MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_008526	GTCTT	2	10	604069	604078	0 %	60 %	20 %	20 %	116494163
11502	NC_008526	TTGGC	2	10	604108	604117	0 %	40 %	40 %	20 %	116494163
11503	NC_008526	GT	3	6	604157	604162	0 %	50 %	50 %	0 %	116494163
11504	NC_008526	GTG	2	6	604399	604404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_008526	TC	3	6	604465	604470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11506	NC_008526	T	6	6	604518	604523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_008526	GGT	2	6	604535	604540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_008526	TGC	2	6	604587	604592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494164
11509	NC_008526	GCA	2	6	604786	604791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494164
11510	NC_008526	GAAC	2	8	604837	604844	50 %	0 %	25 %	25 %	116494164
11511	NC_008526	CAG	2	6	604845	604850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494164
11512	NC_008526	AAT	2	6	604868	604873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494164
11513	NC_008526	GGCG	2	8	604936	604943	0 %	0 %	75 %	25 %	116494164
11514	NC_008526	CTGG	2	8	604970	604977	0 %	25 %	50 %	25 %	116494164
11515	NC_008526	GCTG	2	8	604987	604994	0 %	25 %	50 %	25 %	116494164
11516	NC_008526	CGA	2	6	605008	605013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494164
11517	NC_008526	ATA	2	6	605019	605024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494164
11518	NC_008526	CAAGGC	2	12	605099	605110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494164
11519	NC_008526	CGG	2	6	605176	605181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494164
11520	NC_008526	G	8	8	605252	605259	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_008526	GAA	2	6	605286	605291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_008526	TAC	2	6	605323	605328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_008526	GTC	2	6	605496	605501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494165
11524	NC_008526	CGCCA	2	10	605587	605596	20 %	0 %	20 %	60 %	116494165
11525	NC_008526	TGA	3	9	605668	605676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494165
11526	NC_008526	G	6	6	605716	605721	0 %	0 %	100 %	0 %	116494165
11527	NC_008526	GAT	2	6	605724	605729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494165
11528	NC_008526	TCG	2	6	605783	605788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494166
11529	NC_008526	CAGT	2	8	605797	605804	25 %	25 %	25 %	25 %	116494166
11530	NC_008526	GAT	2	6	605815	605820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494166
11531	NC_008526	A	6	6	605829	605834	100 %	0 %	0 %	0 %	116494166
11532	NC_008526	CAG	2	6	605878	605883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494166
11533	NC_008526	TGG	2	6	605901	605906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494166
11534	NC_008526	CAA	2	6	605993	605998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494166
11535	NC_008526	GGC	2	6	606065	606070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494166
11536	NC_008526	TTGG	2	8	606133	606140	0 %	50 %	50 %	0 %	116494166
11537	NC_008526	GCA	2	6	606191	606196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494166
11538	NC_008526	ACA	2	6	606224	606229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494166
11539	NC_008526	GTT	2	6	606247	606252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494166
11540	NC_008526	AGGACA	2	12	606285	606296	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116494166
11541	NC_008526	GGA	2	6	606452	606457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_008526	TTGC	2	8	606484	606491	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11543	NC_008526	A	6	6	606506	606511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_008526	ACT	2	6	606566	606571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_008526	AGG	2	6	606578	606583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_008526	TGA	2	6	606589	606594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494167
11547	NC_008526	A	6	6	606594	606599	100 %	0 %	0 %	0 %	116494167
11548	NC_008526	TGT	2	6	606631	606636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494167
11549	NC_008526	CTG	2	6	606642	606647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494167
11550	NC_008526	CGA	2	6	606685	606690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494167
11551	NC_008526	CCG	2	6	606708	606713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494167
11552	NC_008526	GTG	2	6	606922	606927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494167
11553	NC_008526	TGC	2	6	606947	606952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494167
11554	NC_008526	GCG	2	6	606960	606965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494167
11555	NC_008526	G	6	6	607000	607005	0 %	0 %	100 %	0 %	116494167
