MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_008526	ATC	2	6	576974	576979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494139
11003	NC_008526	TGTA	2	8	577010	577017	25 %	50 %	25 %	0 %	116494139
11004	NC_008526	TCTT	2	8	577023	577030	0 %	75 %	0 %	25 %	116494139
11005	NC_008526	AAT	2	6	577134	577139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494139
11006	NC_008526	CGTC	2	8	577402	577409	0 %	25 %	25 %	50 %	116494139
11007	NC_008526	AGT	2	6	577410	577415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494139
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11009	NC_008526	TA	4	8	577520	577527	50 %	50 %	0 %	0 %	116494139
11010	NC_008526	TTTAT	2	10	577533	577542	20 %	80 %	0 %	0 %	116494139
11011	NC_008526	AAT	2	6	577578	577583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494139
11012	NC_008526	ACC	2	6	577590	577595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494140
11013	NC_008526	TTG	2	6	577678	577683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494140
11014	NC_008526	TAG	2	6	577730	577735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494140
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11017	NC_008526	ACC	2	6	578014	578019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494140
11018	NC_008526	GTCTT	2	10	578125	578134	0 %	60 %	20 %	20 %	116494140
11019	NC_008526	TTGGC	2	10	578164	578173	0 %	40 %	40 %	20 %	116494140
11020	NC_008526	GT	3	6	578213	578218	0 %	50 %	50 %	0 %	116494140
11021	NC_008526	GTG	2	6	578455	578460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_008526	TC	3	6	578521	578526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11023	NC_008526	T	6	6	578574	578579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_008526	GGT	2	6	578591	578596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_008526	T	8	8	578652	578659	0 %	100 %	0 %	0 %	116494141
11026	NC_008526	GTT	3	9	578685	578693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494141
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11028	NC_008526	TTG	2	6	578704	578709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494141
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11030	NC_008526	ATT	2	6	578774	578779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494141
11031	NC_008526	TTG	2	6	578807	578812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494141
11032	NC_008526	TTG	2	6	578838	578843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494141
11033	NC_008526	ACTTCA	2	12	578998	579009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11034	NC_008526	TGG	2	6	579048	579053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_008526	TAA	2	6	579102	579107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494142
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11038	NC_008526	GCAA	2	8	579190	579197	50 %	0 %	25 %	25 %	116494142
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11040	NC_008526	CAAT	2	8	579475	579482	50 %	25 %	0 %	25 %	116494142
11041	NC_008526	CAA	2	6	579491	579496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494142
11042	NC_008526	AAT	2	6	579507	579512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494142
11043	NC_008526	ATA	2	6	579550	579555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494142
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11047	NC_008526	GCC	2	6	579793	579798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494142
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11050	NC_008526	A	6	6	579930	579935	100 %	0 %	0 %	0 %	116494142
11051	NC_008526	TGT	2	6	579955	579960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494142
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11053	NC_008526	A	6	6	580093	580098	100 %	0 %	0 %	0 %	116494142
11054	NC_008526	TAA	2	6	580124	580129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494142
11055	NC_008526	GTA	2	6	580196	580201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_008526	AAAT	2	8	580290	580297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_008526	TAA	2	6	580311	580316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_008526	GGC	2	6	580347	580352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494143
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11062	NC_008526	CGT	2	6	580756	580761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494143
11063	NC_008526	ATG	2	6	580774	580779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494143
11064	NC_008526	GAAGCC	2	12	580909	580920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494143
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11066	NC_008526	TGG	2	6	581032	581037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_008526	GCT	2	6	581057	581062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11068	NC_008526	GTT	2	6	581090	581095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_008526	CGATAA	2	12	581139	581150	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116494144
11070	NC_008526	TGG	2	6	581196	581201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494144
11071	NC_008526	T	8	8	581266	581273	0 %	100 %	0 %	0 %	116494144
11072	NC_008526	TGGCC	2	10	581356	581365	0 %	20 %	40 %	40 %	116494144
11073	NC_008526	TA	3	6	581440	581445	50 %	50 %	0 %	0 %	116494144
11074	NC_008526	TGTTT	2	10	581455	581464	0 %	80 %	20 %	0 %	116494144
11075	NC_008526	TTCC	2	8	581499	581506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11077	NC_008526	CT	3	6	581535	581540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11078	NC_008526	A	7	7	581658	581664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_008526	TAC	2	6	581677	581682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11081	NC_008526	ATG	2	6	581737	581742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_008526	TGC	2	6	581837	581842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494145
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11085	NC_008526	A	6	6	581969	581974	100 %	0 %	0 %	0 %	116494145
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11102	NC_008526	TATC	2	8	582617	582624	25 %	50 %	0 %	25 %	116494145
11103	NC_008526	GGTAA	2	10	582759	582768	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_008526	AAGG	2	8	582797	582804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_008526	AT	3	6	582877	582882	50 %	50 %	0 %	0 %	116494146
11106	NC_008526	GAA	2	6	582883	582888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494146
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11108	NC_008526	GAG	2	6	582899	582904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494146
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11110	NC_008526	ATT	2	6	583022	583027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494146
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11113	NC_008526	TGA	2	6	583122	583127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494146
11114	NC_008526	TTG	2	6	583128	583133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494146
11115	NC_008526	TAT	2	6	583216	583221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494146
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11118	NC_008526	TGA	2	6	583264	583269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494146
11119	NC_008526	CAAA	2	8	583351	583358	75 %	0 %	0 %	25 %	116494146
11120	NC_008526	ATTC	2	8	583361	583368	25 %	50 %	0 %	25 %	116494146
11121	NC_008526	AGG	2	6	583419	583424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494146
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11123	NC_008526	AT	3	6	583465	583470	50 %	50 %	0 %	0 %	116494147
11124	NC_008526	ATT	2	6	583484	583489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494147
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11142	NC_008526	GAA	2	6	584797	584802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11143	NC_008526	GAA	2	6	584881	584886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11144	NC_008526	TGA	2	6	584931	584936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11239	NC_008526	ATA	2	6	590652	590657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494152
11240	NC_008526	TGC	3	9	590785	590793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494152
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11242	NC_008526	CCT	2	6	590941	590946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11243	NC_008526	ATT	2	6	591033	591038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494153
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