MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_008526	TCA	2	6	864825	864830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494397
16502	NC_008526	CGA	2	6	864859	864864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494397
16503	NC_008526	TGGC	2	8	864894	864901	0 %	25 %	50 %	25 %	116494397
16504	NC_008526	TGA	2	6	864996	865001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494397
16505	NC_008526	GCA	2	6	865059	865064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494397
16506	NC_008526	GCCCA	2	10	865103	865112	20 %	0 %	20 %	60 %	116494397
16507	NC_008526	CAA	3	9	865117	865125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494397
16508	NC_008526	TTGC	2	8	865132	865139	0 %	50 %	25 %	25 %	116494397
16509	NC_008526	CAG	2	6	865264	865269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494397
16510	NC_008526	GCA	2	6	865287	865292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494397
16511	NC_008526	CAA	2	6	865315	865320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494397
16512	NC_008526	GCC	2	6	865418	865423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494398
16513	NC_008526	GTC	2	6	865457	865462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494398
16514	NC_008526	GCG	2	6	865509	865514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494398
16515	NC_008526	CCG	2	6	865607	865612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494398
16516	NC_008526	GATA	2	8	865677	865684	50 %	25 %	25 %	0 %	116494398
16517	NC_008526	GTT	2	6	865701	865706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494398
16518	NC_008526	TTC	2	6	865732	865737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494398
16519	NC_008526	GTC	2	6	865852	865857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494398
16520	NC_008526	AAC	2	6	865875	865880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494398
16521	NC_008526	TCA	2	6	865905	865910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494398
16522	NC_008526	GCT	2	6	865939	865944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16523	NC_008526	TTGC	2	8	865980	865987	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16524	NC_008526	TGT	2	6	866019	866024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16525	NC_008526	CGG	2	6	866126	866131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16526	NC_008526	AAC	2	6	866154	866159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16527	NC_008526	G	6	6	866185	866190	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16528	NC_008526	TG	3	6	866198	866203	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16529	NC_008526	TCA	2	6	866243	866248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16530	NC_008526	GAG	2	6	866306	866311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16531	NC_008526	ATG	2	6	866319	866324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16532	NC_008526	GAT	2	6	866360	866365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16533	NC_008526	GAT	2	6	866371	866376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494399
16534	NC_008526	TGA	2	6	866386	866391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494399
16535	NC_008526	TACT	2	8	866393	866400	25 %	50 %	0 %	25 %	116494399
16536	NC_008526	TGC	2	6	866425	866430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494399
16537	NC_008526	CCGA	2	8	866583	866590	25 %	0 %	25 %	50 %	116494399
16538	NC_008526	ATG	2	6	866610	866615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494399
16539	NC_008526	TAT	2	6	866732	866737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494399
16540	NC_008526	CTA	2	6	866851	866856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494399
16541	NC_008526	TAT	2	6	866888	866893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494399
16542	NC_008526	TCAGAT	2	12	866911	866922	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116494399
16543	NC_008526	AGA	2	6	866956	866961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494399
16544	NC_008526	GTT	2	6	866986	866991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494399
16545	NC_008526	AAC	2	6	867031	867036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494399
16546	NC_008526	ATGC	2	8	867086	867093	25 %	25 %	25 %	25 %	116494399
16547	NC_008526	GTTT	2	8	867106	867113	0 %	75 %	25 %	0 %	116494399
16548	NC_008526	TGC	2	6	867186	867191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494399
16549	NC_008526	CAG	2	6	867233	867238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494399
16550	NC_008526	GGC	2	6	867277	867282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494399
16551	NC_008526	CGG	2	6	867324	867329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494399
16552	NC_008526	CCG	2	6	867330	867335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494399
16553	NC_008526	GCAA	2	8	867338	867345	50 %	0 %	25 %	25 %	116494399
16554	NC_008526	TTTG	2	8	867448	867455	0 %	75 %	25 %	0 %	116494399
16555	NC_008526	TGA	2	6	867463	867468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494399
16556	NC_008526	TTG	2	6	867578	867583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494399
16557	NC_008526	GGT	2	6	867605	867610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494399
