MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_008526	CGG	2	6	550698	550703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494114
10502	NC_008526	CGT	2	6	550714	550719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494114
10503	NC_008526	CTT	2	6	550741	550746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494114
10504	NC_008526	GAT	2	6	550761	550766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494114
10505	NC_008526	CAAT	2	8	550781	550788	50 %	25 %	0 %	25 %	116494114
10506	NC_008526	ACG	2	6	550822	550827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494114
10507	NC_008526	TGA	2	6	550887	550892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494114
10508	NC_008526	GTC	2	6	550978	550983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494114
10509	NC_008526	ATAA	2	8	551067	551074	75 %	25 %	0 %	0 %	116494114
10510	NC_008526	CGC	2	6	551085	551090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494114
10511	NC_008526	ACC	2	6	551192	551197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10512	NC_008526	TTA	2	6	551244	551249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_008526	TTG	2	6	551286	551291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_008526	AG	3	6	551304	551309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_008526	AGGG	2	8	551336	551343	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_008526	AAT	2	6	551380	551385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_008526	GAT	2	6	551461	551466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_008526	CTT	2	6	551483	551488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494115
10519	NC_008526	GTCA	2	8	551489	551496	25 %	25 %	25 %	25 %	116494115
10520	NC_008526	GAT	2	6	551546	551551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494115
10521	NC_008526	GGTT	2	8	551572	551579	0 %	50 %	50 %	0 %	116494115
10522	NC_008526	AGC	2	6	551593	551598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494115
10523	NC_008526	TGT	2	6	551659	551664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494115
10524	NC_008526	CGG	2	6	551680	551685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494115
10525	NC_008526	GAC	2	6	551869	551874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494115
10526	NC_008526	TCA	2	6	551876	551881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494115
10527	NC_008526	TGACGA	2	12	551890	551901	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116494115
10528	NC_008526	TGA	2	6	551944	551949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494116
10529	NC_008526	GATG	2	8	551998	552005	25 %	25 %	50 %	0 %	116494116
10530	NC_008526	ATT	2	6	552008	552013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494116
10531	NC_008526	GAAG	2	8	552049	552056	50 %	0 %	50 %	0 %	116494116
10532	NC_008526	AAG	2	6	552077	552082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494116
10533	NC_008526	TCA	2	6	552156	552161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494116
10534	NC_008526	GTT	2	6	552230	552235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494116
10535	NC_008526	A	6	6	552439	552444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_008526	AGC	2	6	552479	552484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494117
10537	NC_008526	GCTT	2	8	552501	552508	0 %	50 %	25 %	25 %	116494117
10538	NC_008526	TTGG	2	8	552567	552574	0 %	50 %	50 %	0 %	116494117
10539	NC_008526	ATT	2	6	552591	552596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494117
10540	NC_008526	GGT	2	6	552669	552674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494117
10541	NC_008526	TTC	2	6	552737	552742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494117
10542	NC_008526	TGC	2	6	552770	552775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494117
10543	NC_008526	TAC	2	6	552828	552833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494117
10544	NC_008526	CAA	2	6	552841	552846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494117
10545	NC_008526	TTGG	2	8	552868	552875	0 %	50 %	50 %	0 %	116494117
10546	NC_008526	TGGC	2	8	552923	552930	0 %	25 %	50 %	25 %	116494117
10547	NC_008526	CAA	2	6	552964	552969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494117
10548	NC_008526	TAC	2	6	552981	552986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494117
10549	NC_008526	CGG	2	6	552994	552999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494117
10550	NC_008526	CGG	2	6	553061	553066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494117
10551	NC_008526	TGC	2	6	553069	553074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494117
10552	NC_008526	TTG	2	6	553108	553113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494117
10553	NC_008526	AGC	2	6	553118	553123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494117
10554	NC_008526	TGC	2	6	553157	553162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494117
10555	NC_008526	TTA	2	6	553216	553221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494117
10556	NC_008526	AAC	2	6	553248	553253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494117
10557	NC_008526	AC	3	6	553252	553257	50 %	0 %	0 %	50 %	116494117
10558	NC_008526	GCA	2	6	553272	553277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494117
10559	NC_008526	CAG	2	6	553279	553284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494117
10560	NC_008526	TGA	3	9	553295	553303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494117
10561	NC_008526	GAT	2	6	553305	553310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494117
10562	NC_008526	GAG	2	6	553311	553316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494117
