MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_008526	CTT	2	6	1127742	1127747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21502	NC_008526	A	7	7	1127796	1127802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21503	NC_008526	T	6	6	1127825	1127830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21504	NC_008526	GTT	2	6	1127843	1127848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21505	NC_008526	GTA	2	6	1127859	1127864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21506	NC_008526	TTGT	2	8	1127961	1127968	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21507	NC_008526	T	7	7	1127979	1127985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21508	NC_008526	GAT	2	6	1128081	1128086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494641
21509	NC_008526	A	6	6	1128109	1128114	100 %	0 %	0 %	0 %	116494641
21510	NC_008526	GAA	2	6	1128132	1128137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494641
21511	NC_008526	CG	3	6	1128150	1128155	0 %	0 %	50 %	50 %	116494641
21512	NC_008526	ATT	2	6	1128186	1128191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494641
21513	NC_008526	ATT	2	6	1128253	1128258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494642
21514	NC_008526	GCA	2	6	1128294	1128299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494642
21515	NC_008526	TAA	2	6	1128304	1128309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494642
21516	NC_008526	ATT	2	6	1128328	1128333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494642
21517	NC_008526	TGG	2	6	1128376	1128381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494642
21518	NC_008526	ACA	2	6	1128405	1128410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494642
21519	NC_008526	GTC	2	6	1128415	1128420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494642
21520	NC_008526	ATGGGC	2	12	1128478	1128489	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116494642
21521	NC_008526	ATG	2	6	1128503	1128508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494642
21522	NC_008526	A	6	6	1128523	1128528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21523	NC_008526	GT	3	6	1128580	1128585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21524	NC_008526	ATG	3	9	1128627	1128635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21525	NC_008526	GCG	2	6	1128751	1128756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494643
21526	NC_008526	CGC	2	6	1128774	1128779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494643
21527	NC_008526	CCGA	2	8	1128782	1128789	25 %	0 %	25 %	50 %	116494643
21528	NC_008526	TGC	2	6	1128800	1128805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494643
21529	NC_008526	ATT	2	6	1128871	1128876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494643
21530	NC_008526	TCA	2	6	1128882	1128887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494643
21531	NC_008526	ATT	2	6	1128929	1128934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494643
21532	NC_008526	GGC	2	6	1128937	1128942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494643
21533	NC_008526	TCA	2	6	1128968	1128973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494643
21534	NC_008526	CCA	2	6	1129116	1129121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494643
21535	NC_008526	GTT	2	6	1129171	1129176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494643
21536	NC_008526	GAA	2	6	1129245	1129250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494643
21537	NC_008526	GCG	2	6	1129298	1129303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494643
21538	NC_008526	TGC	2	6	1129368	1129373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494643
21539	NC_008526	AAT	2	6	1129440	1129445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21540	NC_008526	T	6	6	1129494	1129499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21541	NC_008526	AAC	2	6	1129513	1129518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21542	NC_008526	AGG	2	6	1129568	1129573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21543	NC_008526	T	6	6	1129594	1129599	0 %	100 %	0 %	0 %	116494644
21544	NC_008526	AAGCA	2	10	1129610	1129619	60 %	0 %	20 %	20 %	116494644
21545	NC_008526	TAA	2	6	1129641	1129646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494644
21546	NC_008526	ATG	2	6	1129670	1129675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494644
21547	NC_008526	CG	3	6	1129712	1129717	0 %	0 %	50 %	50 %	116494644
21548	NC_008526	TTA	2	6	1129722	1129727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494644
21549	NC_008526	TGA	2	6	1129737	1129742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494644
21550	NC_008526	TTTATT	2	12	1129754	1129765	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116494644
21551	NC_008526	TGC	2	6	1129794	1129799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494644
21552	NC_008526	T	6	6	1129855	1129860	0 %	100 %	0 %	0 %	116494644
21553	NC_008526	GCA	2	6	1129897	1129902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494644
21554	NC_008526	CAT	2	6	1129987	1129992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494644
21555	NC_008526	TCG	2	6	1130025	1130030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494644
