MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_008526	CCAA	2	8	730719	730726	50 %	0 %	0 %	50 %	116494276
14002	NC_008526	T	7	7	730753	730759	0 %	100 %	0 %	0 %	116494276
14003	NC_008526	GAT	3	9	730788	730796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494276
14004	NC_008526	AGC	2	6	730828	730833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494276
14005	NC_008526	TGC	2	6	730850	730855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494276
14006	NC_008526	TAG	2	6	730856	730861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494276
14007	NC_008526	TGAA	2	8	730897	730904	50 %	25 %	25 %	0 %	116494277
14008	NC_008526	TCA	2	6	730916	730921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494277
14009	NC_008526	ATC	2	6	730936	730941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494277
14010	NC_008526	AGC	2	6	730945	730950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494277
14011	NC_008526	GTT	2	6	730951	730956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494277
14012	NC_008526	AGC	2	6	730971	730976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494277
14013	NC_008526	CAA	2	6	731006	731011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494277
14014	NC_008526	TCA	2	6	731063	731068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494277
14015	NC_008526	CTT	2	6	731150	731155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494277
14016	NC_008526	GAA	2	6	731205	731210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494277
14017	NC_008526	AGCACA	2	12	731287	731298	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116494277
14018	NC_008526	CGG	2	6	731322	731327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494277
14019	NC_008526	TCAAA	2	10	731354	731363	60 %	20 %	0 %	20 %	116494277
14020	NC_008526	A	6	6	731414	731419	100 %	0 %	0 %	0 %	116494277
14021	NC_008526	TGG	2	6	731420	731425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494277
14022	NC_008526	GTA	2	6	731436	731441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494277
14023	NC_008526	ACT	2	6	731460	731465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494277
14024	NC_008526	A	6	6	731520	731525	100 %	0 %	0 %	0 %	116494277
14025	NC_008526	ATC	2	6	731602	731607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494277
14026	NC_008526	GCA	2	6	731645	731650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494277
14027	NC_008526	ACC	2	6	731753	731758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494277
14028	NC_008526	ATT	2	6	731862	731867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494278
14029	NC_008526	GCC	2	6	731871	731876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494278
14030	NC_008526	CTGC	2	8	732096	732103	0 %	25 %	25 %	50 %	116494278
14031	NC_008526	AAC	2	6	732232	732237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494278
14032	NC_008526	GC	3	6	732247	732252	0 %	0 %	50 %	50 %	116494278
14033	NC_008526	ACA	2	6	732309	732314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494278
14034	NC_008526	GAT	2	6	732412	732417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494278
14035	NC_008526	GCCA	2	8	732421	732428	25 %	0 %	25 %	50 %	116494278
14036	NC_008526	CG	3	6	732446	732451	0 %	0 %	50 %	50 %	116494278
14037	NC_008526	CGG	2	6	732459	732464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494278
14038	NC_008526	TCC	2	6	732486	732491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14039	NC_008526	TCA	2	6	732548	732553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494279
14040	NC_008526	GCAG	2	8	732588	732595	25 %	0 %	50 %	25 %	116494279
14041	NC_008526	GGC	2	6	732598	732603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494279
14042	NC_008526	GTCA	2	8	732637	732644	25 %	25 %	25 %	25 %	116494279
14043	NC_008526	T	6	6	732652	732657	0 %	100 %	0 %	0 %	116494279
14044	NC_008526	TCA	2	6	732662	732667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494279
14045	NC_008526	T	6	6	732725	732730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_008526	ATTA	2	8	732737	732744	50 %	50 %	0 %	0 %	116494280
14047	NC_008526	ACT	2	6	732751	732756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494280
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14049	NC_008526	GTT	2	6	732795	732800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494280
14050	NC_008526	GTTATT	2	12	732847	732858	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116494280
14051	NC_008526	TAT	2	6	732879	732884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494280
14052	NC_008526	TGA	2	6	732940	732945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494280
14053	NC_008526	TGG	2	6	732946	732951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494280
14054	NC_008526	TTGG	2	8	732957	732964	0 %	50 %	50 %	0 %	116494280
14055	NC_008526	GCT	2	6	732982	732987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494280
14056	NC_008526	GCTG	2	8	733006	733013	0 %	25 %	50 %	25 %	116494280
14057	NC_008526	TTC	2	6	733055	733060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494280
14058	NC_008526	GTTTT	2	10	733109	733118	0 %	80 %	20 %	0 %	116494280
14059	NC_008526	GTT	2	6	733132	733137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494280
14060	NC_008526	TCG	2	6	733236	733241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494280
14061	NC_008526	GAC	2	6	733324	733329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494280
14062	NC_008526	GT	3	6	733474	733479	0 %	50 %	50 %	0 %	116494280
14063	NC_008526	CTG	3	9	733502	733510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494280
14064	NC_008526	GAA	2	6	733545	733550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494280
14065	NC_008526	CGA	2	6	733619	733624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494280
