MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_008526	ACA	2	6	448387	448392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494006
8502	NC_008526	GCT	2	6	448461	448466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494006
8503	NC_008526	CAC	2	6	448470	448475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494006
8504	NC_008526	AC	3	6	448691	448696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8505	NC_008526	TCA	2	6	448937	448942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494007
8506	NC_008526	AGC	2	6	448943	448948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494007
8507	NC_008526	T	6	6	449041	449046	0 %	100 %	0 %	0 %	116494007
8508	NC_008526	ATC	2	6	449114	449119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494007
8509	NC_008526	TCA	2	6	449141	449146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494007
8510	NC_008526	GA	3	6	449153	449158	50 %	0 %	50 %	0 %	116494007
8511	NC_008526	TGG	2	6	449203	449208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494007
8512	NC_008526	GAT	2	6	449220	449225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494007
8513	NC_008526	GGCC	2	8	449301	449308	0 %	0 %	50 %	50 %	116494007
8514	NC_008526	TGA	2	6	449355	449360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494007
8515	NC_008526	GCG	2	6	449459	449464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494007
8516	NC_008526	TCA	2	6	449510	449515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494007
8517	NC_008526	TCA	2	6	449786	449791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494007
8518	NC_008526	TGC	2	6	449998	450003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494008
8519	NC_008526	ATC	2	6	450066	450071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494008
8520	NC_008526	CAA	2	6	450106	450111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494008
8521	NC_008526	ATA	2	6	450171	450176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494008
8522	NC_008526	GACG	2	8	450203	450210	25 %	0 %	50 %	25 %	116494008
8523	NC_008526	GCG	2	6	450298	450303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494008
8524	NC_008526	TTAA	2	8	450316	450323	50 %	50 %	0 %	0 %	116494008
8525	NC_008526	GAA	2	6	450370	450375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_008526	GAA	2	6	450454	450459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494009
8527	NC_008526	TGA	2	6	450504	450509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494009
8528	NC_008526	GCG	2	6	450557	450562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494009
8529	NC_008526	TTC	2	6	450665	450670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494009
8530	NC_008526	CAT	2	6	450681	450686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494009
8531	NC_008526	CCT	2	6	450753	450758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116494009
8532	NC_008526	ATTC	2	8	450771	450778	25 %	50 %	0 %	25 %	116494009
8533	NC_008526	TGA	2	6	450821	450826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494009
8534	NC_008526	GCC	2	6	450831	450836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494009
8535	NC_008526	TCA	2	6	450875	450880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494009
8536	NC_008526	GAC	2	6	450955	450960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494009
8537	NC_008526	AAT	2	6	450985	450990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494009
8538	NC_008526	AAT	2	6	451053	451058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494009
8539	NC_008526	GAA	2	6	451066	451071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494009
8540	NC_008526	CAAG	2	8	451101	451108	50 %	0 %	25 %	25 %	116494009
8541	NC_008526	GAT	2	6	451116	451121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494009
8542	NC_008526	CAT	2	6	451150	451155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494009
8543	NC_008526	GGAAC	2	10	451165	451174	40 %	0 %	40 %	20 %	116494009
8544	NC_008526	TCA	2	6	451175	451180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494009
8545	NC_008526	GAG	2	6	451250	451255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494009
8546	NC_008526	ATA	2	6	451268	451273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494009
8547	NC_008526	GCG	2	6	451337	451342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494009
8548	NC_008526	GGTTG	2	10	451350	451359	0 %	40 %	60 %	0 %	116494009
8549	NC_008526	ACTG	2	8	451378	451385	25 %	25 %	25 %	25 %	116494009
8550	NC_008526	TG	3	6	451384	451389	0 %	50 %	50 %	0 %	116494009
8551	NC_008526	ATCA	2	8	451549	451556	50 %	25 %	0 %	25 %	116494009
8552	NC_008526	GGC	2	6	451566	451571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494009
8553	NC_008526	GGAC	2	8	451641	451648	25 %	0 %	50 %	25 %	116494009