21556	NC_008526	CGA	2	6	1130049	1130054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494644
21557	NC_008526	AGG	2	6	1130275	1130280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21558	NC_008526	A	7	7	1130300	1130306	100 %	0 %	0 %	0 %	116494645
21559	NC_008526	CTGG	2	8	1130314	1130321	0 %	25 %	50 %	25 %	116494645
21560	NC_008526	TGA	2	6	1130359	1130364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494645
21561	NC_008526	ATG	2	6	1130584	1130589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494645
21562	NC_008526	AACG	2	8	1130630	1130637	50 %	0 %	25 %	25 %	116494645
21563	NC_008526	GAT	3	9	1130663	1130671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494645
21564	NC_008526	ATG	2	6	1130679	1130684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494645
21565	NC_008526	ATT	2	6	1130774	1130779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494645
21566	NC_008526	ATT	2	6	1130796	1130801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494645
21567	NC_008526	GTT	2	6	1130819	1130824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494645
21568	NC_008526	AGA	3	9	1130836	1130844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494645
21569	NC_008526	GAT	2	6	1130913	1130918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494645
21570	NC_008526	ATC	2	6	1130985	1130990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494645
21571	NC_008526	TGA	2	6	1131007	1131012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494645
21572	NC_008526	TGG	2	6	1131048	1131053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494645
21573	NC_008526	GGC	2	6	1131054	1131059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494645
21574	NC_008526	CAA	2	6	1131072	1131077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494645
21575	NC_008526	ATGCA	2	10	1131115	1131124	40 %	20 %	20 %	20 %	116494645
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21577	NC_008526	TGAA	2	8	1131199	1131206	50 %	25 %	25 %	0 %	116494645
21578	NC_008526	ACG	2	6	1131231	1131236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494645
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21582	NC_008526	ACG	2	6	1131399	1131404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494645
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21584	NC_008526	ATG	2	6	1131574	1131579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494645
21585	NC_008526	GAT	2	6	1131588	1131593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494645
21586	NC_008526	GGC	2	6	1131678	1131683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494645
21587	NC_008526	TGA	2	6	1131761	1131766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494645
21588	NC_008526	GC	3	6	1131806	1131811	0 %	0 %	50 %	50 %	116494645
21589	NC_008526	TTG	2	6	1131856	1131861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494645
21590	NC_008526	CCA	2	6	1131955	1131960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494645
21591	NC_008526	AAT	2	6	1132012	1132017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494645
21592	NC_008526	A	7	7	1132026	1132032	100 %	0 %	0 %	0 %	116494646
21593	NC_008526	AGC	2	6	1132047	1132052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494646
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21600	NC_008526	GAT	2	6	1132615	1132620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494646
21601	NC_008526	TTC	2	6	1132715	1132720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494646
21602	NC_008526	GCT	2	6	1132721	1132726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494646
21603	NC_008526	CAG	2	6	1132727	1132732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494646
21604	NC_008526	GGC	2	6	1132775	1132780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494646
21605	NC_008526	TCA	3	9	1132785	1132793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494646
21606	NC_008526	TGC	2	6	1132858	1132863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494646
21607	NC_008526	GTTT	2	8	1132876	1132883	0 %	75 %	25 %	0 %	116494646
21608	NC_008526	ATC	2	6	1132889	1132894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494646
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21611	NC_008526	TC	3	6	1133022	1133027	0 %	50 %	0 %	50 %	116494646
21612	NC_008526	CGAA	2	8	1133086	1133093	50 %	0 %	25 %	25 %	116494646
21613	NC_008526	CAG	2	6	1133145	1133150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494646
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21617	NC_008526	ATC	2	6	1133297	1133302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494646
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21737	NC_008526	AACC	2	8	1139270	1139277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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21997	NC_008526	GAGCGT	2	12	1151914	1151925	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116494663
21998	NC_008526	GC	3	6	1151953	1151958	0 %	0 %	50 %	50 %	116494663
21999	NC_008526	CGG	2	6	1152016	1152021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494663
22000	NC_008526	TC	3	6	1152093	1152098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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