14066	NC_008526	CCT	2	6	733657	733662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14067	NC_008526	TAACC	2	10	733734	733743	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14068	NC_008526	GGT	2	6	733839	733844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494281
14069	NC_008526	GTG	2	6	733857	733862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494281
14070	NC_008526	ATA	2	6	733889	733894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494281
14071	NC_008526	GCC	2	6	733895	733900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494281
14072	NC_008526	CAGC	2	8	733924	733931	25 %	0 %	25 %	50 %	116494281
14073	NC_008526	GGC	2	6	733967	733972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494281
14074	NC_008526	GGC	2	6	733995	734000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494281
14075	NC_008526	CGT	2	6	734107	734112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494281
14076	NC_008526	GCC	2	6	734115	734120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494281
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14079	NC_008526	AGT	2	6	734326	734331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494282
14080	NC_008526	AAC	2	6	734340	734345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494282
14081	NC_008526	TGA	2	6	734420	734425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494282
14082	NC_008526	GCT	2	6	734446	734451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494282
14083	NC_008526	CTT	2	6	734469	734474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494282
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14085	NC_008526	CAA	2	6	734600	734605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494282
14086	NC_008526	ATC	2	6	734665	734670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14087	NC_008526	GATA	2	8	734720	734727	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_008526	TAA	2	6	734733	734738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_008526	CGA	2	6	734985	734990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494283
14090	NC_008526	GGC	2	6	735016	735021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494283
14091	NC_008526	CAATA	2	10	735137	735146	60 %	20 %	0 %	20 %	116494283
14092	NC_008526	GAT	2	6	735218	735223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494283
14093	NC_008526	CAA	2	6	735230	735235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494283
14094	NC_008526	TGGT	2	8	735278	735285	0 %	50 %	50 %	0 %	116494283
14095	NC_008526	ATG	2	6	735321	735326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494283
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14101	NC_008526	TTGAAG	2	12	735516	735527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494283
14102	NC_008526	AAT	2	6	735608	735613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494283
14103	NC_008526	ATT	2	6	735650	735655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494283
14104	NC_008526	TA	3	6	735682	735687	50 %	50 %	0 %	0 %	116494283
14105	NC_008526	TGG	2	6	735734	735739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494283
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14107	NC_008526	GGC	2	6	735772	735777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494283
14108	NC_008526	TGG	2	6	735779	735784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494283
14109	NC_008526	TG	3	6	735873	735878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_008526	CGTC	2	8	735879	735886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14111	NC_008526	GGCC	2	8	735926	735933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14112	NC_008526	TGACA	2	10	736020	736029	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14113	NC_008526	TGC	2	6	736061	736066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494284
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14116	NC_008526	A	6	6	736187	736192	100 %	0 %	0 %	0 %	116494284
14117	NC_008526	CAC	2	6	736210	736215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494284
14118	NC_008526	AAG	2	6	736225	736230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494284
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14120	NC_008526	TAA	2	6	736401	736406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494284
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14240	NC_008526	ATCGAT	2	12	742613	742624	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116494289
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14486	NC_008526	TTC	2	6	755001	755006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494302
14487	NC_008526	CTT	2	6	755021	755026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494302
14488	NC_008526	GAT	2	6	755033	755038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494302
14489	NC_008526	GAC	2	6	755039	755044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494302
14490	NC_008526	CCA	2	6	755174	755179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494302
14491	NC_008526	CGT	2	6	755246	755251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494302
14492	NC_008526	ATTC	2	8	755262	755269	25 %	50 %	0 %	25 %	116494302
14493	NC_008526	CCT	2	6	755277	755282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14494	NC_008526	TCA	2	6	755371	755376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14495	NC_008526	T	6	6	755409	755414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14496	NC_008526	TA	4	8	755429	755436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14497	NC_008526	TAA	2	6	755487	755492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14498	NC_008526	GC	3	6	755505	755510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14499	NC_008526	ACA	2	6	755578	755583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14500	NC_008526	GAT	2	6	755623	755628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494303

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