MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_008526	TGC	2	6	1101081	1101086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494615
21002	NC_008526	TGGT	2	8	1101128	1101135	0 %	50 %	50 %	0 %	116494615
21003	NC_008526	CAA	3	9	1101148	1101156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494615
21004	NC_008526	AAG	2	6	1101176	1101181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494615
21005	NC_008526	GGC	2	6	1101195	1101200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494615
21006	NC_008526	A	7	7	1101210	1101216	100 %	0 %	0 %	0 %	116494615
21007	NC_008526	TTA	2	6	1101224	1101229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494615
21008	NC_008526	CAA	2	6	1101526	1101531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494615
21009	NC_008526	GCT	2	6	1101574	1101579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494615
21010	NC_008526	TTGA	2	8	1101634	1101641	25 %	50 %	25 %	0 %	116494615
21011	NC_008526	TGA	2	6	1101753	1101758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21012	NC_008526	TGTT	2	8	1101772	1101779	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21013	NC_008526	TGT	2	6	1101798	1101803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494616
21014	NC_008526	TTG	2	6	1101828	1101833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494616
21015	NC_008526	ATC	2	6	1101942	1101947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494616
21016	NC_008526	ATC	2	6	1102128	1102133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494616
21017	NC_008526	TC	3	6	1102188	1102193	0 %	50 %	0 %	50 %	116494616
21018	NC_008526	TGA	2	6	1102231	1102236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494616
21019	NC_008526	TGA	2	6	1102357	1102362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494616
21020	NC_008526	GC	3	6	1102388	1102393	0 %	0 %	50 %	50 %	116494616
21021	NC_008526	GGTCA	2	10	1102412	1102421	20 %	20 %	40 %	20 %	116494616
21022	NC_008526	GGA	2	6	1102432	1102437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494616
21023	NC_008526	GAA	2	6	1102450	1102455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494617
21024	NC_008526	AGC	2	6	1102477	1102482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494617
21025	NC_008526	GCA	2	6	1102495	1102500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494617
21026	NC_008526	TG	3	6	1102608	1102613	0 %	50 %	50 %	0 %	116494617
21027	NC_008526	CAA	2	6	1102642	1102647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494617
21028	NC_008526	CAT	2	6	1102753	1102758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494617
21029	NC_008526	GTT	2	6	1102768	1102773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494617
21030	NC_008526	CGG	2	6	1102786	1102791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494617
21031	NC_008526	CCG	2	6	1102820	1102825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494617
21032	NC_008526	CAA	2	6	1102902	1102907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494617
21033	NC_008526	TTGG	2	8	1103018	1103025	0 %	50 %	50 %	0 %	116494617
21034	NC_008526	GGTT	2	8	1103061	1103068	0 %	50 %	50 %	0 %	116494617
21035	NC_008526	GAT	2	6	1103161	1103166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494617
21036	NC_008526	TTC	2	6	1103207	1103212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494617
21037	NC_008526	GAC	2	6	1103249	1103254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494617
21038	NC_008526	GTT	2	6	1103302	1103307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494617
21039	NC_008526	GTTGG	2	10	1103342	1103351	0 %	40 %	60 %	0 %	116494617
21040	NC_008526	T	6	6	1103388	1103393	0 %	100 %	0 %	0 %	116494617
21041	NC_008526	ATT	2	6	1103450	1103455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494617
21042	NC_008526	TGG	2	6	1103499	1103504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494617
21043	NC_008526	CAATT	2	10	1103637	1103646	40 %	40 %	0 %	20 %	116494617
21044	NC_008526	TGA	2	6	1103740	1103745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494617
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21046	NC_008526	ATAA	2	8	1103769	1103776	75 %	25 %	0 %	0 %	116494617
21047	NC_008526	TTA	2	6	1103807	1103812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494618
21048	NC_008526	CGG	3	9	1103838	1103846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494618
21049	NC_008526	TGG	2	6	1103954	1103959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494618
21050	NC_008526	TGA	2	6	1104011	1104016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494618
21051	NC_008526	GCT	2	6	1104045	1104050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494618
21052	NC_008526	CCAA	2	8	1104068	1104075	50 %	0 %	0 %	50 %	116494618
21053	NC_008526	CAG	2	6	1104265	1104270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494618
21054	NC_008526	TGC	2	6	1104272	1104277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494618
21055	NC_008526	CG	3	6	1104297	1104302	0 %	0 %	50 %	50 %	116494618
21056	NC_008526	CAG	2	6	1104307	1104312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494618
21057	NC_008526	TTG	2	6	1104313	1104318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494618
21058	NC_008526	AT	3	6	1104330	1104335	50 %	50 %	0 %	0 %	116494618
21059	NC_008526	CTTA	2	8	1104344	1104351	25 %	50 %	0 %	25 %	116494618
21060	NC_008526	AAG	2	6	1104362	1104367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494618
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21062	NC_008526	TCA	2	6	1104438	1104443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494618
21063	NC_008526	GC	3	6	1104462	1104467	0 %	0 %	50 %	50 %	116494618
21064	NC_008526	CAG	2	6	1104479	1104484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494618
21065	NC_008526	GCT	2	6	1104508	1104513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494618
21066	NC_008526	GC	3	6	1104672	1104677	0 %	0 %	50 %	50 %	116494618
21067	NC_008526	AGA	2	6	1104744	1104749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494618
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21069	NC_008526	TGT	3	9	1104939	1104947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21070	NC_008526	AGG	2	6	1104961	1104966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21071	NC_008526	GTC	2	6	1104992	1104997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494619
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21074	NC_008526	GCT	2	6	1105099	1105104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494619
21075	NC_008526	TGCG	2	8	1105118	1105125	0 %	25 %	50 %	25 %	116494619
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21084	NC_008526	CTG	2	6	1105550	1105555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494619
21085	NC_008526	TTTGC	2	10	1105681	1105690	0 %	60 %	20 %	20 %	116494619
