MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_008526	TTG	3	9	891488	891496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494423
17003	NC_008526	AGC	2	6	891591	891596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494423
17004	NC_008526	GGC	2	6	891600	891605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494423
17005	NC_008526	A	6	6	891610	891615	100 %	0 %	0 %	0 %	116494423
17006	NC_008526	GC	4	8	891618	891625	0 %	0 %	50 %	50 %	116494423
17007	NC_008526	CAG	2	6	891640	891645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494423
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17009	NC_008526	GAT	2	6	891727	891732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494423
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17011	NC_008526	CAGC	2	8	892060	892067	25 %	0 %	25 %	50 %	116494423
17012	NC_008526	GCA	2	6	892126	892131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494423
17013	NC_008526	ATTG	2	8	892170	892177	25 %	50 %	25 %	0 %	116494423
17014	NC_008526	TTTGA	2	10	892306	892315	20 %	60 %	20 %	0 %	116494423
17015	NC_008526	CGAA	2	8	892402	892409	50 %	0 %	25 %	25 %	116494423
17016	NC_008526	TGC	2	6	892572	892577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494423
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17019	NC_008526	TGAGT	2	10	892674	892683	20 %	40 %	40 %	0 %	116494423
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17031	NC_008526	TTGA	2	8	893200	893207	25 %	50 %	25 %	0 %	116494423
17032	NC_008526	TTG	2	6	893228	893233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494423
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17099	NC_008526	TGGC	2	8	896580	896587	0 %	25 %	50 %	25 %	116494426
17100	NC_008526	A	6	6	896657	896662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17107	NC_008526	GCG	2	6	897002	897007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494427
17108	NC_008526	TGC	2	6	897029	897034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494427
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17361	NC_008526	TTA	2	6	909307	909312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494437
17362	NC_008526	GCA	2	6	909336	909341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494437
17363	NC_008526	AGA	3	9	909342	909350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494437
17364	NC_008526	CAA	2	6	909426	909431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494437
17365	NC_008526	GGC	2	6	909460	909465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494437
17366	NC_008526	GCT	2	6	909591	909596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494437
17367	NC_008526	AC	3	6	909690	909695	50 %	0 %	0 %	50 %	116494437
17368	NC_008526	GCG	2	6	909791	909796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494437
17369	NC_008526	CAA	2	6	909813	909818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494437
17370	NC_008526	GCGATG	2	12	909910	909921	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116494437
17371	NC_008526	GAA	3	9	909946	909954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494437
17372	NC_008526	AAGGCC	2	12	909967	909978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494437
17373	NC_008526	ATC	2	6	910058	910063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494437
17374	NC_008526	GGCAAT	2	12	910081	910092	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116494437
17375	NC_008526	TCA	2	6	910121	910126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494437
17376	NC_008526	ATG	2	6	910323	910328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494438
17377	NC_008526	TGA	2	6	910429	910434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494438
17378	NC_008526	CAA	2	6	910446	910451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494438
17379	NC_008526	A	6	6	910581	910586	100 %	0 %	0 %	0 %	116494438
17380	NC_008526	TGA	2	6	910651	910656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494438
17381	NC_008526	AAC	3	9	910671	910679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494438
17382	NC_008526	GT	3	6	910680	910685	0 %	50 %	50 %	0 %	116494438
17383	NC_008526	CAA	2	6	910705	910710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494438
17384	NC_008526	CGA	2	6	910729	910734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494438
17385	NC_008526	TTG	2	6	910773	910778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494438
17386	NC_008526	TTA	2	6	910815	910820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494438
17387	NC_008526	GGC	2	6	910880	910885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494438
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17389	NC_008526	CAT	2	6	911067	911072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494439
17390	NC_008526	GAA	2	6	911120	911125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494439
17391	NC_008526	ACG	2	6	911130	911135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494439
17392	NC_008526	AAC	2	6	911137	911142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494439
17393	NC_008526	CAG	2	6	911208	911213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494439
17394	NC_008526	CGG	2	6	911231	911236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494439
17395	NC_008526	CGA	2	6	911320	911325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494439
17396	NC_008526	TGG	2	6	911362	911367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494439
17397	NC_008526	GGC	2	6	911379	911384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494439
17398	NC_008526	A	6	6	911394	911399	100 %	0 %	0 %	0 %	116494439
17399	NC_008526	CTG	2	6	911454	911459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494439
17400	NC_008526	CAA	2	6	911548	911553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494439
17401	NC_008526	TGC	2	6	911614	911619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494439
17402	NC_008526	TTG	2	6	911629	911634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494439
17403	NC_008526	GTT	2	6	911649	911654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494439
17404	NC_008526	CAGCTT	2	12	911660	911671	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116494439
17405	NC_008526	TTGAT	2	10	911728	911737	20 %	60 %	20 %	0 %	116494439
17406	NC_008526	ATC	3	9	911754	911762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494439
17407	NC_008526	GCG	2	6	911789	911794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494439
