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494744
23514	NC_008526	ATC	2	6	1232123	1232128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494744
23515	NC_008526	ACA	2	6	1232172	1232177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494744
23516	NC_008526	TGG	2	6	1232304	1232309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494744
23517	NC_008526	CCA	2	6	1232321	1232326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494744
23518	NC_008526	CTGA	2	8	1232353	1232360	25 %	25 %	25 %	25 %	116494744
23519	NC_008526	ATC	2	6	1232372	1232377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494744
23520	NC_008526	CAT	2	6	1232427	1232432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494744
23521	NC_008526	GATGCT	2	12	1232473	1232484	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116494744
23522	NC_008526	GGC	2	6	1232490	1232495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494744
23523	NC_008526	GCA	2	6	1232503	1232508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494744
23524	NC_008526	GC	3	6	1232557	1232562	0 %	0 %	50 %	50 %	116494744
23525	NC_008526	GACA	2	8	1232613	1232620	50 %	0 %	25 %	25 %	116494744
23526	NC_008526	TGGT	2	8	1232633	1232640	0 %	50 %	50 %	0 %	116494744
23527	NC_008526	TGATTG	2	12	1232792	1232803	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116494744
23528	NC_008526	AAG	2	6	1233041	1233046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494744
23529	NC_008526	TTG	2	6	1233062	1233067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494744
23530	NC_008526	ATC	2	6	1233085	1233090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494744
23531	NC_008526	AGA	2	6	1233260	1233265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23532	NC_008526	T	7	7	1233302	1233308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23533	NC_008526	AGG	2	6	1233327	1233332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23534	NC_008526	GAC	2	6	1233340	1233345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494745
23535	NC_008526	ATT	2	6	1233350	1233355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494745
23536	NC_008526	TGC	2	6	1233526	1233531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494745
23537	NC_008526	CGG	2	6	1233552	1233557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494745
23538	NC_008526	GGC	2	6	1233578	1233583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494745
23539	NC_008526	TTTTG	2	10	1233589	1233598	0 %	80 %	20 %	0 %	116494745
23540	NC_008526	CGA	2	6	1233657	1233662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494745
23541	NC_008526	TGT	2	6	1233685	1233690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494745
23542	NC_008526	GCA	2	6	1233695	1233700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494745
23543	NC_008526	TGGCAG	2	12	1233707	1233718	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116494745
23544	NC_008526	TGT	2	6	1233814	1233819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494745
23545	NC_008526	TCA	2	6	1233929	1233934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494745
23546	NC_008526	GCA	2	6	1234053	1234058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494746
23547	NC_008526	TTA	2	6	1234077	1234082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494746
23548	NC_008526	TGG	2	6	1234126	1234131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494746
23549	NC_008526	GTGA	2	8	1234170	1234177	25 %	25 %	50 %	0 %	116494746
23550	NC_008526	GCG	2	6	1234298	1234303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494746
23551	NC_008526	GAT	2	6	1234367	1234372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494746
23552	NC_008526	ATTTT	2	10	1234410	1234419	20 %	80 %	0 %	0 %	116494746
23553	NC_008526	ATT	2	6	1234437	1234442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494746
23554	NC_008526	TGC	2	6	1234454	1234459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494746
23555	NC_008526	ATC	2	6	1234552	1234557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494746
23556	NC_008526	GTG	2	6	1234561	1234566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494746
23557	NC_008526	GCC	2	6	1234617	1234622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494746
23558	NC_008526	GCAT	2	8	1234633	1234640	25 %	25 %	25 %	25 %	116494746
23559	NC_008526	TTGA	2	8	1234641	1234648	25 %	50 %	25 %	0 %	116494746
23560	NC_008526	TTG	2	6	1234657	1234662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494746
23561	NC_008526	TAT	2	6	1234674	1234679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494746
23562	NC_008526	CG	4	8	1234685	1234692	0 %	0 %	50 %	50 %	116494746
23563	NC_008526	AAAT	2	8	1234791	1234798	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23564	NC_008526	TTTGGA	2	12	1234855	1234866	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116494747
23565	NC_008526	A	6	6	1234869	1234874	100 %	0 %	0 %	0 %	116494747
23566	NC_008526	GATC	2	8	1234881	1234888	25 %	25 %	25 %	25 %	116494747
23567	NC_008526	GAA	2	6	1234959	1234964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494747
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23569	NC_008526	GAA	2	6	1234996	1235001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494747
23570	NC_008526	TG	3	6	1235155	1235160	0 %	50 %	50 %	0 %	116494747
23571	NC_008526	TGAT	2	8	1235195	1235202	25 %	50 %	25 %	0 %	116494747
23572	NC_008526	TGC	3	9	1235253	1235261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494747
23573	NC_008526	GCA	2	6	1235297	1235302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494747
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23576	NC_008526	TGA	2	6	1235400	1235405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494747
23577	NC_008526	ATC	2	6	1235410	1235415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494747
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23580	NC_008526	TGC	2	6	1235670	1235675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494747
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23582	NC_008526	AAG	2	6	1235842	1235847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494747
23583	NC_008526	GT	3	6	1235877	1235882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23584	NC_008526	GAT	2	6	1235896	1235901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23585	NC_008526	T	6	6	1235914	1235919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23586	NC_008526	GGA	2	6	1235932	1235937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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23588	NC_008526	TAA	2	6	1236034	1236039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494748
23589	NC_008526	CAA	2	6	1236148	1236153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494748
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23598	NC_008526	ACG	2	6	1236558	1236563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494748
23599	NC_008526	ATACTG	2	12	1236597	1236608	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116494748
23600	NC_008526	A	6	6	1236614	1236619	100 %	0 %	0 %	0 %	116494748
23601	NC_008526	CGA	2	6	1236622	1236627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494748
23602	NC_008526	TGT	2	6	1236628	1236633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494748
23603	NC_008526	A	6	6	1236695	1236700	100 %	0 %	0 %	0 %	116494748
23604	NC_008526	GCC	2	6	1236740	1236745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494748
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23606	NC_008526	TGAA	2	8	1236808	1236815	50 %	25 %	25 %	0 %	116494749
23607	NC_008526	TGG	2	6	1236834	1236839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494749
23608	NC_008526	TGT	2	6	1236850	1236855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494749
23609	NC_008526	TGC	2	6	1236856	1236861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494749
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23614	NC_008526	TAT	2	6	1237148	1237153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494749
23615	NC_008526	TTA	2	6	1237158	1237163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494749
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23617	NC_008526	ACC	2	6	1237240	1237245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494749
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23972	NC_008526	CAAG	2	8	1255155	1255162	50 %	0 %	25 %	25 %	116494766
23973	NC_008526	GCG	2	6	1255176	1255181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494766
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