11556	NC_008526	ATC	2	6	607009	607014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494167
11557	NC_008526	TCC	2	6	607016	607021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116494167
11558	NC_008526	AAG	2	6	607036	607041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494167
11559	NC_008526	TGG	3	9	607075	607083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494167
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11561	NC_008526	GGT	2	6	607113	607118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494167
11562	NC_008526	AAC	2	6	607123	607128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494167
11563	NC_008526	TTA	2	6	607145	607150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494167
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11565	NC_008526	AGA	2	6	607273	607278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494167
11566	NC_008526	GCCA	2	8	607292	607299	25 %	0 %	25 %	50 %	116494167
11567	NC_008526	A	6	6	607332	607337	100 %	0 %	0 %	0 %	116494167
11568	NC_008526	CG	3	6	607383	607388	0 %	0 %	50 %	50 %	116494167
11569	NC_008526	TCA	2	6	607414	607419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494167
11570	NC_008526	GAC	2	6	607505	607510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494167
11571	NC_008526	GTC	2	6	607533	607538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494167
11572	NC_008526	GCGGA	2	10	607594	607603	20 %	0 %	60 %	20 %	116494167
11573	NC_008526	CCA	2	6	607615	607620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494167
11574	NC_008526	TGC	2	6	607642	607647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494167
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11576	NC_008526	CGCC	2	8	607765	607772	0 %	0 %	25 %	75 %	116494167
11577	NC_008526	GCAACG	2	12	607896	607907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494167
11578	NC_008526	CAT	2	6	607938	607943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494167
11579	NC_008526	CTG	2	6	607947	607952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494167
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11585	NC_008526	ATA	2	6	608440	608445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494167
11586	NC_008526	GGC	2	6	608471	608476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494167
11587	NC_008526	TGG	2	6	608477	608482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494167
11588	NC_008526	CCTA	2	8	608524	608531	25 %	25 %	0 %	50 %	116494167
11589	NC_008526	GTT	2	6	608588	608593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494167
11590	NC_008526	A	6	6	608633	608638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_008526	GTG	2	6	608737	608742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494168
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11593	NC_008526	GCC	2	6	608794	608799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494168
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11595	NC_008526	TAG	2	6	608992	608997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494168
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11601	NC_008526	CGC	2	6	609462	609467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494168
11602	NC_008526	A	6	6	609579	609584	100 %	0 %	0 %	0 %	116494168
11603	NC_008526	GAAA	2	8	609601	609608	75 %	0 %	25 %	0 %	116494168
11604	NC_008526	TGGT	2	8	609623	609630	0 %	50 %	50 %	0 %	116494168
11605	NC_008526	GCGA	2	8	609634	609641	25 %	0 %	50 %	25 %	116494168
11606	NC_008526	A	7	7	609707	609713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_008526	CATT	2	8	609801	609808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11608	NC_008526	GAA	2	6	609809	609814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_008526	GTC	2	6	609841	609846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494169
11610	NC_008526	GGTT	2	8	609869	609876	0 %	50 %	50 %	0 %	116494169
11611	NC_008526	AGC	2	6	609892	609897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494169
11612	NC_008526	ACC	2	6	609945	609950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494169
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11614	NC_008526	GAT	2	6	609984	609989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494169
11615	NC_008526	A	6	6	609996	610001	100 %	0 %	0 %	0 %	116494169
11616	NC_008526	GC	3	6	610019	610024	0 %	0 %	50 %	50 %	116494169
11617	NC_008526	AC	3	6	610052	610057	50 %	0 %	0 %	50 %	116494169
11618	NC_008526	CCATC	2	10	610089	610098	20 %	20 %	0 %	60 %	116494169
11619	NC_008526	CAA	2	6	610143	610148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494169
11620	NC_008526	GCC	2	6	610158	610163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494169
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11622	NC_008526	AAT	2	6	610207	610212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494169
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