8554	NC_008526	GCTT	2	8	451686	451693	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8555	NC_008526	AGCAT	2	10	451712	451721	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8556	NC_008526	ATT	2	6	451780	451785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_008526	A	6	6	451812	451817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_008526	T	7	7	451839	451845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_008526	TCAT	2	8	451852	451859	25 %	50 %	0 %	25 %	116494010
8560	NC_008526	GAT	2	6	451933	451938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494010
8561	NC_008526	GCC	2	6	451957	451962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494010
8562	NC_008526	A	6	6	451979	451984	100 %	0 %	0 %	0 %	116494010
8563	NC_008526	ATCC	2	8	451993	452000	25 %	25 %	0 %	50 %	116494010
8564	NC_008526	CTT	2	6	452067	452072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494010
8565	NC_008526	GCT	2	6	452084	452089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494010
8566	NC_008526	GCG	2	6	452090	452095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494010
8567	NC_008526	GATTG	2	10	452212	452221	20 %	40 %	40 %	0 %	116494010
8568	NC_008526	TCCTAA	2	12	452230	452241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494010
8569	NC_008526	CGA	2	6	452246	452251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494010
8570	NC_008526	CCA	2	6	452262	452267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494010
8571	NC_008526	ATGC	2	8	452273	452280	25 %	25 %	25 %	25 %	116494010
8572	NC_008526	AC	3	6	452381	452386	50 %	0 %	0 %	50 %	116494010
8573	NC_008526	CGA	2	6	452403	452408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494010
8574	NC_008526	GGC	2	6	452410	452415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494010
8575	NC_008526	GCA	2	6	452423	452428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494010
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8578	NC_008526	TCTT	2	8	452509	452516	0 %	75 %	0 %	25 %	116494011
8579	NC_008526	TGT	2	6	452579	452584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494011
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8581	NC_008526	GTAA	2	8	452687	452694	50 %	25 %	25 %	0 %	116494011
8582	NC_008526	TCA	2	6	452707	452712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494011
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8584	NC_008526	AGTTA	2	10	452931	452940	40 %	40 %	20 %	0 %	116494011
8585	NC_008526	ACTG	2	8	452987	452994	25 %	25 %	25 %	25 %	116494011
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8588	NC_008526	AAT	2	6	453089	453094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494011
8589	NC_008526	GCA	2	6	453100	453105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494011
8590	NC_008526	TAA	2	6	453112	453117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494011
8591	NC_008526	ATA	2	6	453138	453143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494011
8592	NC_008526	GCC	2	6	453172	453177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494011
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8594	NC_008526	AT	3	6	453259	453264	50 %	50 %	0 %	0 %	116494011
8595	NC_008526	ATG	2	6	453294	453299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494011
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8599	NC_008526	CAT	2	6	453413	453418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494011
8600	NC_008526	AATCG	2	10	453573	453582	40 %	20 %	20 %	20 %	116494011
8601	NC_008526	CTT	2	6	453599	453604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494011
8602	NC_008526	TGA	2	6	453613	453618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494011
8603	NC_008526	TCT	2	6	453697	453702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494011
8604	NC_008526	GTG	2	6	453708	453713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494011
8605	NC_008526	TAA	2	6	453773	453778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494011
8606	NC_008526	TTG	2	6	453783	453788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494011
8607	NC_008526	TTG	2	6	453839	453844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494011
8608	NC_008526	AGAT	2	8	453905	453912	50 %	25 %	25 %	0 %	116494012
8609	NC_008526	CGA	2	6	453924	453929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494012
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8612	NC_008526	TTTC	2	8	454106	454113	0 %	75 %	0 %	25 %	116494012
8613	NC_008526	GCT	3	9	454138	454146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494012
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8617	NC_008526	GGA	2	6	454337	454342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494013
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8619	NC_008526	GAT	2	6	454413	454418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494013
8620	NC_008526	ATA	2	6	454438	454443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494013
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