17408	NC_008526	T	6	6	911854	911859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17409	NC_008526	CTTA	2	8	911987	911994	25 %	50 %	0 %	25 %	116494440
17410	NC_008526	GGTT	2	8	912002	912009	0 %	50 %	50 %	0 %	116494440
17411	NC_008526	GCC	2	6	912073	912078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494440
17412	NC_008526	GC	3	6	912086	912091	0 %	0 %	50 %	50 %	116494440
17413	NC_008526	GAC	2	6	912178	912183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494440
17414	NC_008526	GCT	2	6	912198	912203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494440
17415	NC_008526	TTGC	2	8	912204	912211	0 %	50 %	25 %	25 %	116494440
17416	NC_008526	TAG	2	6	912229	912234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494440
17417	NC_008526	TGG	2	6	912267	912272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494440
17418	NC_008526	GGC	2	6	912290	912295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494440
17419	NC_008526	TAT	2	6	912358	912363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494440
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17424	NC_008526	CTG	2	6	912531	912536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494440
17425	NC_008526	GGC	2	6	912628	912633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494440
17426	NC_008526	GGC	2	6	912651	912656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494440
17427	NC_008526	TTG	2	6	912685	912690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494440
17428	NC_008526	GTCTT	2	10	912721	912730	0 %	60 %	20 %	20 %	116494440
17429	NC_008526	CAG	2	6	912733	912738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494440
17430	NC_008526	TTGG	2	8	912753	912760	0 %	50 %	50 %	0 %	116494440
17431	NC_008526	GGTGT	2	10	912816	912825	0 %	40 %	60 %	0 %	116494440
17432	NC_008526	AACC	2	8	912949	912956	50 %	0 %	0 %	50 %	116494440
17433	NC_008526	GGA	2	6	913058	913063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494440
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17435	NC_008526	TTG	2	6	913086	913091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494441
17436	NC_008526	TGC	2	6	913116	913121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494441
17437	NC_008526	AGG	2	6	913173	913178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494441
17438	NC_008526	ATC	2	6	913214	913219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494441
17439	NC_008526	TGC	2	6	913230	913235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494441
17440	NC_008526	TTG	2	6	913335	913340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494441
17441	NC_008526	CGC	2	6	913383	913388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494441
17442	NC_008526	ACG	2	6	913420	913425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494441
17443	NC_008526	GAGTCA	2	12	913426	913437	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116494441
17444	NC_008526	GATCA	2	10	913469	913478	40 %	20 %	20 %	20 %	116494441
17445	NC_008526	TGG	2	6	913662	913667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494441
17446	NC_008526	TCA	2	6	913798	913803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494442
17447	NC_008526	T	6	6	913827	913832	0 %	100 %	0 %	0 %	116494442
17448	NC_008526	CAA	2	6	913854	913859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494442
17449	NC_008526	CAA	2	6	913869	913874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494442
17450	NC_008526	CGG	2	6	913887	913892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494442
17451	NC_008526	ATG	2	6	913921	913926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494442
17452	NC_008526	TCA	2	6	913966	913971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494442
17453	NC_008526	AAT	2	6	913983	913988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494442
17454	NC_008526	AAC	2	6	914054	914059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494442
17455	NC_008526	TATT	2	8	914091	914098	25 %	75 %	0 %	0 %	116494442
17456	NC_008526	GTGG	2	8	914114	914121	0 %	25 %	75 %	0 %	116494442
17457	NC_008526	AAG	2	6	914248	914253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494442
17458	NC_008526	GAAA	2	8	914293	914300	75 %	0 %	25 %	0 %	116494442
17459	NC_008526	CGC	2	6	914352	914357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494442
17460	NC_008526	TCAA	2	8	914411	914418	50 %	25 %	0 %	25 %	116494442
17461	NC_008526	TTGA	2	8	914430	914437	25 %	50 %	25 %	0 %	116494442
17462	NC_008526	GCT	2	6	914510	914515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494442
17463	NC_008526	TCA	2	6	914519	914524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494442
17464	NC_008526	TGA	2	6	914552	914557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494442
17465	NC_008526	GC	3	6	914577	914582	0 %	0 %	50 %	50 %	116494442
17466	NC_008526	AC	3	6	914591	914596	50 %	0 %	0 %	50 %	116494442
17467	NC_008526	A	6	6	914608	914613	100 %	0 %	0 %	0 %	116494442
17468	NC_008526	CAT	2	6	914616	914621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494442
17469	NC_008526	ATG	2	6	914719	914724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494442
17470	NC_008526	ACTT	2	8	914727	914734	25 %	50 %	0 %	25 %	116494442
17471	NC_008526	A	6	6	914746	914751	100 %	0 %	0 %	0 %	116494442
17472	NC_008526	GTCA	2	8	914775	914782	25 %	25 %	25 %	25 %	116494442
17473	NC_008526	GAA	2	6	914843	914848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494442
17474	NC_008526	ATT	2	6	914880	914885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494442
17475	NC_008526	AATT	2	8	914911	914918	50 %	50 %	0 %	0 %	116494442
17476	NC_008526	CCAA	2	8	914950	914957	50 %	0 %	0 %	50 %	116494442
17477	NC_008526	A	6	6	914982	914987	100 %	0 %	0 %	0 %	116494442
17478	NC_008526	GAT	2	6	914994	914999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494442
17479	NC_008526	CAAG	2	8	915032	915039	50 %	0 %	25 %	25 %	116494442
17480	NC_008526	TGAC	2	8	915079	915086	25 %	25 %	25 %	25 %	116494442
17481	NC_008526	AAC	2	6	915123	915128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494442
17482	NC_008526	TCT	2	6	915133	915138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494442
17483	NC_008526	ATC	2	6	915184	915189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494442
17484	NC_008526	GTC	2	6	915286	915291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494442
17485	NC_008526	ATGG	2	8	915345	915352	25 %	25 %	50 %	0 %	116494442
17486	NC_008526	CAT	2	6	915449	915454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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