MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_008526	TGC	2	6	654635	654640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494203
12502	NC_008526	CGG	2	6	654772	654777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494203
12503	NC_008526	AAT	2	6	654812	654817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494203
12504	NC_008526	CTA	2	6	654903	654908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_008526	GGT	2	6	654969	654974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_008526	TGG	3	9	655044	655052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494204
12507	NC_008526	CA	3	6	655117	655122	50 %	0 %	0 %	50 %	116494204
12508	NC_008526	T	7	7	655174	655180	0 %	100 %	0 %	0 %	116494204
12509	NC_008526	GCC	2	6	655310	655315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494204
12510	NC_008526	GAC	2	6	655324	655329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494204
12511	NC_008526	CAT	2	6	655418	655423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494204
12512	NC_008526	GCTG	2	8	655431	655438	0 %	25 %	50 %	25 %	116494204
12513	NC_008526	CGA	2	6	655564	655569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494204
12514	NC_008526	GCG	2	6	655615	655620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494204
12515	NC_008526	CTG	2	6	655622	655627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494204
12516	NC_008526	ATT	2	6	655652	655657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494204
12517	NC_008526	TCA	2	6	655813	655818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494205
12518	NC_008526	AAT	2	6	655874	655879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494205
12519	NC_008526	ATC	2	6	655887	655892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494205
12520	NC_008526	TCA	2	6	655937	655942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494205
12521	NC_008526	T	6	6	655945	655950	0 %	100 %	0 %	0 %	116494205
12522	NC_008526	ATT	3	9	655953	655961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494205
12523	NC_008526	TTG	2	6	656026	656031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494205
12524	NC_008526	ATG	2	6	656080	656085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494205
12525	NC_008526	TGT	2	6	656145	656150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494205
12526	NC_008526	TTG	2	6	656203	656208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494205
12527	NC_008526	GTT	2	6	656226	656231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494205
12528	NC_008526	GCG	2	6	656315	656320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494205
12529	NC_008526	CAG	2	6	656328	656333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494205
12530	NC_008526	GT	3	6	656338	656343	0 %	50 %	50 %	0 %	116494205
12531	NC_008526	TGC	2	6	656344	656349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494205
12532	NC_008526	CCG	2	6	656362	656367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494205
12533	NC_008526	ACA	2	6	656381	656386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494205
12534	NC_008526	GTC	2	6	656392	656397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494205
12535	NC_008526	CCG	2	6	656403	656408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494205
12536	NC_008526	CGCC	2	8	656412	656419	0 %	0 %	25 %	75 %	116494205
12537	NC_008526	GCA	2	6	656441	656446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494205
12538	NC_008526	AGC	2	6	656452	656457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494205
12539	NC_008526	TGA	2	6	656483	656488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494205
12540	NC_008526	TTC	2	6	656589	656594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12541	NC_008526	TAA	2	6	656626	656631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_008526	TGAC	2	8	656704	656711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12543	NC_008526	AAT	2	6	656735	656740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_008526	AT	3	6	656770	656775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_008526	ATT	2	6	656897	656902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494206
12546	NC_008526	ATC	2	6	656939	656944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494206
12547	NC_008526	TGA	2	6	657045	657050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494206
12548	NC_008526	TGA	2	6	657087	657092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494206
12549	NC_008526	TTGC	2	8	657296	657303	0 %	50 %	25 %	25 %	116494206
12550	NC_008526	GTT	2	6	657310	657315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494206
12551	NC_008526	CTG	2	6	657332	657337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494206
12552	NC_008526	CGA	2	6	657340	657345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494206
12553	NC_008526	ACCA	2	8	657346	657353	50 %	0 %	0 %	50 %	116494206
12554	NC_008526	AC	3	6	657409	657414	50 %	0 %	0 %	50 %	116494206
12555	NC_008526	TC	3	6	657426	657431	0 %	50 %	0 %	50 %	116494206
12556	NC_008526	ATG	2	6	657464	657469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494206
12557	NC_008526	TG	3	6	657468	657473	0 %	50 %	50 %	0 %	116494206
12558	NC_008526	A	6	6	657572	657577	100 %	0 %	0 %	0 %	116494206
12559	NC_008526	GAA	2	6	657578	657583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494206
12560	NC_008526	AGC	2	6	657591	657596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494206
12561	NC_008526	AGC	2	6	657663	657668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494206
12562	NC_008526	A	6	6	657672	657677	100 %	0 %	0 %	0 %	116494206