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21087	NC_008526	CA	3	6	1105772	1105777	50 %	0 %	0 %	50 %	116494619
21088	NC_008526	CAATC	2	10	1105782	1105791	40 %	20 %	0 %	40 %	116494619
21089	NC_008526	GC	3	6	1105816	1105821	0 %	0 %	50 %	50 %	116494619
21090	NC_008526	AGA	2	6	1105851	1105856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494619
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21097	NC_008526	CAAA	2	8	1106282	1106289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21098	NC_008526	TCG	2	6	1106306	1106311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21099	NC_008526	TTTG	2	8	1106314	1106321	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21100	NC_008526	TGT	2	6	1106474	1106479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494620
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21102	NC_008526	TTG	2	6	1106504	1106509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494620
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21104	NC_008526	T	6	6	1106594	1106599	0 %	100 %	0 %	0 %	116494620
21105	NC_008526	AAAT	2	8	1106625	1106632	75 %	25 %	0 %	0 %	116494620
21106	NC_008526	GCTG	2	8	1106658	1106665	0 %	25 %	50 %	25 %	116494620
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21112	NC_008526	GATA	2	8	1106929	1106936	50 %	25 %	25 %	0 %	116494620
21113	NC_008526	AGT	2	6	1106940	1106945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494620
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21115	NC_008526	TGA	2	6	1107034	1107039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494621
21116	NC_008526	ATC	2	6	1107095	1107100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494621
21117	NC_008526	TAA	2	6	1107114	1107119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494621
21118	NC_008526	TGT	2	6	1107204	1107209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494621
21119	NC_008526	AAAT	2	8	1107249	1107256	75 %	25 %	0 %	0 %	116494621
21120	NC_008526	TAA	2	6	1107269	1107274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494621
21121	NC_008526	CGC	2	6	1107402	1107407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494621
21122	NC_008526	AAC	2	6	1107452	1107457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494621
21123	NC_008526	AGC	2	6	1107476	1107481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494621
21124	NC_008526	A	6	6	1107570	1107575	100 %	0 %	0 %	0 %	116494621
21125	NC_008526	TCA	2	6	1107610	1107615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494621
21126	NC_008526	ATG	2	6	1107618	1107623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494621
21127	NC_008526	CAT	2	6	1107653	1107658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494621
21128	NC_008526	ATA	2	6	1107665	1107670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494621
21129	NC_008526	GAT	2	6	1107676	1107681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494621
21130	NC_008526	ATTT	2	8	1107802	1107809	25 %	75 %	0 %	0 %	116494622
21131	NC_008526	GGTTG	2	10	1107814	1107823	0 %	40 %	60 %	0 %	116494622
21132	NC_008526	GCT	3	9	1107855	1107863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494622
21133	NC_008526	GGT	2	6	1107900	1107905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494622
21134	NC_008526	GTC	2	6	1107918	1107923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494622
21135	NC_008526	GTT	2	6	1107958	1107963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494622
21136	NC_008526	ATT	2	6	1107972	1107977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494622
21137	NC_008526	TGC	2	6	1108001	1108006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494622
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21144	NC_008526	CAT	2	6	1108466	1108471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494622
21145	NC_008526	GCTT	2	8	1108590	1108597	0 %	50 %	25 %	25 %	116494622
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21147	NC_008526	TCA	2	6	1108627	1108632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494622
21148	NC_008526	TCA	2	6	1108672	1108677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494622
21149	NC_008526	TCG	2	6	1108736	1108741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494622
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21151	NC_008526	CAT	2	6	1108800	1108805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494622
21152	NC_008526	GCT	2	6	1108834	1108839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494622
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21172	NC_008526	AACC	2	8	1110133	1110140	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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21186	NC_008526	T	7	7	1111248	1111254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21187	NC_008526	T	7	7	1111263	1111269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21188	NC_008526	ATCA	2	8	1111272	1111279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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21203	NC_008526	T	6	6	1112187	1112192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21204	NC_008526	TGA	2	6	1112270	1112275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21207	NC_008526	T	6	6	1112305	1112310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21229	NC_008526	TTC	2	6	1113561	1113566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494625
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21231	NC_008526	AAG	2	6	1113639	1113644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494625
21232	NC_008526	A	6	6	1113743	1113748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21233	NC_008526	TGT	2	6	1113766	1113771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21235	NC_008526	AT	3	6	1113953	1113958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21344	NC_008526	A	7	7	1118912	1118918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21345	NC_008526	AGCT	2	8	1118937	1118944	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21346	NC_008526	CAGT	2	8	1118948	1118955	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21347	NC_008526	T	7	7	1118955	1118961	0 %	100 %	0 %	0 %	116494633
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21351	NC_008526	TCA	2	6	1119220	1119225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494633
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21353	NC_008526	TGC	2	6	1119349	1119354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494633
21354	NC_008526	GC	3	6	1119396	1119401	0 %	0 %	50 %	50 %	116494633
21355	NC_008526	GGC	2	6	1119409	1119414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494633
21356	NC_008526	GC	3	6	1119447	1119452	0 %	0 %	50 %	50 %	116494633
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