MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 5930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008511	A	6	6	279906	279911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_008511	TAA	2	6	280024	280029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_008511	T	7	7	280072	280078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_008511	A	6	6	280085	280090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_008511	ATG	2	6	280092	280097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_008511	A	6	6	280181	280186	100 %	0 %	0 %	0 %	116332666
5507	NC_008511	T	6	6	280188	280193	0 %	100 %	0 %	0 %	116332666
5508	NC_008511	GTTT	2	8	280198	280205	0 %	75 %	25 %	0 %	116332666
5509	NC_008511	CGT	2	6	280217	280222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332666
5510	NC_008511	CCAT	2	8	280273	280280	25 %	25 %	0 %	50 %	116332666
5511	NC_008511	TCC	2	6	280294	280299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332666
5512	NC_008511	TCT	2	6	280301	280306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332666
5513	NC_008511	GTT	2	6	280310	280315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116332666
5514	NC_008511	TC	3	6	280349	280354	0 %	50 %	0 %	50 %	116332666
5515	NC_008511	CAA	2	6	280362	280367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332666
5516	NC_008511	TTC	2	6	280396	280401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332666
5517	NC_008511	T	7	7	280406	280412	0 %	100 %	0 %	0 %	116332666
5518	NC_008511	TCA	2	6	280502	280507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332666
5519	NC_008511	CTGT	2	8	280518	280525	0 %	50 %	25 %	25 %	116332666
5520	NC_008511	A	6	6	280628	280633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_008511	TTC	2	6	280663	280668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_008511	CAT	3	9	280673	280681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_008511	CAC	2	6	280728	280733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_008511	GA	3	6	280758	280763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_008511	AGT	2	6	280788	280793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_008511	A	6	6	280817	280822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_008511	AAC	2	6	280835	280840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_008511	GAA	2	6	280869	280874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332667
5529	NC_008511	CAAA	2	8	280964	280971	75 %	0 %	0 %	25 %	116332667
5530	NC_008511	ATT	2	6	281004	281009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332667
5531	NC_008511	TCG	2	6	281092	281097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332667
5532	NC_008511	A	8	8	281143	281150	100 %	0 %	0 %	0 %	116332668
5533	NC_008511	ATG	2	6	281181	281186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332668
5534	NC_008511	A	6	6	281195	281200	100 %	0 %	0 %	0 %	116332668
5535	NC_008511	CTT	2	6	281267	281272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332668
5536	NC_008511	AACGA	2	10	281290	281299	60 %	0 %	20 %	20 %	116332668
5537	NC_008511	T	8	8	281345	281352	0 %	100 %	0 %	0 %	116332668
5538	NC_008511	GGA	2	6	281411	281416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332668
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5540	NC_008511	TTTC	3	12	281455	281466	0 %	75 %	0 %	25 %	116332668
5541	NC_008511	CTTT	2	8	281473	281480	0 %	75 %	0 %	25 %	116332668
5542	NC_008511	CGC	2	6	281485	281490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116332668
5543	NC_008511	T	6	6	281562	281567	0 %	100 %	0 %	0 %	116332669
5544	NC_008511	GGA	2	6	281595	281600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332669
5545	NC_008511	TGGGAA	2	12	281708	281719	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116332669
5546	NC_008511	GTGTTT	2	12	281806	281817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_008511	AAT	2	6	281855	281860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_008511	GAA	2	6	281868	281873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_008511	ATT	2	6	281877	281882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_008511	TA	3	6	281903	281908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_008511	T	7	7	281995	282001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_008511	TAC	2	6	282106	282111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_008511	T	6	6	282169	282174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_008511	T	7	7	282280	282286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_008511	T	6	6	282312	282317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_008511	CTT	2	6	282323	282328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_008511	T	7	7	282582	282588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_008511	TTGT	2	8	282627	282634	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_008511	TC	3	6	282678	282683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_008511	TAT	2	6	282743	282748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_008511	TGGA	2	8	282783	282790	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_008511	GGA	2	6	282816	282821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_008511	GCC	2	6	282823	282828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_008511	T	7	7	282832	282838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_008511	GTT	2	6	282914	282919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_008511	A	6	6	283107	283112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_008511	T	6	6	283114	283119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_008511	T	8	8	283188	283195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_008511	CCA	2	6	283350	283355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5570	NC_008511	CCG	2	6	283370	283375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_008511	TCG	2	6	283426	283431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_008511	TGT	2	6	283452	283457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_008511	GATT	2	8	283467	283474	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_008511	CTT	2	6	283518	283523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_008511	T	7	7	283526	283532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_008511	GAT	2	6	283539	283544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_008511	TCA	2	6	283631	283636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_008511	ATCG	2	8	283674	283681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5579	NC_008511	TGT	2	6	283692	283697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_008511	TAC	2	6	283852	283857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5582	NC_008511	ATC	2	6	283957	283962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_008511	T	7	7	283980	283986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_008511	TA	3	6	284017	284022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_008511	T	7	7	284026	284032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_008511	TTTAG	2	10	284092	284101	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_008511	GTAA	2	8	284128	284135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_008511	ATC	2	6	284219	284224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_008511	TAT	3	9	284241	284249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_008511	T	6	6	284249	284254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_008511	TA	3	6	284258	284263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_008511	TAT	2	6	284281	284286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_008511	CTA	2	6	284346	284351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_008511	TTAAA	2	10	284352	284361	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_008511	A	6	6	284373	284378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5597	NC_008511	T	6	6	284483	284488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_008511	T	7	7	284586	284592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_008511	TGA	2	6	284613	284618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_008511	TAC	2	6	284627	284632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_008511	TGAT	2	8	284633	284640	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_008511	TTTCAA	2	12	284667	284678	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116332670
5603	NC_008511	TCT	2	6	284736	284741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332670
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5605	NC_008511	T	6	6	284830	284835	0 %	100 %	0 %	0 %	116332670
5606	NC_008511	TCGAT	2	10	284853	284862	20 %	40 %	20 %	20 %	116332670
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5609	NC_008511	CAT	2	6	285128	285133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332670
5610	NC_008511	CA	3	6	285137	285142	50 %	0 %	0 %	50 %	116332670
5611	NC_008511	TCGGA	2	10	285143	285152	20 %	20 %	40 %	20 %	116332670
5612	NC_008511	CGG	3	9	285160	285168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332670
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5614	NC_008511	ATC	2	6	285258	285263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332670
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5621	NC_008511	CGG	2	6	285517	285522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332670
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5623	NC_008511	AAAG	2	8	285531	285538	75 %	0 %	25 %	0 %	116332670
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5627	NC_008511	AACA	2	8	285785	285792	75 %	0 %	0 %	25 %	116332670
5628	NC_008511	TTC	2	6	285809	285814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332670
5629	NC_008511	T	6	6	285930	285935	0 %	100 %	0 %	0 %	116332670
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