10563	NC_008526	TGC	2	6	553458	553463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494118
10564	NC_008526	ATG	2	6	553491	553496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494118
10565	NC_008526	TTC	2	6	553529	553534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494118
10566	NC_008526	CCAAT	2	10	553539	553548	40 %	20 %	0 %	40 %	116494118
10567	NC_008526	ATTG	2	8	553681	553688	25 %	50 %	25 %	0 %	116494118
10568	NC_008526	TTG	2	6	553770	553775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494118
10569	NC_008526	GTT	2	6	553913	553918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494118
10570	NC_008526	GGT	2	6	553919	553924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494118
10571	NC_008526	CAT	2	6	553932	553937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494118
10572	NC_008526	GTG	2	6	553968	553973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494118
10573	NC_008526	ATT	2	6	554050	554055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494118
10574	NC_008526	CTG	2	6	554056	554061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494118
10575	NC_008526	GAA	2	6	554074	554079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494118
10576	NC_008526	TGC	2	6	554103	554108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494118
10577	NC_008526	GTT	3	9	554114	554122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494118
10578	NC_008526	TCG	2	6	554127	554132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494118
10579	NC_008526	TTC	2	6	554147	554152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494118
10580	NC_008526	GAA	2	6	554190	554195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10581	NC_008526	AAG	2	6	554241	554246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494119
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10584	NC_008526	GCA	2	6	554437	554442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494119
10585	NC_008526	CG	3	6	554450	554455	0 %	0 %	50 %	50 %	116494119
10586	NC_008526	GTT	2	6	554456	554461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494119
10587	NC_008526	GAC	2	6	554462	554467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494119
10588	NC_008526	AAG	2	6	554495	554500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494119
10589	NC_008526	CAG	2	6	554507	554512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494119
10590	NC_008526	TGT	2	6	554544	554549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10591	NC_008526	T	7	7	554639	554645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_008526	TGG	2	6	554660	554665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_008526	GTG	2	6	554677	554682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_008526	A	6	6	554709	554714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_008526	AGG	2	6	554716	554721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_008526	AGC	2	6	554747	554752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494120
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10598	NC_008526	TCT	2	6	554866	554871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494120
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10600	NC_008526	CAT	2	6	554963	554968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494120
10601	NC_008526	CAT	2	6	555008	555013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494120
10602	NC_008526	CAGT	2	8	555023	555030	25 %	25 %	25 %	25 %	116494120
10603	NC_008526	CAGA	2	8	555031	555038	50 %	0 %	25 %	25 %	116494120
10604	NC_008526	TGA	2	6	555039	555044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494120
10605	NC_008526	ACA	2	6	555100	555105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494120
10606	NC_008526	TAT	2	6	555123	555128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494120
10607	NC_008526	TGA	2	6	555156	555161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494120
10608	NC_008526	AGT	2	6	555172	555177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494120
10609	NC_008526	CAA	2	6	555215	555220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494120
10610	NC_008526	ATG	2	6	555302	555307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494120
10611	NC_008526	AGC	2	6	555382	555387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494120
10612	NC_008526	TAT	2	6	555406	555411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494120
10613	NC_008526	TTAA	2	8	555475	555482	50 %	50 %	0 %	0 %	116494120
10614	NC_008526	GGGA	2	8	555526	555533	25 %	0 %	75 %	0 %	116494120
10615	NC_008526	CAA	3	9	555602	555610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494120
10616	NC_008526	TTG	3	9	555656	555664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494120
10617	NC_008526	CTG	2	6	555716	555721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494120
10618	NC_008526	A	6	6	555741	555746	100 %	0 %	0 %	0 %	116494120
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10620	NC_008526	AGG	2	6	555906	555911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494120
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10990	NC_008526	CAT	2	6	576361	576366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494139
10991	NC_008526	TA	3	6	576424	576429	50 %	50 %	0 %	0 %	116494139
10992	NC_008526	CCA	3	9	576519	576527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494139
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11000	NC_008526	TTC	2	6	576946	576951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494139

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