MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008526	AAT	2	6	231614	231619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493805
4502	NC_008526	CAG	3	9	231636	231644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493805
4503	NC_008526	GCA	2	6	231804	231809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493805
4504	NC_008526	ATC	2	6	231822	231827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493805
4505	NC_008526	CGG	2	6	231849	231854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493805
4506	NC_008526	GCA	2	6	231914	231919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493805
4507	NC_008526	TTA	2	6	231923	231928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493805
4508	NC_008526	ATT	2	6	231936	231941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493805
4509	NC_008526	AGA	2	6	231994	231999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493805
4510	NC_008526	A	6	6	232046	232051	100 %	0 %	0 %	0 %	116493805
4511	NC_008526	AGA	2	6	232165	232170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493805
4512	NC_008526	CGAG	2	8	232251	232258	25 %	0 %	50 %	25 %	116493805
4513	NC_008526	TTA	2	6	232310	232315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493805
4514	NC_008526	TTA	2	6	232338	232343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493805
4515	NC_008526	A	7	7	232345	232351	100 %	0 %	0 %	0 %	116493805
4516	NC_008526	GGT	2	6	232424	232429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_008526	ATT	2	6	232463	232468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493806
4518	NC_008526	A	7	7	232509	232515	100 %	0 %	0 %	0 %	116493806
4519	NC_008526	GAA	2	6	232528	232533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493806
4520	NC_008526	GAAC	2	8	232564	232571	50 %	0 %	25 %	25 %	116493806
4521	NC_008526	GAA	2	6	232588	232593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493806
4522	NC_008526	TGG	2	6	232675	232680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493806
4523	NC_008526	AAC	2	6	232737	232742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493806
4524	NC_008526	AAT	2	6	232763	232768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493806
4525	NC_008526	ATG	2	6	232811	232816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493806
4526	NC_008526	ATTTG	2	10	232843	232852	20 %	60 %	20 %	0 %	116493806
4527	NC_008526	ATA	2	6	232866	232871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493806
4528	NC_008526	TAA	2	6	232885	232890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493806
4529	NC_008526	CTT	2	6	232910	232915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493806
4530	NC_008526	CTTTT	2	10	232930	232939	0 %	80 %	0 %	20 %	116493806
4531	NC_008526	AAC	2	6	232950	232955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493806
4532	NC_008526	GC	3	6	232968	232973	0 %	0 %	50 %	50 %	116493806
4533	NC_008526	AAC	2	6	233081	233086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493806
4534	NC_008526	GGC	2	6	233171	233176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493806
4535	NC_008526	GCA	2	6	233279	233284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_008526	ATG	2	6	233353	233358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_008526	CAT	2	6	233374	233379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_008526	GT	3	6	233423	233428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_008526	AGG	2	6	233450	233455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_008526	GGGCAA	2	12	233551	233562	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116493807
4541	NC_008526	TGA	2	6	233613	233618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493807
4542	NC_008526	GGT	2	6	233680	233685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493807
4543	NC_008526	TAT	2	6	233718	233723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493807
4544	NC_008526	TCT	2	6	233905	233910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493807
4545	NC_008526	AAC	2	6	233945	233950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493807
4546	NC_008526	GCT	2	6	233965	233970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493807
4547	NC_008526	AATC	2	8	234010	234017	50 %	25 %	0 %	25 %	116493807
4548	NC_008526	CCAGT	2	10	234080	234089	20 %	20 %	20 %	40 %	116493807
4549	NC_008526	TAC	2	6	234205	234210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493807
4550	NC_008526	AGC	2	6	234222	234227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493807
4551	NC_008526	TCT	2	6	234294	234299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493807
4552	NC_008526	GAGT	2	8	234399	234406	25 %	25 %	50 %	0 %	116493807
4553	NC_008526	TCAC	2	8	234432	234439	25 %	25 %	0 %	50 %	116493807
4554	NC_008526	TGA	2	6	234459	234464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493807
4555	NC_008526	ACC	2	6	234520	234525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493807
4556	NC_008526	ATG	2	6	234533	234538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493807
4557	NC_008526	CAA	2	6	234574	234579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493807
4558	NC_008526	ACG	2	6	234583	234588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493807
4559	NC_008526	AAG	2	6	234591	234596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493807
4560	NC_008526	ATT	2	6	234701	234706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493807
4561	NC_008526	CG	3	6	234730	234735	0 %	0 %	50 %	50 %	116493807
4562	NC_008526	TATT	2	8	234741	234748	25 %	75 %	0 %	0 %	116493807
4563	NC_008526	TGG	2	6	234750	234755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493807
4564	NC_008526	ACA	2	6	234766	234771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493807
4565	NC_008526	TGGT	2	8	234849	234856	0 %	50 %	50 %	0 %	116493807
4566	NC_008526	AC	3	6	234905	234910	50 %	0 %	0 %	50 %	116493807
4567	NC_008526	GAAGC	2	10	234918	234927	40 %	0 %	40 %	20 %	116493807
4568	NC_008526	TAT	2	6	234939	234944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493807
4569	NC_008526	ATT	2	6	234973	234978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493807
