MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008526	ATGA	2	8	679948	679955	50 %	25 %	25 %	0 %	116494225
13002	NC_008526	CAG	2	6	679983	679988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494225
13003	NC_008526	ATGG	2	8	680057	680064	25 %	25 %	50 %	0 %	116494225
13004	NC_008526	TCC	2	6	680097	680102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13005	NC_008526	TGA	3	9	680110	680118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_008526	GAG	2	6	680172	680177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_008526	GTCC	2	8	680221	680228	0 %	25 %	25 %	50 %	116494226
13008	NC_008526	CGAT	2	8	680264	680271	25 %	25 %	25 %	25 %	116494226
13009	NC_008526	TTTGC	2	10	680273	680282	0 %	60 %	20 %	20 %	116494226
13010	NC_008526	CAG	2	6	680307	680312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494226
13011	NC_008526	CAG	2	6	680322	680327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494226
13012	NC_008526	TGCT	2	8	680392	680399	0 %	50 %	25 %	25 %	116494226
13013	NC_008526	TTC	2	6	680413	680418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494226
13014	NC_008526	CAG	2	6	680442	680447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494226
13015	NC_008526	AATG	2	8	680455	680462	50 %	25 %	25 %	0 %	116494226
13016	NC_008526	CCT	3	9	680505	680513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116494226
13017	NC_008526	CGC	2	6	680835	680840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494226
13018	NC_008526	ATC	2	6	680869	680874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494226
13019	NC_008526	CAT	2	6	680907	680912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494226
13020	NC_008526	AGC	2	6	680933	680938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494226
13021	NC_008526	TTC	2	6	681022	681027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494226
13022	NC_008526	TGG	2	6	681054	681059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494226
13023	NC_008526	TCA	2	6	681062	681067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494226
13024	NC_008526	GCT	2	6	681083	681088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494226
13025	NC_008526	CAGAG	2	10	681127	681136	40 %	0 %	40 %	20 %	116494226
13026	NC_008526	GTT	2	6	681142	681147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494226
13027	NC_008526	TTG	2	6	681160	681165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494226
13028	NC_008526	CAG	2	6	681183	681188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494226
13029	NC_008526	TCC	2	6	681213	681218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13030	NC_008526	GAA	2	6	681288	681293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494227
13031	NC_008526	TGTT	2	8	681306	681313	0 %	75 %	25 %	0 %	116494227
13032	NC_008526	TGT	2	6	681332	681337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494227
13033	NC_008526	GAT	2	6	681348	681353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494227
13034	NC_008526	CTT	2	6	681354	681359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494227
13035	NC_008526	CAC	2	6	681437	681442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494227
13036	NC_008526	TCA	2	6	681499	681504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494227
13037	NC_008526	CA	3	6	681503	681508	50 %	0 %	0 %	50 %	116494227
13038	NC_008526	CGT	2	6	681524	681529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494227
13039	NC_008526	GCG	2	6	681538	681543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494227
13040	NC_008526	TCA	2	6	681667	681672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494227
13041	NC_008526	AAT	2	6	681753	681758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494227
13042	NC_008526	TCT	2	6	681779	681784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_008526	T	6	6	681814	681819	0 %	100 %	0 %	0 %	116494228
13044	NC_008526	TCT	2	6	681975	681980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494228
13045	NC_008526	ATG	2	6	682053	682058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494228
13046	NC_008526	CGC	2	6	682072	682077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494228
13047	NC_008526	CAA	2	6	682111	682116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494228
13048	NC_008526	CAG	2	6	682123	682128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494228
13049	NC_008526	TGA	2	6	682158	682163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494228
13050	NC_008526	AAT	2	6	682220	682225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494228
13051	NC_008526	TGA	2	6	682265	682270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494229
13052	NC_008526	TG	3	6	682273	682278	0 %	50 %	50 %	0 %	116494229
13053	NC_008526	ATC	2	6	682299	682304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494229
13054	NC_008526	TCTG	2	8	682336	682343	0 %	50 %	25 %	25 %	116494229
13055	NC_008526	CTT	2	6	682448	682453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494229
13056	NC_008526	GTG	3	9	682513	682521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494229
13057	NC_008526	CG	3	6	682614	682619	0 %	0 %	50 %	50 %	116494229
13058	NC_008526	TGA	2	6	682655	682660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494229
13059	NC_008526	T	6	6	682674	682679	0 %	100 %	0 %	0 %	116494229
13060	NC_008526	TCGT	2	8	682699	682706	0 %	50 %	25 %	25 %	116494229
13061	NC_008526	TTG	2	6	682757	682762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494229
13062	NC_008526	TTCA	2	8	682779	682786	25 %	50 %	0 %	25 %	116494229
13063	NC_008526	ATCG	2	8	682792	682799	25 %	25 %	25 %	25 %	116494229
13064	NC_008526	TCAG	2	8	682819	682826	25 %	25 %	25 %	25 %	116494229
