MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_008526	AAG	2	6	629403	629408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494182
12003	NC_008526	GAA	2	6	629464	629469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494182
12004	NC_008526	TGG	2	6	629493	629498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494182
12005	NC_008526	TGG	2	6	629511	629516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494182
12006	NC_008526	TTG	2	6	629593	629598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494182
12007	NC_008526	TGT	2	6	629657	629662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494182
12008	NC_008526	GGC	2	6	629673	629678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494182
12009	NC_008526	ATC	2	6	629734	629739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494182
12010	NC_008526	CGA	2	6	629817	629822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494182
12011	NC_008526	GGCA	2	8	629868	629875	25 %	0 %	50 %	25 %	116494182
12012	NC_008526	GAA	2	6	629920	629925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494182
12013	NC_008526	AGTTT	2	10	629934	629943	20 %	60 %	20 %	0 %	116494182
12014	NC_008526	T	6	6	629961	629966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12015	NC_008526	T	6	6	630106	630111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12016	NC_008526	GA	3	6	630120	630125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12017	NC_008526	TGA	2	6	630135	630140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12018	NC_008526	GATT	2	8	630181	630188	25 %	50 %	25 %	0 %	116494183
12019	NC_008526	AGA	2	6	630194	630199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494183
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12021	NC_008526	GTG	2	6	630315	630320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494183
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12040	NC_008526	TGC	2	6	631207	631212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494183
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12046	NC_008526	CG	3	6	631671	631676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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12089	NC_008526	T	6	6	633072	633077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12095	NC_008526	GC	3	6	633545	633550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12096	NC_008526	GCGG	2	8	633682	633689	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12097	NC_008526	GAG	2	6	633737	633742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12098	NC_008526	AAG	2	6	633831	633836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12099	NC_008526	ATT	2	6	633885	633890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12105	NC_008526	A	7	7	634347	634353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12106	NC_008526	AAT	2	6	634359	634364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12107	NC_008526	T	7	7	634371	634377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12108	NC_008526	CAT	2	6	634422	634427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12109	NC_008526	TGT	3	9	634463	634471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12112	NC_008526	T	7	7	634744	634750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12113	NC_008526	TGCGAC	2	12	634786	634797	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12114	NC_008526	TAT	2	6	634800	634805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12115	NC_008526	GTA	2	6	634822	634827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12117	NC_008526	TGC	2	6	634869	634874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494186
12118	NC_008526	CA	3	6	634890	634895	50 %	0 %	0 %	50 %	116494186
12119	NC_008526	CAA	2	6	634908	634913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494186
12120	NC_008526	CGC	2	6	634925	634930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494186
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12122	NC_008526	CGC	2	6	634966	634971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494186
12123	NC_008526	ATAG	2	8	634981	634988	50 %	25 %	25 %	0 %	116494186
12124	NC_008526	GCA	2	6	635007	635012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494186
12125	NC_008526	ATG	3	9	635013	635021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494186
12126	NC_008526	GCC	2	6	635027	635032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494186
12127	NC_008526	CGA	2	6	635049	635054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494186
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12129	NC_008526	CTG	2	6	635069	635074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494186
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12138	NC_008526	TTG	2	6	635335	635340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12139	NC_008526	CTT	2	6	635364	635369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12140	NC_008526	A	6	6	635374	635379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12141	NC_008526	AAG	2	6	635382	635387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12142	NC_008526	CTT	2	6	635410	635415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12143	NC_008526	TAT	2	6	635416	635421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12144	NC_008526	TGA	2	6	635444	635449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12145	NC_008526	ATC	2	6	635481	635486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494187
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12151	NC_008526	AACA	2	8	636012	636019	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12152	NC_008526	GTTTT	2	10	636030	636039	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12153	NC_008526	TCAG	2	8	636083	636090	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12154	NC_008526	TCG	2	6	636162	636167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494188
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12185	NC_008526	A	6	6	637718	637723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12221	NC_008526	A	7	7	639695	639701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12248	NC_008526	CTT	2	6	641292	641297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12487	NC_008526	ATAGC	2	10	653577	653586	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12488	NC_008526	CTG	2	6	653639	653644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12489	NC_008526	A	7	7	653666	653672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12490	NC_008526	TGG	2	6	653868	653873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12491	NC_008526	GAA	2	6	653978	653983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494203
12492	NC_008526	CGTTTT	2	12	654100	654111	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116494203
12493	NC_008526	GCC	2	6	654161	654166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494203
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12499	NC_008526	GAA	2	6	654551	654556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494203
12500	NC_008526	TCC	2	6	654612	654617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116494203

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