12563	NC_008526	GAT	2	6	657686	657691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494206
12564	NC_008526	ATC	2	6	657851	657856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494206
12565	NC_008526	GCT	2	6	657892	657897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494206
12566	NC_008526	CAC	2	6	657943	657948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494206
12567	NC_008526	ATG	2	6	657993	657998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494206
12568	NC_008526	TCGG	2	8	658074	658081	0 %	25 %	50 %	25 %	116494206
12569	NC_008526	TGG	2	6	658129	658134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494206
12570	NC_008526	ATG	2	6	658163	658168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494206
12571	NC_008526	TCA	2	6	658188	658193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494206
12572	NC_008526	GAC	2	6	658196	658201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494206
12573	NC_008526	CCAA	2	8	658202	658209	50 %	0 %	0 %	50 %	116494206
12574	NC_008526	ACG	2	6	658242	658247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494206
12575	NC_008526	TTCA	2	8	658298	658305	25 %	50 %	0 %	25 %	116494206
12576	NC_008526	GTT	2	6	658346	658351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494206
12577	NC_008526	ATG	2	6	658371	658376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494206
12578	NC_008526	AAG	2	6	658436	658441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494206
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12580	NC_008526	TGTT	2	8	658547	658554	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_008526	CCAGC	2	10	658660	658669	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12582	NC_008526	CAT	2	6	658744	658749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12583	NC_008526	GATA	2	8	658812	658819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12584	NC_008526	GT	5	10	658848	658857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_008526	GTT	2	6	658869	658874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12586	NC_008526	TTC	2	6	658945	658950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494207
12587	NC_008526	TTG	2	6	658969	658974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494207
12588	NC_008526	GAT	2	6	658976	658981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494207
12589	NC_008526	GCC	2	6	659094	659099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494207
12590	NC_008526	GAC	2	6	659142	659147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494207
12591	NC_008526	AGT	2	6	659205	659210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494207
12592	NC_008526	T	6	6	659289	659294	0 %	100 %	0 %	0 %	116494207
12593	NC_008526	ATC	2	6	659299	659304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494207
12594	NC_008526	AAC	2	6	659384	659389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494207
12595	NC_008526	A	6	6	659394	659399	100 %	0 %	0 %	0 %	116494207
12596	NC_008526	TTG	2	6	659457	659462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494207
12597	NC_008526	TGG	2	6	659497	659502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494207
12598	NC_008526	CTA	2	6	659525	659530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494207
12599	NC_008526	CAG	2	6	659599	659604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494207
12600	NC_008526	GCA	2	6	659710	659715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494207
12601	NC_008526	CAT	2	6	659744	659749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494207
12602	NC_008526	ACA	2	6	659773	659778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494207
12603	NC_008526	AGC	2	6	659796	659801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494207
12604	NC_008526	GCCATT	2	12	659853	659864	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116494207
12605	NC_008526	CG	3	6	659874	659879	0 %	0 %	50 %	50 %	116494207
12606	NC_008526	GGC	2	6	659916	659921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494207
12607	NC_008526	TTG	2	6	659949	659954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494207
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12609	NC_008526	TGA	2	6	660143	660148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494207
12610	NC_008526	TTG	2	6	660172	660177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494207
12611	NC_008526	CGG	2	6	660195	660200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494207
12612	NC_008526	CGA	2	6	660245	660250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494207
12613	NC_008526	CGAA	2	8	660275	660282	50 %	0 %	25 %	25 %	116494207
12614	NC_008526	AGG	2	6	660418	660423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494207
12615	NC_008526	AGG	2	6	660584	660589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494207
12616	NC_008526	GTG	2	6	660774	660779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494208
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12987	NC_008526	ATG	2	6	679262	679267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494225
12988	NC_008526	CAT	2	6	679284	679289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494225
12989	NC_008526	AGCC	2	8	679305	679312	25 %	0 %	25 %	50 %	116494225
12990	NC_008526	GCC	2	6	679513	679518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494225
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12993	NC_008526	ATC	2	6	679637	679642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494225
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