13065	NC_008526	GCC	2	6	682851	682856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494229
13066	NC_008526	GT	3	6	683031	683036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_008526	TTG	2	6	683040	683045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_008526	TTA	2	6	683060	683065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_008526	ACC	2	6	683079	683084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13070	NC_008526	TGA	2	6	683141	683146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_008526	GCA	2	6	683199	683204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13072	NC_008526	ACA	2	6	683221	683226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_008526	AC	4	8	683228	683235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13074	NC_008526	ATGCTC	2	12	683268	683279	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13075	NC_008526	A	6	6	683340	683345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_008526	A	9	9	683353	683361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_008526	GCAC	2	8	683382	683389	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13078	NC_008526	TTGG	2	8	683403	683410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_008526	GTA	2	6	683437	683442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_008526	TA	3	6	683441	683446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_008526	AAC	2	6	683452	683457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13082	NC_008526	TGT	2	6	683498	683503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494230
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13085	NC_008526	TTG	2	6	683684	683689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494230
13086	NC_008526	TCT	2	6	683750	683755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494230
13087	NC_008526	GTCTT	2	10	683768	683777	0 %	60 %	20 %	20 %	116494230
13088	NC_008526	GTTT	2	8	683804	683811	0 %	75 %	25 %	0 %	116494230
13089	NC_008526	TGC	2	6	683828	683833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494230
13090	NC_008526	TCT	2	6	683876	683881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494230
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13092	NC_008526	T	6	6	684012	684017	0 %	100 %	0 %	0 %	116494230
13093	NC_008526	AGC	2	6	684050	684055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494230
13094	NC_008526	TCC	2	6	684093	684098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13095	NC_008526	AC	3	6	684159	684164	50 %	0 %	0 %	50 %	116494231
13096	NC_008526	A	6	6	684184	684189	100 %	0 %	0 %	0 %	116494231
13097	NC_008526	TGATTT	2	12	684195	684206	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116494231
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13102	NC_008526	CTA	2	6	684446	684451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494231
13103	NC_008526	TGTT	2	8	684455	684462	0 %	75 %	25 %	0 %	116494231
13104	NC_008526	TGC	2	6	684521	684526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494231
13105	NC_008526	TTTA	2	8	684624	684631	25 %	75 %	0 %	0 %	116494231
13106	NC_008526	T	6	6	684663	684668	0 %	100 %	0 %	0 %	116494231
13107	NC_008526	GCT	2	6	684670	684675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494231
13108	NC_008526	TGG	2	6	684714	684719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494231
13109	NC_008526	GAT	2	6	684739	684744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494231
13110	NC_008526	GCA	2	6	684748	684753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494231
13111	NC_008526	CAT	2	6	684787	684792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494231
13112	NC_008526	CAG	3	9	684988	684996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494231
13113	NC_008526	GATT	2	8	685017	685024	25 %	50 %	25 %	0 %	116494231
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13116	NC_008526	T	7	7	685176	685182	0 %	100 %	0 %	0 %	116494231
13117	NC_008526	GAT	2	6	685198	685203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494231
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13119	NC_008526	GAC	2	6	685242	685247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494231
13120	NC_008526	T	6	6	685296	685301	0 %	100 %	0 %	0 %	116494232
13121	NC_008526	ATGCAG	2	12	685309	685320	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116494232
13122	NC_008526	ATG	2	6	685516	685521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494232
13123	NC_008526	ATT	2	6	685528	685533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494232
13124	NC_008526	CCG	2	6	685548	685553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494232
13125	NC_008526	A	6	6	685566	685571	100 %	0 %	0 %	0 %	116494232
13126	NC_008526	GCTA	2	8	685610	685617	25 %	25 %	25 %	25 %	116494232
13127	NC_008526	TTGTT	2	10	685720	685729	0 %	80 %	20 %	0 %	116494232
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13132	NC_008526	GCC	2	6	686112	686117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494232
13133	NC_008526	AAAC	2	8	686145	686152	75 %	0 %	0 %	25 %	116494232
13134	NC_008526	TGC	2	6	686210	686215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494232
13135	NC_008526	AGC	2	6	686279	686284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494232
13136	NC_008526	ACG	2	6	686289	686294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494232
13137	NC_008526	CAAG	2	8	686318	686325	50 %	0 %	25 %	25 %	116494232
13138	NC_008526	AAC	2	6	686374	686379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494232
13139	NC_008526	AGC	2	6	686450	686455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494232
