MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008526	TGT	2	6	258030	258035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493827
5002	NC_008526	CGA	2	6	258111	258116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493827
5003	NC_008526	GAC	3	9	258125	258133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493827
5004	NC_008526	CAA	2	6	258161	258166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493827
5005	NC_008526	A	6	6	258276	258281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_008526	ATG	2	6	258318	258323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_008526	TGC	2	6	258350	258355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_008526	GCA	2	6	258375	258380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_008526	T	6	6	258385	258390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_008526	GTG	2	6	258438	258443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_008526	GTATAA	2	12	258467	258478	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116493828
5012	NC_008526	GCA	2	6	258542	258547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493828
5013	NC_008526	GTT	2	6	258596	258601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493828
5014	NC_008526	ATC	2	6	258677	258682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493828
5015	NC_008526	CGGG	2	8	258683	258690	0 %	0 %	75 %	25 %	116493828
5016	NC_008526	TGG	2	6	258706	258711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493828
5017	NC_008526	CAC	2	6	258781	258786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493828
5018	NC_008526	TCA	2	6	258804	258809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493828
5019	NC_008526	ACAA	2	8	258851	258858	75 %	0 %	0 %	25 %	116493828
5020	NC_008526	TTG	2	6	258928	258933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493828
5021	NC_008526	ATGC	2	8	258934	258941	25 %	25 %	25 %	25 %	116493828
5022	NC_008526	GAC	2	6	258968	258973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493828
5023	NC_008526	CAAT	2	8	258974	258981	50 %	25 %	0 %	25 %	116493828
5024	NC_008526	CAT	2	6	259006	259011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493828
5025	NC_008526	GCAG	2	8	259061	259068	25 %	0 %	50 %	25 %	116493828
5026	NC_008526	GTGC	2	8	259187	259194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_008526	T	7	7	259214	259220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_008526	A	6	6	259221	259226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_008526	TGAG	2	8	259237	259244	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_008526	GTA	2	6	259253	259258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_008526	GTCA	2	8	259270	259277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5032	NC_008526	A	7	7	259307	259313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_008526	AAG	2	6	259441	259446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_008526	AAC	2	6	259473	259478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_008526	GGC	2	6	259543	259548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_008526	TGA	2	6	259583	259588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_008526	TGGA	2	8	259755	259762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_008526	GAT	2	6	259808	259813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_008526	GCA	2	6	259881	259886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_008526	CGC	2	6	259928	259933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5041	NC_008526	GTGA	2	8	259934	259941	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_008526	TGT	2	6	259967	259972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_008526	GAA	2	6	259977	259982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_008526	TGT	2	6	259999	260004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_008526	CAG	2	6	260049	260054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_008526	AGCG	2	8	260104	260111	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5047	NC_008526	T	6	6	260119	260124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_008526	AGA	2	6	260190	260195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_008526	AT	3	6	260234	260239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_008526	GAA	2	6	260241	260246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_008526	GGC	2	6	260260	260265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_008526	GTCTG	2	10	260267	260276	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5053	NC_008526	GAA	2	6	260504	260509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_008526	GA	3	6	260542	260547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_008526	GGT	2	6	260578	260583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_008526	GTC	2	6	260592	260597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_008526	TCGTG	2	10	260601	260610	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5058	NC_008526	GGA	2	6	260704	260709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_008526	ATC	2	6	260728	260733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_008526	AC	3	6	260755	260760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5061	NC_008526	ATGG	2	8	260769	260776	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_008526	CGC	2	6	260894	260899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_008526	AC	3	6	260924	260929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_008526	GAGC	2	8	260988	260995	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5065	NC_008526	CCT	2	6	261068	261073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_008526	CA	3	6	261111	261116	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5067	NC_008526	TCGCA	2	10	261261	261270	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5068	NC_008526	TAAG	2	8	261383	261390	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_008526	CGG	2	6	261467	261472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_008526	AGAA	2	8	261513	261520	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_008526	TAG	2	6	261534	261539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_008526	GCGA	2	8	261542	261549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5073	NC_008526	GCTT	2	8	261574	261581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5074	NC_008526	CGG	2	6	261712	261717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_008526	GGA	2	6	261744	261749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_008526	TTGC	2	8	261928	261935	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5077	NC_008526	GTG	2	6	262047	262052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_008526	AC	3	6	262055	262060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5079	NC_008526	GGA	2	6	262062	262067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_008526	ATGT	2	8	262076	262083	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_008526	TC	3	6	262148	262153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5082	NC_008526	GGA	2	6	262178	262183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_008526	AGC	2	6	262406	262411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_008526	ATA	2	6	262482	262487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_008526	TCC	2	6	262661	262666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5086	NC_008526	AGG	2	6	262769	262774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_008526	AGC	2	6	262809	262814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_008526	