16558	NC_008526	CGTTGG	2	12	867612	867623	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116494399
16559	NC_008526	GTG	2	6	867650	867655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494399
16560	NC_008526	TG	3	6	867686	867691	0 %	50 %	50 %	0 %	116494399
16561	NC_008526	TTATC	2	10	867709	867718	20 %	60 %	0 %	20 %	116494399
16562	NC_008526	CAA	2	6	867785	867790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494399
16563	NC_008526	AGC	2	6	867822	867827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494399
16564	NC_008526	TGGAC	2	10	867868	867877	20 %	20 %	40 %	20 %	116494399
16565	NC_008526	AGG	2	6	867899	867904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16566	NC_008526	TAT	2	6	867914	867919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494400
16567	NC_008526	T	6	6	867919	867924	0 %	100 %	0 %	0 %	116494400
16568	NC_008526	CTG	2	6	868115	868120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494400
16569	NC_008526	GCA	2	6	868132	868137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494400
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16571	NC_008526	GGC	2	6	868194	868199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494400
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16579	NC_008526	CTGG	2	8	868605	868612	0 %	25 %	50 %	25 %	116494400
16580	NC_008526	TTG	2	6	868616	868621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494400
16581	NC_008526	GAC	2	6	868627	868632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494400
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16586	NC_008526	AAC	2	6	868890	868895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494400
16587	NC_008526	TGG	2	6	868899	868904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494400
16588	NC_008526	CAG	2	6	868934	868939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494400
16589	NC_008526	GAT	2	6	869200	869205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494400
16590	NC_008526	GGC	2	6	869446	869451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494400
16591	NC_008526	A	6	6	869515	869520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16592	NC_008526	TTATGA	2	12	869575	869586	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116494401
16593	NC_008526	AGA	2	6	869596	869601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494401
16594	NC_008526	ATGC	2	8	869834	869841	25 %	25 %	25 %	25 %	116494401
16595	NC_008526	AGC	2	6	869866	869871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494401
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16597	NC_008526	CAG	2	6	870015	870020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494401
16598	NC_008526	CTT	2	6	870029	870034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494401
16599	NC_008526	TC	3	6	870175	870180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16600	NC_008526	CATG	2	8	870333	870340	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16601	NC_008526	GAT	2	6	870377	870382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16602	NC_008526	GAA	2	6	870388	870393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494402
16603	NC_008526	TTG	2	6	870416	870421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494402
16604	NC_008526	AAG	2	6	870575	870580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494402
16605	NC_008526	CTA	2	6	870612	870617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494402
16606	NC_008526	ATTG	2	8	870628	870635	25 %	50 %	25 %	0 %	116494402
16607	NC_008526	TAT	2	6	870769	870774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494402
16608	NC_008526	CTG	2	6	870836	870841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494402
16609	NC_008526	TGGC	2	8	870843	870850	0 %	25 %	50 %	25 %	116494402
16610	NC_008526	T	6	6	870908	870913	0 %	100 %	0 %	0 %	116494402
16611	NC_008526	CGGT	2	8	870929	870936	0 %	25 %	50 %	25 %	116494402
16612	NC_008526	GAA	2	6	870952	870957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494402
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16615	NC_008526	TGA	2	6	871008	871013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494402
16616	NC_008526	GTC	2	6	871096	871101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494402
16617	NC_008526	ATT	3	9	871153	871161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494402
16618	NC_008526	ATG	2	6	871187	871192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494402
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16986	NC_008526	ATT	2	6	890644	890649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494422
16987	NC_008526	TGA	2	6	890786	890791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494422
16988	NC_008526	CAAA	2	8	890802	890809	75 %	0 %	0 %	25 %	116494422
16989	NC_008526	ATG	2	6	890828	890833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16991	NC_008526	T	6	6	890856	890861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16992	NC_008526	GAC	2	6	890882	890887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16995	NC_008526	ACA	3	9	891039	891047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494423
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