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13141	NC_008526	ACA	2	6	686492	686497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494232
13142	NC_008526	CAG	2	6	686529	686534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494232
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13144	NC_008526	A	7	7	686676	686682	100 %	0 %	0 %	0 %	116494232
13145	NC_008526	CAG	2	6	686748	686753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494232
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13148	NC_008526	CATCCG	2	12	686835	686846	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116494232
13149	NC_008526	AGC	2	6	686879	686884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494232
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13151	NC_008526	ACA	2	6	687077	687082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494232
13152	NC_008526	GGC	2	6	687104	687109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494232
13153	NC_008526	GCT	2	6	687150	687155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494232
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13155	NC_008526	GTCG	2	8	687320	687327	0 %	25 %	50 %	25 %	116494232
13156	NC_008526	AGG	2	6	687382	687387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494232
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13159	NC_008526	GCAA	2	8	687541	687548	50 %	0 %	25 %	25 %	116494232
13160	NC_008526	GAAC	2	8	687593	687600	50 %	0 %	25 %	25 %	116494232
13161	NC_008526	CAA	2	6	687633	687638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494232
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13188	NC_008526	CAGG	2	8	688827	688834	25 %	0 %	50 %	25 %	116494234
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13191	NC_008526	AAT	2	6	689080	689085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13192	NC_008526	AAG	2	6	689131	689136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13193	NC_008526	T	6	6	689150	689155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13194	NC_008526	A	6	6	689157	689162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13195	NC_008526	TCG	2	6	689320	689325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494235
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13204	NC_008526	CTGA	2	8	689732	689739	25 %	25 %	25 %	25 %	116494235
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13211	NC_008526	TCA	2	6	690114	690119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13212	NC_008526	ATG	2	6	690173	690178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494237
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13217	NC_008526	TGC	2	6	690318	690323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494237
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13224	NC_008526	T	6	6	690692	690697	0 %	100 %	0 %	0 %	116494237
13225	NC_008526	GGT	2	6	690844	690849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494237
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13227	NC_008526	GCTG	2	8	690964	690971	0 %	25 %	50 %	25 %	116494237
13228	NC_008526	ATG	2	6	691019	691024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494237
13229	NC_008526	GTT	2	6	691051	691056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494237
13230	NC_008526	CAT	2	6	691062	691067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494237
13231	NC_008526	GCG	2	6	691166	691171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494237
13232	NC_008526	GGTG	2	8	691197	691204	0 %	25 %	75 %	0 %	116494237
13233	NC_008526	AGA	2	6	691245	691250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494237
13234	NC_008526	TCA	2	6	691322	691327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13235	NC_008526	GCTG	2	8	691353	691360	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13236	NC_008526	CCGCT	2	10	691400	691409	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13237	NC_008526	GCA	2	6	691529	691534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494238
13238	NC_008526	GCG	2	6	691577	691582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494238
13239	NC_008526	GGTT	2	8	691604	691611	0 %	50 %	50 %	0 %	116494238
13240	NC_008526	GAA	2	6	691621	691626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494238
13241	NC_008526	AAG	2	6	691629	691634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494238
13242	NC_008526	CTT	2	6	691708	691713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494238
13243	NC_008526	CAG	2	6	691716	691721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494238
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13357	NC_008526	GTC	2	6	697682	697687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13358	NC_008526	CG	3	6	697801	697806	0 %	0 %	50 %	50 %	116494246
13359	NC_008526	TTAG	2	8	698035	698042	25 %	50 %	25 %	0 %	116494246
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13485	NC_008526	GGCT	2	8	704658	704665	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13486	NC_008526	GGTC	2	8	704736	704743	0 %	25 %	50 %	25 %	116494252
13487	NC_008526	GCG	2	6	704867	704872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494252
13488	NC_008526	GGT	2	6	704891	704896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494252
13489	NC_008526	ACC	2	6	704927	704932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494252
13490	NC_008526	TCA	2	6	705000	705005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494252
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13492	NC_008526	ACC	2	6	705080	705085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494252
13493	NC_008526	CAT	3	9	705088	705096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494252
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