TAG	2	6	262878	262883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_008526	GAG	2	6	262965	262970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_008526	GAGC	2	8	262984	262991	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5091	NC_008526	GAA	2	6	263035	263040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_008526	AAC	2	6	263081	263086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_008526	GAT	2	6	263123	263128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_008526	CGG	2	6	263214	263219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_008526	GA	3	6	263312	263317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_008526	TAGG	2	8	263430	263437	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_008526	TGG	2	6	263476	263481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_008526	TAC	2	6	263484	263489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_008526	CCT	2	6	263572	263577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5100	NC_008526	GGT	2	6	263708	263713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_008526	CGT	2	6	263903	263908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_008526	GAG	2	6	263952	263957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_008526	GCC	2	6	264011	264016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5104	NC_008526	C	6	6	264079	264084	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5105	NC_008526	GAGAT	2	10	264087	264096	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_008526	GA	3	6	264127	264132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_008526	TGGAAG	2	12	264150	264161	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_008526	CTGCGA	2	12	264315	264326	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_008526	GCA	2	6	264360	264365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_008526	GTG	2	6	264412	264417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_008526	AAG	2	6	264426	264431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_008526	CTT	2	6	264468	264473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_008526	AGT	2	6	264483	264488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_008526	TGG	2	6	264489	264494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_008526	CTGC	2	8	264499	264506	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5116	NC_008526	T	7	7	264557	264563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_008526	TAAG	2	8	264573	264580	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_008526	AGCA	2	8	264604	264611	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5119	NC_008526	CAT	2	6	264625	264630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493829
5120	NC_008526	GTG	2	6	264706	264711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493829
5121	NC_008526	GGT	2	6	264775	264780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493829
5122	NC_008526	GC	3	6	264869	264874	0 %	0 %	50 %	50 %	116493829
5123	NC_008526	TGCT	3	12	265003	265014	0 %	50 %	25 %	25 %	116493830
5124	NC_008526	CGA	2	6	265069	265074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493830
5125	NC_008526	ACG	2	6	265114	265119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493830
5126	NC_008526	CGAT	2	8	265183	265190	25 %	25 %	25 %	25 %	116493830
5127	NC_008526	CG	3	6	265208	265213	0 %	0 %	50 %	50 %	116493830
5128	NC_008526	CT	3	6	265222	265227	0 %	50 %	0 %	50 %	116493830
5129	NC_008526	CGTT	2	8	265228	265235	0 %	50 %	25 %	25 %	116493830
5130	NC_008526	T	6	6	265302	265307	0 %	100 %	0 %	0 %	116493830
5131	NC_008526	GGT	2	6	265323	265328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493830
5132	NC_008526	CGGT	2	8	265409	265416	0 %	25 %	50 %	25 %	116493830
5133	NC_008526	TTA	2	6	265469	265474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493830
5134	NC_008526	TAT	3	9	265554	265562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493830
5135	NC_008526	ATTCG	2	10	265604	265613	20 %	40 %	20 %	20 %	116493830
5136	NC_008526	TTC	2	6	265714	265719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493830
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5142	NC_008526	GAT	2	6	265911	265916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493831
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5144	NC_008526	T	6	6	265960	265965	0 %	100 %	0 %	0 %	116493831
5145	NC_008526	GC	3	6	265966	265971	0 %	0 %	50 %	50 %	116493831
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5149	NC_008526	T	6	6	266393	266398	0 %	100 %	0 %	0 %	116493832
5150	NC_008526	GACT	2	8	266415	266422	25 %	25 %	25 %	25 %	116493832
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5155	NC_008526	AGG	2	6	266628	266633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5156	NC_008526	TTG	3	9	266702	266710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5157	NC_008526	CCGA	2	8	266722	266729	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5158	NC_008526	T	6	6	266817	266822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5163	NC_008526	CGG	2	6	267136	267141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493833
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5174	NC_008526	TAT	2	6	267615	267620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493833
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5184	NC_008526	CAAA	2	8	267950	267957	75 %	0 %	0 %	25 %	116493833
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5188	NC_008526	CAA	2	6	268121	268126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493834
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5223	NC_008526	CG	3	6	269526	269531	0 %	0 %	50 %	50 %	116493835
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5233	NC_008526	CAAGCG	2	12	269900	269911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493835
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5236	NC_008526	ACA	2	6	270065	270070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493836
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5238	NC_008526	AAAG	2	8	270157	270164	75 %	0 %	25 %	0 %	116493836
5239	NC_008526	TGC	2	6	270294	270299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493836
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5242	NC_008526	T	7	7	270361	270367	0 %	100 %	0 %	0 %	116493836
5243	NC_008526	CGG	2	6	270422	270427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493836
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5246	NC_008526	GGT	2	6	270562	270567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493836
5247	NC_008526	ACATG	2	10	270577	270586	40 %	20 %	20 %	20 %	116493836
5248	NC_008526	TGA	2	6	270594	270599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493836
5249	NC_008526	TGG	2	6	270746	270751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493837
5250	NC_008526	TTG	2	6	270861	270866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493837
5251	NC_008526	ATGGC	2	10	270910	270919	20 %	20 %	40 %	20 %	116493837
5252	NC_008526	AAGC	2	8	271032	271039	50 %	0 %	25 %	25 %	116493837
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5379	NC_008526	GCGG	2	8	278924	278931	0 %	0 %	75 %	25 %	116493846
5380	NC_008526	ATTG	2	8	278959	278966	25 %	50 %	25 %	0 %	116493846
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5494	NC_008526	A	7	7	284467	284473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5500	NC_008526	AAG	2	6	284819	284824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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