4570	NC_008526	GT	3	6	235001	235006	0 %	50 %	50 %	0 %	116493807
4571	NC_008526	ACG	2	6	235010	235015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493807
4572	NC_008526	TGA	2	6	235046	235051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493807
4573	NC_008526	AAT	2	6	235072	235077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493807
4574	NC_008526	ACT	2	6	235150	235155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493807
4575	NC_008526	AAG	2	6	235180	235185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493807
4576	NC_008526	TGA	2	6	235239	235244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493807
4577	NC_008526	CGA	2	6	235364	235369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493807
4578	NC_008526	ACA	2	6	235396	235401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493807
4579	NC_008526	GGC	2	6	235431	235436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493807
4580	NC_008526	AATC	2	8	235501	235508	50 %	25 %	0 %	25 %	116493807
4581	NC_008526	ATTA	2	8	235570	235577	50 %	50 %	0 %	0 %	116493807
4582	NC_008526	AAG	2	6	235585	235590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493807
4583	NC_008526	AAG	2	6	235619	235624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493807
4584	NC_008526	GTC	2	6	235704	235709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493807
4585	NC_008526	ATG	2	6	235745	235750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493807
4586	NC_008526	TGA	2	6	235758	235763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493807
4587	NC_008526	GCA	2	6	235813	235818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493807
4588	NC_008526	GCT	2	6	235951	235956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493807
4589	NC_008526	CTT	2	6	236069	236074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493807
4590	NC_008526	ATTA	2	8	236089	236096	50 %	50 %	0 %	0 %	116493807
4591	NC_008526	AAG	2	6	236104	236109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493807
4592	NC_008526	ATG	2	6	236111	236116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493807
4593	NC_008526	CAA	2	6	236119	236124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493807
4594	NC_008526	T	6	6	236311	236316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_008526	GAA	2	6	236350	236355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_008526	GAA	2	6	236434	236439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493808
4597	NC_008526	TGA	2	6	236484	236489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493808
4598	NC_008526	GCG	2	6	236537	236542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493808
4599	NC_008526	TTC	2	6	236645	236650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493808
4600	NC_008526	CAT	2	6	236661	236666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493808
4601	NC_008526	CCT	2	6	236733	236738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116493808
4602	NC_008526	ATTC	2	8	236751	236758	25 %	50 %	0 %	25 %	116493808
4603	NC_008526	TGA	2	6	236801	236806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493808
4604	NC_008526	GCC	2	6	236811	236816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493808
4605	NC_008526	TCA	2	6	236855	236860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493808
4606	NC_008526	GAC	2	6	236935	236940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493808
4607	NC_008526	AAT	2	6	236965	236970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493808
4608	NC_008526	AAT	2	6	237033	237038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493808
4609	NC_008526	GAA	2	6	237046	237051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493808
4610	NC_008526	CAAG	2	8	237081	237088	50 %	0 %	25 %	25 %	116493808
4611	NC_008526	CAT	2	6	237130	237135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493808
4612	NC_008526	TCA	2	6	237155	237160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493808
4613	NC_008526	ATA	2	6	237248	237253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493808
4614	NC_008526	GGTTG	2	10	237330	237339	0 %	40 %	60 %	0 %	116493808
4615	NC_008526	ACTG	2	8	237358	237365	25 %	25 %	25 %	25 %	116493808
4616	NC_008526	TG	3	6	237364	237369	0 %	50 %	50 %	0 %	116493808
4617	NC_008526	CA	3	6	237489	237494	50 %	0 %	0 %	50 %	116493808
4618	NC_008526	ATCA	2	8	237529	237536	50 %	25 %	0 %	25 %	116493808
4619	NC_008526	GGC	2	6	237546	237551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493808
4620	NC_008526	GGAC	2	8	237621	237628	25 %	0 %	50 %	25 %	116493808
4621	NC_008526	GCTT	2	8	237666	237673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4622	NC_008526	AGCAT	2	10	237692	237701	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4623	NC_008526	ATT	2	6	237760	237765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4977	NC_008526	AGCA	2	8	256538	256545	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4978	NC_008526	TCA	2	6	256592	256597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4989	NC_008526	AGC	2	6	257502	257507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493827
4990	NC_008526	AGGC	2	8	257550	257557	25 %	0 %	50 %	25 %	116493827
4991	NC_008526	CG	3	6	257559	257564	0 %	0 %	50 %	50 %	116493827
4992	NC_008526	AGC	2	6	257589	257594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493827
4993	NC_008526	CCT	2	6	257618	257623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116493827
4994	NC_008526	TGG	2	6	257682	257687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493827
4995	NC_008526	ATT	2	6	257722	257727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493827
4996	NC_008526	AGATC	2	10	257755	257764	40 %	20 %	20 %	20 %	116493827
4997	NC_008526	GTT	2	6	257803	257808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493827
4998	NC_008526	TGT	2	6	257866	257871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493827
4999	NC_008526	CTA	2	6	257878	257883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493827
5000	NC_008526	GCACT	2	10	257988	257997	20 %	20 %	20 %	40 %	116493827

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